KEGG   Prevotella scopos: J4856_06085
Entry
J4856_06085       CDS       T08373                                 
Name
(GenBank) RagB/SusD family nutrient uptake outer membrane protein
  KO
K21572  starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
pscj  Prevotella scopos
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pscj00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pscj02000]
    J4856_06085
Transporters [BR:pscj02000]
 Other transporters
  Accessory factors involved in transport [TC:8]
   J4856_06085
SSDB
Motif
Pfam: SusD_RagB SusD-like_3 SusD-like_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: QUB45725
LinkDB
Position
2:176076..177707
AA seq 543 aa
MNTKFKYIFSTAALLLSVGFTSCIGDLDVKPIDPNLNTKENTSPESAFNKCYAHIAMAGN
GGANGDSDVDGIDGGTSGYVRQLFNSQELTTDEAICAWGDEGISNMNFDSYDASHPMLKG
FYYRLYAGITYCNQYLADFGDYNATMSAEVRFIRALNYYYLLDGWGNVPFTTAISSAKPA
RIQRADLYKWLIDELKNEVEPNLNDASPKTSATTGYGRVDKAAAWMLLARLYMNAEVYTG
TADWTNAKLYAKKVIDSPYKLYTTKKGQWSAYQQLFMGDNGENGASVEAIFPILQDGLKT
TSYGTTLYLMAGSNDNSEHIKSATVAGNNTTGGWAGNRMRTDLVLKFFPNNDAPNVAAYA
MPAAADDDRALFDGEGRNVSNGDDEKGVKVFTNGFSVCKFNNFKTDGSAGHNSLFPDADF
FLMRAAEAYLMYAEADARQNNGTTTAQGTAYINALRTRANATTQTAYSLRQICDEWSREF
YFEGLRRTTLIRFGYFGGNVNYNWSWKGGVKNGRNFDSHLNLFPIPTSDMVANKANLIQN
PGY
NT seq 1632 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatactaaattcaaatatatattctctacagcagcacttttgctgtcagtagggttc
acctcttgtataggcgatttggatgtaaaaccaattgatccaaaccttaatacaaaggaa
aatacgtcgccagaaagcgcattcaataagtgctatgctcatattgctatggctggtaac
ggtggagctaatggtgatagcgatgttgatggtatcgatggtggaaccagtggttacgta
cgtcagctattcaattcacaggagttgaccactgatgaggctatctgcgcatggggtgat
gagggtatttctaacatgaacttcgatagttatgacgcttcacatccaatgttgaagggt
ttttactatcgtctttatgcgggtatcacctattgcaatcagtatcttgcagacttcggt
gactacaacgcaacgatgtcagcagaggttcgtttcatccgtgctttgaattattactat
ctcttggacggatggggtaatgttcctttcacaacagcaatatcttctgctaagccagct
cgcatccagcgtgcagacctttataagtggcttattgatgaattgaagaatgaggttgag
cctaatttgaacgatgcaagtcctaagacttcagccactactggttatggtcgtgtcgac
aaagctgctgcttggatgctcttggctcgtctttatatgaatgctgaggtttatacaggt
actgctgattggactaatgctaagttatatgcaaagaaggttatcgactctccttataag
ctctataccaccaagaagggtcagtggagtgcttatcagcaactctttatgggcgataat
ggtgagaatggtgcttctgttgaggctatcttccctatccttcaggatggtttgaagact
acttcatatggtacaaccctctatctcatggctggttctaacgacaacagcgagcatatc
aagagtgctaccgttgcaggtaacaatacaactggtggttgggctggtaaccgtatgcgt
acagacctcgtattgaagttcttcccaaataacgatgctcctaatgttgctgcatacgct
atgccagcagctgcagatgacgatcgtgccctctttgatggtgaaggtcgtaatgtaagc
aatggtgacgatgagaagggtgtaaaggtatttaccaacggattctctgtttgtaagttt
aataactttaagacggacggcagtgcaggtcataactcgctcttcccagacgccgacttc
ttcctcatgcgtgctgctgaggcttacttgatgtatgctgaagcagatgcacgtcagaac
aatggaacgacaactgcacagggaactgcttatatcaatgcgctccgtacacgtgctaat
gctactactcagaccgcttattcactccgccagatctgtgacgagtggagtcgtgagttc
tacttcgaaggcttgcgtcgtacaacacttatccgtttcggctacttcggtggtaatgtt
aattacaactggagctggaagggtggtgtgaagaacggccgtaacttcgactctcatctt
aacctcttcccaattccgacaagtgatatggttgctaataaagccaacttgattcagaat
ccgggctattaa

DBGET integrated database retrieval system