Pseudoalteromonas sp. APM04: MTP24_08695
Help
Entry
MTP24_08695 CDS
T11363
Name
(GenBank) DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2
Organism
psad Pseudoalteromonas sp. APM04
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Competence
Lactamase_B
DUF4131
NTP_transf_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOB72238
LinkDB
All DBs
Position
APM04_1:complement(1853868..1856135)
Genome browser
AA seq
755 aa
AA seq
DB search
MDSFLSHLKQPFTSVWISLGFVIGCISTVFYYETLEFIIITVSIVIIGAYFKPFLSLLLG
FICGICIVIAHYHIFYNFEHIINDEKYAYPVEVVIQEVISNKAPQYVKAKLVRINGKYYS
NLSAPSAMLSVNLDHPLRDNDRFVASVNLKKFRSNKNFNVFDNELYAFKQRIFFKGKVLN
KELKIKSTSEQNSVQSYKSFIKNTYENTTLNWLYYALLTGDKTLMTPSDKQLMQSLGLSH
LLAISGLHIGLVFGFGFFITKWVFIHVKLFNNQTINFSIAYSAIGFVSAFVYVYLSNFLV
SATRALIMLGCYLLLYYFQRQPMRWRSILFAFVIVLVVNPFNTLNPGLYFSFFAVVVIFL
VIKNVPHFTNSFLKVLFALITIQAALFIGLLPLSFYFFYGVSITGLVINLVAIPFLSLIL
MPCLFLLTAISTVFDISMVIIFIDSGLAFIFTCLNKLPAGFGWLNIGIIGLSVIIYAYIT
LLIFYFSPYRRLAFLPLVILYIDYLLADKPTWKLHVFDVGHGLMALIEKDDKGFIYDFGP
SYFNRFSRAKSILLPFIDINNIAVTHSVVSHLDNDHSGGLSHFISAGLKFSFNEFHPNGP
SKGCIPNEVNMAGLIIKSFPTPLYGNENDESCVIKVSYKEYSVLFTGDISKNRESQLINS
SDTLKSTVLLSPHHGSSTSSSNKFINAVMPQVVIHSSAYKGQWQFPKTEVVERYRNINAL
QYVTGQHGQITVEFYEETVTVITARDYQSYWFIKD
NT seq
2268 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggatagttttcttagccatttaaagcaaccatttacatcagtgtggatcagtcttggt
tttgtaattggctgtatttcaaccgtgttttattacgaaactctcgaatttattattatt
acagtgtccattgtaataataggcgcttattttaagccgtttttgtctttattgttaggc
tttatttgtggaatttgtatcgttatagcgcattatcatattttttataactttgagcac
ataattaatgatgaaaagtacgcatatccagtcgaagttgtaatacaagaagtcatctca
aacaaagctccccaatatgtcaaagcaaaattagtgcgtattaatggaaaatattattct
aatttgagtgcacctagcgcgatgttaagcgttaatttagatcacccattgcgtgataat
gatcgttttgtggcaagtgttaatttaaaaaaatttagaagtaataagaactttaatgta
tttgataacgaactgtatgcatttaagcagcgaattttctttaaaggaaaagttcttaat
aaagaattaaaaatcaaaagcacttcagaacaaaatagtgttcaaagttataaaagcttc
attaaaaatacatacgaaaatacaacactaaattggctttactatgctttattaacaggg
gataagacgttaatgacaccgagtgataagcagctgatgcaatcactgggtttaagccat
ttacttgctatttcaggcttacacattgggttggttttcggttttggtttcttcattaca
aagtgggtatttatccacgttaagttgtttaataatcaaacgatcaatttttcaattgct
tacagtgcgattggttttgtatcagcgtttgtttatgtctatttaagtaactttttggtt
tcagcgactcgtgcactaataatgcttggctgttatttacttctatattactttcaaagg
cagccaatgagatggcgcagtattttgtttgcgtttgttattgtactcgttgttaatccg
ttcaatacccttaatcctggattatatttttcattttttgcagtcgtggttattttttta
gttattaaaaatgtacctcactttaccaattcatttctaaaggtactttttgcattaatt
actattcaggctgcactatttattggtttactgcctctgtctttttactttttttatggc
gtgagtattactggcttagtcataaacttagtcgcaattccatttctttcattgatttta
atgccttgtttatttttattaacggctataagtaccgtatttgatattagtatggtgatt
atatttatcgatagcggtttagcttttatttttacctgtttaaataaattaccggcaggt
tttggttggctaaacataggaattattggtctaagtgtcattatttatgcttatattact
cttttaattttttatttttcgccatataggcggctcgcttttttacctttagtcatactc
tatattgattatttacttgctgataagcctacatggaaattacatgtattcgatgttggg
cacggtcttatggcgcttattgaaaaagatgataaagggtttatttatgattttggacct
agttactttaatcgttttagccgtgctaaaagtattttgttaccttttattgatataaat
aatattgcagtgactcattctgtagttagtcaccttgataatgaccattccggtggttta
tctcattttatcagcgcaggtttaaagttttcatttaatgaatttcaccctaatggaccc
tcaaaggggtgtattccaaacgaagtaaacatggctgggctaataattaaaagtttccca
actcccttgtatggtaatgaaaatgatgagtcgtgcgtaataaaagtttcatataaagag
tacagcgttctatttacaggcgatatttcaaaaaatagagagtcgcaactgataaactct
agcgatactttaaaaagtacagtgttacttagccctcatcacggtagtagtacgtcatca
agtaataaatttattaatgcagttatgccacaggttgttattcattcaagtgcttacaaa
gggcagtggcaatttcctaaaactgaggttgttgagcgttatagaaacattaatgccttg
cagtatgttactgggcaacacgggcaaattacggtggagttttacgaagagactgtgact
gttattacagcacgagattaccaaagctactggtttataaaagattga
DBGET
integrated database retrieval system