Pseudoalteromonas sp. CF6-2: L3Q70_19410
Help
Entry
L3Q70_19410 CDS
T11185
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pscf Pseudoalteromonas sp. CF6-2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pscf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pscf02000
]
L3Q70_19410
Transporters [BR:
pscf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
L3Q70_19410
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
OMP_b-brl_3
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJX27419
LinkDB
All DBs
Position
unnamed:610733..613354
Genome browser
AA seq
873 aa
AA seq
DB search
MALITLNFINIFTYIGFILLVFSSTYSVAQTSDKEKNALETIQIRGFHDSAVKSLHNKRN
SQSIIDTISAQDIGKFPDKNVAEALQRVTGISLSRIQGEGERVGVRGTTPEQNRTYLNGQ
SIASADWWISSQPNRGFNYTLLPADLVASLEVYKTPQADHDEGSLGGAVNIKTMRPLTTP
NKHFVINTQLQYNDLSGEFDPQLASFYNWKNSTQSTGLLLTFSRNERSLRRDGLESWGWH
EQNYTLNDDNSLSPVDRLADINRVWTPGGGGSALFKQRRILTTATFAFEHQLNFDWNIQL
NGLYSVLDADNSNQNFLWQPSSVFARGGRIHDAEIINNTLAFARYSKVTDINRPYSTAME
AIWRKSQIDTSSIQLVASQQADLWHNTYQLGFTHGGGGSKQDYTSQFSANTAFSVDTRQQ
QNIIANYAISPLDAAQWQLTEARNDSQDSTDQELYIQTDFERAVDHSIISSIKFGVKYRD
HQRDFIRLRSINGSYDQLTEQLAWTLADFPAAIPHDFLTGIGNQHTLKNYSYVDINLLAK
QFNTLNFVQQEEKASRFDIQERTTAGYVKLNLNGDTYNANLGLRVVNTRQDSAAYARIAS
PIELPDSYQWQTHYKNYTDLLPSINLNIDITDDVISRFSVARVMSRPQYNHLMPSTNYNV
TQAQGQGGNPDLDPYRANQFDASLEWYFADAGLLSAALFNKDVESFIEFNRGVEVHENIA
MTIDRPINGSGGTIRGFELGYQQELFYGFGLIANYTFVDGERSKRNNASLNAIPGTSKHT
INLTSYYENERFSGRLAYNYRTDFATGVGETIMENFGQLDGNLTIKLNKQFDIIVDAINL
SNETTYTYERNQYAPTGIYKNGRRFYLGIRYSH
NT seq
2622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttaataacgctcaattttattaacatttttacctatattggttttattttactt
gtatttagttcaacgtacagcgttgctcaaacaagtgataaagaaaagaacgctttagaa
accattcaaattaggggttttcatgacagcgctgtcaagtcactccataataaacgaaat
agccaatcaattatagatactattagcgcacaagatatcggtaaatttcctgataaaaat
gtcgcagaggcactccaacgtgtgaccggtatttcattatcacgtattcaaggtgaaggt
gagcgagtgggtgttagaggaacaacgccagagcaaaaccgtacttatttaaatggtcaa
tcaattgcatcagccgattggtggatttcatcgcaacccaacagggggtttaactatacc
ttattgcccgctgatttagttgcctcactcgaagtctataaaacaccacaagcggaccat
gatgaaggctcattagggggagcggttaacataaaaaccatgcgccctctgacaacaccg
aataagcactttgtgataaatactcaactgcagtataacgacctatcaggtgagtttgat
ccacaactagcgagtttctataactggaaaaatagtacacagagtactggcttactactt
acttttagtcgcaatgagcgctcattacgtcgtgatggcctagagtcgtgggggtggcac
gaacaaaactacaccttgaatgatgataacagcctctcccctgtagacaggctagccgat
ataaatcgagtttggacgcctggcggtggtgggtcggcgctctttaagcaacgtcgaatt
cttaccactgcaacatttgcttttgagcaccaacttaattttgattggaatattcaacta
aatggcttgtattcagtgcttgatgccgacaatagtaaccagaactttttatggcaacca
agtagcgtttttgccagaggaggtcgtattcatgacgctgaaatcattaacaatacattg
gcttttgctcgttatagcaaagtcactgatataaatagaccttatagcactgcaatggaa
gctatttggcgaaaatcacaaatcgacacaagcagtatacagttggtcgcatcgcaacag
gctgatttgtggcataatacttatcaattaggctttactcatggcggtggaggctcaaag
caagactatacctctcaattctcagcgaatacggcgtttagtgtcgacacacggcaacaa
caaaatatcattgctaattatgccatttcaccccttgatgccgcacaatggcaactcacc
gaggccagaaacgacagtcaagattccactgatcaagagctttatatacaaactgacttt
gaacgtgccgttgatcattcaattatttcttctataaaatttggcgtaaaatatcgcgat
catcaacgtgactttattcgcttacgctcaattaatggctcatacgatcaactaacagag
caacttgcttggacacttgctgattttcctgctgctataccacatgattttttaaccggt
attggtaatcagcacactttaaaaaactatagctatgttgatatcaacttacttgcaaag
caatttaatacacttaattttgtacagcaggaagaaaaagccagtcgttttgatatacaa
gaaagaacgactgcgggctatgttaagctcaatttaaatggcgatacatacaacgcaaac
cttgggctacgagttgttaatactcgccaagatagcgctgcttatgctcgcatcgcatcg
cctattgagcttccggacagctaccaatggcaaacccactataaaaattacacagactta
ctgcccagtataaacctcaacattgatattaccgatgatgtgatttctcgctttagtgta
gccagagtcatgtctcgcccgcaatataatcacttaatgccttctaccaactacaatgtc
acccaagcacaaggccaaggcggtaaccctgatttagacccttacagagccaatcaattt
gatgcgagccttgaatggtactttgctgatgcagggttattgtctgctgctttatttaat
aaagatgttgagtcatttattgaatttaaccgtggtgttgaagtgcatgaaaacattgct
atgacaatagacagaccaatcaatggcagtggtggtacgattcgtggttttgaactcggt
tatcaacaagaactattttatggtttcgggttaattgcaaattatacctttgttgatggc
gaaagaagtaaacgtaataatgccagccttaacgccattcctggtacttcaaaacatact
ataaacttaactagctactacgaaaacgaacgctttagtggccgtttagcatataattat
cgcactgactttgcgactggcgtgggtgaaaccatcatggaaaacttcgggcagttggac
ggtaatttaaccataaaactaaacaaacaattcgatattattgttgatgcaataaacctt
agcaacgaaacaacctacacatatgaacgtaatcagtatgctcctacgggcatctataag
aatggccgacggttttatttaggtattcgttacagccactga
DBGET
integrated database retrieval system
