Pseudoalteromonas piratica: OM33_19960
Help
Entry
OM33_19960 CDS
T03513
Name
(GenBank) ligand-gated channel protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pseo
Pseudoalteromonas piratica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pseo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pseo02000
]
OM33_19960
Transporters [BR:
pseo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
OM33_19960
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIY67318
UniProt:
A0A0A7ELA1
LinkDB
All DBs
Position
2:1176350..1178473
Genome browser
AA seq
707 aa
AA seq
DB search
MIKTSLTLTALFVSTAVLADSPAPAQQAKDMERIIVTGSRVEERIDEVTASVVIVDQQAL
LRNMEVTNELQSILAIQVPGMGPNTGTNSSSGQNLRGRSALVLIDGLPQSTPLRNGRLAI
RSLDPSVIERVEVIKGATSIYGNGAAGGIINYITKSADSKDGFNGKLNLATNFSATDFED
SLGKRADVTIDGRSNKLSFVANVAFEDNGIIKDADGDALGLLYGMSGFESKNAFTKLAYD
LTDQSALSLTYNYFEGQQEADYISTNKNVNLGEKSYATKNTTGEKAPGDPQGPRGNHNLK
LQYEHADIFTDTLFTGDVYWQKLENVFFYSTKFRDPALGLAGGQSMIESEKTGVRANFNT
TFDFDNTAASFTYGVDLLNDTTAQSLVDGRAWTPKMDMDNAALYLQSKFVINDDWVVKAG
LRHEEIDVAVEDFKTLMVCRKTCSDVIDVEGGNIEYSATTYNIGLRFNAIDAFMPFISYS
EGFDVTDLGRTLRTADTPSVKKIDTDASIIKNYEIGFDGNSGIFNYQFATFISQSDIGTS
LVEDPATGKYESVRSPQEIYGFEAALEAQATDNIKLGVNYSWLEGKNTDTDEYLNGSTIN
PPKLAGYADISLSDDWQMSVTLMHVGSRDRFEKVGDVYTGTNGPVSSYQVVNLSTSYQIN
QAFKVYGGVENLLNQDYYPARSQSYTGNGYNVKGKGATVNIGMNYFF
NT seq
2124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaacgtccctcactttaaccgctctttttgtttcaaccgcagtgttagccgat
agccccgcccccgcacaacaagccaaagatatggagcgcattattgttactggtagtcgt
gttgaagagcgtattgatgaagtgaccgcatcggttgtgattgttgaccaacaagcacta
ctccgtaatatggaagtcactaatgaactgcaaagtattttagctattcaagtgccgggc
atgggtccaaacacgggcacaaacagtagttctggtcaaaacttgcgtggccgtagtgcc
ttggtgttgattgatggtttgcctcaatcaacgccacttagaaacggacgtttagcgatt
cgttcattagatccaagtgtgattgaacgggtagaagtgataaaaggtgccacctcaatt
tatggtaatggtgctgcgggtggtattatcaactacatcaccaaaagtgccgacagcaaa
gacggttttaacggtaaactcaatcttgctactaatttttcagccactgattttgaggac
agccttggcaagcgtgcagatgttactattgatggacgcagtaacaaactcagctttgtt
gccaacgtggcgtttgaagataacggaataattaaagatgctgacggtgatgcacttgga
cttctctatggcatgtctggctttgaatctaagaatgcatttaccaaactagcctatgat
ttaaccgaccaaagtgccctatcactgacatacaactattttgaaggccaacaagaagcc
gattacatcagtactaataaaaacgttaatttgggtgaaaaaagttacgccactaagaac
accacaggtgagaaagcaccgggcgatccgcaaggcccccgtggcaaccataatttaaaa
ctacaatacgaacatgccgatatctttaccgatacgctattcactggtgacgtgtattgg
caaaaacttgaaaacgtatttttctacagcaccaaattccgtgatcctgcccttggcctt
gccggcggacaatcgatgatcgagtcagagaaaaccggtgttcgtgccaactttaacacc
acctttgattttgataatactgccgcaagctttacctatggcgttgatttactgaatgat
actacggcccaatcactcgtggatggccgcgcttggacacccaaaatggacatggacaac
gccgcgctctatctacagtctaagtttgtgattaatgacgattgggtagttaaagcaggc
cttcgccatgaagaaatagatgttgccgttgaagattttaaaaccttaatggtatgccgt
aaaacctgtagtgatgtgattgatgtggaaggtggcaatattgaatacagtgcgacaacc
tacaatattggcctgcgtttcaacgccattgacgcatttatgccatttattagttactca
gagggctttgatgtcaccgatttaggccgcacattgcgtactgctgatacgccaagcgtt
aaaaaaattgatacggacgcgtcaattattaaaaactatgaaattggttttgatggcaac
tcaggtattttcaactaccaatttgcaacctttattagccaatctgatatcggcaccagc
ctagttgaagacccagcaacaggtaaatacgaaagcgtacgatctcctcaagaaatttat
ggctttgaagcagcattagaagcacaagcaacagacaacattaaactgggtgttaactac
agttggttagaaggtaaaaacaccgataccgacgagtacctaaacggcagtaccattaac
ccacccaaactagcaggttatgccgatatttcgttaagtgacgattggcaaatgtcagtt
accctaatgcatgttggcagtcgtgaccgctttgagaaagtaggtgatgtttacaccggt
acaaatggccctgtcagtagctatcaagttgttaacttgagtacttcttatcaaattaac
caagcctttaaagtgtatggcggtgttgaaaacttgcttaaccaagattactacccagct
cgctcacaaagctatactggcaacggttacaatgtaaaaggcaaaggcgcaaccgttaat
attggtatgaattacttcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system