KEGG   Pseudoalteromonas sp. APM04: MTP24_05730
Entry
MTP24_05730       CDS       T11363                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
psad  Pseudoalteromonas sp. APM04
SSDB
Other DBs
NCBI-ProteinID: UOB74610
LinkDB
Position
APM04_1:1204227..1207391
AA seq 1054 aa
MIESIIRWSIGNRFFVLLITLIIAFGGLYSLQKTPVDALPDLSDVQVIIKTSYPGQAPQV
VQDQVTFPLTTAMLSVPGAQTVRGYSFFGDSYVYIIFDDDTDLYWARSRVLEYLSQVASS
LPDSAKPQLGPDATGVGWVYIYALTDKSGNHDLSQLRSIQDWFLKYELQTVPGVSEVSAV
GGMVKQYQVQVDPDKLRAYNVPLSHIQMALKRGNKETGASVVEMAEAEYMVTATGYIQSV
GDIEKIPLGINEQGTPLRIGDVATVNLGPQMRRGIAELNGEGEVVGGVVVMRFGENAQQT
INGVKEKLESLKSSLPEGVEIVPVYDRSKLIARAVDNLWSKLLEELAVVAIVCVAFLFHL
RSSIVAVVTLPLGILVSFIIMYMQGINANIMSLGGIAIAIGAMTDGAIVMIENMHKHMEK
TPLTDENRWQIVAKAASEVGPALFFSLLIITVSFLPVFILEAQEGRMFSPLAYTKTYAMA
ASAGLAITLVPVLMGYFIRGKVVSEKKNPLNRLLIAIYMPVLKQVMKFPKSTIVAAILVT
IVGFWPVDKIGSEFIPPLDEGDLMYMPTTYPGISIGKARELLQQTDKLIRTVPEVETVFG
KVGRAETATDPAPLTMIETFIQLKPQEQWREGVTTESLKAEFDKLVKFPGLTNAWVMPIK
TRIDMLATGIKTPVGIKVAGPELDVIQEIGQQIEQILPEVTGTASVYSERVAGGRYIKVD
ISRDKASRFGLNIEDVQQVVSTAIGGMNVTQTVEGQERYPVNLRYPQDYRDSPEQLSRLP
VVTPSGQRIALGDVADIRVENGPPGIKSENARLNGWTFIDIDGVDVGTYVESAKIHLANN
LKLPAGYSITWAGQYEYMERAKEKLTYVLPLTLAIIVILLYLNFRAFSEVAIIIVTLPMA
MIGGLWLMYLEGFNFSVAVGVGFIALAGVAVEIGVIMLVYLNQALAELKEKAEERAEPIS
DDAYQDALLHGAGLRVRPVMMTVATIIIGLMPILYGTGTGSEIMSRIAAPMVGGMTSAVL
LTLIVLPVIYSIVKKPELNAFNKELSKAELKSNA
NT seq 3165 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgaatcaattattagatggtctatcggcaatcgtttctttgttttgttgattacc
ttaattatcgcgtttggtggtttgtattcattacaaaaaacaccagtagatgcactcccc
gatctttctgatgtgcaggtgataattaagacgagctatccgggacaggcaccacaagta
gtgcaagatcaagtgacgtttccccttactacagccatgttgtcagtaccgggagcgcaa
actgttcgtggttactcattttttggtgattcctacgtctatatcatttttgatgatgat
actgatttgtattgggctagaagcagagtacttgaatacttaagccaagtagcatcaagc
ctgcctgattcggcaaaaccacaattaggacctgatgcgacaggtgtgggttgggtatac
atctacgctttaacagataagtcaggaaaccatgatctaagccaattaagaagtattcaa
gactggtttttaaagtatgaactacaaactgttccgggcgtgtctgaggtttccgccgtt
ggcggtatggttaagcaatatcaggtacaagtcgatcccgacaagctcagagcttataac
gtgccgttaagtcatatccaaatggcacttaaacgaggcaataaagaaactggcgcatcc
gttgtggaaatggcggaagctgaatatatggttactgctacgggatatattcaatcagtt
ggagacatagagaaaattccacttggtattaacgagcaaggcacgccattgcgtattggt
gatgttgctaccgtaaatttagggcctcaaatgcgccgtggtatcgcagagcttaatggt
gaaggcgaagttgttggtggtgttgtcgttatgcgctttggtgaaaatgcccaacaaacc
ataaacggggtaaaagaaaaacttgaatcgcttaaatcttctctaccagagggggtggag
attgttcctgtctatgacagatcgaagttaatagctcgtgctgttgataatctttggagc
aagttgctagaggagcttgcagtcgttgctattgtctgtgtggctttcctatttcatctt
cgctcatctattgtggcagttgttactctgccattaggtatcttggtgtcgttcattatc
atgtatatgcaaggcatcaatgccaacattatgtctttaggcggtatcgctattgcgatt
ggtgcgatgactgatggtgcaatagtgatgattgaaaatatgcacaagcatatggagaaa
acaccactaacagatgaaaatcgctggcaaattgttgctaaggctgcgagtgaagtaggc
cctgcactattttttagcttactgatcattacagtctcattcttacctgtatttatcttg
gaagcgcaagaaggaagaatgttctctccgctcgcctatacaaaaacctatgcaatggcg
gcatcagcaggtttggcgatcacattggtgcctgttttgatgggctactttattcgaggc
aaagttgtttctgaaaagaaaaacccgttaaaccgattattgattgctatctacatgcct
gttttaaagcaagtcatgaagtttccaaaatcgacaatagtagcagcaatattagtgact
atcgttggcttttggcctgtcgataaaattggtagtgaattcattccgccattggatgaa
ggcgatctcatgtatatgcctactacctatcccggtatttcaattggtaaagcaagggag
ttattgcagcaaacagacaagcttattcgcactgtgccagaagttgaaactgtatttggt
aaagtaggaagagctgaaactgcaaccgatcctgcacctttaaccatgattgaaaccttt
attcaattgaagccacaagagcagtggcgagagggtgtgactactgaatcgttaaaagct
gagtttgataaattggttaagtttccgggcttaacgaatgcttgggttatgccaatcaag
acccgaatcgacatgttagcaacaggcataaaaacgcctgtgggtattaaagtcgccgga
ccagagcttgatgtgattcaggaaatcggccaacaaatagagcaaattttacccgaagtt
acaggcacagcatcagtttactcagagcgagttgcaggtggacgatatatcaaggttgat
atttcacgcgataaggcaagtcgctttgggttaaacatcgaagatgttcaacaagtggtt
tctacagctattggtggtatgaacgttacccaaacggtagaaggtcaagagcgttaccct
gttaacttacgctatccgcaagactatcgagactctcctgagcagctatcacgattacct
gttgtaacaccaagtggtcaacgcattgcactaggtgatgtcgcagatattcgagttgag
aacggtccgccgggaattaagagtgaaaatgctcgtttaaatggctggacgtttatcgat
atagacggtgttgacgtaggtacttatgttgaaagtgcaaaaatacacttggctaataat
ctaaaactaccagcaggttattcaattacttgggctgggcaatacgaatatatggaaaga
gcgaaagaaaagctcacctatgtattgcctttaacactcgccattattgttattctactt
tacttaaacttcagagcgtttagtgaggtggctatcattatcgttaccttgccgatggcg
atgattggtggcttatggttgatgtatctggaagggtttaacttctctgtggctgttggc
gtgggctttattgctctagctggggtagcggttgagattggtgtgataatgttggtttat
ctcaatcaggcacttgctgagcttaaggaaaaagctgaagagcgagctgaacctatctct
gatgatgcatatcaagatgcattattgcacggtgcaggcttacgagttcgtccagtaatg
atgacagttgcaacaatcattatcggcttgatgcccattttatatggtacaggaacaggt
tcggagattatgagtcgtattgctgcacctatggtaggcggaatgacaagtgctgtgcta
ctcactcttattgtgctcccagtaatttactcaatcgttaaaaagccagaattaaacgcc
tttaacaaggagctttctaaggcggagctaaaaagtaatgcttag

DBGET integrated database retrieval system