Pseudoalteromonas sp. NC201: PNC201_22055
Help
Entry
PNC201_22055 CDS
T05464
Symbol
pknD
Name
(GenBank) Serine/threonine-protein kinase PknD
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
psen
Pseudoalteromonas sp. NC201
Pathway
psen02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psen00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
PNC201_22055 (pknD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
Cadherin_3
He_PIG
NHL
SBBP
SGL
Calx-beta
RibLong
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUJ72627
UniProt:
A0A2K9K4Q3
LinkDB
All DBs
Position
pNC201:complement(987341..994483)
Genome browser
AA seq
2380 aa
AA seq
DB search
MITQRSLLSRVRKIVSNSCIAGSIFFALTSSAFALENWQKVERLTPTDETTNADELVFKV
TFVNAHTVAPTASDFTILGDEKDTNNDTTIDTGSKTTASITQVTVDSGNSSIYHVTLSGG
DLASYNGVVALLPASNSIRPEVFEAYYVSNGTELPASDKLIVFDYADQTSELGNGYFGAT
AAEARTTADALCKSKFLRKHNRLNNIIDSSASTAVSNGPVRAHAVISFSASDDIASLDTN
YSLPSVNVFNSGGTKLADANWDDFVNGTLSALNSNASDMLENSGNVKYFWSFSDSGGTFN
AANNCSGGTSPSNTVKGVANQNGSWYTLIGSVPCNNALNLICVAWHESAYLDANISNTAP
TISNLPASFTVTEDVATTVDLSAVVLADNEDDSLTVTLALDSGTIASTDGNGTVSSVTVA
GSGTASMTLSGSAAALNTYLDVTTKLNITTETDNTAAMTLTVTPNDGTVDGDAATSTVNV
TAVNDKPTFTSTAVTASTEDSVYKYSIATSDPDKDDVTVSVSASTPLPSWLSLNTSTEAT
VSTLAGQSSGYADGTGTAASFKSPYDVATDSNNNVYVADYSNHVIRKITPKGVVTTLAGS
GTAGSDEGTGSAASFNFPKAVTVDASGNVYVADSSNNKIRKITPAGVVTTFAGSGSPGST
DGTGTAATFAAPTGITIDSNGNLFVVETNPHIVRKITPAGVVTTFAGSKGSSGFTDATGT
SAKFNFPYNGGSSSNNDLFIADRNNHAIRKVTSASVVTTFAGTGSAGSANGTGTQASFNK
PYDIALDSADNLYVSEQTGHTIRKITSAGVVTTFAGSAGVSGSTDGLASVARFSQPFGIA
VDSNGIVYVADTGNHRIRKISPAETTLTGTPSNDDVGDHYICLIVSDGTETSEQCFTITV
TNVNDAPVVATNTGLTLDGGTTINITSSALSASDVDDSGTGLTYTVTTLPSHGNLFVDAN
SNDSLDSGEALGSNGTFTQADIENGNLFYAHDDSQNASDSFVFSLEDGLEDGVTAITNQT
FSFVVELNKAPVISGTPAATVNENVAYSFTPTATDEDNDTLTFSITNKPSWATFSTSTGS
LTGTPSYTDAGAYNGIVITVSDGTASDTLNFDITVANVNRTPSISGTPATSVDENSSYSF
TPTASDPDGDTLTFSITNKPSWATFSTSTGALSGTPSFTDAGDYNGIVVTVSDGTATQTL
NFNINVVNVNRSPSISGSPSTSVLEGGTYNFTPTASDPDNDNLSFSIANKPIWASFSSTT
GALTGTPNFNQAGTYSGIVITVSDGSASQNLTFSIAVTDVNRAPTITGTPATTVNEGVIY
SFTPSASDEDNDNLSFSITNAPDWATFSSTTGTLTGTPTFNDGGEQYNITISVSDGNESA
NLNFTLSVVNINRLPTISGTPGVKVTVGENYSFVPAATDEDEDTLSFTITNKPSWALFSA
STGELSGTPSETDIGTTSGIQISVSDGTDNASLPAFNLEVVAENTAPEGENLSLTVKEDT
SLTILPTLQDAEDDTLTLTIGSQPANGSLTNSGAGWVYQPEADFNGDDSFTYSVSDGELQ
SDNYTVTLTITPVNDLPIANSDSFQLDGSANNTFTLDVLANDTDVDGDTLVIEGVKASLG
NASVVGNALQYTAPSNFAGSVTLNYAIRDGHGGRAKANALLEISGAVNGEPPVVTAPADL
EINATGLFTKVNLGTATALNSSGEPLPVTLTEGKTIFAPGEHNVYWQATDADGNLGTDQQ
LLRVNPLVSLSKDKTIAEGSKVDIQVLLNGPAPQYPVTVDYTVTGSAISGVDHDLSSGSV
TISSGTKANISIQTVADGEFEGDETITVSLNNGINLGAKRETTITVSEQNIAPDVSLVVT
QNDQNRLTVSQDEGIVSVVATVADPNAGDTVTNAWKVTGMTSDQYTEDTLQLSFNPQELQ
AGTYKITHTATDSSSAQDSESVFIQVTQSLQQLSDTEDTDGDLIPDSQEGYADDDGDGIP
DFQDAITECNVMPQEVVTQDGFLVEGNPGVCLRKGEFTASGETGGLLMTDDEGNSQLGDD
DDAQITGGLFDFIAYGLPKAGQVYQLVMPQRLPIPRDAVYRKFKASSGLWVNFVEDANNL
VFSAEGEPGICPPPGDESWSEGLTEGHWCVQLQIEDGGINDDDGEANGSIVDPGGVGVLL
SNNQMPVALDDTISMKWNTNITIDVLANDTDADGDMLTVANASASFGDVQINPDNTLYYT
PNTGYVGVDTLSYAITDGNGGTAGASVVITVVANTAPITVSDVATVVSGKPITINVLAND
SDSDGDTLQVTEATAQHGSVAVNADYSLTYQSNSGFVGSETVTYTITDGEASVQGSVNIT
VNKAPTDTVTNKSDSGSMPVWLIWLSLAFVVIRRWQAITR
NT seq
7143 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattacacagcgctcacttttaagccgtgttcgtaagattgtctctaacagctgcata
gctggcagtatatttttcgccttaacctcatccgcatttgcactcgaaaattggcaaaaa
gtcgaaaggctcacaccaactgacgaaactaccaatgcagatgaattagtctttaaagtc
acctttgttaacgcacataccgttgcgccaaccgccagtgactttacgattctgggcgat
gaaaaagacaccaataacgacacaactattgatacaggcagtaaaacaaccgcatcaatc
acacaagtcaccgtcgactcaggtaacagctcaatttaccatgttacgctctctggaggt
gaccttgccagctacaacggcgtcgttgcgttattgcctgcgagtaactcgataagacct
gaagtgttcgaagcctactacgttagtaacggcactgagctcccagcctctgataaactc
attgtatttgattacgcagatcagaccagcgagctgggcaatggctactttggagcaact
gccgcagaagcaagaaccacagcagatgccctatgcaaaagtaaatttctacgcaagcat
aaccgactaaacaatattattgatagttctgcttcaacagcagtaagtaatggaccggtt
agagcacatgctgtaatttcattctctgcatccgatgacatcgccagccttgacactaat
tacagcctacctagtgttaatgtttttaatagcggaggcactaagcttgctgacgccaat
tgggatgactttgtcaacggcacacttagcgcccttaatagtaatgcgtccgacatgcta
gaaaattcgggcaacgttaagtatttttggagtttctccgattcgggaggcacttttaac
gctgcgaataactgttcgggcggaacctcaccttctaatactgtcaaaggtgttgccaac
caaaatggcagttggtataccttaataggtagtgtgccctgtaacaacgcactgaattta
atttgtgtcgcatggcatgaatcagcctatttagatgccaatatttccaataccgcacct
acaattagtaacttaccagcaagctttactgtgacagaagatgtcgcaactacggttgat
ctatcagcggtcgtcttagctgataacgaagatgacagcttaacggttaccttggctctg
gacagtggcaccatcgcaagcaccgatggtaatggcacagtgagcagcgtcacagtggcg
ggaagtggcactgcaagtatgacattaagtgggtcagcggctgcgcttaatacctatctc
gatgtgacgactaagctaaatatcaccacggaaaccgacaacacagcggcaatgacgctc
acggttacgccgaatgacggtaccgttgatggtgatgcagcaaccagcaccgtgaacgtc
acggcagtcaacgataagccaacctttacttccacagcggtcactgcatcaactgaggat
tcagtgtacaaatattcaatagccaccagcgaccctgacaaagatgatgtcaccgtttct
gtctcggctagcaccccgcttccaagttggctaagcttaaatacaagcacagaagcaacg
gtgtctacacttgcaggtcaaagctctggttatgccgatggaactgggactgccgcctca
tttaaatctccttatgacgttgcaaccgacagtaacaacaatgtgtatgttgccgattac
agtaaccatgtgatccgtaaaattacacctaagggagttgtcactacacttgcaggttct
ggaaccgcaggctctgatgaaggcactggtagtgctgcttcatttaactttcccaaagcc
gtaacggttgacgcttctggcaatgtttatgttgcagattcttcaaacaataaaatccgt
aagatcaccccggcaggagtagtaactacctttgcaggcagtggttctcctggcagcacg
gacggaactggcacagcagccacttttgctgcaccaacaggtatcacgattgacagcaac
ggaaatctatttgtcgtagaaacgaaccctcatatcgttcgtaaaataacccctgcaggc
gtcgtaaccacgtttgcgggtagtaaagggtcttctgggtttactgatgcaacaggaaca
tcggcaaaattcaacttcccctataatggcggtagtagtagcaacaacgacctatttata
gcggaccgcaacaatcacgctattcgtaaagtcacctcggcaagcgttgtaaccactttt
gcaggaacgggatcggcgggttcggctaatggtacaggaacgcaagcaagctttaataag
ccatacgatatcgcactagacagcgccgataacctttatgtatccgagcaaacgggccac
actattcgcaagataaccagtgcaggcgtagtaaccacttttgcaggaagtgccggagtc
tcaggaagtacagatggtttagcgagtgtggcacgcttcagccaaccctttggtattgca
gtagacagcaatggcatcgtttatgttgcagataccggcaaccatcgaattcgaaaaata
tcaccggcagagacgacgttgacgggtacgcctagcaatgacgatgttggcgatcactat
atttgtttaattgtttccgacggtactgaaaccagcgagcaatgctttaccattacggtt
acaaacgtcaatgatgcgcccgttgtcgcaactaacacgggtttaaccttagatggtggt
acaacaataaacatcacgagttcagctctgtctgcaagcgatgttgatgacagtggtaca
ggtttaacgtacacagtaactaccttgccaagtcacggaaacctctttgttgatgccaac
agtaatgacagcttagacagtggtgaagcgctcggcagcaatggtacgttcacacaagct
gatattgaaaatggcaacttattttatgcccacgacgactctcaaaatgcgagtgacagt
tttgtcttttcactagaggatggcttggaagacggtgttaccgcaattaccaatcaaaca
tttagctttgttgttgagttaaataaagcaccggttatcagcggtactccagcggcgacc
gtcaacgaaaacgttgcatatagttttacgcctaccgcaactgacgaagataacgacacc
ttaacatttagcatcaccaataaaccaagctgggcaacctttagcacctcaaccggtagt
ttaacgggaacacctagttataccgatgcaggtgcatacaatggtattgttattacagtg
agtgatggcacagccagtgataccttaaattttgatattactgtcgccaacgtgaaccgc
acaccaagtattagtgggacacctgcgactagtgttgatgaaaatagcagttatagcttt
actccaacagcctctgatcctgatggagatacgcttactttcagtatcaccaataaacca
agttgggccactttcagtaccagtacaggagccttgagcggcacgccaagctttactgat
gctggcgactacaacggtattgtagtaacagtcagcgatggtaccgcaacacaaacgctg
aactttaatattaatgttgtaaatgtgaaccgttccccctcaattagtggctctccatcc
acttcagtgcttgaaggcggtacttataatttcacaccaaccgcaagtgaccctgataat
gacaacctaagcttctctattgccaataagccgatctgggcatcatttagttcaactact
ggagcattaactggaactcctaacttcaatcaggcaggtacttacagtggcatagtcatt
acagttagtgacggtagcgcctctcaaaatctgaccttctcaatcgctgtaacagatgta
aatcgcgcacctaccattacgggtacgccagcaaccactgtgaatgagggagtaatttat
agcttcacccctagtgcttccgatgaggataatgataacctttcctttagcattaccaac
gcgcctgattgggctacattcagtagtacaacgggtacgctaacaggtactcctaccttt
aatgatggtggtgagcaatacaacatcacaatcagtgttagtgatggtaatgaaagcgca
aaccttaacttcacgctaagcgtagtcaacatcaatcgtttaccgacgataagtggtact
cctggcgtaaaagtcacagtgggggaaaactatagctttgtacctgctgcaacggatgaa
gatgaggacacattaagctttacgatcactaataagccaagctgggctctattctcagca
tcaaccggtgagctatctggtactccgtcagagacagatattggtacgactagcggtatt
caaatcagcgttagtgacggtactgacaatgcgagtttaccagcatttaaccttgaagtg
gttgcagagaatacggcaccagaaggtgaaaacctctcgctcactgtaaaagaagatacc
tctttgactattctgccgacattacaagatgccgaagatgataccttaacgctgacaatt
ggtagtcagccagcaaatgggtcattaaccaacagcggtgcaggctgggtatatcaacca
gaagctgacttcaatggggacgatagttttacctattcagtgagcgatggagagctgcaa
agtgataactataccgttacattgactatcacacctgtaaatgatttacctattgcgaat
agtgatagcttccagcttgatggttcagccaataatacattcacccttgatgtgctagcg
aatgataccgatgtagatggtgataccctcgttattgaaggtgtcaaggcaagtttaggc
aacgccagcgtagtcggcaatgctctgcagtacactgcgccaagtaacttcgcgggctct
gttactctgaactacgccattcgtgatggtcatggtggtcgagctaaagcaaatgcacta
ttagaaataagtggtgcagtcaatggtgaacctcctgttgtcaccgccccagcagatcta
gagattaatgcgacagggctatttaccaaggtaaacctgggtactgcgacagcacttaat
agcagcggtgaacctttacccgttacgcttacagaaggtaaaaccatatttgcaccagga
gagcataacgtctactggcaagcaacagacgcagacggtaacttaggaacagatcaacag
ttgttgagagtgaatccgctagtgtcgttgagtaaagataaaaccattgctgaaggcagt
aaggtagatattcaagtgctactaaatggccctgctccgcaatatcctgtaactgtcgat
tataccgtaacaggtagtgcaatatcaggtgttgatcatgacttgagtagcggctcggtg
acgataagctcgggcacgaaagccaacatttcaattcaaacagttgcagatggtgagttt
gagggcgatgagacgatcacggtcagcttaaataacggtattaaccttggtgcaaaacgg
gaaaccactattacagtgagcgagcaaaatattgcgccggatgtctcactagttgtgact
cagaatgaccaaaaccggctaaccgttagccaagatgaaggaattgtatctgtcgttgca
acggtggccgatccaaatgctggcgacacagtgacgaacgcatggaaagtaacaggtatg
acttccgatcaatatacggaggacacactgcaactaagctttaaccctcaagaactgcaa
gcggggacatacaagatcacgcatacagcaactgactctagtagtgcgcaagatagtgag
agcgtatttattcaagtgacccagtcattgcaacagttatctgatacggaagatacggat
ggcgatcttatccctgatagtcaagagggttacgccgatgatgatggagacgggatccct
gatttccaagacgctatcaccgagtgtaacgttatgcctcaggaagtagtgacgcaggac
ggcttcttagtcgaaggtaaccctggagtctgtttacgtaagggcgagtttactgctagt
ggtgaaaccggtggcctactgatgacagatgacgagggtaattcacaactaggtgacgat
gatgatgcacaaatcactggcggcttgtttgactttattgcttacgggctaccgaaagca
ggtcaagtatatcagctagtgatgccacagcgcctacctatcccaagagatgctgtatat
cgtaagtttaaagcgtcctcaggtctttgggtgaactttgtggaagacgcaaataacctc
gtctttagtgcggaaggtgagcctggcatttgtcctcctccaggagatgaaagctggtct
gagggcctgacagaaggacattggtgtgtgcaacttcagatagaagatggtggtatcaat
gatgacgatggtgaagcaaacggtagtattgtggatccaggtggtgtcggtgtactgcta
tctaataatcagatgcctgtagcgctagacgatacaattagtatgaagtggaacactaat
attactatcgatgttttagcgaatgacactgatgctgatggagatatgctcaccgtagca
aatgcttctgcaagctttggcgatgtacaaattaatccagataatactctgtactataca
ccaaacacggggtatgtcggagtagatacgctgagttacgccataaccgatggtaatgga
ggaaccgcaggagcgagcgtagtaattactgtagttgccaatacggctcccataacggtt
tccgatgttgcaacagttgtttctggaaagccaattaccattaatgttctagcaaacgac
agtgatagcgatggcgatacgctgcaagtaactgaggcaacggcacagcacggtagtgtc
gcagttaatgctgactacagcttaacctatcagtcaaattctgggtttgttggcagtgaa
accgttacctacacaatcacagatggtgaagcgagtgttcaaggtagtgtgaatattaca
gtcaacaaagcacctactgataccgtcacgaacaagagtgatagtggtagtatgccggta
tggttgatttggctcagccttgcatttgtagtaattcgccggtggcaagctataacacgt
tag
DBGET
integrated database retrieval system