Pseudoalteromonas piratica: OM33_21280
Help
Entry
OM33_21280 CDS
T03513
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
pseo
Pseudoalteromonas piratica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIY67543
UniProt:
A0A0A7ELW7
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1496191..1499148)
Genome browser
AA seq
985 aa
AA seq
DB search
MKTKSYKKSQVAMLVAGLLGTSLATPIHAEQEDLTASTEKDVEVIEVKGIRGSLIRAMDI
KREAFGVMDAISAEEMGKFPDTNLAESLQRITGVSVSRANGEGSEITVRGFGPSFNLVTL
NGRQMPGTGNSRSYKLENLAAEGVSTLEVYKTARAEKPTGGLGATVNIVTAKPFQRPGQQ
ASATVKGIYDTSNEKGDDVTPEVSGIYSNTFFDDRFGFGVSFSRQERDFQRQEANIQGWQ
ANVDLPTLEEGTFVDPRAIDGDGNRIGNHFFPKDMNYSIADVERERTNAQVTFQYEPIDG
LVATLDYTYTNAITATEVAGWGIWNEFGGNINSYELDENGTAVFADISGNDGSFTASKDT
TEVDSQSIGLNLVWQINDDWKVELDYHDSSNETDNGKDKGLGSSGQVILGSDQLVNKIYD
YRTGEIPHAMINWRNGSNELMPGEIDSNFSQFIHSPGKSEIEQLQLHTTWYNDAFDIPLV
TVKFGGTFTDQTMSGSNAWSGLRGGPGFNPSFTEIFPDSMFTRHDTSDLLDAFSGGGSDL
NPHYYYSYDFDEAVARQLAFLTEDIMGGDVYSIDPYFDGIDGEGAVTEETMAFYLQTDWE
FTIADYDAQLIVGVRYEDTDVTSNVRQRVEKQVNWESASEWIMQYEAGGTDNFLEQTGGY
DIWLPMMDLRVDLTDDLVTRFSWGKTMSRAPLGNLAGVRMLSGSPKPGARTGSQGNTSLL
PFESTNLDLSLEYYYAEGSYASVGYFKKDVDNFIQTTITETTIDGLNDIYNGPRYLQAIA
DIEARGEQATSTAIFEQMLANGHGNADGKIEPAAGDPLIVWNISQPTNTDSKSVDGIELA
VQHLIGDTGFGLGVNATFVDGDVEFDVNSLVQQAPLTGLSDSANFQAFYEKDGLSVKLTY
AWRDAYLIGVGQAQGSSDAPPQFAKEYGQIDVSVNYDINENFTVFLDGINLNNETEQGYG
RYEEQFLFARQYGPRYIFGMRYSFN
NT seq
2958 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaaagctataaaaaaagccaagtagcaatgttagtggctggcttattaggt
acaagtcttgcgacgccaatacatgcagagcaagaggacttgacagcaagtactgaaaaa
gacgtcgaagtaattgaagtaaaagggattagagggagtctgatccgcgctatggatatc
aaacgcgaagcatttggtgtgatggatgcgatcagcgctgaggaaatgggtaaatttcct
gatactaaccttgcggaatcgctacaacgtataaccggtgtatcggtaagccgtgccaac
ggtgagggcagtgaaataacagtacgcggatttgggccaagttttaacttagtgacactc
aatggccgacaaatgcctggtacgggtaattcgcgctcatataaacttgaaaacctcgcg
gcggaaggggtgagcactctcgaagtgtataaaacagcgcgcgctgaaaaaccaacaggt
ggtttaggtgcaacggtaaacattgtaactgcaaaaccatttcaacgccctggacagcaa
gccagtgcaaccgtcaaaggtatttacgatacttcgaatgaaaaaggggatgatgttact
cctgaagtttcaggtatttacagtaatacattcttcgatgaccgatttggctttggagta
tcattctctcgtcaagagcgcgattttcaacgccaagaagcgaatattcaaggttggcaa
gcaaatgtggatttaccaaccttagaagaaggtacatttgttgacccaagagcaatcgat
ggcgatggtaaccgcattggtaatcatttctttcctaaagacatgaactatagcattgct
gacgttgagcgtgagcgtaccaatgcacaagtcaccttccaatacgagccaattgatggc
cttgttgcgacgcttgattacacttataccaatgcaattacggcaactgaagtggctggt
tggggtatttggaatgaatttggtggcaatatcaatagctatgaactagacgaaaatggc
accgctgttttcgctgacattagcggcaatgatggttcctttactgcgagcaaagacaca
acagaagtggattcgcagtcaatcggtttgaatcttgtttggcaaataaacgatgattgg
aaagtggaacttgattaccacgattcaagtaatgagactgacaacggcaaagataaaggc
cttggcagttccggtcaggttattttaggttctgatcagctggttaataagatttatgat
tatcgtacgggagagatcccgcatgcgatgattaattggcgtaatggttcaaacgagctt
atgccaggtgaaattgattctaactttagccagttcattcactctccgggcaaatctgaa
attgaacaattgcaactacataccacttggtataacgacgcgtttgatatcccgttagtg
acggttaaatttggcggtacattcacggatcaaaccatgagtggttcgaatgcatggagt
ggtctgcgtggtggccctggttttaatccgtcatttactgagattttcccagatagcatg
tttacgcgtcatgataccagtgacttactggatgcgtttagcggtggtgggagcgactta
aaccctcattattactatagctacgactttgatgaggctgtagcccgccaattagctttt
ctaacagaagatattatggggggcgatgtttactctattgacccttacttcgatggtatt
gatggcgaaggtgctgttactgaagagaccatggcattttaccttcaaactgattgggaa
tttacgattgccgactacgacgcgcaactaattgtaggcgtacgttatgaagatactgac
gttactagtaatgttcgccagagggtcgaaaaacaggtcaactgggaaagtgcgtctgag
tggattatgcaatatgaagcgggcggcacggataacttcctggagcaaacaggaggctat
gatatctggctgccaatgatggatctacgcgtcgacttaactgatgatctcgtaacccgt
ttctcatggggtaaaaccatgtctcgtgcaccgcttggcaacttagcgggcgttcgtatg
ctaagtggcagtccaaaacctggcgctcgaactggctcgcaaggtaatacaagtctgttg
ccgtttgaatcgaccaatttagacttatcacttgagtactattacgccgagggaagttat
gcatcggttgggtactttaaaaaagacgttgataactttattcaaaccaccatcactgaa
acaaccatcgatggcctaaacgatatttataatggcccacgttatttgcaagccattgcg
gatattgaggcgcgtggtgaacaagcgacaagtacggctatttttgaacagatgttagcg
aatgggcacggaaatgctgacggtaaaattgagccagcagcaggtgatcctctgattgtt
tggaatattagccagccaacaaatacggacagtaaatctgtcgatggtattgagcttgcc
gttcaacacttaattggtgacaccggctttggcctaggtgtgaatgccacatttgtggat
ggtgatgttgaatttgatgtgaacagtttagtacaacaagcaccacttacaggcttgagt
gattcggcaaactttcaagcgttttatgaaaaagatggtctgtctgtaaaacttacctat
gcgtggcgtgacgcttacttaattggtgttggccaggctcaaggctcgtcagatgcgcca
ccgcaatttgccaaagaatacggccaaattgacgttagtgttaattacgatattaacgag
aactttacagtgttcctagatggcattaatttgaataacgaaaccgagcaaggttatggt
cgttacgaagagcaatttttatttgctcgtcagtatggtccacgttatatctttggtatg
cgttactcgtttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
