Pseudoalteromonas sp. CF6-2: L3Q70_00635
Help
Entry
L3Q70_00635 CDS
T11185
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
pscf Pseudoalteromonas sp. CF6-2
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
TPR_1
HATPase_c
Response_reg
TPR_2
TPR_8
HisKA
TPR_MalT
TPR_10
TPR_7
TPR_16
SNAP
TPR_NPHP3
Hpt
CFAP70_TPR_C
DUF6340
RPN7
SHNi-TPR
ARM_TT21_4th
DUF3856
HATPase_c_2
OKR_DC_1_N
HATPase_c_3
LysM_OapA
EMP24_GP25L
TPR_COPA_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJX25700
LinkDB
All DBs
Position
121112..123949
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MLIKLRSGLINLTFFCWGLFLFTDIAHAHPSLLERFNQSQQWDEKLQLGKKLLASSVLSS
QKQHEIHMQLGDLALEQGNFTAAVEHYQLAEKSTTLESDPEGYFLAMKMQGVTYYYQGLM
QQAVATYLRALKVAENMKDPISKANLLSNIGLAYFNMFNMHQALDYYKQAKTLFEQYGTA
QDKADILHNIAGIYIRLSSYSTALDMYRETLEIYQELGDKDGVAQSYGNMGVAYSELGQY
QLSLHYYQRALRYYQSTNNAYYLSSRHGNIANVYLRTGDLELAISHAEKAVEFAQQIDNK
SLELAGLFSLAKIELLQGKLAKAEQTLNASTKMAEEFKDELRVLDGLGMRALIKAGQGDY
KASVALFDQFVRDTNTAKNEKLLKSLGELQSQIQASQLNQEILDLKQQQSVQELEMSKQR
QLAIMLFILFIMLVVTGVTVYRRSIEKRAKEQLSLMVAKRTKELEKTADQLRKANEIKSQ
FLANISHEIRTPLTAILGQTDNLMNGLYKPESLNDELRVIHKQSEHLKELINDVLDISKI
EANKLELNLKEGDLVKLSTDVHAMLSGQAIDKNLQFTFHNELGEQFYSYLDFTRIKQILI
NLCANAIKFTHQGEVRLYASLSQHGVWFRVTDTGIGMNEEQLKLIFECFSQADNSISRRF
GGTGLGLSLSQQLAMMMGGYISVESEVNKGSEFSFYLPCKEHIPAMDKIEHDVSNLQASS
GLSGKVLLAEDHVDNRRLIHRYLESMGLEVIAVENGEQAVEQCLQAFPDVVLLDIQMPVL
DGLSALKLLRDCGFTQPVYALTANAISHEVEAYLKAGFTGYLAKPIDKKVFYTQLAKHCK
NAINIKDEQQDMSDLVASFIGSFDYEASQVQLHFSEQDLFNLQQDAHRIGGAAKMFALDE
VANSAMALELALKHNQLIELPSLVAQLLDQLHSASETQNSSMSPS
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttataaaattgcgcagcggcttaattaacttgacgtttttttgctggggcttattt
ttatttaccgatattgcgcatgcccacccttcattattggagcgttttaatcaatctcag
caatgggatgaaaagttgcagttaggaaaaaaactgctggcttcttctgtgttaagttca
caaaaacagcatgaaattcatatgcaactaggcgatttggcactcgagcagggcaatttt
actgctgccgttgagcattaccagttggctgagaaaagtacgactttggaatcggatcct
gaggggtattttttagcaatgaaaatgcaaggtgtcacctattattaccaaggtctaatg
caacaagccgtcgcgacgtacctacgtgctttgaaagtcgcggaaaatatgaaagatcct
atttctaaagcaaatttgctcagtaatattggccttgcttattttaatatgttcaatatg
catcaagcactggattactataaacaagctaaaacattgtttgagcaatacggcactgct
caagataaagctgatattttgcataatatcgcaggcatttatattcgtttatcgagttat
agtacagcacttgatatgtatcgagagacgcttgagatctatcaagagctaggtgataaa
gatggagtggcacagtcttatggcaatatgggagtcgcttattctgagttagggcaatat
cagttgtcactacattattatcagcgagctttacgctattaccaatcaacaaataatgcc
tattacttatcatcgcgacatggcaatatcgccaatgtttacttgcgcacaggcgatctt
gaacttgctattagtcatgccgagaaagcggtagagtttgcccagcagatagataataag
tccttggagttagcgggcctattttcgcttgcgaaaatagagttactgcaagggaagtta
gcaaaggcagagcaaacccttaatgcctccacaaaaatggcagaagaatttaaggatgaa
ttacgcgttcttgacggtttgggcatgcgtgcattaattaaagcagggcaaggggattat
aaagcgtcggtggccttgtttgaccaatttgtgcgcgacacgaataccgctaaaaatgag
aagttgctgaaatccttgggtgaactacaaagtcaaatacaagcaagccaactaaaccaa
gagatccttgatttaaaacaacagcaaagtgtgcaagagctagaaatgtctaagcaacga
cagttggctattatgttatttattctatttataatgttggtggtgacaggggtcactgtt
tatcgacgtagcatagaaaaaagagcaaaagagcagctgtctctgatggttgctaagcgc
actaaagagttagaaaaaacagcggatcaactacgcaaagctaatgaaataaaaagccag
tttttagcgaatataagtcatgaaatacgtaccccgctgacagccattttaggtcagacc
gataacttgatgaatggcctttataaacccgaatctctcaatgacgaattgcgtgtcatt
cacaagcaaagtgagcacttaaaagagcttattaatgacgtacttgatattagtaaaatc
gaagctaataaactggaattaaacttaaaagaaggtgatctcgttaaattatcaacggat
gttcatgccatgctaagtgggcaagccatagataaaaacttgcagttcacatttcataat
gagttaggtgagcaattttatagttatttagactttactcggatcaaacaaattttgatc
aatctatgtgctaatgctatcaagtttactcatcagggagaggtgaggttatatgcttcc
ttatcccagcatggggtatggtttcgagtaacagatactggcattggtatgaatgaagag
cagcttaagttgatcttcgaatgttttagtcaggctgataatagtataagccgacgtttt
ggcggaacgggattaggactgagcttatcgcagcagctagcgatgatgatgggtggttat
ataagtgttgagagtgaagtaaacaaaggcagcgagttttcattttacttaccctgcaaa
gagcatattccagctatggataaaatagagcatgatgtaagcaatctgcaagcatcttcg
ggacttagcggtaaggtactcctagcggaagatcatgttgataatcgtagattaattcac
cgttatttagagtcgatgggattagaagtcattgctgtagaaaacggtgagcaagccgtt
gaacagtgtctgcaagcttttcctgacgttgttttacttgatattcaaatgccggtgctc
gatgggttaagtgcgcttaaattgttacgtgattgtggttttactcaacctgtttatgcg
ttaacagcgaatgctattagccatgaagttgaagcctatttaaaagcaggctttacaggc
tatttagccaagccgatagacaaaaaagtgttttacactcagcttgcgaaacactgtaaa
aatgccattaatataaaggacgagcaacaggatatgagcgatttggttgcaagctttatt
ggtagttttgactatgaagcttcacaagttcagttgcatttctcagagcaagatttattt
aatctacaacaagatgcgcaccgaattggaggggctgcaaaaatgtttgccctcgatgaa
gttgccaacagcgcgatggcacttgaattggcacttaagcataatcaacttatagagctg
ccaagtttagtcgctcaattacttgatcagctgcacagtgcatcagagactcaaaatagc
tcaatgtcaccctcctga
DBGET
integrated database retrieval system