Piscirickettsia salmonis: PSLF89_2454
Help
Entry
PSLF89_2454 CDS
T03982
Symbol
fadE
Name
(GenBank) acyl-CoA dehydrogenase
KO
K06445
acyl-CoA dehydrogenase [EC:1.3.99.-]
Organism
psal
Piscirickettsia salmonis
Pathway
psal00071
Fatty acid degradation
psal01100
Metabolic pathways
psal01212
Fatty acid metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psal00001
]
09100 Metabolism
09103 Lipid metabolism
00071 Fatty acid degradation
PSLF89_2454 (fadE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACDH_C
Acyl-CoA_dh_N
Acyl-CoA_dh_1
Acyl-CoA_dh_M
Coatomer_E
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP74131
LinkDB
All DBs
Position
complement(1867085..1869487)
Genome browser
AA seq
800 aa
AA seq
DB search
MTFIVGFFNPRMIVWSITGVILLVIWSYLGTSSVLIKTFIWVVFLAIAVIYTFRPIRRRF
ISSVILKIFKKSLPTVSQTEEEALNAGDSWFEADIFRGQPNWQKLQALTISKMSTEEQAF
FDNETEQLCQMIDDWQATHEDKDLSPKVWQFMKDQGFFGLVIDKKYGGKGFSAYAHSSIV
MKVASKSSSAGVTVMVPNSLGPGELLYHYGTDEQKNKFLPELAQGRQIPCFALTAPEAGS
DAASIPDKGIVCMGHYQGEETLGIRLTFNKRYITLAPVATLVGLAFHLYDPERLLDGEEA
IGITCALMPHDHPGVNIGNRGIPLDMCFMNGTVRGEDVFIPIDWIIGGRARAGQGWKMLV
ECLSIGRSISLPACATATGALSFVMTGAYALVREQFNTSIGHFEGVEEALARIGGLTYLL
DACRRLTVTAVDQGIKPSVASAIAKYHMTEMSRQVINDAMDIHGGRGILLGPRNYLGRAY
QSVPIGITVEGANILTRNLILFGQGAMCAHPYLRKEFYAARDGKLAEFDQALFSHGGYLF
KNFCRSLWHGLTAGKLIAVPESRLAGYYQQISRMSATFALTADVALLYLGGSLKRKERLS
ARLGDVMSYLYMASSALKRYADEGEPQQECIYVEWAVQHCLYQVQVAFDEFYQNFPQRFL
ASVLRRLTFFWGKPYKMPQDHLDHKVAQDMLKNTEVRRRFAALVYVPEQMPDDAVGRVEC
AFQLRLEAAAILVKVKQAVKAGEIAKGALKGQIEQLSQRGALSAQELELLKRYEHARWEV
IQVDEFSKESLQNNKTRPIA
NT seq
2403 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttttattgtcggtttttttaacccgcggatgattgtttggtcgattactggagtc
atattattggtaatttggagttatttgggtacaagtagcgtattaattaaaacctttatc
tgggtagtttttttggcgattgccgtgatttatacattcagacccatacgccgtcgtttt
attagctcagtaattttaaaaatatttaaaaagagcttgccgacggtgtcacaaacggaa
gaagaagcacttaatgctggagatagttggttcgaagctgatatttttcgtggtcagcct
aattggcaaaagcttcaggcgttaacgatttcaaaaatgagcacagaggaacaggctttt
tttgataatgagactgagcagttatgtcagatgattgatgattggcaagcaacgcatgaa
gataaagatttatcaccaaaagtctggcaatttatgaaagaccagggtttttttggtttg
gtgattgataaaaaatatggaggtaaaggcttttctgcttatgcccattctagtattgtg
atgaaagttgcttcaaaaagctcaagtgctggggtgacggtgatggtgccgaattcattg
ggtccaggagagttactctatcactatggtacggatgagcaaaaaaataagtttttgcct
gagttggcacaaggtcgacaaattccctgttttgccctaacggcgcctgaggcgggtagt
gacgcagcttcaattccagataaagggattgtttgtatgggtcattatcagggtgaggaa
acactaggtatccgcttaacttttaataaacgctatattacgttagcaccggtagcgaca
ttggttggtttggcgtttcatctttatgaccctgagcgtttattagatggggaggaagcg
attgggattacttgtgctttaatgccacatgatcatccgggtgttaacataggcaatcgt
ggtattccattggatatgtgctttatgaatggcactgtacgtggtgaagatgtttttatt
cctattgactggattatcggtgggcgagcacgtgctggtcaaggttggaagatgttggtg
gagtgtttatcgattggccgctctatttcattgccggcctgtgcgacagcaacgggtgca
ttaagctttgtgatgacaggtgcatatgcattagtgcgtgagcaatttaatacatcaatt
ggtcattttgaaggggttgaagaggctttagcacgtatcggtggcttgacttatctgctt
gatgcgtgtcgacgtttaacggttacggcagttgatcaaggcatcaagccgtcggttgct
tctgcgattgctaaatatcatatgaccgagatgagtcgacaggtaattaatgatgcgatg
gatattcatggtgggcgtggcattttgcttggtccacgtaactacttaggtcgtgcttat
caaagtgtaccgattggcatcacggtggaaggtgcgaatatattaacgcgtaatcttatt
ttatttgggcaaggagcgatgtgtgcacacccctatttacgtaaagaattttatgcggca
cgtgatggtaaattagccgagtttgatcaggcgttattctctcatggtggttatttattt
aaaaatttctgccgcagtctttggcacgggttgactgcaggtaagttgattgcagtaccg
gaaagtcgtttagctggttattatcagcaaattagccgtatgagtgcaacatttgcattg
actgcggatgtggcattgctttacttaggcggctcattaaagcgaaaagagcgtctttct
gctcgtttgggcgatgtgatgagctatttgtacatggcttcaagtgcattaaaacgttat
gctgatgaaggcgagccacaacaagaatgtatctatgtagagtgggctgtgcagcattgt
ttatatcaggtgcaagttgcctttgatgaattttatcaaaactttccccagcgtttttta
gccagcgtgctacgacgtttgacattcttttggggtaagccttataaaatgccgcaagat
catcttgatcataaagtcgcacaagacatgttaaaaaatacggaagtgcgtcgccgtttt
gctgcattagtttatgttcctgaacagatgccagatgatgcagttggccgtgttgaatgt
gcatttcagttgcgcttagaagctgcggctattttagttaaagtcaaacaagcggttaag
gcaggagaaattgctaaaggggctttaaaggggcagattgagcagttgagtcagcgcggt
gcgttatcagcacaagaattagagttactaaaacgttatgagcacgcacgctgggaagtg
attcaagttgatgagtttagcaaggagtcactgcaaaataataaaacaagacccatagct
tga
DBGET
integrated database retrieval system
