Prevotella scopos: J4856_06275
Help
Entry
J4856_06275 CDS
T08373
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
pscj
Prevotella scopos
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Cmr1_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QUB45759
LinkDB
All DBs
Position
2:229257..231314
Genome browser
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MLNTLLLASLAIGGIAKDAPDSIVSKNVPLNEVVVSDFKQNKRNLTSVAVSTINLQQLQN
QQIVNLKELTAVMPNFYMPDYGSYANTPVYIRGIGAKSKGSAVGFYVDGVPHFESSAFNI
DLSDIAGVDVLRGPQGTLYGRNTIAGIINVYTHNPLDYQKMRIKVGYGRYNDFVAQASNY
AKINDQFGVSSALSYHHNDGMFTNEFLNKKADKLNEIEGRIGLYWRPTTNWLIHLNNTLS
HSKQNGYPYAPYDIQKQELSPISYNRLSVFKRLIFTTGLNARYENNNVSFNSQTSYQFIK
SHQGIDQDFTPKDLFFTDNDYHQNMFSQELTLKSNDKGRYQWIVGVFGMLLHSNPFIGTS
YFTKDFSTPTSYKNPTAGFAIYHQSSYNIWRGLSATVGLRFDYEHAKIDYEQHKLTLTTG
AITPVNNFVSTASFRQFTPKFTIQYLTNKDNLYYASFTRGYKPGGFNTSFKTDDERAYDP
EYSLNYEVGARLKFLDGRLRAEADLFYIDWRHMQAIYTVPNVGNLITNAGHTDSKGFELS
LAYHPVKSLQFSMNYGYTHARYLEYKKSSKEDFSGNRLPMVPNHTLSIDGTYTVMQAGWF
DKIILNTGLTGLGRIYWADDNIVRQNFYATLNAKVSLTKGIVTLDLWGKNLTGTDYLAYC
FKMSTGNYAQKGKLLSFGTSVSLTF
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaacacattgttattggcctcccttgctatcggaggaatcgccaaagatgctccc
gattcaatagtgagtaaaaatgtcccattgaatgaagtcgttgtatcagacttcaagcag
aataagagaaaccttacttctgttgctgtatcaaccattaacctacaacaactgcagaac
cagcagattgtcaacctgaaggagctgacggctgtgatgcctaacttctatatgcctgac
tatggttcatatgcaaatacgcccgtctatattcgtggtatcggagccaagagtaagggt
tctgcagtgggtttctatgtcgatggcgtgcctcattttgagtcgtcagcatttaatata
gatctcagtgatatagctggtgtggatgtacttcgagggccacaaggaacgttgtatgga
cgtaataccatcgctggtatcataaacgtttacacgcataatccgcttgattatcaaaag
atgcggataaaggtcggctatggaaggtacaacgactttgtagcgcaggcttcaaactat
gctaagataaatgatcagttcggtgtttcaagtgctctttcctatcatcacaacgatggt
atgtttacgaatgaattcttaaataagaaggcagataagttgaatgagattgaaggacgt
atcggactttactggcgacccaccacgaattggctcatccatcttaacaatacgctcagt
catagtaagcagaatggttatccttatgcaccttatgatattcaaaaacaggaactatct
ccaatcagctataatcgcctgagtgttttcaaacgtcttatcttcacaacaggccttaat
gcccgatatgagaataataacgttagtttcaatagtcagacatcttaccaatttatcaag
tcacaccaaggtatagatcaagactttaccccaaaggacttgttctttactgataatgac
tatcatcaaaatatgttttctcaagagctgaccttgaagtcgaatgacaagggacgttac
caatggattgtgggtgtgtttggtatgctgctccattcgaacccattcatcggaacaagc
tattttacgaaggacttctcaacccctacatcctataagaaccctactgcaggctttgcc
atctatcatcagagttcttataatatatggagagggctgtccgcaacagttggtctgcgt
tttgattacgaacacgcaaagatagattatgaacagcataagttgacattgacgacaggg
gcaataacacctgtaaataacttcgttagtacagcgagcttccgtcagtttacccctaag
ttcacgattcaataccttacaaacaaagacaatctctattatgcaagtttcactcgtggc
tataagccgggtggatttaacaccagctttaagactgatgatgagcgtgcatacgatcca
gaatacagcttgaactatgaggttggtgcaagattaaagttcttggatggaagattgaga
gccgaagctgacctcttctacattgactggcgacacatgcaagcaatctatacggttccc
aatgtaggaaatttaattacaaatgcaggtcatacggatagtaagggtttcgaactttct
ttggcttatcatccagtgaagagtttgcagttcagtatgaattatggctatacccacgct
cgttatctagagtataagaagagttctaaagaagatttctcagggaatagactgccaatg
gtacctaatcacacactgtcaatagacggaacttacactgttatgcaggcaggctggttt
gataagattattctgaatactggtttgacaggccttggtcgaatctactgggctgatgat
aatattgttcgtcagaacttctatgcaacgctcaatgctaaggttagtcttacaaagggt
atcgtgacattagatttatggggaaagaacctcaccggaaccgactatttggcctattgc
tttaagatgtcaacgggtaactacgcacagaaaggtaaactgctgtctttcggtacttcc
gtcagtttgacgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system