Prevotella scopos: J4856_00005
Help
Entry
J4856_00005 CDS
T08373
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pscj
Prevotella scopos
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TcdB_toxin_midN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QUB44421
LinkDB
All DBs
Position
1:126..4373
Genome browser
AA seq
1415 aa
AA seq
DB search
MLRSVTLPFGGHININYEQTTPSYDLPGRRWVMSSVETTGGYKENGAVRSRNTFEYSGGY
RDRRERDFYGFKQVRTNQIDTENGDRLYRYSVQTYGKNRDYYAHGLVTSEYLYTAEGKKL
QGAVYDYDLKTLAVGHNTTDAVVFPALKTLVQSNFDEASGDSLAVAVSNTYDDYGNLQGY
KETTTGYSLEANINYHKIADKYIVSIPSRITVSSGGKTYRERSTKVDGNGEITEIMLHNG
DKPSVYNMTYDGYGNITRMTKPENYNHQRMFYAYTYDDRYHSLVTSVKDAYGYSSSTAYD
GLWNAPSVTTDLNGQKMEYAYDALGRQMTIRAPYEIESGQPFTIRFEYFPAERKAHTIHY
SKEGNIDTYTFADSLMRAVQTKQTGVVWSGGSNQKVSIVSGRAVIDAFGRNIAAYYPMTE
SHGNIGTYNHATGDLQAKTEYDAHDRTMSVTLADGSVTRTAYSIGSHDGEPMLQTTVTDA
LGRHAESYTDAKGHNRETVQHARGEDITVKYSYDPVGQVMTVQHPNGRETKYAYDLLGRK
LMVNHPDAGETDMTYDAAGNLLTKLTAELRKSISDKGYISYTYDFERLHEVLYPENLFNR
VTYTYGKAGDKYNRAGRLALVEDASGGEAYYYGRQGEVTKTVRTVMASVADIRTYVYGAT
YDSWNRVQTMTYPDGEVVTYHYNAAGQVESLTSNKQGRQSVIVDRIGYDKEGHTVYTKLG
NGTETTYTYDKQRERLQVMNLTADGQTVMENRYRYDAVDNILGITNAANPTSLTKLNKAK
LGGKSSHTYEYDELNRLVHASGKAKRASYDMVMSFGRMSEPLTKVQKVDSTTTAKSYNFA
YKYEDNNHPTAPTQIGHDHYTYDANGNPVLVTNDSTNTTREMYWDEDNRLMVLSDNGKTS
RYTYNAAGERIMKSYGTMEGVYINGAPQGITFHETDNFTLYPASILSVNKNRFTKHYFIG
DKRIASRIGTGLFNNVYGRNGSYVTAGQQDYAERMNQIQTQKEAYYKKVGVAPGVPTEKG
AYGDPENTGVGYNSVLTELGNHDVPQGWIQTPRPNTTPNTNPGPPVSWNDPSNPDDPQAG
YGYIPNDTTCEETFFYHSDHLGSTSYITDDKANITQYDAYLPYGELLVDEHSSREDLPYK
FNGKQFDEETGLYYYGARYMNPVTSLWYGVDALTEKYPNVTGYCYTFNNPIKLLDPDGNS
PIGAAVEGISAFVVSAGVDFISNWIFEGMDYKTAFSHVRWGAAAFDGISTAAISLLVDGA
GTTKTIGKIANSKAGRFAIDVARTMITNIIGDIEKGKDFNKIDLTEEFISATFSTLLDKR
MEKRANELLSGLERSNKKLYTALNKLKRNQKAGKSETRLKSDASRVKIAKDRYRGDVRKY
AKAVTKKNLVVAGGDLVFEKVSERPDNKTSNNNNK
NT seq
4248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgcgctctgtgacacttcctttcggcggacatatcaatatcaactatgagcagaca
actccaagttacgatttgccgggacgtcgctgggtgatgtcatcggttgagacgacaggt
ggatacaaggagaacggagcagtacgaagcaggaataccttcgaatatagcggtggctat
cgtgaccgtcgtgagcgtgacttctatggtttcaaacaggtacgtactaatcagatagac
actgagaacggtgatagactctatcgttactccgtacagacctatggtaagaacagggat
tactatgcacatggacttgttacgagtgaatatctctatacggctgagggaaagaaactg
cagggcgctgtctatgactacgacctgaagacactcgctgttggccataatacgacagat
gctgttgtcttccctgctctaaaaacactcgttcagagtaactttgatgaagccagtggg
gacagtctggcggttgctgtcagcaatacttacgatgactatggtaacctacagggatat
aaggagacgacaacgggctatagcttagaggcaaacatcaactatcataagatagccgac
aagtatatcgtcagtatcccgagccgcatcactgtcagcagtggtggtaagacgtaccgt
gaacgctcaacgaaggtggacggaaacggtgagataacggagatcatgctccataatggt
gacaagccatcagtctataacatgacttacgatggctatggtaacatcacacgcatgacg
aagccggagaactataaccatcagcgtatgttctatgcttatacgtatgatgaccgctat
cacagtcttgtgacaagtgtcaaggatgcatacggctatagctccagtacggcttatgat
ggtctatggaatgctccgtctgtaacgaccgacctcaacgggcagaagatggaatacgcc
tacgatgcactgggcagacagatgactatccgtgctccgtatgagatagagagtggtcag
ccgtttactatccgctttgagtacttccctgcagagcgtaaggcacataccatccattat
tctaaggaaggcaacatagatacctacacctttgccgactcgctgatgcgtgccgtccag
acgaagcagacaggtgtggtgtggtctggtggcagcaatcaaaaggtctccatcgtcagt
gggagggctgttatcgatgcctttggacgtaatattgcggcttattatccaatgacggag
agccatggtaatattggtacttacaaccatgctacaggtgatctgcaggcaaagacagag
tatgatgcgcacgaccgtaccatgagtgttacgcttgctgacggcagtgtgacacgcaca
gcctacagtatcggtagtcatgacggtgaaccgatgcttcagacaacggtcacggatgca
ctgggacgacatgcggagagttatacggatgccaagggacacaaccgtgaaacggtgcag
catgctcgtggtgaggatatcacggtgaagtacagctatgaccctgtcggacaggtaatg
acggttcagcatcctaacggtagggagacgaagtatgcctacgacttgcttggtcggaaa
ctgatggtgaatcatcctgatgcaggtgagacggatatgacttacgatgcggcgggtaac
ctcctgacgaagctcacggcagagcttaggaagtcgatatctgacaagggctatatctct
tacacctacgacttcgaacggctgcatgaggtgctttatcctgaaaatctctttaatcgt
gttacttatacctatggtaaggctggggataagtacaaccgtgccggtcgtcttgccctc
gttgaggatgcttcgggtggtgaagcctattactacggcagacagggtgaggtgacaaag
accgtccgtacggtcatggcaagtgtggcggatatcaggacttatgtctatggtgccacc
tatgatagctggaaccgtgtgcagacgatgacttatcctgatggtgaagtggttacttac
cattacaatgctgccggacaggtggagagtctgacgagcaataaacagggacgtcagagc
gttattgttgataggataggttacgataaggagggtcatacggtctatacgaagctcggt
aatggcacggagactacctatacatatgacaagcagcgtgaacgtctgcaggtgatgaac
cttacagcggacggtcagactgtgatggagaacaggtaccgctatgatgctgtggataat
atcctcggtatcacaaatgctgccaacccaacgtcgctgacgaaactcaacaaggcgaag
ctgggaggaaagagttcgcatacgtatgaatatgatgaactgaatcgccttgttcatgca
agcggtaaggctaagcgtgcatcgtatgatatggtgatgtcgttcggacggatgagtgaa
ccgctgactaaggtgcagaaggtggactcaacgacgactgctaagtcttataactttgct
tataagtacgaggacaataaccacccgacagctccaacacagattggtcacgatcattac
acgtatgatgccaacggtaatcctgtgttggtgacaaatgactcaacgaacactacccgt
gagatgtattgggatgaagacaaccgcctgatggtcttaagcgataatggcaagacgagt
cgttatacttacaacgctgccggcgaacgtattatgaagagttacggtacgatggagggt
gtgtatatcaacggtgcaccgcagggtatcacattccacgagacggacaactttacgctc
taccctgcaagtatcctctctgtaaacaagaatcgctttacgaagcattacttcattggt
gacaaacgaattgcttcaagaataggaacaggtctgttcaacaacgtttatggacgtaat
ggctcatacgtaacggctggtcagcaggactatgctgaacgtatgaatcagattcagaca
cagaaggaggcttattataagaaggtgggcgtagctcctggtgtaccgacagagaagggt
gcgtatggtgatccggagaacacaggtgtaggttataattctgtcctcacagaacttggc
aaccatgatgtgccacagggttggattcagactccacgccccaacaccacaccgaatacc
aaccccggtccacctgtaagctggaacgacccaagcaaccctgatgacccgcaggctggt
tatggttatattccaaacgacacaacatgtgaggagaccttcttctatcacagtgaccac
ctcggcagcacgtcttacatcacagacgataaagccaacatcactcagtatgatgcttac
ctgccttatggtgagctgttagtggatgaacatagcagccgtgaagacctaccgtataag
ttcaacggcaaacagttcgatgaggaaactggcttgtactattacggtgcaaggtacatg
aatcctgtcacgagtttatggtatggggtagatgctttgacagaaaaatatcctaacgtt
actggatattgttatacttttaataatcctataaaacttcttgatcctgatggtaattca
ccaataggagctgcggtggaaggcattagtgcctttgttgtgtccgctggagtagatttt
atttccaactggatttttgaaggtatggattataaaacagcttttagccatgtccgttgg
ggagctgcagcttttgatggtatttctacggcagctatctccttgcttgttgatggtgca
gggacaacaaaaacaataggaaaaattgcaaatagtaaagcgggacgatttgcaatagat
gttgctcggactatgattaccaatatcattggtgacattgaaaaagggaaagactttaat
aaaatagatttaactgaagagtttatttctgctactttctcaacattattagacaaaaga
atggagaaaagagcaaatgagttgctcagtggattagaacgcagcaataaaaaattatat
actgcgcttaataagttgaaacgaaatcaaaaagcaggaaaatctgaaactcgactgaag
agtgatgcgtctagggtaaaaattgcgaaagatagatatagaggagatgttcgtaaatat
gcaaaagcggttactaaaaagaatcttgttgtagcaggaggtgatttggtatttgaaaaa
gtatctgaaagaccagataataaaacgtctaataataataataaataa
DBGET
integrated database retrieval system