Polypterus senegalus (gray bichir): 120532965
Help
Entry
120532965 CDS
T08668
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
psex
Polypterus senegalus (gray bichir)
Pathway
psex04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psex00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
120532965
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
psex00536
]
120532965
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
psex00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
120532965
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120532965
NCBI-ProteinID:
XP_039615423
LinkDB
All DBs
Position
7:165131743..165274114
Genome browser
AA seq
2838 aa
AA seq
DB search
MVLYGATKYLLGWLAVSSIVANEVEGQAAGHYGNGRGEQHVVMKPSADGLRRRRPQDVLR
GPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCILPICRNSCGDGFCSRPNMCTCPNGKISPTCETK
STQQCNIRCMNGGICSEEQCKCQKGYTGTYCSQSICDNDCQNGGRCVGPNRCACIYGFTG
PQCERDYRTGPCFTYINNNEMCQGQLTAVICTKTLCCATVGRAWGHPCEICAPQPQPCRR
GFLANIRTGACQDVNECQAISGICLGGNCLNTIGSYECKCSAGYRQNEATQKCEDVDECD
ALPDMCNGGQCVNTMGSYFCNCPEGYVTSVDSIRCVDQRMGRCYTSLLNTDCSQELPIPL
TKTQCCCETGRCWSSGLEPEKCPVQGSEAHHLICTESLPEFTSEFKRVLPDGAGDVDSDL
RHPLSGGNGPGPAVVVALNQSNNACHQFSNMCVNGHCVPLASSFRCVCSEGFQADPQGEC
LDIDECRCSPCTNADCVNTPGSYYCRCHTGFQHAAIRQTCTDIDECLQNGILCRNGRCVN
TEGSFQCICNIGFYLSSDGMSCVDQDECASSNMCLNGMCINEEGSFRCICKPGFSLASNG
RYCVDIDECQTAGICMNGRCINLEGSFRCQCLAGLAVGVDGRFCLDTHIKSTCYGAIQKG
VCVNPFLGTFTKSECCCANVDYSFGEPCRPCPPMNSAEFQALCISGPGFSVEGKDINECA
LNPDICSNGICENLRGSYRCTCNIGYESDATGKMCIDIDECVVNRRQCEIGLCRNNPGSF
TCTCPKGYFFQPEFNTCEDINECTSKPCVNGICRNNGGSFTCECSTGGKLDLTGLVCIDS
LRGTCWLNIQDGRCEVNINGATIKSECCATLGVAWGSPCIPCEIDSACPRGFARVRGVAC
EDVNECRVFPGICPNGHCVNTKGSFLCQCLEGLTLDATGRLCIDIRLEQCYLTYNEDECS
KPMLGRFRRDACCCSVGAAWGVYCEECPNPGSGDFDSLCPRGLGFANRGEITDRPFYKDI
NECKTFPSICTRGKCRNTIGSFRCHCDSGFAIDAEERNCTDIDECQISPDLCGNGSCVNT
AGSFDCECFPGFESGFMMMKNCIDINECERNHLLCHGGTCKNTDGSYICLCPTGYQLSFA
GDACIDINECDLSDSLCKNGKCVNIMGTYQCICAPGYQVTPERQSCVDIDECSIGNGECE
AHCSNSEGSYKCSCNEGYILLPEKRNCADIDECEDNIDICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGF
MASMDMKTCVDINECDLHANICMFGECENTKGSFTCNCQLGYSVKKGATGCTDIDECGIE
AHNCDIQASCINMPGSFSCSCQEGWVGTGVKCTDLNECANGSHLCSSNAQCLNTPGSYHC
SCSEGFTGDGYTCSDMDECMENGNLCENGRGLNTPGLYRCECDMGFSPATDSRSCQDINE
CLFQSICVFGTCKNLPGMFRCICNDGYELDRTGGNCTDIDECTNPINCVNGICVNSPGGY
QCNCPPEFELNPTGVGCVDIRFGYCYLDFEYSEDGSLSCSGEIGVAVSRSSCCCSQGKTW
GNPCELCPRINTNEYKTLCPGGEGFKPNPITIILEDIDECEELPGLCQGGSCLNTFGSFM
CHCPAGYNLSEESHICEDVDECVAYSNICGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMPINGGNSCLD
MRKSLCYRNYNGTSCENDLPFSLTKRLCCCSYNIGKSWNKNCEACPIPGSSEYRVLCGNV
VPGFTFHIHTGKAVDINECQEIPGICMNGVCINMIASFRCECPTGFSYNDLILGCEDIDE
CSNRGICQHHADCINSPGSYRCECSSGFKLSPIGSCIDYNECLEIPNICSHGECVDLLGS
YRCVCHSGFKATTDQKMCIDTDECERQPCGNGTCKNTIGFYNCLCHPGFELTLSNDCTDI
DECRTLLGHVCRHGQCINSVGSFHCLCEDGYKLTPEGRNCVDINECVLFPGTCFPGTCQN
LDGTFQCICPRGYEVQNENCIDINECEEDPYICLFGTCVNNPGSFQCLCQPGFVLSENGR
TCFDKREKFCFTKFENGRCSVPIAFNTTKAKCCCSNIPREGWGDPCELCPQEGQEAFQIL
CPFGFGTIEDIGGKREDVNECVENPGICLNGHCINMDGSFRCECPVGYGLDVSGISCVDL
DECSVGNPCGNGTCSNVMGGFECNCNDGFEPGPMMTCEDINECTYNPLLCAFRCINTYGS
YECICPVGYILREDRQMCRDLDECTEGFHNCEYRGMICKNLIGTFLCVCPPGMINSPDGE
RCQDENECYTKPGVCENGHCLNTHGSYACDCNEGFKLAATGTNCIDHRQGFCFTEVLHTM
CQMSFSSRNLSTKSECCCSGGKGWGNQCELCPLLGTGHYKKLCPHGPGYSIGDKDINECK
VMSNLCKNGQCINTIGSFRCLCQLGYVMDLTGTTCVDMNECLQSPKPCSFICKNIEGSYL
CSCPHGYILQDDGKTCRDLDECQTKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPSGFTQHHTACIDNNE
CASQPSLCGPKGICHNNPGSFRCECQRGYSLDSSGLNCNDIDECKSQHRCKHGCQNTAGG
YRCSCPQGYNQHYQWNQCVDENECADPKRCGAALCYNTLGSYRCSCPSGYSFNELTTSCH
DINECETFKNPCNYGCSNTEGGYMCGCPPGYYRVGQGHCVSSVVLHQDQFLTPVGQATEE
EALFLEACYECKVKDLPKKDLRRRRSTKETQLFEEAPVSLDSLDNQVPLRLHLKSSKQQH
IMTFIPATESLNNKVQYSISSGNYDGLFRINQRAGLSYLHTSKKKLSPGIYRLEVISENH
LEGQTDRSLHLQLLIELE
NT seq
8517 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgctgtatggtgctacgaagtacctcctcgggtggctcgctgtatcaagcatcgtg
gcgaatgaagtggaaggtcaagcggctggacactacggcaatggaagaggggagcaacac
gtagtgatgaaaccgtcggcggatggactgaggagaagaagaccgcaggatgtgctgcga
ggaccaaatgtttgtggatctcgctttcattcttactgctgccctggctggaaaacatta
cctggaggaaaccagtgcattttgcccatttgccgaaacagttgtggagatggattttgc
tctcgtccgaacatgtgcacttgccctaatggaaaaatatctccaacatgtgaaacaaaa
tctacacagcaatgcaacataaggtgcatgaatgggggtatctgctctgaggaacagtgc
aagtgccagaaaggatatactggaacatactgtagtcagtctatctgtgacaatgactgc
cagaatggaggccgctgtgttggaccaaatcgctgtgcttgtatttatggttttactggt
ccccagtgtgaaagagattacagaactgggccatgctttacttacatcaacaacaatgag
atgtgccagggtcagctaactgctgtaatctgcaccaagactctctgctgtgctacggtt
ggacgagcttggggtcacccttgtgagatctgtgcaccacagccacagccctgtagacgt
ggcttcttagccaatattcgaacaggagcctgtcaagatgttaatgagtgccaggctatt
tcaggtatttgcctaggtggaaactgtctcaatacaattgggtcctatgagtgcaagtgt
tctgctggctacaggcagaatgaagcaactcaaaaatgtgaagatgtagatgaatgtgat
gctctccccgatatgtgcaatggaggacaatgtgtcaataccatgggaagttatttctgc
aactgcccagagggttatgtaacttcagtggacagtattcgctgtgttgatcagagaatg
gggaggtgctacaccagtctgttgaataccgactgttctcaggagcttccaattcccctt
acaaaaacccagtgctgctgtgagactgggagatgttggtcctcaggactcgagccagag
aagtgtcctgtccaagggtcagaagcgcaccatttaatatgcacagaaagcctaccagaa
ttcacttcagaattcaaacgtgttttgccagatggagcaggtgatgtagactcagattta
agacatcctttaagtggtggcaatggtcctggtccagcagtcgtggtagctctcaaccaa
agcaataatgcttgccatcagttcagcaatatgtgtgtaaatggccattgtgttcccctt
gcatcaagcttccgatgtgtatgcagtgagggtttccaggcagatccacaaggtgaatgt
ttagatattgatgaatgcagatgtagcccttgtacaaatgcagattgtgtaaatactcct
ggctcatactactgcaggtgtcatacaggattccagcacgctgccatcaggcagacctgc
acagatattgatgagtgcctgcagaatggaatcctctgcagaaatggccgctgtgttaat
acagaaggcagtttccagtgcatttgcaatataggcttttatctaagttcagatggcatg
agttgtgtggatcaagatgagtgtgctagcagcaacatgtgcctcaatggaatgtgcatc
aatgaagaaggaagctttaggtgcatctgcaagccaggcttttccctggcctccaatggt
cgctattgcgtggatatcgatgaatgccagacagcaggaatatgcatgaatggccgctgc
attaatttggaaggctcattcagatgccagtgtcttgcaggtcttgctgttggagtggat
ggaaggttttgtcttgacactcacataaagagtacttgttatggagccatccagaaaggt
gtttgtgtgaatccatttcttgggaccttcaccaaatctgaatgctgttgtgcgaatgtg
gattacagctttggagagccgtgccgaccctgcccacccatgaactcagctgagtttcaa
gcattgtgtatcagcggacctggattctcagtggaaggaaaagatattaatgagtgtgct
ttgaatcctgatatttgctccaatggaatatgtgaaaatctgcgtggaagctacaggtgt
acctgcaatattggctatgaatctgatgccactggcaagatgtgcattgacattgatgag
tgcgtagtgaacagaagacagtgtgaaattggcttatgccggaacaatcctggaagtttt
acctgtacctgccccaaaggttacttcttccagccagaattcaatacatgtgaagatatc
aatgagtgcactagcaaaccctgtgttaatggaatctgcagaaacaatggtggttctttc
acttgtgagtgctccacaggaggcaagcttgacttgactggcttggtctgtatagacagt
ttgagaggaacttgctggctgaacattcaagatggtcgctgtgaggtgaacattaatgga
gccaccattaaatcagagtgttgtgctacattaggagtggcatggggtagcccctgtatt
ccttgtgagatagattccgcatgcccaagaggatttgcccgagtcagaggtgtagcatgt
gaagatgtcaatgagtgtcgggtttttccaggcatttgcccaaatggccattgtgtcaac
accaaaggttcattcctatgccagtgccttgaaggtctcaccttagatgccacaggcagg
ctgtgtatagacatacggctagagcagtgctacctgacctacaatgaggatgagtgctcc
aagcccatgttgggcagattccggagagatgcctgctgctgctcagttggagctgcctgg
ggtgtgtactgtgaggagtgtccaaacccaggcagtggtgactttgacagcctttgccca
cgtggtctggggtttgccaacagaggagaaatcacagacaggccattttacaaagatatt
aatgaatgcaaaacttttcccagtatttgcactcgcggcaaatgtcgcaacactattggc
agcttcaggtgtcattgtgacagtggatttgccattgatgcagaggaaagaaactgcaca
gacattgacgagtgtcaaatctctccagacctctgtgggaatggcagctgtgtaaacact
gcaggaagttttgactgtgagtgtttccctggatttgaaagtggattcatgatgatgaaa
aattgcattgacatcaatgaatgtgaaaggaatcatcttctttgccatgggggcacctgc
aaaaacacagatggcagctacatatgtctttgtcctactggatatcaactgtcttttgca
ggggatgcttgcatcgatatcaatgagtgtgatctaagtgatagcctgtgcaagaatgga
aaatgtgtgaacattatgggcacttatcagtgcatatgtgctcctggatatcaagtcacc
cctgagcgacagtcctgtgttgatattgatgagtgctccattggaaatggagaatgtgaa
gcccactgtagcaattcagaaggcagctataagtgcagttgcaatgaaggttacattctg
cttccagaaaaaagaaattgtgcagacattgatgaatgtgaggacaacatagatatttgt
gatggaggacagtgcacaaatattcctggtgaatatcgttgcctctgctttgatggtttt
atggcatccatggatatgaagacctgtgtcgacattaatgaatgtgatttacatgccaac
atttgcatgtttggggagtgtgagaacaccaaaggctcattcacctgcaattgccagctg
ggctattctgtcaagaaaggagcaacaggctgtacagatattgatgagtgtggaattgaa
gctcataattgtgacattcaagcttcatgcattaacatgcctggcagtttcagctgcagt
tgtcaagaaggctgggtgggaactggagtcaagtgtacagatctcaatgaatgtgcaaat
gggagtcacctgtgtagctccaatgcccagtgtctgaacacaccaggatcataccattgc
agctgttctgagggattcacaggggatggatacacttgttcagatatggatgagtgtatg
gagaatggtaacctctgtgaaaatggcaggggtctgaatacacctgggctgtaccgttgt
gagtgtgatatgggcttctcgcctgccactgacagcagatcttgccaagatatcaatgaa
tgcttattccaaagtatttgtgtatttggcacatgcaaaaatctcccaggcatgttcagg
tgcatttgcaatgatggttatgaacttgatcggacaggaggtaactgcacagatatagat
gaatgtacaaatccaatcaattgtgttaatggaatatgtgtaaacagtcctggaggatat
caatgtaactgtccgcctgaatttgagctaaacccaactggagttggttgtgtggacatt
cgatttggttactgttacctggactttgaatacagtgaagatggtagtctgtcttgcagt
ggagaaataggggttgctgttagtcgttcctcttgctgctgctcacaaggaaaaacctgg
ggaaatccctgtgaactctgtccacgtatcaatacaaatgaatacaaaacattgtgtccg
ggaggtgaaggctttaaacctaaccctattactattatactggaagatattgatgaatgt
gaggagctgccaggactttgtcagggtggaagctgtttgaatacatttggcagtttcatg
tgtcactgcccagcaggatacaatcttagtgaagaaagtcatatttgtgaagatgttgat
gagtgtgttgcttacagtaacatttgtggccctggcacatgctacaacacattgggcaat
tacacctgcatatgtcctcccgagtacatgcctatcaatggaggaaacagttgcttggat
atgagaaaaagtctatgctaccgaaactacaatggaacatcttgcgagaatgacctgcct
ttcagtctcacaaagcgactgtgctgctgttcttataatataggaaaatcctggaataag
aattgtgaagcttgtccaattcctgggtcatctgaatatcgtgtgctgtgtggtaatgtt
gtgcctggatttacttttcacatccatactggtaaagcagtggacattaatgagtgtcag
gaaattcctgggatttgcatgaatggtgtctgcattaacatgattgccagcttccgctgc
gaatgtccaactggtttcagctacaatgacctgatcttaggttgcgaagatatagatgag
tgcagcaatagaggtatctgccaacatcatgcagattgtatcaacagtccaggcagttat
cgctgtgaatgttcatctgggtttaaactttcacctataggatcatgtatagattataat
gagtgccttgaaattccaaacatctgcagtcatggcgaatgtgttgacttgctggggagc
tatcgttgcgtttgtcattctggcttcaaggccactacagatcagaaaatgtgtattgat
acagatgaatgtgagaggcagccatgtggaaatggaacttgtaagaacaccataggtttt
tataactgcctgtgccaccctggctttgagctgaccctcagcaatgactgcacagatatc
gatgaatgcagaaccttattgggacatgtgtgtcgacatggccagtgtattaacagtgtt
ggctctttccactgtttgtgtgaagatggatacaaacttacaccagagggaaggaactgt
gttgatatcaatgaatgtgttttatttcctggaacttgcttccctgggacatgccagaat
cttgatggaactttccaatgcatttgtcctcggggatatgaagttcagaatgaaaactgt
attgacattaatgagtgtgaagaagacccttatatttgcctatttggaacttgtgtaaat
aatccgggaagtttccagtgcctctgccagcctggctttgtcttatcagaaaatggaaga
acctgttttgataaacgagaaaagttttgtttcacgaagtttgagaatggaaggtgttct
gtgcctatagcatttaacaccacaaaagccaaatgctgctgcagtaacataccaagggaa
ggctggggtgatccctgtgaactctgccctcaggaaggacaagaagctttccaaatactt
tgtccttttggttttggtaccattgaagatattggtggcaaacgagaagatgtaaatgaa
tgtgtggaaaaccctggcatctgcttaaatggccactgcatcaacatggatggctctttc
cgttgtgaatgcccagtgggttatggcttggatgtcagtggcatcagctgtgtggaccta
gatgagtgttcagttggaaatccttgtggaaatgggacctgttcaaatgtgatgggtgga
tttgagtgcaactgtaatgatggctttgagcctggtcctatgatgacttgtgaggatatt
aatgaatgtacttacaatcccttattgtgtgccttccgatgcatcaatacctatggaagc
tacgagtgtatctgccctgtaggttatatcctgcgtgaggacaggcagatgtgcagagat
ctggatgaatgcacagagggatttcacaactgtgaatatagaggcatgatttgtaagaac
ctgattggaacttttctgtgtgtttgcccacctggaatgatcaacagtccagatggagaa
agatgccaagatgagaatgaatgttacacaaaacctggagtttgtgaaaatggtcactgc
ctgaacacacatggcagctatgcatgtgactgcaatgagggctttaaattagcagcaact
ggcacaaattgcatcgaccacagacaagggttttgcttcactgaagttttgcacaccatg
tgccagatgtctttcagcagtcgaaatttgtctacaaaatccgaatgttgctgcagtggt
gggaagggctggggaaaccaatgtgaactctgcccactgcttggaactgggcattataag
aagctatgtcctcatggtcctggatacagcataggtgacaaagatataaatgaatgcaaa
gttatgagcaatctgtgcaaaaatggacaatgcatcaataccataggctcctttaggtgc
ctttgccagctgggctatgtcatggatttgactgggaccacgtgtgtggatatgaatgaa
tgtcttcagtctccaaagccatgcagttttatctgtaagaatatagagggcagctatctt
tgttcatgccctcatggctatattttgcaggatgatgggaaaacttgcagagatctcgat
gagtgtcagaccaaacaacacaactgccagttcctctgtgtcaacactattggaggcttt
acctgtaaatgtccatctggatttactcagcatcacacagcctgtattgataacaatgaa
tgtgcatctcagccttcactctgtggacccaaagggatttgtcacaacaacccaggcagc
tttcgttgtgagtgtcaacgaggttactctctggattccagtggcctcaattgtaatgat
atagatgaatgcaaaagccagcacagatgcaaacatgggtgtcagaacacagcagggggg
tacagatgtagctgtccgcaggggtacaaccagcactaccagtggaaccaatgtgttgat
gagaacgagtgtgctgatccaaagaggtgtggagctgccttgtgctacaatactctagga
agctacaggtgctcttgtccatctggttattcatttaatgagctaacaacttcctgccat
gacattaatgaatgtgaaacttttaagaatccctgtaattatggatgctcaaatacagaa
ggaggttatatgtgcggttgtccacctgggtattacagagtgggacaaggtcactgtgtg
tcttcagtggtgctacaccaggatcagttcttgaccccagtgggacaggccactgaggaa
gaagccttgtttctagaagcttgctatgaatgcaaggtcaaggatctcccaaagaaagat
ctcagaaggagaaggagtactaaagaaacacagctcttcgaggaggcaccggtcagcctg
gacagcttggacaatcaagtaccactcaggttacatctcaagagtagcaagcagcaacac
atcatgacgtttatccctgcaactgagtctctcaacaacaaggttcaatatagcatttca
tccggcaattatgacggtctctttcgcattaaccagcgtgctggcctcagctatctgcac
acaagcaagaagaagttgtctccaggaatctataggctagaggtgataagtgagaaccat
cttgaaggacagacagacagaagtcttcatctgcaattgcttattgaactggagtga
DBGET
integrated database retrieval system