Pseudoalteromonas sp. APM04: MTP24_16330
Help
Entry
MTP24_16330 CDS
T11363
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
psad Pseudoalteromonas sp. APM04
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOB75499
LinkDB
All DBs
Position
APM04_2:77088..81176
Genome browser
AA seq
1362 aa
AA seq
DB search
MKLSDLFKVSLIATAVSLAGCGGDLVVSEGDTTINEGDTITNVVEGGSDTGGETSSRDDS
QNGTTGFPTTVDNAFVQGLATDVSSEFPEITDKPVYRLTADTTFTTDATLTNDAHWIVNG
RTAVGNDRADNAKLYIQQGTTIIGESGDDFLVVRRGSQLESVGTVSQPITMTSIQDVTGG
ETAIGQWGGLVLLGNAPANSCGDQQGEATADELANCGVSAEGDAGQFGGDVADDNSGTLK
YLIVKQAGKTLGNGDELNGISFAGVGSATTVDYIQVHENLDDGIEFFGGTVDVSNVVLTS
IGDDSLDWSFGWTGSATNVYIQQAANVGDNAIEADNSEFDSSATPLTMPTVSNVTIVGAE
GNNGIRLRAGTAGALSNVFVTGPATYENCLRVGSDSVPRAEDGTLTITNSVVACQTTANN
FGSEAINGGDVKSWFEAQDGNQTLTPADLMLDDNGYTPLPGSPLIANGQIGAFNGTTNWM
EGWTVGINGGFPTDISNALEQGLATNVSSEFPQITDKPVYRLTQDTTFTADVTLTNDAHW
ILNGRTAVGNDRADATTLYVQAGTTLIGETGDDFLVVRRGSQINANGNATAPITMTSIQD
VTGGETNIGQWGGLVLLGNAPANSCGDQQGETTPEELANCGVSAEGDAGQFGGDISDDNS
GVLRYIVVKHAGKTLGNGDELNGISFAGVGSQTKVEYIQVHQNLDDGVEFFGGTVNVRNI
VLTDIGDDAFDWSFGWTGRAQNIYIQQSAVEGDNAIEADNSEFDSNATPLTKPLISNVTI
VGADGTNGVRLRAGTAGVLRNVVITGPDGYSNCLRVGSDSVANAESGELSIENSVVACNE
DNNFGSEAIAGGNVQSWFEGQTGNQTLTAANLSLATDGYTPKSSSPLLGAGVDTSGLDSF
FTKTDYIGAFDGDNNWMEGWTVAIKPSFPTDIQNALEQGLATDVSASFPAITDKPVYQLN
SDVVFTADVTLTNDAHWILKGRTAVGNDRADNTTLYVQFGTTLIGESGDDFLVVRRGSKI
EAVGTATQPITMTSIQDVTGGETTIGQWGGLVLLGNAPANSCGDQEGEATADELANCGVS
AEGDAGQFGGNDPEDNSGTLKYVAVKQAGKTLGNGDELNGISLAGVGSQTELDYIHVHEN
LDDGVEFFGGTANISHLVLTNIGDDSLDWSFGWTGKAQYVLIKQSGSEGDNAIEADNSEF
DSDASPLTMPTISNVTIIGDAGVNGIRLRAGTAGILKNVVVTGGTDYANCLRVGSDSAPR
AEDGSLTITHSVVACETANNFGTQAIGDGNVESWFLGQAGNSVQTAASLALASNGYMPSS
ESLLLGAGFDSSSLDSYFDTVDYIGAMDAQTDWTAGWVKVGL
NT seq
4089 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattatctgacttattcaaagttagtttgattgcaactgcagtatctttagcgggt
tgtggtggtgacttagtagtatctgaaggcgacacaacaattaacgaaggcgatacaata
acaaacgttgttgaaggcggctcagacacaggcggtgaaacgtcatctcgtgatgattca
caaaacggcacaactggtttccctaccactgttgacaacgcatttgttcaaggcttagcc
acagacgtatcaagcgaatttccggaaattactgataagccagtgtatcgcctaacagca
gatacaacgttcactaccgatgcaacacttacaaacgacgcgcattggattgtaaatggt
cgtacagcagtaggtaatgaccgtgcagataacgcaaagctttatattcaacaaggtaca
acaattattggtgaatctggcgatgactttttagtcgttcgtcgtggttcacagcttgag
tcggttggtacagtaagccagccaattactatgacctctattcaagatgtaacaggtggt
gaaacagccattggtcaatgggggggtttagtattactaggtaatgcacctgctaactca
tgtggcgaccaacaaggtgaagcaacagccgacgagctagctaactgtggtgtctctgct
gaaggtgacgcaggccagtttggtggcgatgttgcagatgataactcaggtacattaaag
tatttaatcgttaagcaagcaggtaaaactctgggtaatggcgatgagctaaacggtatt
tcgtttgccggtgtaggttctgcaacaaccgttgattacattcaagtacacgaaaacctt
gatgacggtatcgagtttttcggtggtacagttgatgtaagcaatgttgtattaaccagc
attggtgatgattcacttgactggtcgttcggttggacaggctctgcaactaacgtatac
attcaacaagctgcaaacgtgggcgataatgcgattgaagcagataactctgagtttgat
tcaagtgcaacaccacttacaatgccaaccgtttcaaacgtaacaattgtaggtgctgaa
ggtaacaacggtattcgtttacgtgcaggtactgcgggcgcattaagtaatgtattcgta
acgggtccagctacttatgaaaattgtttacgtgtaggttcagactctgtaccacgcgca
gaagatggtacattaactattactaattcagttgttgcatgtcaaacaacagctaacaac
tttggtagtgaagcgattaatggcggcgatgttaaatcgtggtttgaagctcaagacggc
aaccaaacgctaactccagcagatttaatgcttgatgataatggttacacaccactgccg
ggttcaccgcttattgccaatgggcaaattggtgcatttaatggtacaactaactggatg
gaaggttggacagtaggtattaatggcggcttcccaacagatatttcaaatgcattggag
cagggtttagcgaccaatgtatcaagtgaatttccacaaattaccgataagcctgtttac
cgtttaacacaagatacaacgtttacagccgatgtaacgcttacaaacgacgcacattgg
attttaaatggccgtactgcggtaggtaacgatcgcgctgatgcgactacactttacgtt
caagcgggcactacgcttattggtgaaactggtgacgatttcttagttgttcgccgtggt
tcacaaattaacgctaatggtaacgcaacagcacctatcactatgacatctattcaagat
gtaacgggtggcgaaacaaatattggtcaatggggtggtttagtattacttggtaatgca
cctgctaactcatgtggcgaccaacaaggtgagactacaccagaagagctcgctaactgt
ggtgtatcggcagaaggtgatgcaggtcagtttggtggtgatatcagcgatgataactca
ggtgttcttcgttacattgttgtaaaacatgctggtaaaacactgggtaatggcgatgaa
ctaaacggtatttcttttgctggtgtaggttcacaaactaaggttgaatatatccaggtt
catcaaaacctagacgacggtgtagagttttttggtggtacagtaaatgtacgtaacata
gtactgactgatattggcgatgacgcatttgattggtcgtttggttggacaggtcgtgca
caaaatatctatattcaacaaagtgcagttgaaggcgataatgccattgaagctgataac
tctgaatttgattcaaatgcaacgccattgactaagccacttatttctaacgtaacaatt
gtaggtgcagatggtactaacggtgttcgtttacgtgcaggtacagcgggtgtgcttcgt
aatgttgttatcactggcccagatgggtattcaaactgtttacgtgtaggttctgactcg
gtagcaaatgcagaatcgggtgagctttctattgaaaactcagtagtagcctgtaatgaa
gataataacttcggtagcgaagcaattgctggtggtaacgttcaatcgtggtttgaaggc
caaacaggtaaccaaacactcacggctgcaaacctaagcttagcaactgatggatataca
cctaagtcaagttcacctttacttggtgcaggtgttgatacctctggccttgattcgttc
ttcactaaaaccgattacattggtgcgtttgacggtgataataattggatggaaggctgg
accgttgctattaaacctagcttcccaactgatatccaaaacgcattagagcaagggcta
gcaacagatgtgtctgcaagtttcccagctattaccgataagcctgtttaccagttaaat
tcagatgttgtattcacagctgatgtaacactaacaaatgatgcacattggatcttaaaa
ggacgtacagctgttggtaatgaccgcgcagataacacaacattgtatgttcagtttggt
acaacattaattggtgaatcgggtgatgactttttagttgttcgtcgtggttcaaaaatt
gaggccgtaggcacagcaactcagccaatcaccatgacatctattcaagatgtaacgggt
ggcgaaacaacgattggccaatggggcggcttagtattattaggtaatgcaccggctaac
tcatgtggagatcaagaaggtgaagcaacagctgatgaacttgcaaactgtggtgtatct
gctgaaggtgatgctggccaatttggtggtaatgacccagaagataactcaggtacatta
aagtatgttgctgtaaaacaagccggcaaaactttaggtaatggtgatgaactaaacggt
atatcacttgctggtgtaggtagccaaacagagctagattacatccacgttcatgaaaac
ctagatgacggcgtagagtttttcggtggcactgcaaacatcagccacttagtgcttact
aatattggtgacgactctttagattggtcatttggttggacgggtaaagcgcaatacgta
cttatcaaacaatcaggctctgagggcgataacgcgattgaagctgataactctgaattt
gattcagatgcatcaccgcttactatgcctactatctctaatgtaaccattattggtgac
gcaggcgtaaacggtattcgcttacgtgcaggtactgccggcatacttaaaaacgtagtg
gtaaccggtggcacagattacgcaaactgtttacgtgtaggttctgactcagcaccacgt
gccgaagacggttcacttactatcactcactcagtggttgcgtgcgaaacagctaacaac
tttggtactcaagcaattggtgatggcaatgttgagtcttggttcttaggtcaagcgggt
aactcagtgcaaacagctgcaagccttgcactagcgagtaatggttacatgccttcaagt
gaatcattactactaggtgcaggttttgattcttctagcctagatagctactttgataca
gtagattacattggtgcaatggatgcacaaacagactggacagcgggttgggtaaaagta
ggtctttaa
DBGET
integrated database retrieval system