Polypterus senegalus (gray bichir): 120534123
Help
Entry
120534123 CDS
T08668
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: kielin/chordin-like protein
KO
K24522
kielin/chordin-like protein
Organism
psex
Polypterus senegalus (gray bichir)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psex00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
psex04990
]
120534123
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
psex04990
]
Von Willebrand domain-containing proteins
VWC domain-containing proteins
120534123
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWC
VWD
FnI_RECK
Laminin_G_1
FlaC_arch
Laminin_G_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120534123
NCBI-ProteinID:
XP_039617362
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(89752226..90066753)
Genome browser
AA seq
2437 aa
AA seq
DB search
MAALGNCSLTPVAQPDLQPNSYYYYDDNVIDLLEALNITRSIKGVSKTKGLDPGIPAWKF
RQRVPHLTLPRDYSIYFLTTMQDSIGFHFVAQQVKNSDGTLISFVSPAALKKDGHPLFRL
VSSTRSNQLHLEYRTMHSKDPATILFPGGTPFANGKWARVALNLEAHKVTLFIDCEESII
FEKKHGEDVLSMILPIDLEITFASMPGNKASKFLGYWQTAEISPTGFLRRPWHCENLSDA
LSYSLMEVNSDDTQLESPIKTSKHFSDDKSDIEHYQQQQSEPDVLPRGPRPHPLNCDERI
RRLEETVDNISMMLSMVKSQNTDLLARVKYLETCECRRPQCSWEGRNYDDGSRWEKDQCT
ACTCTNGQVQCSVNEKCTGCIYEGKRYDNGESFNFDQCVRCMCLSGDVNMXKTQCNDAPC
GNPVKRPGECCPMCEDCIDGRKNGETWEPDPCSNCSCLNGNVNCIKQECIPTSCQHPIIP
RNKCCPECFGCFYNGHRLRNGQSFQADHCTRCTCRNGSVQCEPLACPELPCLNHYLPPGE
CCPICRQGCEYEGVAYINGAIFLSMSNPCMNCSCLDSLVRCSPIQCHTVTCLNPFRKPGQ
CCPSCPVCEVDGQIYDHEQTFTTADGCQKCTCMNGKLSCLEIQQCPHFCTHGVKPPFGSC
CRDCSNCDFQGQLIPNGISFMASGDMCKQCTCNDGNIVCSRISCPILDCSVFENEPHECC
QHCKGCIHSGIKYKHKSEWRQQDNPCNICRCLEGQVLCERERCVLPCRHPANSKTGSCCP
VCEGCLFNGQEYTNGASVHHGDRCQNCVCVNGDVHCNPIPCSPVQCTRPVQRPGDCCPRC
EECDYESQTFVHGQSFISSHNPCLSCRCLSGEVTCEHMELSCPPVMCTHPAKLTGQCCAT
CDMCEYERRIYPNGKEFTPPGSSACLHCICKGGNVRCKEEVCPAVYCSNPVKEPHQCCAS
CKVCILDGVEFEEGAEWEPDEDACSICTCSNGEVICQVSQCPPLSCQHPSKSNKGDCCAS
CDSCMYNQRIYNNGQDFIDPDSPCQNCRCQDGTVQCIPNNCPRLHCSNPDIKSGQCCPRC
PDCTFENRVFVDGEKFPNPLNPCQECICVNGHVNCENRDCPGAVCTYPMPGTCCRNNCNG
CSFAGKDYVNGAEYPHPTDKCKVCHCINGNVQCFPRRCPPLLCSNPFIIPGECCPQCPAP
PAECFYSGLPYKHMERFYDPVDKCRSCICNNGTITCQRKPCAPVLCTHPIVQDCCRTCDG
CLYGGKEMANGEQFTDTSDPCRLCVCREGTVSCDRRSCPILDCPFPVQAQCCPACEGCNY
AGQEYLNGQEFTDPQNQCKRCTCINGFVTCNPKPCYNPGCTHPISLPGKCCPVCEGCFFN
GITIANGETFSDPSDSCSHCTCRSGSIHCLKKLCPSAPCSYPVVGQCECSYCEGCYFLGQ
IYTDGEVFPGSKGGCEECTCLKGEVTCGTKKCTQVACPHPGLDTCSCPVCDGCSFNGRNC
HNGENFPDPKNKCQRCTCLNGGVTCVSVTCPAVNCRHPVKPPGECCPQCTGICHYLGNIY
ESGATFDSSSDSCSVCTCMNEVVTCQKKPCREQCTHPVPSSSCCPVCDQCFLDGTEFGNR
QAFLSPSDSCQRCNCLNGNVVCTGVICPQTTCTSPRTIPGQCCPECLGCTYLGKEYAEGV
HWISSINECLECGCVRGEVKCSEVHCDVKCTDPVLVPGQCCPYCQDCFFEGKVYLNGDLF
HPDTCRQCSCKKGNVHCGSTPCPPLNCMQQVTDVGSCCPRCKGCVYNGREYHDGSSWFAS
TTPCMSCMCVEGVTTCSEIHCVLPCVNQIHVPGECCPVCADCVYNNHVYGPQESFQPADD
PCEICTCEVMPDGEQHLRCYRKQCPSLVDCPKSHIHFPSPDQCCPTCAQPLSNCTATLLG
NEIHATDDPCYTCQCKDLTWTCIHQGCPHLSCPSSEQFTPADSCCPICDECLIESENRRV
SDGERWTDSVDECITCTCNLGHIECHIEECLPVICQDGLVKMKSPGKCCYECQDPNTSCI
YQSTTYQSNEHWEVDECTTCTCVSGEVHCQTERCPQVTCASDETAALIPGMCCPHCIPRP
ATCIAFGDPHYRTFDGKMINFQGTCTYVLAEDCEGGDFSIHTTNDDKGRKGVSWIKEVTV
LIGDVVVQLLQDWIVLVDYQTVTLPFLKEPYIYVERKTNTILLNTNIGVKVLWNGKSHLE
VSVPGTYKGHTCGLCGNFNNYPQDDMRIRTGQIVLSEAAFGNNWKVQGENVTNVQCADGD
DVDPCKEAGYRARKEGNSKCKILKSKVFERCHSVVPPEMFFASCVYDLCACGSNVDDCLC
DALEAYASECREAGIILHWRSPSLCAVGCPQDRGYVFDECGPPCPKTCFNKDVPLGVIEA
HCFKPCIPGCQCPAGLVEHESHCILPESCPRIIYGNI
NT seq
7314 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgctttggggaattgttcgttgactccagtggctcagcccgacctccagcccaac
agctactactactacgatgacaacgtgattgatttactggaagcattgaacatcaccaga
tccatcaaaggtgttagtaaaactaaaggtctggatcctggaattcctgcctggaaattt
cgtcaaagagtacctcacctgactcttcctcgtgactattcaatctacttcctaacaacc
atgcaggactctattggctttcattttgtggcacagcaagtcaagaattcagatggcaca
cttatctcatttgtttcaccagcagcactaaagaaagatggtcaccccttgttccggctt
gtttccagcacgagatccaaccagttgcatctggaatatagaacaatgcatagcaaggat
cctgcaacaattcttttccctggtggcacaccctttgcaaatggcaaatgggctcgtgtg
gctctcaacctggaagctcataaagtcactcttttcattgactgtgaagagtcaattatt
tttgagaaaaaacatggtgaagatgttttgagtatgatccttcctattgacctagaaatt
acttttgccagtatgcctgggaacaaagctagcaagtttttgggatattggcaaacagca
gagatctctccaactggattccttagacggccatggcactgtgaaaacttgtcagatgca
ttatcgtattctttaatggaagtaaatagtgatgacacccaattagaatcaccaataaag
acttcaaaacatttttctgatgacaagtcagatattgaacactaccagcagcagcaaagt
gaaccagatgttcttccacgaggacccaggcctcatcctctgaactgtgatgaaagaatt
aggagacttgaggagactgttgataatatcagcatgatgttgagtatggttaaatctcag
aatacagacctgttagccagggtgaagtaccttgaaacatgtgagtgtcgaagaccccag
tgctcatgggaaggtagaaattatgacgatggaagcaggtgggaaaaagaccagtgtaca
gcctgtacatgtaccaatggccaagtgcagtgctctgtgaatgaaaagtgcactggttgc
atctatgaaggcaaaagatatgataatggggagtctttcaactttgatcagtgtgtaaga
tgcatgtgcttgagtggagatgtaaacatgtgaaaaacacaatgcaatgatgctccttgc
ggtaaccctgtgaaacggccaggagaatgttgtccaatgtgtgaagattgtatcgatgga
aggaagaatggagaaacatgggaacctgatccttgcagtaattgttcatgcctgaatggc
aatgtcaattgcatcaaacaagaatgcattccaactagctgtcagcatcccattattccc
cggaataaatgttgtccagaatgttttggctgcttttacaatgggcacagactacgaaat
ggacagagtttccaagctgatcactgtactagatgcacctgtaggaatggcagtgtacaa
tgtgagccccttgcttgtccagaattaccgtgcttgaaccactatctacctcctggagag
tgttgtcctatctgtcgtcaaggttgtgagtatgaaggagtagcatacatcaatggagca
atcttcctatctatgagcaacccatgtatgaactgttcatgtttggacagtttagttaga
tgctctccaatacagtgccatactgtcacctgtttaaatccctttcgaaagcctggccag
tgctgtccgtcttgcccagtttgtgaagtagatggacagatttatgaccatgaacaaact
tttactactgcagatggctgtcaaaaatgcacatgtatgaatggcaagctgtcttgctta
gaaatccagcagtgtccacacttctgtacccatggtgttaagcctccatttggatcctgc
tgcagagactgctcaaactgtgatttccaaggtcaacttattccaaatggcatatctttt
atggccagcggagatatgtgtaagcagtgcacatgcaatgatggaaatatagtctgctca
aggatctcatgcccaattcttgattgcagtgtttttgaaaatgaacctcatgagtgttgc
cagcactgcaaagggtgcatacattctggtattaaatataagcataaatcagaatggaga
caacaagacaacccatgtaacatctgcagatgtttggaaggtcaagtcttgtgtgaaagg
gagaggtgtgttctaccttgtcgacatccagcaaattctaaaacaggatcttgctgccca
gtctgtgagggttgtctcttcaatgggcaggaatacacaaatggtgccagtgtgcatcat
ggagatcgctgccagaattgtgtctgtgtgaatggagatgtccattgtaaccctattcca
tgctctcctgttcagtgcaccagacctgttcagagaccaggtgactgttgcccacggtgt
gaagaatgtgactatgagtctcaaacatttgtgcatggtcaatcattcatttcatcacat
aacccctgtctgagctgcaggtgcttgagtggtgaagtaacatgtgaacacatggaatta
agttgtcctccagttatgtgcactcatcctgctaagctgaccgggcagtgctgcgccact
tgtgatatgtgtgagtatgaaagacgaatttatcccaatggcaaggaatttacaccccct
ggaagcagtgcctgccttcactgtatctgtaaaggtggtaatgttcggtgtaaagaggaa
gtctgcccagctgtctactgctcaaacccagtcaaagagccacatcagtgctgtgcatca
tgtaaagtctgtatcctagatggagtagagtttgaggaaggggcagagtgggaaccagac
gaagatgcttgtagcatctgcacttgcagcaatggagaagtaatttgccaggtttctcag
tgtccacccttgtcctgtcagcatcctagcaaaagcaacaaaggtgactgctgtgcatca
tgtgacagttgcatgtataatcagcgtatatataacaatggacaggactttattgatcca
gatagtccctgccagaactgccggtgtcaggatggtactgtccagtgtattcccaataac
tgcccaagacttcactgttcaaatcctgatattaaaagtggtcagtgctgccccaggtgt
ccagattgcacatttgaaaaccgtgtgtttgtggatggagagaaatttcctaatccatta
aatccctgtcaggagtgtatctgtgtaaatggccacgtgaactgtgaaaacagggactgc
cctggtgcagtttgtacatatccaatgccaggaacctgttgcagaaacaactgtaatggt
tgtagctttgctggaaaagattatgtaaatggagcagagtaccctcatcctactgacaag
tgcaaagtttgccactgtataaatggaaatgtacagtgctttcccagacgatgccctccg
ctattatgctccaacccttttataatacctggtgaatgttgtccgcagtgtccagctcca
ccagctgaatgtttttacagtggattaccttacaagcacatggagcgtttctatgatcct
gtggataaatgccgctcatgcatttgtaataatgggacaatcacctgccaacgcaagcct
tgtgcgcctgtcctgtgtacacaccctattgttcaagactgctgcagaacctgtgatggc
tgtctttatggtggtaaagaaatggcaaatggggaacagttcaccgatacctctgaccct
tgccggctatgtgtttgtagagaaggaacagtttcttgtgatagaagaagttgccctatc
ctggactgtccttttccagtacaggcccagtgctgcccagcttgtgaaggatgtaattat
gcaggtcaggaatacttgaatggacaggagttcacagatccccagaaccagtgcaaacgc
tgcacctgtataaatggatttgtgacatgtaatcccaaaccatgctataacccaggatgt
acccatcctatttctcttcctggtaaatgctgtccagtctgtgaagggtgctttttcaat
ggtatcacaattgcaaatggggagactttttcagatccttcagactcctgttcccactgt
acatgcaggtctggatcaattcattgcctaaagaagctctgcccatcagccccttgttcc
taccctgttgttgggcaatgtgaatgctcatactgtgaagggtgctatttccttggacaa
atatacactgatggtgaagtttttcctggttctaaaggaggttgtgaagaatgcacttgc
cttaaaggagaagtaacttgcggaacaaagaaatgcacccaagttgcatgtcctcacccg
ggattagatacctgctcttgtcctgtatgtgatggatgtagcttcaatggcagaaattgt
cataatggagagaattttccagacccaaaaaataagtgtcagcgttgcacttgtttgaat
ggaggtgtaacttgtgtatcagtaacttgtcctgctgtgaactgccgtcatccagtgaag
cctcctggagaatgttgtcctcagtgcacaggaatctgccattatttaggcaacatctat
gaaagcggggccacttttgactcttcttctgatagctgttcagtgtgcacatgtatgaat
gaggtggtgacatgtcagaagaaaccatgccgtgagcagtgtacacacccagtcccatca
tccagctgctgtccagtctgtgatcaatgcttccttgatggaactgaatttggcaacagg
caggcgttcttatctccttcagactcttgtcagcgctgtaattgcctcaatggaaatgta
gtatgcactggtgtgatttgtcctcaaacaacatgcaccagtcctcgcactatacccggg
cagtgctgtccagaatgtttaggctgtacctatttgggtaaagaatatgctgaaggtgtt
cattggatttcatcgattaatgaatgtctggagtgcggctgtgtgagaggagaagtgaag
tgttcagaggtgcactgtgatgtaaaatgtacagatcctgtccttgtgcctggtcagtgc
tgcccatattgccaggattgtttttttgaaggaaaggtctatcttaatggagatttattc
cacccagacacctgtcggcagtgctcatgcaaaaaaggaaatgttcattgtggcagcact
ccttgtcctcctttgaactgcatgcagcaagtgaccgatgttggatcctgttgcccacgc
tgtaagggatgtgtttacaatgggagggaataccatgatggcagtagttggtttgcttcc
acaacaccttgtatgtcatgcatgtgtgtagaaggagttactacctgctctgaaatacac
tgtgtcctaccttgtgtaaaccagatccatgttccaggagagtgctgccctgtatgtgca
gattgtgtatataacaaccacgtgtatggtccacaggaaagctttcaaccagcagatgat
ccatgtgagatctgtacttgtgaggtgatgccagatggagaacagcacttgcgttgttac
cgtaagcagtgcccaagtctggttgactgtcctaagagtcacatccatttcccatcgcca
gatcagtgttgccctacctgtgcacaacctcttagcaactgtacagctacccttttagga
aatgaaattcatgctacagatgatccttgctatacctgtcaatgcaaggacttgacatgg
acttgtattcatcaaggttgtcctcatttaagctgtccatcttctgagcagttcacccct
gcagattcctgttgtcccatatgtgacgagtgtttgattgaatctgaaaatcgtcgtgtt
tctgatggtgagagatggactgacagtgtagatgaatgcatcacttgtacctgtaacttg
ggtcacatagagtgtcacattgaagaatgcttgccagtgatttgtcaggatgggctggtg
aagatgaagtcccctgggaagtgctgttatgaatgccaagacccaaatacatcttgcata
taccagagcaccacgtaccagtctaatgagcactgggaagtagatgaatgcacgacatgt
acgtgtgtttcaggagaggttcactgtcaaactgagcgctgtcctcaggtcacttgtgcc
tctgatgagacggcagccctgattccaggaatgtgctgtccacattgtattccacgtcca
gcaacatgcattgcttttggagatcctcattaccgaacctttgatggtaagatgatcaac
ttccaaggcacatgtacatatgttctagcagaagactgtgaaggtggagattttagtatt
cacacaaccaatgatgacaaaggtcgtaaaggagtgtcctggataaaagaagttactgta
ctgattggagatgtagtggtgcagttgctacaagactggattgtcttggttgactatcag
acagtaaccttgccatttcttaaggagccatacatatatgttgaacgcaagacaaatacc
atactattgaacacaaacattggagtgaaggtgctgtggaatggaaagtcccacctggag
gtcagcgttccaggaacatacaaaggacacacatgtggtctttgcggaaatttcaacaac
taccctcaagatgatatgagaatacgcactgggcagattgtgttatctgaggctgctttt
ggaaataactggaaggttcaaggagagaatgttacaaatgtacaatgtgcagatggagac
gatgttgatccctgtaaggaagcaggataccgggctcgaaaggaaggcaattccaaatgc
aaaattctaaagtcaaaggtttttgaacgctgccatagtgtggtgccccccgaaatgttc
tttgcttcttgtgtgtacgatctttgcgcctgtgggtccaatgttgatgactgcttgtgt
gatgccctagaagcatatgcatctgaatgtcgagaggcaggaatcattctgcactggagg
tcaccatcactatgtgctgttggctgtcctcaggaccgtggttatgtttttgatgaatgt
ggtccaccttgtcctaaaacctgcttcaacaaagacgtaccccttggagtcatagaggct
cattgtttcaaaccctgcatcccaggctgccagtgtcccgctgggcttgtagaacatgaa
tctcactgtattttaccagaatcctgccctaggatcatctatggaaatatatga
DBGET
integrated database retrieval system
