Lathyrus oleraceus (garden pea): 127084486
Help
Entry
127084486 CDS
T08598
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
psat
Lathyrus oleraceus (garden pea)
Pathway
psat03015
mRNA surveillance pathway
psat03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psat00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
127084486
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
127084486
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
psat03041
]
127084486
Spliceosome [BR:
psat03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
127084486
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127084486
NCBI-ProteinID:
XP_050880902
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(338529420..338532352)
Genome browser
AA seq
488 aa
AA seq
DB search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NT seq
1467 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagggtacggtcatgatggcggaggtggttctgcgccatcttcctatggagct
agtggtggatacggttcaaccggtggttacggaggtggcgcaggtggaaattatggagga
ggcagcgctggtggttatggcgggaatgaaagcggcggtggttacggagggaaaggtagc
ggaaacggtggtggcgccggatatggaggtggcgatggtggaggtggaggttatggcgga
aggagtggatacggtggaaccgatggagggggatatggtggaagaggcggcggtggcagt
aggggaagtggtggatatggaggtcgaggtggtggtggtggatttcaaggcggagatcgc
ggtggtagaggtggtggtggccgtggtggccgcggtggaggtggaagtggcagagatgga
gattggcgttgccctaatgaaagttgtgggaacgtgaactttgccagaagaaatgagtgt
aacaagtgtggcactccatgtcctaccagcggtaatgaccgcagtggcggtggtagtggt
ggtggatataatagaggaggaagtggcgggggatatggcagtaaccaaggcggtagatct
gggaactacgatggaggtagaactaatgactataacggtggaaggagtaataacaatgat
ggccgtggtggagggagcaataggggtggctcatatggtggtggtaatcaaggcagagac
gatgggggctatggtcaagctcctcctcctgctgctgctcagtcttatggtggtggtgga
aactaccctcctacttatggtgggaatgcaaattatggaacagatgctgttcctccaccc
acaagctatactggtggacctaattcatatcctccttcatatggagggaacactggtggt
tatggtggagataatcaaggtgatgcacggagtggtggtagggctgcacctccagctggg
cacgacagtggtaatcgtggtggatttggtggagctccttctgagtcagcagctccagtg
aagcagtgcgataagaattgtggagatacatgtgacaactctagaatctacatctcaaac
ttaccacccgatgtgactgttgatgaattgcaacaactttttggaggcattggacaagtt
ggaagaattaagcagaagaggggttataaagatcaatggccttacaacataaagatttat
accgatgagaatggaaaaaacaagggtgatgcatgccttgcttatgaagatccctttgca
gctcactctgctggcggtttttacaacgactatgatttgaggggttacaaaatcagtgtt
gcaatggcagagaaatctgcaccaagggctccacaagcaaataaccatgggggcaatagg
ggtggctatggtggagataggcgcagagacaattcaggccctgatcgacgggatcattat
agtgggaatcggtcacgcccatactag
DBGET
integrated database retrieval system
