KEGG   Pseudanabaena sp. ABRG5-3: ABRG53_2830
Entry
ABRG53_2830       CDS       T05820                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K09800  translocation and assembly module TamB
Organism
pser  Pseudanabaena sp. ABRG5-3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pser00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pser02000]
    ABRG53_2830
Transporters [BR:pser02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   ABRG53_2830
SSDB
Motif
Pfam: TamB APC_15aa
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBC25087
LinkDB
Position
3142001..3147118
AA seq 1705 aa
MGQAQLPPQEPANSTLARNLGRVGVGLAIALTASSLGAFWYGRYFLNERLSPLLEVELTK
ALKRPLQLGKVERVGMSSIRFGKSIVPPTDKESNFLAVEAIEVKVDPWSYLTRRQIGLDA
IVEQPQVFLKQDVTGLLQLPKITPPERPTQEGFIDLRTITFTDAQLTIQSIAKGELISLS
QVQIDSNWKIVDLNNQSVQMNGKGHVTLPNLAAIATPPNPEQLKKAIETANAEKDGSKGS
VSFAVDWDLTKGQGTVDIQSPNLQIAAVQGFAVNSPIEIQQGLLDFEAKVAIVAGKEAPN
VSITAQLSEGSIKAPQLAKSITEIGGKVSFDGATATLTEFSAQYGLLKGIVSGTFNQQKG
FNLDFSTAALDLAKGIESFGVKTPVAITGDVKVGGKLTGTLQKPSLILNITTPKNVSFDR
IKVDRFLATIELKDLNTVLIKKVQAASTGATLTGEGQIKLPQKDKPAEILFNSSLVGVAE
EFTNLYGAKLPVAIGQVTSSLQITGNLNNPQVLAQIEAPNATYPARGEVFVDDGLATIRN
TRVRFPIGEIGLAGTYNIASGAWKTQLNSNGIPLAAFIPNQKGILQGLINLRSDRGSFSL
ADIIGDASIQLPQGLTELPDAIAANLTWDGKNLLIPSLQVGNYLTANGKVDLAFPNNSPN
QLPTGIAGINLDMISRNVSISRLASLSSAISPQASGLLNFRGNLSGAIDQLKIAGALQLD
DVNLASLGSGLAKQGLVAPSRGSLNFNGSVNGYLTDPRLVGNLRIAALKVNQVELDSLNF
NGVLDGISQVPQATGDLLLAGLRVDKLAFDPRLEGKVNFNANQGVNVDLRGNRDRIAARL
DPSFRPIDFTVNLGEATARGRRLDNNPNRLQVAVANLPLPLIASFTGQNDVSGKISSNLI
VDFSSNPSANGEITVERPRFGRFIAERAVAKVAYADGVFAVRDGNLSVRQGESTNEYKFS
LTYNPALEDPLAGVVEIAQGRMQDVFATLQWANVVDATQVFSLTKTRAADLQPLEAIKLL
GEPLYKQLQYLTQIELRQEQQETVNSSRNFNLPPLTEFRGDIKGKVTFGFNKSRGIRLGF
DLVGKKFEYGKFAVDDIKVVGRYFNGVFAITNANFQSDKSYGKITKARLRLAPASNPLLR
VREQSGEIELKDFPIESLRPLPFFSAIPVDLTGKINGNLSITGTNLFDTKVVGKLSLTDG
TVNRQPIEFIAVQFNYDKLNVNFNANMKTSGKEAVVASGNVGVFGNFNVKLNVKNEGIAF
INIFNQPVRWVDGQGNINLTASGTFKDPKIAGKITVDNAKVKIAGLPGDFTEVQGDIAFT
SDRLISNITSNFSEGKLALKGILPISNPNLLKPDTPEYQQALAINADKLKLNIRDISSDN
FNSRVIILGSLLTPKITGEVLLGDGRVVIGNDADPNSAANASANSDVPDVAFDRLAVKLQ
NMQVTRFPIFNFLGEGTLIVNGTLQRPEPEGRVKITRGQFNAISARFRLDRSYENFVDFK
PSQGLNPSLNVRVSGAVAEVTRVPINSNRPNDLFSPNEVPVSNLGAQRTLQVQASVTGTA
LAPDIRLSSSPPRSQAEIIALIGGGVLQKQGASDPAAALANFAGSTVLNFLQDAIGDALN
LAEFNLSPVTTNTSGSSRTGTLGLSAEAVINVSNSFSVALQRIINDSTQPTNFSVRYRVD
PNILLRGNYGSDGNKGISIEYENRF
NT seq 5118 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgggacaggctcaactaccaccgcaggaaccagccaactctacactcgccagaaacctt
gggcgtgtaggtgttggactagcgatcgcattaacggcaagcagcttaggagctttttgg
tatggacgctattttctcaatgagcgcctatcacctttattagaggtggagttaaccaaa
gccctcaaacgtcctttacagcttggcaaagtcgagcgagtgggcatgtccagcatcagg
tttggtaagtcgatagtaccgccaaccgataaagagtccaatttcctagccgttgaagcc
attgaagttaaggttgatccttggagctatctcacccgtcgccaaattggcttagatgcg
atcgttgaacagccacaagtatttctgaagcaggacgttacagggcttctgcaattaccg
aaaatcacgccgcccgaacgccccacccaagagggctttattgatttacggacaattacc
tttaccgatgctcagttaacaatccaatcgatcgctaaaggcgaattgatttccctcagt
caagtccagatcgatagcaattggaaaattgtcgatctcaataatcaaagtgtacaaatg
aacggtaaaggtcatgtgaccttaccaaatcttgccgcgatcgctacgccaccgaatcct
gaacaattgaaaaaggcgatcgaaactgctaacgcagaaaaggatggcagtaaagggagt
gtttcttttgccgttgattgggacttaaccaaaggacaaggtacagttgatatccaatct
ccaaatctgcaaatcgccgcagtccaaggatttgccgtaaattcgcccattgaaatccag
caaggattgcttgactttgaggcgaaagttgccatagttgcgggcaaagaagctcctaat
gtatccataacagctcagctcagtgaagggtctattaaagctccacaattagccaaatca
attaccgaaatcggtggcaaagttagctttgatggcgcaactgctactttaacggagttt
tctgctcaatatgggttactaaagggaatcgttagtggcacttttaatcaacaaaagggc
tttaatctcgatttttctacggcggcgttggatttagctaaaggcattgagagctttggt
gtcaaaacgcctgtagcgatcacaggggatgttaaggttggtggcaaactgacgggaact
ctgcaaaaaccttccctaatcttaaatatcactacacctaaaaacgttagcttcgatcgc
ataaaagtcgatcgctttcttgccacgattgaactgaaggatctaaatacagtactgatc
aagaaagttcaagcggcttccacaggcgcaaccttgacaggcgaaggacaaattaaactg
ccacaaaaagataaacctgcggaaattttatttaattctagtttggttggtgttgccgaa
gaatttacaaatctctatggggcaaagctgccagtagccatcggacaagtgaccagttct
ttacaaattactggcaatctcaataaccctcaagttctcgcccagattgaagctcccaat
gcaacctacccagcccgtggcgaagtatttgtcgatgatggcttagccacgattcgtaat
actagagttcgctttcccattggggagatagggctagcaggtacttataacatcgccagt
ggcgcatggaaaacacagctaaatagtaatggcattcccctagccgctttcatccccaat
caaaaagggattctccaaggtttaattaatctacgaagcgatcgcggtagtttttccttg
gctgatatcattggcgatgcttcgatccagctaccacagggactcacggagcttcccgat
gcgatcgccgccaatctcacatgggatggcaaaaatctgctaatcccttccttgcaagtt
ggcaattatttaaccgcaaatggaaaagttgatcttgctttccctaataattcacccaat
caactacccacaggaattgcagggattaatcttgacatgatttcccgcaatgtcagtatt
agtcgcctagcatctctctctagtgccatatctccgcaggcatcgggactgttgaacttt
cgcggcaatctatcgggggcgatcgatcagctcaaaattgcaggagcattacaactagat
gatgttaatctagcttctcttggttcagggttagccaaacaaggattagttgcaccatct
agaggatctctcaattttaatggttccgttaatggctatttgaccgatccccgactagtt
ggcaatttgcgaatagcggctctcaaggtcaatcaagtggaacttgatagcctcaacttt
aatggtgttctcgacggaattagtcaggttccccaagccactggcgatctcctcctagca
ggcttgagagtagataagctcgccttcgatccccgtttagaaggcaaagttaactttaat
gctaatcaaggcgtaaatgttgatctgcgaggaaatcgcgatcgcattgccgcaagactc
gacccctcttttcgccccattgacttcactgtgaatttaggtgaagccacggcccgtggt
cggcgattagataacaaccccaatcgcttacaagtagctgttgccaatttacccctcccc
ctcattgcctcctttacaggtcaaaatgatgtgagtggcaagatttcgagcaatctcatc
gtagattttagtagtaatcccagtgccaatggcgaaattacagtggaacgtcccagattc
gggcgttttatcgcagagcgagccgtagccaaagtagcctacgccgatggggtatttgcg
gtgcgtgacggtaatttgagtgtacggcaaggtgaatccacgaatgaatacaagttcagt
ttgacctacaatcccgcccttgaagatccgcttgctggggttgttgaaatcgcgcaaggg
agaatgcaggatgtatttgcgactctgcaatgggcaaacgtcgttgatgccactcaggta
tttagtttgacgaaaaccagagccgcagatttacaacctctagaagccattaagctctta
ggtgaacctctttacaagcagttacaatatctcacccaaatcgagcttcgccaagaacag
caggaaacggtcaactcatcgcgcaacttcaatcttccaccattaacagaattccgtggt
gatattaaagggaaagttacttttggatttaataagagtcgaggtattcgcttaggattt
gatctagttggtaaaaagtttgagtatgggaaatttgctgttgatgatatcaaagtcgta
ggtcgttacttcaatggtgtatttgcgatcaccaatgccaacttccagtccgacaagagc
tatggcaaaatcaccaaagctcgcctcagacttgctcctgcctctaatcccttactgcgt
gtccgtgagcaaagtggcgaaattgagctgaaggatttccctattgagtctctgcgtcca
ttaccattctttagtgctattcccgttgatttgacaggtaaaattaacggcaatctctcc
attacaggaacaaatctttttgatactaaagttgttggcaaactgagtttgaccgatggt
acggttaatcgccagccgattgaattcattgccgttcaatttaactacgacaagttaaat
gtcaacttcaacgcgaatatgaagacttcaggtaaagaggctgtcgtcgcttcgggtaat
gttggtgtttttggtaacttcaatgtgaaattgaatgtcaaaaatgaagggattgccttt
atcaatatctttaatcaacctgtgcgttgggttgatgggcagggcaatattaacctcaca
gcaagtggaacctttaaagatcccaagattgcaggaaaaatcaccgtcgataatgccaaa
gtcaaaattgcaggcttaccaggggactttacagaagtgcaaggggatatcgcttttact
agcgatcgcttaattagcaacatcaccagcaactttagtgaagggaaactagcgttaaag
ggaattctgcccattagcaaccccaatctcctcaaacctgatactcctgaatatcaacaa
gccctagcgattaatgccgataagttgaaattaaatattcgtgacattagctctgataac
ttcaatagtcgggtgatcatccttggttcactgctaacaccgaaaatcacaggcgaagtg
ctgctaggtgatggcagagtggttattggcaatgatgctgaccccaatagtgccgctaat
gccagtgctaacagtgatgtacctgatgtcgcctttgatcgccttgcggttaaattacaa
aatatgcaggtaacgcgcttccctatctttaacttccttggtgaaggcacgctgattgtc
aatggaactttacaaagaccagaaccagagggacgagttaaaatcacccgtggtcagttc
aacgcaatttcggcaagattccgtctcgatcgctcctacgaaaactttgttgactttaaa
ccctcacaagggctaaatcctagcctcaatgtccgagtttcaggagccgtagccgaggtc
acacgtgtcccaattaactcgaatcgccccaatgatttgtttagtcctaacgaagtacct
gtcagcaatctgggggctcagcgtacactgcaagtccaagctagtgtgacggggactgcc
ctcgcccccgatattcgcctatctagtagtccaccccgtagtcaagcagaaatcattgcg
ctcattggtggtggcgtattacaaaaacaaggagcttccgatcctgccgccgcccttgct
aactttgcaggtagtaccgtcttaaactttctacaagatgcgatcggtgatgcactcaat
cttgcggagtttaaccttagtcctgtcacaaccaatacctcaggtagtagtagaacagga
acacttgggctgtcggctgaggctgtcatcaatgtcagtaatagcttctctgtggcgcta
caacggattatcaacgactccactcaaccaactaatttctcggttcgttatcgtgttgat
ccgaatattttgttgcgcggcaactatggatctgacgggaataaagggatttccatcgaa
tacgagaatcggttttaa

DBGET integrated database retrieval system