KEGG   Candidatus Phytoplasma sacchari: O7R10_01525
Entry
O7R10_01525       CDS       T09130                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
psah  Candidatus Phytoplasma sacchari
Pathway
psah03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:psah00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    O7R10_01525 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:psah03021]
    O7R10_01525 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:psah03400]
    O7R10_01525 (rpoC)
Enzymes [BR:psah01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     O7R10_01525 (rpoC)
Transcription machinery [BR:psah03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     O7R10_01525 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:psah03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      O7R10_01525 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 RNA_pol_A_CTD Apocytochr_F_C Peptidase_M23
Other DBs
NCBI-ProteinID: WBL31276
UniProt: A0ABY7M0M0
LinkDB
Position
complement(333922..338001)
AA seq 1359 aa
MDLNMKVEDLFFSPKILKELRSIGINILRDFDSYSLSDLKYLLNEEILKDIIPILKNIFL
PSSLENLNLSQDLINIFKNNKIYNLRSLLETDENFLKKLIVKNSFFADQIKNIFSFYQYK
NLNFHDIIDIKNKKNSIINSNKEYGSREYDYFKIRLASSHEIRQWSYGEIVNYETINYRT
AKPEIGGLFCPKIFGPVKDLQCFCSKKTTLRKGQICLKCGVEITEQKVRRERMGHIELAS
PIVHTWYLNSSPSRLAILLGIKAKELSEIVYYASYIVFDPGKTNLEKKQIISEIQYGQYL
EHYGNNFIALTGAEAIKTMLEELNLNEIISELRIFLKKVSKQKRDNIIKRLEIIESFNKS
DNKPEWMVMDVIPVLPADLRPIVPLDGGRFATTDINDLYRRILNRNNRLKKQIKQKAPRL
IIKNEKRMLQEAVDALFDNAKTSKKNNSNIERNKNLKSLSEMLRGKQGRFRQNLLGKRVD
YSGRSVIIVGPDLKIHQCGIPRQMAFILFKPFILNKLQEVKGIDRKNATILYEKMNEYVL
SILEEVVKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPKLIDGKAIRLHPLVTPAFNADFDGDQMAVY
LPLSIEAQAEARLLMLVSNNILDPKNGSPVLSPSQDMVLGNYYLTIEKSKYFISECFNCK
KEEITDLEYKHRNEGKFFFDLKEAELAFYNKEIELHTRILVKASNIDSNFTDEQNKKYLI
TTLGKLIFNRILPSNFNYIQEPTIFNLETKTPDIYFIPKNGNPKDFLPKVPITEPFKKKF
VSMIIDYVFKKSNITETSKMLDNIKDLGFKYSTIAGITISHFDINVYSKKKELLIEVENK
ISEIEKWYDNGFLTISEKKSLVIKEWKIVRDKIQDGLMQEFDKNNHLFMISDSGARGNAS
NFSQLSGMRGLMNSPKGEILEIPVKSSFKEGLTVSEFFISTHGARKVSTDTALKTAESGY
LTRRLVDVAQDNIIMKEECGSDKGIFIEAIVRDEKEIISLEQRIFGRFSAENIINPVTQE
LILNKNELITKEIISKIIESNIKKVKIRSVLNCNFDHGICSRCYGLNLATNKNVEIGEAV
GVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVLAVSDITQGLPRIQELFEARKPKGKSVISECNGFV
KDIKNINSNFYEIKIVSDEDNKKEFVYNVLINSEILVHKNIHVKAGQKLTNGSIDLRELL
RITNVEETQKYILEEVQKVYQSQSVFISDKHIEIIIRQMFKQVLIIYEGDTDLLPGLEVS
IKDFRKENMKMIKNNKSLAVARPILLGITRASLKSDSLLSAASFQETTKILIDAAIKGQI
DYLYGLKENVIVGGLIPAGTGILETLSFKYPKNKISENI
NT seq 4080 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatttaaatatgaaagttgaagatttatttttttctcctaaaatattaaaagagtta
agatctattggtatcaatattttaagagattttgattcttatagtttatccgatttaaaa
tatttattgaatgaagaaattttaaaagatattattcctattttaaaaaatattttttta
ccatcttctctagaaaatcttaatttatcacaagatttaattaatattttcaaaaataat
aaaatatataatttacgttctcttttagaaacagatgaaaattttttaaaaaaattgatt
gttaaaaatagttttttcgcagatcaaattaaaaatattttcagtttttatcaatataaa
aatttaaattttcatgatattatagatattaaaaacaaaaaaaatagtattataaatagc
aataaagaatatggaagtcgtgagtacgattattttaaaattcgtttagcttcttctcat
gaaataagacagtggtcttatggtgagattgttaattatgaaactattaattatcgtact
gcaaaacctgaaataggaggtcttttttgtcctaaaatttttgggcctgtaaaagattta
caatgtttttgttcaaaaaaaactacattaagaaaaggtcaaatttgtttgaaatgtgga
gttgaaattactgaacaaaaagtaagaagagaaagaatggggcatattgaattagcatct
cctatagtacatacttggtatttaaatagttctcctagtaggttagctattttattaggt
ataaaagctaaagaattatcggaaatagtttattatgcttcttatattgtttttgatcct
ggtaaaacaaatttagaaaaaaaacaaataataagtgaaattcaatatggtcaatattta
gaacattatggaaataatttcattgctttaactggtgctgaagctattaaaactatgtta
gaagaattaaaccttaatgaaataattagtgaattaagaatttttcttaaaaaagtttct
aaacagaaaagagataatattattaaaagactggaaataatagaatcttttaataaatca
gataataaacctgaatggatggttatggatgtaattccagttttaccagcagatctaagg
cctatagttcctctagatggaggacgtttcgcaactactgatattaatgatttatatcga
agaatacttaatcgtaataatcgtttaaaaaaacaaattaaacaaaaagccccgagatta
attattaaaaatgaaaaaagaatgcttcaagaagctgttgatgctttgtttgataatgca
aaaacaagtaaaaaaaataattctaatattgaaagaaataaaaatttaaaatctttatca
gaaatgttgagaggaaaacaaggtcgttttcgtcaaaatcttttaggaaaaagggttgat
tattcaggaagatctgttattatagttggtccagatttgaaaatacatcagtgtggtata
ccaagacaaatggcttttattttatttaaaccttttattttgaataaattgcaagaagtt
aaagggattgatagaaaaaatgctactattttatatgaaaaaatgaatgaatatgtattg
agcattttagaagaagttgttaaagaacacccagttttattaaacagagctccaactttg
catcgtttaggtatacaagcttttgaacctaaattaatagatggaaaagcaatcagatta
catcctttggtaactcctgcttttaatgctgattttgatggtgatcaaatggctgtttat
ttacctttatctatcgaagcacaagctgaagcacgtttattaatgttggtttctaacaat
attttagatcctaaaaatggtagtcctgttttatctccttctcaagatatggttttaggt
aattattatttaactattgaaaaaagtaagtattttatttcggaatgttttaattgtaaa
aaagaagaaataactgatttagaatataaacatagaaatgaaggaaaatttttttttgat
ttgaaagaagccgaattagcgttttataataaagaaattgaacttcatactcgaatatta
gttaaagcttctaatatagattctaattttactgatgaacaaaataaaaaatatcttatc
actactttaggaaaattaatttttaacagaattttaccttctaattttaattatattcaa
gaaccaaccatatttaatttagaaacaaaaactcctgatatttattttattcctaaaaat
ggtaacccaaaagattttttaccaaaagttcctattacagaacctttcaaaaaaaaattt
gtatctatgattatagattatgtttttaaaaaaagcaatattacggaaacttcaaaaatg
ttagataatataaaagatttaggttttaaatattctacaatagccggaattactatttcg
cattttgatattaatgtttattcaaagaagaaagaattattaatagaagttgaaaataaa
atttcagaaatagaaaaatggtatgataatggttttttaactatttcagaaaagaaaagt
ttagtaattaaagagtggaaaattgttcgtgataaaattcaagatggtttaatgcaagaa
tttgataaaaataatcatttatttatgataagtgatagtggagctcgtggtaatgcctct
aatttttctcaattatctggaatgagaggattaatgaatagccctaagggtgaaatttta
gagattcctgtcaaaagttcttttaaggaaggattaactgtatctgaattttttatttca
actcatggtgctcgtaaagtatctactgatactgctttaaaaacagcagaatctggttat
ttaactcgtagattggttgatgtagctcaggataatatcattatgaaagaagaatgtggt
agtgacaaaggtatttttattgaagctattgttagagatgaaaaagaaattatttcatta
gaacaacgtatatttggacgtttttctgcagaaaatattattaatcctgttacccaagaa
ttaattttgaataaaaatgaattaattacaaaagaaattattagcaaaattatcgaatct
aatatcaaaaaagttaaaattagaagcgttcttaattgtaactttgatcatggtatttgt
tcgagatgttatggtttgaatttagctacaaataaaaatgtagaaattggagaagcggtt
ggtgttatagctgctcaatccattggagaacctggaacacaattaactatgagaactttt
catactggaggtgttcttgctgtttctgatattactcaaggtttacctagaattcaggaa
ctttttgaagctagaaaaccaaaaggaaaatccgttattagtgagtgtaatggttttgta
aaagatataaaaaatattaactctaatttttatgaaataaaaattgtttcagatgaagat
aataaaaaagaatttgtttataatgttttaataaattctgagattttagttcataaaaat
atacatgtaaaagctggacaaaaattaactaatggttctatagatttaagagaattatta
agaattactaatgttgaagaaactcaaaaatatattttagaagaagtacaaaaagtttat
cagtctcaaagtgtatttattagtgataaacatattgaaattattattcgtcaaatgttt
aaacaagttttaattatttatgaaggtgatactgatttattgccaggtttagaagtttca
ataaaagattttcgaaaagaaaatatgaaaatgattaaaaataataaatcattagctgta
gcgagacctattttattaggcataacaagagcttctttaaaaagtgattctttattatca
gctgcttcttttcaagaaacaactaagatattaattgatgcagcgatcaaaggacaaata
gattatttatacggtttgaaagaaaatgttattgtaggtggtcttatcccagcaggaaca
ggtattttagaaactctatcttttaaatatcctaaaaataaaatatcggaaaatatttga

DBGET integrated database retrieval system