Pseudanabaena sp. ABRG5-3: ABRG53_0879
Help
Entry
ABRG53_0879 CDS
T05820
Name
(GenBank) type I secretion target GGXGXDXXX repeat protein domain protein
Organism
pser
Pseudanabaena sp. ABRG5-3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBC23136
UniProt:
A0A2Z5WVE0
LinkDB
All DBs
Position
complement(980245..986574)
Genome browser
AA seq
2109 aa
AA seq
DB search
MLTSLFADLSPTLAMPIVASLTDAIASVYGFLTEFAKREDFFDKSKFVFGETLDRNVLSA
LREQWVSGDFSKLPDLKLLSASDLQGANAAFAGSTGEIYLSESFLSQYVGNPQVLAAVLL
EEVGHSVDWQVNAVDTVGDEGELFSAVLRGVDLSAGQVQQMKQENDSVVFNFGGSLIQGE
KSDVVYSSNNPLTATDITKLYVFGSIDPSSPDYTSHIQGNNSTAETIKYALPATIKYDMS
DYMDKGAGRYAYPSLFGAVSEFFQYDFFLPVGTYNYTTKGTKITSGSGLDFLLDEEDFKV
SISQYGTDIVSSDHADRSYIFGSTGFAITSITFKVDGILGIETNRWIEKMTIKPLSDGFD
FNSDNAVADVFNSTLKSLVDPYNLSRGEVEILFDGDNGKTYNNYNGFSFTADTFKQWNVS
INGKITDRLKDLDGIAKLSLFGGISYLNNIVSDKFLSYERDGLNASHERDGTLNVIYGVD
GGDNLDRFDFAVQKIDPNVTIDLVGISPSALLDKSLPSDARYLIVGGNGDDTINGYLFDD
ELQGGNGVDHLYGGEGNDTLYGGLDRGNAEGDYLYGQAGSDRLFGEAGNDYLDGGTEDNS
KDYLYGGEGDDILYGWGGDDDLRGEDGSDILWGGTGEDFLYGGYDIDGTSTSFRDPDDWA
DRNQLYGQNDSDRLFGEEGNNYLDGGNEDNAKDYLYGGKGNDVLHGWGGDDYIDGEAGID
TVQYIESPNGVVVNIDESRNYSDEKATRQIFSVDARNPIGYYADLSPSFSIDAGKAKDGF
GFIDTVKNVENIDASSHDDVLIGNAADNVIKGFGGDDFLIGNAGNDTLDGGQGINTVSYR
LDPSGATVNLLTGKAVDGWGNTDTLIGISNVIGSDSKEVGDNITGNQGTNQITGGFGNDR
IDGQGGDDWLYGEFGNDTIIGGLGVDHIFGNQGVDTIWGDSEGVGGEGYRDQIFAGSDDI
IKGGDGDDIIRAGGGNDYVRGDSGYGNDQIWGDSGDDTIEGGAGEDRISGGTGDDDIFGQ
GENDTIFGDSGIDEISGGLGDDGISGGSDNDIIFGDEGDDSITGDSGADTIYGNIGNDKI
SGGTENDLISGGDNNDIITGDAGDDKIFGDNGADNIQGNTGNDTISGGDDNDLISGGDDN
DTITGDSGDDNISGDAGDDNIQGNTGNDTIFGNTGNDLISGGDDNDTIQGNEGDDQIFGD
NGDDQIQGNTGADTIFGGAGNDNIQGNEDNDTITGDAGNDYIIGDAGDDNIQGSSGDDTI
FGNIGNDIIRGGDDNDTIQGNEGADQIFGDNGNDFIQGNEGDDIISGGNDNDRIEGNQGN
DQIFGDAGDDTIAGNDGSDRILGGSGNDTITGDAGNDLINGNDGADLINGNDGDDTIFGD
AGNDNIYGDAGNDNISGGNDNDNIFGGNGNDNIQGDAGDDTILGGDGNDTIQGNDGNDTI
FGENGQDLITGNGGDDVISGGNDNDIIFGDDGNDTIAGDNGDDNVFGGNGNDTIQGNEGN
DKLYGDAGNDLMEGNNGDDFLAGGDGNDTMKGGDGEDFLNGQTGNDLIYGDAGNDILYGE
AGDDKIYGGDGDDYMIGGEGGDILDGGAGNDTISYYTSATGVRILLQSGQSFGGDAEGDR
IYGTENVEGSNFDDQISGDNGDNKLIGLAGDDRLEGKVGKDSLYGGKGNDFLDGGEDNDI
LLGGEGNDNLDGSSGDDIIGGGAGDDIVFGGRSGDDILSGGDGNDTIDGSAGNDLIFGGN
GNDSIDAGSHNDLVDGGAGDDIIYAGTGDDVILGGAGNDIIYGDTGNDILVGGLGNDILY
GSKGNGQGYNTFVLSLNSGTDTIFSFQSTQDVIGLFGGLSANQITWTKSAQDTILSAQGQ
TLAILKGVQFGAKQTPIFSLINSLPAALDPVPALKEPTLPPAIGGSDIFPGTGYQTPTPT
LPTLGITLTDTSGVNGSGDSILDGTSGNDFLFGFAGNDRLNGNDGDDLLVGGLGQDMLVG
GNGADTFRFDSFSDSLASAADQISGFNQAEGDRFQFLFNPASVFNAGDINGVSLAVAASN
AYQNKDRTGGSLNANEAVFFNWNNTTYLGVNDNNASFDANNDAIVQVSQMAFAANDTQLG
VLNAAKYFV
NT seq
6330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgacttcactttttgctgatctgtcccctactttggctatgcctattgtcgcttca
ttgacagatgcgatcgcatctgtgtatggctttttgacagagtttgcgaagcgggaggac
ttttttgataagagtaagttcgtgtttggtgaaacattggatcgcaatgtgttgagtgct
ttgcgggagcagtgggtgagtggtgatttctcgaagttgcctgatttgaagttgttgtct
gcttcggatttacaaggggctaatgctgcctttgctggttcgacaggggagatctatcta
tctgagagtttcttgtctcaatatgtgggtaatccacaggtgttggcagcggtgttgttg
gaggaggttgggcattcggtggattggcaggtgaatgctgtggatacggttggggatgag
ggggagttgttttcggcggtgttgcgtggggtggatttgagtgctggtcaggtgcagcag
atgaagcaggagaatgattctgtcgttttcaattttggtggaagtttgattcaaggagaa
aaatcagacgtagtttactcttccaataatcctctaactgctacagatattactaagctt
tatgtattcggatcgattgatccatcttcacctgattatacttcgcatattcaagggaac
aattctacagcagaaaccattaagtatgctcttccagcaaccattaagtatgatatgtct
gactacatggataagggtgctggacgatatgcttatccatcattatttggggctgtttca
gaattctttcaatatgatttctttctcccagttgggacttacaattacaccaccaaggga
acaaagataactagcggtagtggacttgatttcttgttggatgaagaagatttcaaagtt
agtatttctcaatatggtactgatattgttagttctgatcatgcagatcgttcttacata
tttggctcgacaggttttgcaattacttccatcacatttaaggtggatgggatcttgggg
attgaaacaaatagatggattgaaaaaatgactatcaagcctttgtctgatggttttgat
ttcaattcagataatgctgttgctgatgtctttaactctacactcaaatctctggtagat
ccttataatctgagtcggggtgaagtagagatactttttgatggcgataatggaaaaact
tacaataattataacggttttagctttactgcggatacttttaaacagtggaatgtaagt
atcaacggtaaaattactgacagactcaaagatcttgatgggatagcaaaactttctttg
tttggagggatatcgtacctcaataatattgtatcagataaattcttgtcatacgaacga
gatggattaaatgcctcacacgaacgagatgggacattaaatgtaatttatggcgttgat
ggtggagacaatcttgatagatttgactttgcagtgcagaaaatagatcctaacgttacg
atagaccttgttggaatcagcccctctgcgttactcgataagtctcttccctctgatgct
agatatcttattgttggtggtaatggtgacgatacaatcaatggatatctatttgatgat
gaattgcaaggtggaaacggtgtagatcatctttatgggggtgaaggaaacgatacactt
tacggaggcttagatcgtgggaatgcagaaggtgactatttgtatggtcaagctggcagt
gatcgtttatttggagaagctggtaacgactatctagatggtggtacagaggataattct
aaagactatctttacggtggagagggtgatgatattctctacggttggggtggagatgat
gatcttcgaggtgaagatggcagtgatattctttggggtggtactggggaagacttcctt
tatggtggctatgacatagatggtacatctacatcatttcgagatcccgatgattgggcg
gatcgcaaccagttatatggtcaaaacgattcagatcgtttgtttggagaagagggaaat
aattacctagatggtggaaatgaagataatgcaaaagattatctttatggaggtaaaggt
aatgatgttcttcatggctggggtggagatgactacattgatggagaagcaggaattgat
actgttcaatatattgaatcgccaaacggtgttgttgtaaacattgatgaatccagaaat
tattcagatgagaaagcaacaagacaaatattttccgttgatgcaagaaatccgattgga
tattatgctgatctctctccctcattttctattgatgcaggaaaagccaaagatggattt
gggtttattgatacagtaaaaaatgtcgaaaatattgatgcaagttctcatgatgatgtt
ctgattggaaatgctgctgacaatgtgattaaaggttttggtggtgatgactttttaatt
ggaaatgctggcaacgatacacttgatggtggacaaggtattaacactgttagttatcgt
cttgatccttcaggcgcaactgtcaatttattaacaggtaaagctgttgatggctgggga
aatacagatactcttattgggatatccaatgtaattggctctgattccaaagaagttggc
gacaacattacaggaaatcaaggaactaatcaaattacaggcggttttggaaatgaccga
attgatggacagggtggagatgattggttatatggagagtttggtaatgatacgatcatt
ggtggtttaggcgtagatcacatcttcggaaatcaaggtgtagacacaatttggggtgac
agtgaaggtgttggaggtgaaggctatagagatcaaatctttgcgggatctgatgacatt
attaaaggtggagatggagacgacattattcgcgcaggtggagggaatgattatgttaga
ggagatagcggctacggtaacgatcaaatttggggcgactctggtgatgacaccatagaa
ggtggtgcaggagaagaccgaatcagtggtggtactggtgatgatgacatttttggtcaa
ggagagaacgatacgatctttggcgatagtggcattgacgaaatctctggtggcttagga
gatgatggtattagtggtggttctgataatgacataattttcggtgatgaaggcgatgac
agcattacaggagattcaggggctgacaccatctacggaaacattggcaatgataaaatt
tctggcggtactgaaaacgacctaatctctggtggtgacaacaacgacatcattactggt
gacgcaggtgatgacaaaatcttcggtgataacggtgctgacaacattcaaggcaatact
ggcaatgacaccatcagtggcggtgacgacaacgacctaatttctggcggtgacgacaac
gacactattactggtgactcaggagatgacaacatctcaggtgatgctggtgatgacaac
attcaaggcaacactggcaatgacaccatctttggcaacactggcaatgacctaatctct
ggtggtgacgacaacgacaccatccaaggtaacgaaggtgatgaccagatctttggtgat
aatggcgacgaccaaatccaagggaatacaggagcagataccatctttggaggtgctggt
aacgacaacatccaaggcaacgaagataacgacaccattacaggtgatgcaggtaatgac
tacatcataggcgatgcaggtgacgacaatatccaaggcagctcaggtgatgacaccatc
ttcggtaatatcggcaacgacataattcgtggtggtgatgacaacgacaccatccaaggt
aacgaaggcgctgaccagatctttggtgacaatggtaacgacttcattcaaggcaacgaa
ggtgatgacatcattagcggcggtaacgacaacgatcgcatcgaaggcaaccaaggcaac
gaccaaatcttcggcgatgcaggtgatgacacgatcgcaggtaatgacggcagcgatcgc
attttaggcggtagtggcaacgacaccatcacaggcgacgcaggcaacgacctgatcaat
ggcaatgacggcgcagacctgatcaatggcaacgatggcgatgacaccatctttggcgat
gcaggcaacgacaatatttatggcgacgcaggcaacgacaacatcagcggtggtaacgac
aacgacaacatctttggtggtaatggcaacgacaatatccaaggtgatgcaggcgatgac
accattcttggcggtgatggcaacgacacgatccaaggcaacgatggcaacgacactatc
tttggtgaaaacggacaagacctaattacaggcaatggcggcgacgatgtcatcagtggc
ggcaacgataacgacatcatctttggtgatgacggtaacgacacgatcgcaggcgataac
ggcgatgacaacgttttcggcggtaatggcaacgacactatccaaggtaacgaaggcaac
gacaaactctatggcgatgctggtaatgacctcatggaaggtaacaacggcgatgacttc
ctcgcaggtggtgatggcaacgacaccatgaaaggtggtgatggtgaggacttcctcaac
ggtcagacaggcaatgacctaatctatggcgatgctggtaacgacatcctctatggcgaa
gcaggagacgacaaaatctatggtggtgatggagatgactacatgatcggcggtgaagga
ggtgacatccttgacggcggcgcaggtaatgacaccatctcctactacacatcagccaca
ggagtaaggattttgttgcaatcagggcaatcctttggtggtgatgctgaaggcgatcgc
atttatggcacagaaaacgtcgaaggctccaactttgatgatcaaatcagtggtgacaat
ggcgataacaaactgattggcttagcaggtgacgacagactcgaaggtaaagtcggcaaa
gattccctctacggtggtaaaggtaatgacttccttgatggtggagaagataacgacatt
ctgctgggtggtgaaggcaacgataatctagatggcagttctggcgatgacatcatcggc
ggtggtgcaggtgatgatattgtcttcggtgggcgatcgggcgatgacatcctctctggt
ggtgatggtaacgacaccatcgatggcagtgctggtaatgacctaatttttggcggcaac
ggcaacgatagcattgacgcaggttcccataatgacctcgtagatggcggtgctggtgac
gacatcatttatgcaggtacgggcgatgatgtgatcctcggtggtgctggcaatgacatt
atctatggtgatactggcaacgatatattggtcggtggtttaggtaacgatattctctat
ggcagtaaaggaaatggtcagggatataacacctttgttctctcacttaatagtggtact
gacacaatttttagcttccaatcaacccaagatgtcattggcttattcggtggactaagc
gccaaccaaatcacttggacaaaatcggctcaagataccatccttagcgctcaaggacaa
acattagccattctcaagggagtgcaatttggagctaagcaaacgccaatcttctcattg
attaattctttacctgctgccctcgatcctgtaccagccctcaaagagccaactctccct
cctgctatcggtggtagtgacattttcccaggtacaggctatcaaactcctacgcctacc
ttgcccacactagggattacgctgactgatacatcaggcgtgaatggtagtggcgattcc
attctcgatggtacgagtggcaatgactttctattcgggttcgctggcaacgatcgcctc
aatggtaacgatggtgatgacttgctagttggtggtctaggtcaagacatgttagtcgga
ggcaacggggcggataccttccgtttcgatagcttctctgattctctagcgagtgctgcc
gatcaaatctcaggcttcaaccaagctgaaggcgatcgcttccaattcctgtttaatcca
gctagcgttttcaatgctggtgatatcaatggagttagtctagcggttgccgccagcaat
gcttatcaaaacaaagatcgcacaggtggtagtttgaatgctaacgaagctgtgttcttc
aattggaataacactacttacttgggagtaaacgataataacgctagttttgatgctaat
aacgatgcgattgttcaagtttcacaaatggcttttgcggctaatgatactcaacttggt
gtactcaatgctgctaaatattttgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system