Pseudoalteromonas sp. APM04: MTP24_10865
Help
Entry
MTP24_10865 CDS
T11363
Symbol
bamA
Name
(GenBank) outer membrane protein assembly factor BamA
Organism
psad Pseudoalteromonas sp. APM04
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
POTRA_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOB72619
LinkDB
All DBs
Position
APM04_1:complement(2342063..2344534)
Genome browser
AA seq
823 aa
AA seq
DB search
MAIKKHLAVSSLLGASFAALGQTSFIVEDLKVEGLQRVALGAALTHIPINVGDNVDDYTI
SKTIKSLYRSGHFDNIKALRDGNNVIFKVTERPTISFIEFEGNKDIKDEQLNESLDQQDI
RQGEPLDKTVIDNIEKGLVEFFHSIGKYNATVDISVTKLPRNRVKLKLEFDEGDAASIRQ
INLVGNELFSNEELLKLAESQQDLPWWQFMGSDRYQKQTIEGDLEKIRSFYLDRGYLRFN
IDSTQVSVSPERESVYVTANLTEGVKYKVKGFDFIGDLLGREDLIKSVIPLRAGELYNGS
VVTSSEEFIKSYLARFGYANAEVRTIPEIDDEKQEVQLTLSVNPGKRVYVRRIIVGGNQN
TADEVLRREMTQLEGAWLSNQNLERSKLQIQRLPYMETVDFNVVPVPGVDDQVDVDFTVK
EQSAGSFNAGLAYGSYLGLQFNIGVTESNFLGTGNQIGLNLNTSTGSESVSLSYTDPYFT
PDGVSQGSSIFYRNYDASKFSLVDYKSKSYGLGTNIGFPIDAINRVNFGVRWIKEELSDI
AEYEQTRVLRETFFDPENPDAGFDFTKYELSVGWSRITVNRGLFPTAGSRQTLNLTGTTP
NSDLTYFKLNYDSRFYWPISNDHRWVFSARAALGYGNGYGSTNGYDQTLPFQEFFRITEM
ELRGFDRNTILPQAVSRIATTIPGTLNPDGSTSGPINSASEFDQLIPQGRIGGNAKAVAG
MELIVPTPFLDEENTSSVRTSFFVDAANVWDTEFSVDRYQNLLVDQRNKLDDYSDPMRFR
VSTGLSLQWISPMGPMLISFAYPLQKEEDDDTKTISFNISNTF
NT seq
2472 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctataaaaaaacatttggcagtttcaagtttattgggtgcaagctttgccgcccta
ggccaaacttcctttattgttgaagacttgaaagttgaaggcttacaacgcgtagcactt
ggtgctgcattgactcatattcctattaacgtaggcgataatgtagatgactacacaatt
tcaaaaacaataaagtcactttatcgttctggtcacttcgacaacatcaaagcattacgt
gatggcaacaacgttatttttaaagtaacagagcgcccaacaattagctttattgagttt
gaaggcaataaagatatcaaagatgagcaacttaacgagtcgcttgatcaacaagatatt
cgccaaggcgaaccattagataaaaccgtaattgataatattgaaaaaggcttagtagag
tttttccatagtattggtaaatacaatgcaacggttgatatcagcgttactaaattgcca
cgtaaccgcgtaaaacttaaactggagtttgatgaaggtgatgccgcgtctatccgccaa
attaacttagtgggtaacgagcttttttctaacgaagaattattaaaacttgctgagtct
cagcaagatttaccttggtggcaatttatgggtagcgatcgctaccaaaaacaaaccatt
gaaggtgatttagaaaaaatccgcagcttttatttagaccgtggttacttacgttttaat
attgattcgacgcaggtatcggtaagcccagagcgtgaatctgtatatgttacggccaac
cttaccgaaggcgttaaatacaaggttaaaggctttgattttattggtgacttactcggt
cgtgaagatttaattaaaagcgttatcccactcagagctggtgagctttacaatggttct
gttgtaacatcttcagaagagttcattaaaagttatttagcacgttttggttatgcaaat
gctgaagtgcgcacaattcctgaaattgatgacgaaaagcaagaagttcagttaacttta
tccgttaacccaggtaagcgtgtttatgttcgtcgtataattgttggtggtaaccaaaac
accgctgacgaagtattgcgccgcgaaatgacgcagctagaaggtgcatggttatcaaac
caaaacctcgagcgttcaaagctacaaattcaacgtttaccttatatggaaactgttgat
tttaacgtagtccccgtgccaggtgtagacgaccaagttgacgtagatttcacagtaaaa
gaacaatctgccggtagctttaatgcgggccttgcttatggttcatacctaggtctacag
tttaatattggtgtgactgaatctaacttcttaggaacaggcaaccaaattggtttaaat
ttaaatacttctactggctctgaaagtgtcagtttatcgtataccgacccttattttaca
ccagatggtgtttcacaaggcagcagtattttttaccgaaactacgacgcaagtaagttt
agtcttgtagattacaaatcaaaaagttatggtttaggtacaaatattggttttccgatt
gatgcaatcaaccgggttaattttggtgttcgttggataaaagaagagctttcagatatt
gccgagtacgagcaaacgcgtgtattacgtgagacattttttgaccctgaaaaccctgat
gcaggctttgactttaccaaatatgaattaagtgttggttggtcacgtataacggttaac
cgtggtttattccctacagcgggttcacgccaaacgttaaatttaacggggactacaccg
aactcagatttaacttacttcaagcttaattacgattcacgcttttactggccaatatct
aacgatcatcgctgggtattctcggctcgtgcggcgctcggttatggtaatggttatggg
tcaacaaatggatacgatcaaacgcttccattccaagagttcttccgtattacggaaatg
gaactacgtggctttgaccgtaatacaatattgccacaagctgtgtcacgtattgcaacg
acgattcctgggacactaaacccagatggttccacctcaggtcctatcaatagtgcgtca
gagtttgaccagttaataccacaaggtcgaattggtggtaacgccaaagcggtggcaggt
atggagttaatcgttcctacaccgtttttggatgaagaaaacacaagttcagtgcgtacc
agtttctttgttgatgctgcgaacgtatgggacaccgagtttagcgtagaccgttatcaa
aacttactcgtagaccaacgcaataagctggatgattattcagatcctatgcgttttaga
gtatcgaccggtttatcattacagtggatctctccaatgggtccaatgctgattagtttt
gcgtatccattgcaaaaagaagaagatgacgatacgaagaccatcagttttaatattagt
aacactttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
