Pseudoalteromonas sp. APM04: MTP24_16505
Help
Entry
MTP24_16505 CDS
T11363
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
psad Pseudoalteromonas sp. APM04
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
SAM_KSR1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOB75533
LinkDB
All DBs
Position
APM04_2:125247..128393
Genome browser
AA seq
1048 aa
AA seq
DB search
MSANLSKNDLLAIFEEIKNEQATQFPLSERFINKLFKPNVLAKGKAYYKNGKIAWLEHNS
DFSVIDSTVQSDTGASYNQRIEISKLPTGYSVDTHCTCNIKSKCLHLAAILLKLKIEHSG
EYGEDYFINDWFSELSTLKSTESTTPSQVLLFVLSVENKKVFISPKIANFDKDQNYTLGR
NLTDQQLNSFITPNDLLESDFRLYSWIRSQNAVGSLELKGQWGFSALQQLIATERLFLHR
SRTAIKPQSGQALSFNWQQEKERTKLVVNLEQSKNWAVLKTTPPTYLDLDHLKVGRIRTP
LSGDEIAHLQTMPAIHSPNFDRIYKQLADNFGAGVIPHPTNTQSVLPHTASNAVIKVTME
EADLRLSLSFKYKNKHYPAGTAPNNLINSAFENTVTNELVNLGFEFCKGGLQSEFTFNKQ
SAIHLHWLTYEVFPSFKEHGWKVTVGKMDIANPQSEVTLIANRAAGHQVHCKVLINSSKL
SQLFSNEDSLYQSLNRQSQLFHYYPVGRQFGVINKSAMNVLSDFKQRFEFVKTRDEFNIP
LSYLPELVKHTAINVELHDDSLELYLEELNNTHKTLPSVSLHGLNESVELREYQQQGVDW
LSFLKRHKLGGILADDMGLGKTLQVIAFLTSTYNRPQAGPTLIVCPTSLVSNWQNEILKF
TKGLKVTTIFGSNRNEPLQHLAQAQCILTTYPLLKRDIAYYSPLFFENIVLDEAQYIKND
TAQVSRLVKRLNADFKLCLSGTPIENNLLELKSLLDFAMPSLLGSQAHFKQHFQTPIERE
ADMQRAEQLKALIMPFILRRTKAQVAQELPQKTEITKEFEFEPKQKEMYQGITRALEEKL
IDLFAEQGVQKSKLAFLEALLKLRQICCHPKLIEPDTQAGSAKLEWLSSHLPLMLSLGRK
VIIFSQFTSALDLIAKQLSELDINFSLLTGQTRHRDKVIDEFTSGKTSVFLISLKAGGTG
LNLTQADTVIHFDPWWNPAVEKQATDRAYRIGQTNPVFVYKLIMSHSIEQKVFKMQEDKQ
ALVDALFTDKSMSFTQFDEQQMLSLIKN
NT seq
3147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgctaacttatcaaaaaatgatttactggctatttttgaagaaattaaaaatgag
caggctacccagtttcctctttctgagcgttttataaataaactttttaagccaaacgtg
ttggcaaagggtaaagcgtattataaaaatggtaaaatcgcctggttagaacataacagt
gatttttcggtgatagactcaaccgttcaaagtgataccggtgcctcttataatcagcga
atcgagatcagtaaattaccaacaggttattctgttgatacccactgtacctgtaatatc
aaatctaaatgcctacacctagcagccattttgttaaagctcaaaattgagcactccggt
gagtatggcgaagactattttataaatgattggttcagcgaattaagtacacttaaaagt
accgaatcaacaacaccatctcaagtactactttttgtattaagtgttgaaaataaaaaa
gtatttatatctcctaaaatagctaatttcgacaaagaccaaaattataccttagggcgc
aatctaaccgaccaacaattaaatagctttataacgccaaatgatttacttgaaagcgac
tttagactttatagttggatccgttcacaaaatgcagttggtagtcttgagttaaaaggt
caatgggggtttagcgcgttacagcagttgattgcaaccgagcgcttatttttgcatcgt
tctcgaactgcaataaagcctcaaagtggccaggcgcttagttttaattggcaacaagaa
aaagagcgtacaaaattagtcgttaatttagaacaaagtaaaaattgggcggtactcaaa
actacacctcctacataccttgaccttgaccacttaaaagttggccgtatacgcacaccg
ttaagtggcgatgaaatagcccacttacaaaccatgcctgcaatacacagccctaatttc
gaccgtatttataaacagcttgcagataactttggtgcgggtgttattccccatcctacc
aatacgcaatctgttttaccgcatacagcgagtaatgcagtaattaaagtgactatggaa
gaggctgatttaaggctgtctttatcatttaagtataaaaataaacattaccccgcaggt
acagcgccaaataatttaattaacagcgcgtttgaaaacacagtaaccaatgagcttgtt
aatttaggttttgaattttgtaaagggggtttacaaagcgagtttacttttaataagcaa
tcagcaattcatttgcactggttaacttacgaggtatttcctagctttaaagagcatggt
tggaaagtaactgttggtaagatggatatcgccaatccgcaaagtgaagttacactgatt
gctaatagagctgcagggcatcaagtgcactgtaaagtgcttattaacagcagcaagctt
tcacaactttttagcaacgaagattcactttatcaatcgttaaatcgacaaagtcagtta
tttcattactaccctgttggccgccaatttggtgttatcaataagtcagccatgaacgtt
ttgtctgattttaagcaacgttttgagtttgtaaaaacacgtgacgaattcaatataccg
ctttcgtacttgccagaacttgtaaaacacactgcaattaatgttgagctgcacgacgac
tcactcgagctctatcttgaggagcttaacaatacacataaaacattgccgagcgtatcg
ttgcatggtttaaatgagtctgtcgaacttagagagtatcaacagcaaggtgttgattgg
ctgagttttttaaaacgccacaaacttggtggcattttagctgacgatatggggttgggt
aaaacactgcaggttattgcgtttttaacgagtacgtacaatcgtccgcaggcaggtcct
acactaatcgtgtgtccaaccagtttagtgagtaactggcaaaacgaaatacttaaattt
accaaaggattaaaggtaaccaccatatttgggtctaatcgtaacgagccactgcaacac
ctagcgcaagcacagtgtatattgactacttaccctttgttaaaacgtgatatagcttat
tactcaccgcttttttttgaaaatatagtgctagacgaagcgcaatatattaaaaatgac
acggcgcaagtatctcgattggtaaaacgtcttaatgctgattttaaattgtgcttaagc
ggtaccccaatcgaaaacaacttgcttgaactcaagtctttactcgactttgctatgccc
tcccttttaggctctcaggctcattttaaacaacattttcaaacgcctattgagcgtgag
gccgacatgcagcgtgcagagcaattaaaagcactcataatgccgtttatactgcgccga
acaaaagcacaagtggcgcaagaactgccgcaaaaaacagaaataacgaaagagtttgag
tttgagcccaaacaaaaagaaatgtatcaaggaataacacgtgcccttgaagaaaaactt
attgatttatttgctgagcaaggcgttcaaaaaagtaaacttgcctttttagaggcttta
ctgaagctaagacaaatttgttgtcatccaaagctcattgaacctgatacacaagccggg
tctgccaaattagaatggttatctagtcacctccctttaatgctaagtttggggcgtaaa
gtaattatatttagccaatttacatcagcgttagatttaattgcaaagcaattaagtgag
ttggatattaactttagtttattaacaggccaaactcgccatcgcgataaagttatagat
gagtttaccagtggcaaaacgtctgtttttttaattagcttaaaagcaggcggcactggg
cttaatttaacgcaagccgatacggttattcatttcgatccatggtggaaccccgcagta
gaaaaacaagccaccgatcgtgcctatcgtattgggcaaacaaacccagtttttgtttat
aagttgattatgagtcattcaattgaacaaaaagtatttaaaatgcaagaagataaacaa
gcacttgttgatgcattatttacagacaaatcaatgagttttacacagttcgatgagcaa
caaatgctgtcacttataaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system