Pseudoalteromonas sp. CuT4-3: VOI46_18920
Help
Entry
VOI46_18920 CDS
T11364
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
pscu Pseudoalteromonas sp. CuT4-3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WRU74783
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:448968..452111
Genome browser
AA seq
1047 aa
AA seq
DB search
MSANLSKNDLLAIFEEIKNEQATLFPLSERFIKKLFRPNVLDKGKEYYKNDQISWLEHSS
DFAVIDSTVQGDTGSAFNQRIEISKVPTGYSVDTHCTCNAKTKCRHLAAVLFKLKIEHSG
EYGEDYFINDWFSELTALKSVDAKAPSQVLLFVLDIENNKVFLTPKIANYDKNNNYTLGR
NLTEQQLNSFVTPNDLLESDFRLFSWIRSQNAVGNLELKGQWGFSALQQLIATDRLFLQR
SRVAIKAQTGQSLNFNWQQQNELSQLIIELEHSKNWALIKTTPPAYLDLDHFKVGRIRTQ
LSADEIAHLQSIPALHDANFDRIYKQLADNFGAGVIPHPNNEQVNVKQLGNAVLKATMDE
QGLKVSLLFKYKNKNYLAGTAPASLINSAFENTVTNELVNLGFEFCKGGLQSEFIFNKQS
PIHLHWLVYEVFPGFKKRGWQVTQTKVNVADPQGHVTLDVNRAAGHQMHCKVQLSDAKAA
VLFNTDDATYQSLNRQSELFYYYPVGRQFGVISKAAINLLTEFKQRFEFVKTRDEFNIPL
SYLPELVKHTAVTIDLHDDSLERYLDELNNTEQAMPVVPLHGLNDSVTLREYQQQGVDWL
SFLKRHQLGGILADDMGLGKTLQVIAFLASSFNRPQAGPTLIVCPTSLVSNWQNEITKFA
KSLKVTTIFGSQRNEPLQHLAQAQCILTTYPLLKRDIAYYSPLYFENIILDEAQYIKNDT
AQVSRLVKRLNADFKLCLSGTPIENNLFELKSLLDFAMPSLLGSQAHFKQHFQTPIEREA
DSERAEQLKALIMPFILRRTKAQVAQELPQKTELLKEFEFEPKQKDMYQGITRALEEKLI
DLFAEQGAQKSKLAFLEALLKLRQICCHPKLIEPETQAGSAKLEWLTTHLPLMLSLGRKV
IIFSQFTSALDLIAERLNDINIKFSMLTGQTRHRDKVIDEFTSGKTSVFLISLKAGGTGL
NLTQADTVIHFDPWWNPAVEKQATDRAYRIGQTNPVFVYKLIMSNSIEQKVFKMQQDKQA
LVDALFTDKSMSFTSFDEQQMLSLIKS
NT seq
3144 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgctaacttatcaaaaaatgatttactggctatttttgaagaaataaaaaatgag
caggcaaccttgttccctctttctgagcgctttataaaaaagctgtttaggcccaacgtg
ctcgataaaggcaaagagtattataaaaacgaccaaattagttggttagagcacagcagt
gattttgctgttattgattcaacggtacaaggcgacaccggatcagcatttaaccaacgc
attgagatcagtaaagtacctactggttactctgttgatacgcattgtacctgtaatgct
aaaaccaaatgtaggcacttagccgctgtattatttaaacttaaaatagagcactcaggt
gaatacggagaagactactttattaacgattggtttagtgaactgacagcacttaaaagt
gttgatgctaaagctccttcgcaagttcttttatttgtattagacattgaaaacaataaa
gtatttttaacgccaaaaattgccaattacgacaaaaataataattacacgctcgggcgc
aatttaactgagcaacaattaaatagctttgtaacgccaaacgatttgctcgaaagtgac
tttagactctttagttggattcgctcacaaaatgcagtaggtaatttagagctaaaaggt
caatggggctttagcgctctacaacaattaattgccaccgatcgtttatttttacaacgc
tctcgtgttgctattaaagcgcaaactgggcaatcgcttaactttaattggcagcagcaa
aacgagttatcgcaattaattattgagcttgaacacagtaaaaattgggcattgataaaa
accacgccgcccgcttatttagacctcgatcactttaaagtaggccggatcagaacacag
cttagcgccgacgaaatcgctcatttacaatctattcccgcactgcacgatgctaatttt
gatcgcatttataaacaacttgccgacaattttggcgccggtgttattccgcatccgaat
aacgaacaagtcaatgttaagcaacttggtaatgctgttttaaaagccactatggatgag
caagggcttaaagtttcgctattatttaaatataaaaataaaaattatttagcgggaaca
gcacccgcgagcttaataaatagtgcatttgaaaacacagtaacaaatgagttagtaaat
ttaggttttgagttttgtaaagggggtttacaaagtgagtttatatttaataaacaatca
cctatacatttacattggcttgtttacgaagtattccctggctttaaaaagcgtggctgg
caggtaactcaaactaaagtaaatgtagccgacccccaagggcacgttacactcgatgta
aaccgtgctgcaggtcaccaaatgcattgtaaagtgcaattaagtgatgccaaagccgct
gtactttttaataccgatgatgccacgtatcaatcgttaaatcgtcaaagtgagctgttt
tattactaccctgttgggcgtcaatttggtgttattagtaaagccgccattaatttactg
accgaatttaaacaacgttttgaatttgttaaaacacgcgatgaatttaatatcccgctt
tcttatttacctgagctggtaaagcataccgcagttactatagatcttcatgatgactca
ttggagcgttatcttgatgagttaaacaacaccgagcaggcaatgcccgtggtgccctta
cacggtttaaatgactcggtaacactacgtgaataccagcaacaaggcgttgattggctt
agctttttaaagcgccaccaattaggtggcatacttgctgatgacatggggcttggcaaa
acgctacaagttatcgcctttttagccagcagttttaatcgcccgcaagcgggccctact
cttatagtgtgccctacaagtttggtaagtaattggcaaaacgaaataaccaaatttgct
aaaagtcttaaagtaaccactatttttggctcgcaacgtaatgagcctttacaacattta
gcgcaagcgcagtgtattttaactacttacccattattaaagcgtgatattgcttattac
tcgccactttattttgaaaatattattttagatgaagcgcaatatattaaaaacgatact
gcacaagtctcgcgcttagttaagcgtttaaatgccgactttaagttatgtttaagcggc
acgccaatcgaaaataatttgtttgagcttaaatcgttactcgactttgcaatgccttca
ttacttggctcgcaagcgcactttaaacagcactttcaaacacctattgagcgcgaagcc
gattcagagcgagctgagcaactaaaagcgcttattatgccgtttatattacgccgcaca
aaagcgcaggtagctcaagagctgccacaaaaaacagagctgttaaaagagtttgagttt
gaacctaagcaaaaagatatgtaccaaggtattacgcgcgccctagaagaaaagctcatc
gacttatttgctgagcaaggcgcacaaaaaagtaagctcgcatttttagaagcgctacta
aagctaaggcaaatttgttgtcatccaaaattaattgagccagaaacacaagcaggttca
gcaaaattagaatggctaactacgcatttaccgttaatgctaagccttggtcgtaaagtg
attatttttagtcaatttacctctgcgctcgatttaattgcagagcgtttaaacgatata
aatatcaaatttagtatgctaactgggcaaacgcgtcatcgcgacaaagttattgacgaa
tttaccagtggcaaaacctcggtgtttttaatcagtttaaaagcaggcggtactgggctt
aacttaactcaagccgataccgttattcactttgatccatggtggaaccctgctgttgaa
aaacaagccaccgatcgtgcttatcgtattggccaaacaaatccagtgtttgtttataaa
ttaattatgagcaattcaattgagcaaaaggtatttaaaatgcagcaagataagcaagcg
ctagttgatgcattatttaccgataaatcaatgagctttacttcgtttgatgagcagcaa
atgttatcacttataaaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
