Pseudanabaena sp. ABRG5-3: ABRG53_4154
Help
Entry
ABRG53_4154 CDS
T05820
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pser
Pseudanabaena sp. ABRG5-3
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GEVED
CLIPPER
NPCBM_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBC26411
LinkDB
All DBs
Position
4599546..4603517
Genome browser
AA seq
1323 aa
AA seq
DB search
MFKKNLKTNRKLSNSKSNPILAIAIRAFLQFLIVLYGVIAKGFHSIRKSLNQLFTKRNWR
SAKHSSRRSEKKYTGRSKTYKLNHISLTAFCLTVLLITSQLVFLNPAYAIPDVCGTPGKE
DPTALSNVINTYYPGTAATAVTGASSIVIGTARGATTPITTGDLLLVIQMQDASINATNT
DAYGDGVTGGNASGYTSLRTSGSYQYVVATNSVPLIGGTVNLSQPLAFTFTNADATTTDG
QRRYQIIRVPQYASASISSTVNSYAWDGSVGGVVALDVAGDLTFSGSGTIDVSGQGFRGG
GGTNLGGDNTTGAASQNSAYVHNAPTVTGIGVATAPTGANNYDGSKGEGIAGTPRYTRNG
GFPPVTGVTDNSVEGYPQGSFSRGAPANAGGGGTDPNKGKNSANTGGGGGANAGSGGKGG
DSWTDNNFTPARQPFGGFGGSALSPSVNRIFLGGGGGAGTSNNSTTGNVPSGGGGGGMVI
VRSGRILGSGTINANGIQGVSPNSTDGGGGGGAGGTVLIQSVTASTPTISINARGGAGLD
SGFREHGPGGGGGGGYIAYQGFTPTTNVSAGAAGLDKSTTPTNYGATPGTNGLVESTTIP
TAEVKPGASCLPSLTVTKTTSTPTVTKPASGTATATYTITTTNPVTTPASSGNAINVAIS
DTLPTNFTYASTTSITPTGGATRTSITDPTVGSSNPTWGSFTIPPGGQVQITFSVTISST
ATLGTYQNPATATYSDPLRTVAGTTTTASYNSASSTGEDVTLVGADYGDAPDTYGTDSTA
GNSSNGVDLVGASHTILSTNNPFIGTNAPDADGTNAPIPYNGTGDDATNTDDEDGVTFPV
ALTSATSSYTANLTATNNSGTTANIIGWIDFNYDGQFQSTEAATTTVVTGSNNVARTLTW
SGITIPPFTATSQQTYARFRITTDPAITTSTPAGSAANGEVEDYAISIQGIDYGDAPDTG
AGTGVGNYQTTSTDGGASHTILSTLKLGTNVPDADSGALQNAAANADDTNGSDDEDGVTT
FPTLTTSSSAYSVTVNVFNNTGSAAPLLGWIDFNRNGVFETTEGQTASVASSASPQNITL
NWTGITVPTAGNTYARFRISDAALTTSTPNGAVGNGEVEDYLIPINVAPSLNIVKRITNV
NGTDISGFNAAAPVGLSNDGDLKWPIANTQYLRGAVNSSISAKPGDLVEYTIYFLSNGSE
NLRNAQICDAIPANTTFEPNTYGAGSGILLGWDSTGAVLPDPANSTLVPSVKVALTNAND
GDLGKFLAANTAEPLAPSPCNLATNSQGAILVKFGASPTIPFATSSGTPQSSYGFVRFKV
KVD
NT seq
3972 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaaagaatttaaaaactaatcgtaaattaagtaactctaaatcaaacccaatc
ttagcgatcgccatacgggcgttccttcaatttttgatagtactttatggggtcatcgcg
aagggtttccactccattagaaaatcgcttaaccaactatttactaagagaaactggaga
tctgcaaagcatagctcacgaagatcggagaaaaagtatacaggtcgctccaaaacctac
aaactaaaccacatttctctgacagctttctgtctaaccgtcttacttattacctcacaa
ttagtcttcttaaatcctgcttatgccatacctgatgtctgtggcacaccaggcaaagaa
gatccaacggcactcagtaatgtcattaacacctactatccaggtacagcagctacagca
gtaactggggcatcatctattgtcattggcacagctagaggagcgacaacgccaatcacc
acaggcgatttgttactggttatccagatgcaggatgcttccatcaacgccaccaatact
gatgcctatggagacggagtcacaggcggcaatgctagtggctatacgagtcttcgtact
tctggttcctaccaatatgtggtcgctaccaatagcgtacctcttatagggggaaccgtt
aacctctctcaaccccttgcctttacctttactaatgccgatgcgacaactactgatgga
caaagacgctatcagataattcgtgtgcctcagtatgctagcgccagcattagctcaaca
gttaactcctatgcttgggatggctctgtgggtggggtcgttgccctagatgttgcaggt
gacttaactttctcaggttcaggaaccatcgatgtaagtggacagggttttcgcggtggc
ggtggcactaacttaggtggggataacactacaggggcagcatcccaaaatagtgcttat
gttcacaatgcgccaacagttacgggaataggagttgctacagctcccacaggcgctaat
aattatgatggatctaaaggagagggaattgctggaacaccccgttacaccagaaatggg
ggttttcctcctgtcacaggcgtaacggataactcggtagaaggttatccacaaggtagt
ttttcacgaggcgcacccgcaaatgcaggtggtggtggaaccgatcccaacaagggaaag
aattccgctaacactggtggtggtggtggtgctaacgcaggtagtgggggtaaaggcggc
gactcttggacagataacaactttactccagcaagacaaccctttggaggctttggtgga
agtgctctttcgccttcagtcaatcgtatctttctaggcggcggcggtggcgctggcact
tccaataactctactactggtaacgtaccatcaggtggtggcggcggcggtatggttatt
gtgcgtagtggtcgcatccttggcagtggcactattaatgcaaacggaattcaaggcgtg
tctcccaatagtactgatggcggcggcggtggtggggcaggtggcactgttctcattcaa
tctgttacagcgtcaactcccactatttccatcaatgcgagaggcggagcaggacttgac
tctggatttagggagcatggacctggtggcggcggtggtggtggatatattgcctatcaa
ggctttacaccaacaacaaatgtgagtgctggggctgctggtctcgataaaagcactaca
ccaactaattacggcgcaactccaggtactaatgggttagttgaatcaacaacaattcct
actgcagaggtaaaacccggagcatcatgcttaccatcactaacagtaaccaaaactaca
agtacccctactgtcaccaaaccagcttcaggtacagcaacagctacctatactattact
actactaatcctgttactactcctgcaagtagtggcaatgccatcaatgtcgccatctct
gatacgctgcccacaaactttacctatgcgtctactacctccataactcctacgggaggc
gcaacaagaacatctatcactgacccaacggtaggaagttctaacccgacttggggatct
tttacgattccgcctggtggacaggtacaaattacctttagtgtgacaatttccagtacg
gctaccctaggcacttaccaaaacccagcaactgcaacttattccgatccattacggaca
gttgcagggacgacaaccacagcatcctataattctgcctctagtacaggtgaagatgtc
actcttgttggcgcagactatggcgatgctcctgacacctacggcactgactcaaccgca
ggtaatagttctaatggagtcgatctcgtaggtgcaagtcataccatccttagtaccaat
aatcctttcattggaaccaatgcccctgatgccgatggtactaatgcaccaattccctac
aatggcactggggacgatgctaccaataccgatgatgaggatggagttacttttcccgtt
gcccttaccagtgcgaccagtagttacaccgcaaatttaacagccacaaataactcaggc
actacagctaacatcattggttggatcgacttcaactatgacggtcaattccaatccaca
gaagctgccaccactactgttgtcacaggaagtaataatgttgcaaggactctaacttgg
agcggtattacgattcctccctttaccgcaactagtcaacagacctatgcccgttttcgg
ataactacagatcccgcaattactactagtactccagcaggatcggctgccaatggcgaa
gtcgaagactatgcgatttccatacagggtatagattacggcgatgcaccagatacagga
gcaggaacaggtgtagggaactaccaaacgactagcaccgatggtggagcaagtcatacg
attctcagcactttaaaactaggaaccaatgtccctgatgctgacagtggcgcattacaa
aatgcggcggctaatgctgatgataccaatggtagtgatgatgaagatggtgttactacc
ttccccacattaactacatccagttcagcctactcagtgacagttaatgtctttaataac
actggcagtgctgcacctttactgggatggattgactttaacaggaatggtgttttcgag
acgacggaaggacaaactgcctctgtagcaagcagtgccagtcctcaaaatattacgctc
aattggacaggcataactgtacctacggcaggaaatacctacgctcgtttccgtattagc
gatgcggccttgaccacatcaacgcctaatggtgcggttgggaatggcgaagttgaggat
tatctaatcccgatcaatgtagctcctagtttaaatatcgtgaaacggattactaacgtc
aatggtacggacattagcgggtttaatgctgctgcaccagtaggtttatccaatgacggt
gatttaaaatggccgatcgcaaatactcagtacctccgtggcgcagttaactctagcatc
agtgcaaaacctggggatttagtggaatacaccatttatttcctatctaacggtagcgaa
aacctgaggaatgctcaaatttgtgatgcgattcctgctaatactacctttgagcctaat
acctatggagctggtagtggaattcttctcggttgggacagtacaggagccgtacttccc
gaccctgcgaactcaactctagtgccgtcggttaaagtcgcactcaccaatgctaatgat
ggggatttaggtaagtttttggcagctaataccgccgaaccacttgctcctagcccttgc
aacctcgctactaatagtcagggagcaatcttagtgaaatttggtgcaagtcctaccata
cctttcgcgacttcttcaggcacaccccaaagttcgtatggatttgtgcgatttaaagtc
aaagtcgattag
DBGET
integrated database retrieval system
