Pseudoalteromonas sp. CuT4-3: VOI46_15670
Help
Entry
VOI46_15670 CDS
T11364
Name
(GenBank) ABC transporter transmembrane domain-containing protein
Organism
pscu Pseudoalteromonas sp. CuT4-3
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_22
ABC_ATPase
RsgA_GTPase
AAA
AAA_21
DEAD
AAA_29
AAA_30
nSTAND3
AAA_14
AAA_23
AAA_16
AAA_5
AAA_18
DO-GTPase2
AAA_15
AAA_28
NB-ARC
SRPRB
MMR_HSR1
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WRU72892
LinkDB
All DBs
Position
3378576..3380354
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MSKTSPKPEKAAFSSLLPIFAFIKPYKWMVVAALGALLVTAGVNLSLGQGVKFVIDHGFI
AGSQAQLQQAVLVLIGLISLLAVGTFSRFYLMSWIGERVSNDIRKAVFNRIVTLHPSYFE
ENRSGELMSRLTTDTTLLQSIIGSSFSMALRSALMLVGGLVMLLVTNLKLTLVVVACVPL
VLVPMMVFGKKVRKLASSSQDAIADISTYAGEIIQNIKVVQSYSHEQREQHAFALETEKA
FNVAKSRIKQRSFLIAAVIFLTFSAISVMLWVGGSDVLAGTMTGGELGAFVFYAIMVAMS
VATVAEVYGELQRAAGAAARLLELLAVKSEIENPVTPQDEKLLIKTDSPAIALENISFNY
PSRPDVSALNKINLTIEQGKTVAIVGPSGAGKTTLFELLQRFYDPAHGEIKFHDVNIKDI
SLTTLRDKMGMVAQNPILFSSDVMHNIRYGNPNATDEQVYAAAKHAHADEFIKQLPQGYN
SFLGEQGVRLSGGQKQRIVLARAILKDPEILLLDEATSALDAQSEHHVQAALEHLMQNKT
TLIIAHRLATVKHADAIVVMENGEIKATGSHQQLLASSPLYQRLCELQFNKN
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaacaagccctaagcccgaaaaagccgcttttagtagtttattacctattttt
gcgtttattaaaccgtataaatggatggtagtggcggcacttggcgcccttttagtcacc
gctggtgttaacttatcattagggcaaggggttaagtttgtcatagatcatggctttatt
gctggctcccaagcgcagctacaacaagctgtattagtgcttattggtttaattagttta
ttggccgtgggcacctttagccgcttttatttaatgtcgtggattggcgaacgcgttagt
aacgatattcgcaaagcggtgtttaatcgcattgttaccttgcaccccagttactttgaa
gaaaaccgcagtggcgagcttatgtcgcgtttaacaaccgacaccactttgctgcaatcg
attattggctcttccttttctatggcgctgcgcagtgcattaatgttagtgggtggcttg
gtaatgctgttagtgactaacttaaagcttacgctcgtagtggttgcgtgtgtgccgcta
gtattagtgccgatgatggtatttggcaaaaaggttcgcaaacttgcaagttctagccaa
gatgcaatagccgatataagcacctatgccggcgagatcattcaaaatattaaggtagtt
caaagctatagccacgaacagcgtgagcaacacgcctttgcacttgaaaccgaaaaagcc
tttaacgttgccaaaagccgtattaaacagcgctcttttttaattgctgcggtaatattt
ttaacctttagtgcgattagcgtaatgctctgggtaggcggtagtgacgtactggcaggc
actatgacaggcggtgagctaggcgcctttgtgttttacgccattatggtggccatgtcg
gtggctaccgtagccgaggtttacggcgagctacaacgagctgctggtgcggcagcgcgc
ctacttgaattactggccgttaaaagtgaaatagaaaaccctgtcactccacaagacgaa
aagctattaataaagactgacagccccgccattgcacttgaaaacattagctttaactac
ccatctcgccccgatgtaagcgcccttaacaaaataaacttaactatagagcaaggtaaa
acagtggctattgtaggcccctctggcgcaggtaaaactacgttatttgaattactacag
cgcttttacgaccctgctcacggcgagattaaatttcatgatgtaaatattaaagacata
tcgcttaccacccttagggacaaaatgggcatggtggcacaaaaccctattttatttagc
tcagatgtaatgcataacattcgttacggcaacccaaacgccactgacgagcaagtatat
gcggccgcaaaacatgctcatgccgatgaatttattaagcaattaccgcaaggttataac
agctttttaggtgagcaaggcgtaagactctcgggtgggcaaaagcagcgtattgtattg
gcacgcgctattttaaaagacccagaaatactgcttttagatgaagccaccagtgcactc
gatgcgcaaagtgagcaccacgtacaagccgcgcttgagcatttaatgcaaaataaaaca
acgttaattattgcccataggctggcaacggttaaacatgccgatgcgattgtagtaatg
gaaaatggggaaataaaagcaacagggagccaccagcaattgctagcaagctcccctttg
tatcagcgtctttgtgaattgcagttcaacaaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
