Pseudanabaena sp. ABRG5-3: ABRG53_a111
Help
Entry
ABRG53_a111 CDS
T05820
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat family
Organism
pser
Pseudanabaena sp. ABRG5-3
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPR_12
TPR_10
TPR_1
TPR_2
TPR_7
TPR_8
TPR_16
Rapsyn_N
CFAP70_TPR_C
TPR_MalT
TPR_NPHP3
ARM_TT21_4th
TPR_19
TPR_SusR
TPR_3
TPR_11
Methyltransf_1N
Fis1_TPR_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBC26685
LinkDB
All DBs
Position
ABRG53a:151186..154287
Genome browser
AA seq
1033 aa
AA seq
DB search
MDESRLKGYLNLIQSLLDCKSGEELALLQNNQELIDIDFIQVMEQVATQAEEEGQQKAAD
FLQTLVKQLKKAFAVAESTYNSQEQGENNQAYHNLIEALLSCPNSQKGQILKDNFDLLDL
GLSETMKQVAETLMEEGEEDTSEWLLNVASQVRVVVAARLFDKGNQYYHLNNFAAAEQSW
QEALALYQEIGDRQREAELLNSLGIACYFMGRYQTAIDYCQQSLKIQKDIGDSPEERLRQ
RTGEAGSLINIGNALYSSGKYDVAIDYYQQSLAIKREIGERRGEATALMNIGNALYSTAK
YDLAIDYYQKSLAIQEEIDDRKEEAKSRGNLGAAYIALGQYKKAIDFYEQQLAIAREIGD
RLGEANALNNLGTLYDALGQYELDIKYQKQSLAIYQEIKYRHGEACSLGNLSCAYRALGQ
YNLDIDYQQQSLAITRELGDLQGEATSLGSLGNTYLLLGEYDAAVDYYQQWLKTSQEIGD
RRGEAKSMAGLGIAYDYLEKYQQAIDYHRNSLKVAEEIGDFDSQGTALNNLGYSLFKSDQ
IEEAETKLQEGIKIRESLRLDLKDSDKISIFEDQARTYRLLQEVLIYQNKFSEALEISER
GRTRAFVDLLAERLFKQTNTQNLANPITYLQVQQVAQLQNSILVEYSIIDENKLLFIWVI
KPTGEINFSQVDLRFLKQEYTSLSNLITQARASLGILESKSDISNHTVFEDCNKFIELKQ
LYKILIQPISHLLPTDPKIPVFFIPQDTLFLIPFPALQDAEGKFLIEKHTIVTALSIQIL
ELTQKRSVEVPETSLEALVVGNPKMPTIPLTDPPAQLSDLAWAKIEAQAIAPLLNTQAIM
GANATKAHITQLFPKARLIHFATHGLLDDIRQLGIPGAIALAPSDGDHGFLTAGEIYDMK
LNAELVVLSACNTGQGKITGDGVIGLSRCLIAAGVKSVIVSLWSVEDLSTTLLMVKFYQI
FQQGVTSTVALNDAQRWLLGVTKTELEVWLKTNERFFNATLKINLRRRLHQLDDNAKLFQ
HPRYWAAFCAIGQ
NT seq
3102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaaagtcgtcttaaaggctatcttaacctaattcaatcactacttgactgtaaa
agtggcgaggagttggcgctgttacaaaataatcaagagttgattgacattgattttatt
caagtgatggaacaggttgcaactcaggctgaagaagaaggacaacaaaaagcggcagat
tttttacagactttagttaagcaattaaaaaaagcttttgcagtagcagaatcaacatat
aattctcaagagcaaggtgaaaataatcaagcttatcacaacttaatagaagcactattg
tcttgtcctaatagtcaaaaagggcaaattttgaaggataattttgatttgcttgattta
ggcctgtcagagacgatgaagcaggttgcagaaaccctcatggaagagggtgaggaagat
acatctgagtggttactaaatgttgcttctcaagtgagggttgttgtagcagctcgccta
ttcgataaaggtaatcaatattaccatcttaacaattttgcagcagccgagcaatcatgg
caagaggctctagctttatatcaggaaattggcgatcgccaaagggaagcagaattgtta
aatagccttggtattgcttgttactttatgggacgatatcagactgctattgattactgc
cagcaatcacttaaaattcaaaaggatattggcgattctccagaggagaggcttcgccaa
cgcacaggagaagcaggttctctgatcaatattggtaatgctctttactcttcaggcaaa
tatgatgtagctatcgattactatcagcagtcacttgcaattaaaagggagataggggag
cgtagaggggaagcgactgcgttaatgaatataggtaatgctttgtactcaactgcaaaa
tacgatttagctatagactattatcaaaagtcactggcaattcaagaggaaatagacgat
cgcaaagaagaggcgaaatctaggggtaatttaggtgcggcttatattgctctgggacag
tacaaaaaagcaatcgacttttatgaacaacaactagcgattgcacgagaaataggagat
cgtcttggagaggctaacgcactaaataatttaggtactctgtatgacgcattaggtcaa
tatgagttggatattaaataccaaaagcagtcactagcaatttaccaggagataaaatat
cgccatggggaagcttgctctcttggaaacttaagttgtgcttatcgtgcattaggtcag
tacaatttggatattgattatcagcagcaatcactagctataacacgagaacttggcgac
ttgcaaggagaagcaacatctcttggtagtttgggtaatacttacttattgctgggggag
tatgatgctgctgttgactattatcagcagtggctgaaaacttctcaagaaatcggcgat
cgcagaggagaagccaaatcaatggcgggtttaggtattgcttatgattatttagaaaaa
taccagcaagctattgactatcatcggaattcacttaaagttgctgaagagattggtgat
tttgatagccaaggaaccgcattgaataatttagggtactctctttttaaatcagatcaa
atagaagaagccgaaacaaaacttcaagagggaataaaaattagagaatctttacgttta
gatctaaaagactctgataaaatatcaatttttgaagaccaagctcgtacttatcggctg
ttgcaagaagtgttaatttatcaaaataaattttcagaagctttagaaatttccgagcgc
ggtcgtactcgtgcatttgtagatttgttagctgaacgtttatttaaacaaaccaataca
caaaacctcgctaatcccataacctatcttcaggttcaacaagttgctcaattacaaaat
tcaatcctagtcgaatactcaattattgatgaaaataaactattgtttatttgggttatt
aaaccaacaggcgaaataaatttttctcaagtagacctgagatttctcaaacaagaatac
acatcactatctaacttaattacacaagctcgtgcatctttaggtattttagaaagtaaa
agtgatatatcaaatcatacagtttttgaagattgtaataaattcattgagttaaagcaa
ctttataaaattcttattcaaccaatctctcacctactaccaactgaccctaaaattcct
gttttcttcattccgcaagatacccttttcttaattcccttccctgcgctgcaagacgca
gaaggcaaattccttatagaaaaacacactattgttactgctctttccattcaaatactg
gagttaacccaaaaacgaagtgtagaagtaccagaaacttctttagaagctctggttgtg
ggaaatccgaaaatgccaactattcccttaactgatccacctgcacagttatcggattta
gcttgggcaaaaattgaagcgcaagcgatcgcaccccttcttaatacccaagccatcatg
ggtgcaaatgcaaccaaagcacatataacacagctttttcccaaagcgcgattgatacac
ttcgcaactcacggattattagatgatatccgacaactgggcatacctggggcgatcgct
cttgctcccagcgatggtgatcatggttttctcacggctggcgaaatctacgacatgaaa
ctaaatgccgaactggttgtgctgagtgcttgcaatacaggacagggtaaaattactggc
gatggcgtgattggactatcccgttgtttgatagctgctggggtaaaaagtgtaattgtg
tctctgtggtcggtagaggatttatccactaccttattgatggtgaaattttaccaaatt
ttccaacagggagtaacgtctaccgtcgctcttaacgatgctcaacgctggttgttggga
gttacgaaaacagaattagaagtttggctaaaaactaacgagagattttttaatgctacg
ttaaaaattaacctgcgccgcaggttgcatcagttagatgataacgccaaactatttcaa
cacccccgatattgggcggcattttgtgcgatcggtcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system