Piscirickettsia salmonis: PSLF89_1786
Help
Entry
PSLF89_1786 CDS
T03982
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
psal
Piscirickettsia salmonis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_5
HemolysinCabind
Big_9
Cadherin_4
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP73614
LinkDB
All DBs
Position
1234471..1238343
Genome browser
AA seq
1290 aa
AA seq
DB search
MADEKNIQSQKDADNAVSDELIETAQRDSGENSIEDALEQVLADTTANSSEDSQFGSYQT
GYRGEGLEEPEDTGGGPERSDTNLESANQGGEFGNNAAPLEEINVSFQSGLDGVETEFDV
GAGDGASLNPILGITPDINNNAAVQSGGAANRGGVTEEESVAEEAEEVVVEAATSPTDDA
EAAESEIPLPDDDSDLSLSAEPAADDDTVTVNGDSDEPVINNNPRAIDDNLTLSEDLAFT
FNAADILVNDSDADGDALALTGISQSPEHGELIDNGDGSWTFTPAENYNGQDSFIYTVSD
GQGGFATATVALTIDPVNDDPVVIDSLESGTEDVPLVFDVSDLISDIDSNNTFIDSFEQP
ENGILTLDGTTFTFTPHEDWHGDTRFNYVVADGEGGTAAGSVDMHLTAVNDDPTAQGHTF
ELKEDGSIRFSEADLLAGATDVDGDNLSVTAVSNPANGDLVNNGDGTWTFTPDDNWNGET
QFDYTLVDGQGGEVTETVTLDVDPQAEKVNVEFILNDQQTIYPDYSDEDTNYIVQSPDDF
GVTELISGEQMATQGIGNSDQISVGYQDENAASIQLESGWNSIKNIFAVSDEAADVSISD
FVRTDVQLGDGGDSTVNIEGAKRGDITTGDGSDTINISAETNGAGWDNTFNIVSAEGADF
INLSGDQDITVFNVNAGSGDDVIQLGNGYANSTIHAGYGDDTVRGGTGEDAIFGGAGDDD
LRGGAGNDPLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGNDALRGGQGEDSLRGGAGDDDLRGGAG
EDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRG
GQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGDDDLRGGAGEDVLRGGQGDDV
LDGGEGVDTVYAGQGNDAATFVVGQSEGIDQYYGGSGEDTLRIELSAEQLENSDIITDLH
GLNDFITDHADESSHNGPAETFEHLGVQVGDFEKLDIIVDGQPMSIDDIPVVNQWRNDDF
SQESSGRYTHYQVGDPEHSPEGGDALETHRGSDSTRDHEGEWHINADHHRGLEGEEGARD
VLTGSDSNDAYTLDWGGREEVASVEEFNTGAGDDIVDLASYRYEYGDTVMNLGEGSDVGW
GNIGEDQIFGGAGNDWLAGNSGNDLLKGGLGDDRLEGNAGDDEIHVGQGDDIAMGHSGSD
LFVFNLDEGNLGQNWVSGGEGEDSLQLSGSGGQNWVLHVENGGDGEVIHGTTGEAGQYGA
EGGLSFSGSITFEDGQSKVQFSDIEKIEWF
NT seq
3873 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatgagaagaatatacagtctcaaaaagatgcagataatgctgtttctgatgag
ttgattgaaacagcacaacgtgactcaggggaaaactctatcgaggacgccttagaacaa
gtgcttgccgatacaacggcaaacagctctgaggactctcaatttggtagttatcaaacc
ggctatcgtggtgaaggtctagaggagcctgaagatacaggtggtggaccagaacgtagc
gataccaacctagagtctgctaatcaaggcggagagtttggtaataatgctgcgcctttg
gaagaaataaatgttagttttcagtctgggttggatggtgtagaaactgagtttgatgtt
ggtgctggtgatggtgcatctcttaaccctattttgggtatcaccccagatattaataat
aatgctgcagttcaatctggtggtgctgcaaaccgtggaggtgtgactgaagaagagagt
gtcgctgaggaagcagaagaagtggttgtagaggctgcgactagtcctactgatgatgca
gaagcggcagaaagtgagattcctttgcctgatgatgattctgacttatcgctatctgct
gagcctgccgcggatgatgacactgtaacggttaatggcgatagtgatgagcctgtcatt
aataataacccgcgtgctattgatgataatttaaccttatcagaagaccttgcctttact
tttaatgcagctgatattttagtgaatgatagtgatgccgatggcgatgctctcgcctta
acgggtattagtcagtcccctgagcatggcgaattaattgacaatggggatggtagctgg
acctttacgcccgctgaaaattataacggtcaagatagctttatttataccgtatctgat
ggccaaggcggttttgctacggcgacggttgctttaaccatcgatccggtcaatgatgat
ccggttgttattgatagcctggagtctggcactgaagatgtgccgctagtttttgatgtg
agtgacttaatctctgatattgatagcaataatacatttattgatagctttgagcagccc
gaaaacggaatattaacgctagatggcacaacctttacgtttactccgcatgaagactgg
catggcgatactcgttttaattatgttgttgctgatggtgagggcggtacggctgctggg
tctgtggatatgcatctaacagcagtgaacgatgatccaacagcgcaagggcacaccttt
gaattaaaagaagatggttcgattcgctttagtgaagcagatttattggccggtgctaca
gatgtcgatggtgataatttgagcgtaaccgctgtgagtaatcctgcaaatggtgattta
gttaacaatggtgatggcacctggacctttacgcccgatgataactggaatggtgagact
cagtttgattatacgctggtagatggtcaagggggtgaagttacagaaactgtgacctta
gatgttgatccacaagctgaaaaagtcaacgtagagtttattttaaatgatcagcaaacg
atttatccagattatagtgatgaggatactaattacatcgtccaatcaccggatgacttt
ggtgtaacggaattgattagtggtgagcagatggctacacagggaattggcaatagcgac
caaatcagtgtgggctaccaggatgaaaatgcagcctctattcaacttgaaagtggttgg
aatagcattaaaaatattttcgcggtgagtgatgaagcagcggatgtcagtatttcagac
tttgttcgtactgatgtacaacttggcgatggcggtgatagtacggttaatattgagggc
gcaaaacgcggcgatattaccaccggtgatggtagcgatacgattaatattagcgcagaa
accaatggtgcaggttgggataatacatttaatattgtcagtgctgagggtgcggatttc
attaatcttagcggtgatcaagacattaccgtttttaatgtcaacgcaggtagtggtgat
gatgtaattcagttgggtaatggttatgcaaactcaacaattcatgccggttatggtgat
gatacggttcgtggtggaacaggtgaagatgcgatttttggtggcgccggtgatgatgat
ttgcgcggcggtgcaggcaatgatcccttgagaggtggtcagggcgaagatagtttacgt
ggcggtgctggtaatgatgatttacgcggtggtgcgggcaatgatgccttgagaggtggt
cagggagaagatagtttacgtggcggtgccggtgatgatgatttacgcggtggtgcgggt
gaagatgttctaagaggtggtcagggagaagatagtttacgtggcggtgctggtaatgat
gatttacgcggtggtgcgggtgaagatgttctaagaggtggtcagggagaagatagttta
cgtggcggtgctggtaatgatgatttacgcggtggtgcgggtgaagatgttctaagaggt
ggtcagggagaagatagtttacgtggcggtgctggtaatgatgatttacgcggtggcgcg
ggtgaagatgttctaagaggtggtcagggcgaggatagcttacgtggcggtgccggtgat
gatgatttgcgcggtggtgcgggtgaagatgttctaagaggtggtcaaggcgatgatgtc
cttgatgggggtgaaggtgttgatacggtttatgctggtcaaggaaatgatgccgcaacc
tttgttgttggacagtctgaggggattgatcagtactatggcggtagtggtgaagatact
ctgcgtattgagttaagtgctgagcagctagaaaatagtgatattattactgatcttcat
ggtttaaatgactttatcacagatcatgctgatgagagtagccataatggccctgctgaa
acttttgaacacctaggcgttcaagtgggtgattttgaaaagctggatattattgtcgat
ggtcagccaatgagtattgatgatattccagttgtaaaccagtggaggaatgatgatttt
tcccaggaaagctcaggtcgttacacccattatcaagttggtgatccagagcatagtcct
gaaggtggcgatgcactggaaactcaccgtgggtctgattcaacacgcgatcatgagggt
gagtggcatattaatgcggatcatcatcgcggtcttgaaggcgaagagggcgcgcgtgat
gtattaaccggttctgatagtaatgatgcttataccttggattggggtggacgtgaagag
gttgcatcggttgaagagtttaataccggagcgggtgacgatatcgttgatttagcgagt
tatcgttatgaatatggcgatacggtgatgaatctgggtgaggggtcggatgtaggctgg
ggaaatatcggcgaggatcagatctttggtggagccggtaatgactggcttgcgggtaat
tcaggtaatgatttactaaaaggcggtttaggggatgatcgtttagagggtaatgctggg
gatgatgaaatacatgttggccagggtgatgatattgccatgggccatagtgggagtgac
ctgtttgtttttaacttagatgaagggaatttaggtcagaactgggtttctggtggtgag
ggtgaagatagcttgcaattatccggttctggtggtcaaaattgggtgctgcatgttgag
aatggtggtgatggtgaagtgattcatgggacgaccggggaggctgggcaatatggtgct
gaaggtggattatcgttctcaggtagtattacttttgaagatggtcagtctaaagtgcag
tttagtgatattgaaaaaattgagtggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
