Pseudoalteromonas piratica: OM33_19780
Help
Entry
OM33_19780 CDS
T03513
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pseo
Pseudoalteromonas piratica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pseo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pseo02000
]
OM33_19780
Transporters [BR:
pseo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
OM33_19780
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIY67287
UniProt:
A0A0A7EMU5
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1128022..1130136)
Genome browser
AA seq
704 aa
AA seq
DB search
MKKQFLFTLVIASNSAFAQDLNTPNTSNNNDIEHIEITQFWQPYRGNVPLFQMPQAVDQI
NADVIENEGITRFIDALSLSPSIVRQNNSGGMFDSFAIRGFSGDENNPTGYLVNGFNSRG
YNGNRSTANIQAIEVMKGPGSALYGQGEPGGTVNIVTKKPQFEKQGYVQGTLGNFNKKQI
EFDYTNGFNEESAFRINGAYEDSDTHRDHVTLESLHLSPSVLWHVSENTKLSYEMEILDQ
KKPLDRGVYVLNNNFDEIEAEDFYGDIRDGAHKVAALGHQFVLNHKLNDNWHLLSGFAYR
DSSFKGLSSDTELSSGRQLVYTDPNTLSRQRRERDYQALDMNARFELSGELATGTIKHNL
LVGMDYYNFELDTDYKVWRTAWGSGDTTYSINPNNPDYTQPQPEPLAKTLTAEEQKGLGL
YAQNLMALTEKSKLLLGVRVDKLDQEILNKRSDSVQTRNQTEFSPRLGYIYDINENVNVF
TNYAEGFRPNPGLDSDRNAFEPEETKSLEVGAKWHNVANRFSGNIAVFTAEKTNMLTAEP
DTGLSATLGEVESQGIEFNLITELTNNTNLELAYAYTDAKTANDVINSDWGVPIPKGSRL
INIAEHVGHVSLRHFTQIMGKDSYVGATVNYVGDRLGETTDPDYILPAYTLVNVSAAIDL
STQLTLKLDVNNVFNEAYFENSYHKLWTMPGSPINYSASLKYQF
NT seq
2115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagcagtttttatttaccctggttattgcttctaacagtgcatttgcacaagac
cttaatacaccaaacacttcaaataataacgatattgaacacatcgaaataacgcagttt
tggcagccttaccgaggtaatgtacctttatttcaaatgccacaagcagttgatcaaatt
aatgctgatgtaattgagaatgagggcattactcgatttattgatgcattgtccttatca
cctagcattgtgcgacaaaataattcaggtggtatgtttgatagctttgctattaggggt
ttttcaggcgatgaaaataacccaacaggttaccttgtaaatggcttcaattctcgtggt
tataacggcaatagaagtacggcgaatattcaagcaattgaagtaatgaaagggccaggc
tctgcactatatggtcaaggtgagcctggtggcactgtgaatattgtgaccaaaaagcca
caatttgaaaagcaaggctatgtacaaggcactttaggcaattttaataaaaagcaaatt
gaatttgattacaccaatggcttcaatgaagagagtgcatttcgcattaatggtgcttat
gaagattctgacacgcatcgtgatcatgtgactttagaaagtctgcatttatcgccttcg
gtattatggcatgtgtcagaaaacacaaaattaagctatgaaatggagattctagatcag
aaaaaaccactcgatcgtggcgtttatgttcttaacaataattttgatgaaattgaagcc
gaagatttttatggtgatattcgtgatggtgcgcataaagtcgctgcgttaggtcatcaa
tttgtccttaatcataaacttaatgacaattggcacttactttcaggcttcgcgtatcgt
gactcgtcgtttaaagggttatcgtctgatactgagttatctagcggtcgccagttagtg
tataccgacccaaataccttatctcgccagcgccgtgagcgcgattatcaagcgcttgat
atgaatgcacgttttgaactaagtggtgaactggcaacgggaactattaaacataacctg
ctagtgggtatggattactataactttgagttggatacagattataaagtgtggcgcaca
gcgtggggctcaggtgatactacttactcaattaatccaaacaaccctgactatacacag
cctcagccagaaccattggctaaaacgctaactgcagaagagcaaaaaggacttggcctg
tacgcacagaacctaatggctttaacagaaaagtcaaagttattacttggtgtgcgagtt
gataaattagaccaagaaattttaaataaacgcagtgactcagtgcaaacgcgcaatcaa
actgagttttcacctcgccttggttacatttacgatattaatgaaaatgtgaatgtattt
accaattatgctgaaggatttagacctaacccaggactcgattcagataggaacgcattc
gagccggaagaaaccaaatcattagaagttggtgcaaaatggcacaatgttgcaaatcgc
ttttcgggcaatattgccgtatttactgctgaaaaaaccaatatgctaacggcagagcca
gatactgggttatcagcaacgttaggtgaagttgaaagccaaggtattgaatttaattta
attactgaactcacgaacaataccaatttagagctggcatatgcatataccgatgcaaaa
actgcaaatgatgtgattaactctgactggggggtgcccattccaaaaggctcacgttta
atcaatattgctgagcatgttgggcatgtatcgttaaggcatttcacgcagataatgggt
aaagacagctatgtgggtgcgacagttaattatgtgggcgaccgtttaggtgagacgact
gatcctgactacattttacctgcatatacccttgtgaatgtgtccgctgccattgatttg
agcacgcaacttacgcttaagttagatgtaaataatgttttcaacgaagcgtattttgaa
aactcataccacaaactttggactatgccgggctctccaatcaattacagtgcgagctta
aaataccaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system