Piscirickettsia salmonis: PSLF89_876
Help
Entry
PSLF89_876 CDS
T03982
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09859
uncharacterized protein
Organism
psal
Piscirickettsia salmonis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psal00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
PSLF89_876
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_1
TPR_11
TPR_8
TPR_12
TPR_7
TPR_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKP72942
LinkDB
All DBs
Position
391112..392518
Genome browser
AA seq
468 aa
AA seq
DB search
MVKPFQLFAVIIVTLGLSGCATTSVFKPYPSTAKTVKNALVRQHYQVAEKYLLPDTTSED
GLLYLLELGRTQQLAGQYQQSLKTYQKAIEIIDKNQQKPIVQLSKLSVTGLSLLTNDNAI
PFTTSGYEQVMVHHYQALNYFVLGNLTGALVEVRRADEVQRQALERHQQELDEANNVAAK
QHYDDSQIWANKKFNAFNAVAGKVQNSFQNAYTFYFSGLLYEISGSLNDAYIDYKKALKL
VPSNPYVQADVLRLAKQLNMTNDLAGYRNYLTHKVITAAANQGTLVVLFEAGFVPAKQQF
RLPLPTGAGLIAIAIPYYNTPWQSPHSLEITQKNNEVIGKTSALVSMQALAAKALQERMP
WIIAREIARSIAKAAMTYQLQKEGSGIAALISSVYNVVSAQADLRSWLTLPDQAQVLQKV
LSTGRQELTLNYQGLVRKVAVNIKPRQMVVVWVVALGHSLNVHVLSKS
NT seq
1407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaaccgtttcagttgtttgcggttattattgttacgttgggcttatcaggttgt
gcgaccaccagtgtgtttaagccatatccaagtacggcaaaaacagttaaaaacgcactg
gtgcggcaacattaccaggtggctgaaaaatatttgctgccagataccacgagtgaagat
ggcttgctttatttattagaactgggccgtacccagcagctagccggtcaatatcaacag
agtttaaaaacctatcaaaaagctattgagatcattgataaaaaccagcaaaagcccata
gttcagctttctaagcttagtgtgacagggctttcgttgttaacgaatgataatgcgatc
ccatttacaacatcgggctatgaacaagtgatggtgcaccattatcaagcgttaaattat
tttgtcttgggcaatttaactggggcattggtcgaagtgcggcgcgctgatgaagtacag
cgtcaagcgttagagcgtcatcaacaggagcttgatgaggcgaacaatgtggcggctaag
caacactatgatgatagtcaaatctgggctaataagaaatttaatgcttttaatgcggtt
gctggcaaagtgcaaaattcttttcaaaatgcctatacgttttatttttcaggtttattg
tatgaaatttcgggttctttaaatgatgcatatattgactataaaaaggcattaaaatta
gtaccaagtaatccgtatgtgcaagctgatgtactgcgtttggctaagcagctgaacatg
acgaatgatttagctggttatcgtaattatttaacgcataaagttattacagcagcggcg
aatcagggtactttggttgttttatttgaagccggttttgtaccggcaaagcagcaattt
agattaccgttaccgactggcgctggattaattgcgattgcgattccttattataatacg
ccatggcaaagcccgcattcgttagaaattactcaaaaaaataatgaggtcattggcaag
acatccgcgctggtgtctatgcaggcgcttgcggccaaagcgttgcaagaaagaatgcca
tggattattgctagagaaattgctcgatcaattgctaaggccgcaatgacgtatcagcta
caaaaagaggggagtggcattgcggcattaattagtagtgtatataacgttgtttcagca
caagcagatttacgcagttggctgaccttgccagatcaagcgcaagtattacaaaaggta
ttgtctacaggtaggcaagaattaacgttaaattatcagggactggttagaaaagtagcc
gtgaatatcaaacctcggcagatggttgttgtctgggtggtggctttggggcattctcta
aatgttcatgtattatcaaaatcttga
DBGET
integrated database retrieval system