Prevotella scopos: J4856_05875
Help
Entry
J4856_05875 CDS
T08373
Name
(GenBank) fimbrillin family protein
Organism
pscj
Prevotella scopos
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QUB45685
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(111540..114347)
Genome browser
AA seq
935 aa
AA seq
DB search
MKFNKIRKCNVGRKSTAALMFTCLSGLTVLGLTACSDNELDSTNIGQNGTAVKFQVTTAG
EQAQQAAKANPALAMTRAGFAEQLKMQGLTPEDLATRKIEIPGNSEYCLIESTVAGIDDD
FTNAGVAATRANITTTATLGKFSAIAYRGTSATSISTTPWFHNAEVNADGTLATTQLWSW
SEPYARFYAVYPQITTSYSKLTLSPASNTSTPYVNIEVEPTVQNQKDLMTACSGTTPIHY
ATQGTAPAVPLQFQHAMTAIRFKIGDRLSGTHKITKIEIVGAKSKGKFTLPSSVQATTGA
SFNSAWSDVSTPATFTLSGISVNTSGHVNETIVGKDGDNFTFYMIPQSLSGLKVKVYFDN
QPNPAIVAPLAGTWKAGTTKTYALSQSANNLKYTFEATPNPSEAANTEGATTSYQITSYV
DDDKQHRAVKWKVVSYDADGDGTFSMSEKPDWLTIPNEGRTTTQDVEQYTATFKANQRDV
LADFNYAMKHADPVTNYNLANAKGETAIENTANCYIISAPGTYRIPLVYGNAIKGGGTNS
SAYTSSKTKVMGTEEFVLQEFVDHNDHKITSPYINVQNAGDPATQAEIVWSDVAGVVSNA
SVTGSRQNSFLEFTVNKNQLVNGNAVIAVKNASGTVMWSWHLWFTPKSSLKKIPFTSGGT
TYNFMTDNLGWKYTKWTGGLKREVVVKIEQQAETGEKKTATITLKQAAGNNVREGYGNLY
QWGRKDPLPGTDTFYPNTGYKFNDGYVIVGDQVTDYTNPANVQRMEKRTIGLSIREPGIM
LPKVGGGKLSWTNHQYINLWSADNDKMYESETPIKNGVKTIYDPSPVGFKVPDAYAFKDL
SKGVAVWENGYTLKLDNDKDIYFPAGGYRDGNDGVIKGVNGYAMYWASAALIHGTGGPGF
AFRALMTSNRFSMPITDSNGFGTRSYGLGVRPVAE
NT seq
2808 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtttaataaaattcgcaagtgcaatgttggacgaaaatcaacagcggcactcatg
tttacatgtcttagcggactgacagtcttgggattaacagcctgctctgacaacgaactc
gactctacaaatattgggcagaatggtactgccgtaaaatttcaggtgacaactgcaggc
gagcaggctcagcaggcagcaaaggctaatccagccttggcaatgacccgtgcaggattc
gcagagcagctgaagatgcagggattgacacctgaggaccttgcaacacgcaagattgaa
attcctggcaacagcgagtattgcctcatagagagtactgttgcaggtattgacgatgac
tttactaatgctggtgtggctgctacacgtgctaatattaccacaacagctacacttggc
aagttctctgcaatcgcttatcgtggaacttctgcaacaagcatcagcaccactccttgg
ttccataacgctgaggtaaatgctgacggtacactcgcaacgactcaactttggtcatgg
agtgagccatacgcacgtttctacgctgtttatccacagataacaacatcttacagcaag
ttaacactttctccagcatctaacacttcaactccatacgtaaatattgaggttgaacca
actgtacaaaatcagaaagatttgatgactgcttgttctggtacaactcctattcactat
gcaacacagggtactgcgcctgcagtaccattgcagttccagcacgcaatgaccgctatc
cgtttcaagattggcgaccgcttgtcaggtactcataagattacaaagattgagattgtt
ggtgcaaagagcaagggtaagttcactttaccttcatcagtacaggctactactggtgca
tctttcaacagtgcatggtctgacgttagcactcctgctaccttcacactcagcggtatc
agcgtaaacacatctggtcatgtcaatgagactatcgttggtaaagatggcgacaacttc
actttctatatgattccacagagtttatcgggtctcaaggttaaggtatacttcgacaat
cagcctaatcctgctatcgtagcaccgctcgctggcacttggaaggctggtactacaaag
acatacgcattatcacagtcggctaataatctcaaatataccttcgaagctactcctaat
ccaagtgaagcagcaaacacagaaggtgcaactacatcatatcagattacatcatacgta
gacgatgacaagcagcatcgtgctgttaaatggaaggtagttagctatgacgctgatgga
gatggtaccttctctatgagtgagaagcctgattggttgactattcctaatgaaggcaga
actacaacgcaagatgttgaacaatatactgctaccttcaaagccaaccaacgtgatgtc
ttggctgacttcaactatgcaatgaagcatgcagaccctgttacaaactacaatcttgct
aatgctaaaggtgagactgcaatagaaaatacagcaaactgttacattatcagtgcacct
ggtacataccgtattccattggtttatggtaacgctattaagggaggtggtactaactct
tcagcatataccagttctaaaactaaagtaatgggtacagaagagttcgtattgcaggaa
ttcgttgatcataacgaccacaagattacttctccatatatcaacgtacagaacgctgga
gacccagcaacacaagctgaaattgtatggtcagatgtagctggtgttgtatccaatgca
tcagtaacaggtagcagacaaaactctttccttgagtttactgttaacaagaatcagttg
gttaatggtaatgctgtcatcgctgttaagaatgcatcaggtactgttatgtggtcatgg
cacttatggtttactcctaagagttctcttaagaagattccatttaccagtggcggcact
acatataactttatgactgataaccttggttggaaatacaccaaatggacaggcggactc
aagcgtgaagttgttgttaagatagaacaacaggctgaaacaggcgaaaagaagactgct
actattacgcttaagcaagctgcaggtaataatgttcgcgaaggatatggaaatctttat
cagtggggacgtaaggatccgctccctggaacggatactttctatcctaatacaggttac
aaattcaacgatggttatgttatagttggtgatcaggttacagattacactaaccctgca
aatgtacaaaggatggagaaacgtaccatcggacttagtattcgtgaaccgggtataatg
ctacctaaggtaggtggtggtaagttgagctggacaaatcatcaatacatcaacctttgg
tcggctgataacgataagatgtatgaatcagagacccctataaagaacggagtaaagact
atctatgacccatcaccagttggtttcaaagtaccagatgcgtatgcatttaaggactta
agcaaaggtgtagctgtatgggagaatggttatacgctcaaattagataatgacaaggat
atctacttcccagctggtggataccgtgatggtaatgatggagttattaaaggcgtaaat
ggttatgctatgtattgggcatccgctgctttaattcatggtacaggtggtcctggcttc
gctttccgtgctttaatgacaagcaatagatttagtatgccaattacagattctaatggt
tttggaacccgttcgtatggcctaggtgtacgcccagtagcagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system