Polypterus senegalus (gray bichir): 120537674
Help
Entry
120537674 CDS
T08668
Symbol
fbn2b
Name
(RefSeq) fibrillin-2b
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
psex
Polypterus senegalus (gray bichir)
Pathway
psex04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psex00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
120537674 (fbn2b)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
psex00536
]
120537674 (fbn2b)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
psex00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
120537674 (fbn2b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120537674
NCBI-ProteinID:
XP_039622714
LinkDB
All DBs
Position
10:134804483..134850800
Genome browser
AA seq
2863 aa
AA seq
DB search
MWTSWFRRLVLVWTMVSWTSAQPPRSLGDGAYEASRFSVGIDERDAANRVRRRGQESLRG
PNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNTCAEGFCSRPNMCTCSNGQLSPSCGAQA
VQSCNVRCMNGGSCNEDSCSCQKGYTGTHCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGP
QCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQISGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGF
IPNIRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHRQSETNQKCEDIDECSTI
SGVCDGGECTNTVGSYVCTCPRGYVTSPDGSRCVDQRRGSCYAALANGRCAEELRGSFTK
MQCCCESGRCWAAVHFPEMCPVRGSDEYRRLCIVGVPHNGGGGVGGGGGNGGFPGSNNID
FGNGNGGPGNGGGNGMGPNKIDTLNQTTDFCKHFTNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGFRQ
DVRGECIDVDECSSSPCVNGDCVNNPGSYYCKCHEGYQSTPTKQACIDIDECIMNGIMCR
NGRCVNTDGSFQCICNAGFELTPDGKNCADYDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGF
FLAPNGRYCTDIDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLPGLAIDVDGRVCVDTHMRSTCY
SSIKKGICTQSSQRATTKSECCCANPEHAFGEPCQPCPAKNSAEFQALCSSGIGITVDGR
DINECALIPDICQYGTCENLLGSYRCICNIGYESDPSGKVCIDVDECNVNRLLCDNGLCR
NTPGSYTCTCPKGFVFKSDSETCEDVNECESKPCVNGICRNTAGSFHCECSHGSKLDSSN
TVCVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCSTLGAAWGSPCERCEIDTACSRGFAR
TKGVQCEDVNECDVFPGICTNGQCVNTQGSFRCECSPGLTLDGTGRTCMDVRLEHCYLKW
EEDECGEPLPGKFRVDACCCSVGAAWGFDCEECPKPGTKEYEAICPRGPGFAIRGEVLTG
RPFYKDVNECKVFPSLCSHGTCRNTIGSFRCRCNSGFALNAEERNCTDIDECRISPDLCG
HGSCVNTPGSFDCECFEGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGTCINTDGSFECICPP
GHELSSDGVSCVDVNECELSENLCRNGRCVNMAGTYQCSCNPGYQGTPDRQGCVDIDECT
IMNGGCDSHCTNSEGSYECSCREGYALMPDKRTCADIDECEDTPDICDGGQCTNIPGEYR
CLCYDGFMASMDMKTCIDVNECDLNPNICLHGSCENTKGSFICHCQLGYFVKKGSTGCTD
IDECEIGAHNCDMHAACVNVPGSFKCRCRDGWIGNGLKCTDLDECATEDHNCNLNANCVN
TPGSYRCACKDGFSGDGFSCSDVDECADNVNLCENGQCLNAPGGYRCECEMGFTPTEDSK
ACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCICDDGYELDRGGGNCTDVNECADPVNCINGLC
VNTPGSYLCNCPPDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLSTLDRGDGGISCSAEIGVGVTRASCC
CSRGGAWGNPCELCPPVNSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGNCF
NTFGSFQCECPLGYYLNEDTRICEDIDECTAHIGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQVN
GGNNCMDMRKSLCYRNFNDTCENELSFNMTKKMCCCSYNVGKAWNKPCEACPTPATPEYQ
LLCGNQAPGFIIDIHTGKPIDIDECREIPGICANGVCINQIGSFRCECPMGFSYNNILLI
CEDIDECNNGDILCQRNANCINIPGSYRCECSPGFKLSPTGACIDRNECQEIPNVCSHGE
CIDTQGSYRCACHNGFKATADLTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFELTH
NNDCMDVDECSALIGQVCRNGQCINRLGSFQCLCQEGFELTPDGKNCIDINECISFPGTC
SPGTCQNLDGTFRCICPPGYSVQNDHCIDIDECKEEPNLCMFGTCTNIPGGFQCNCQPGY
VLSDNGRRCFDTRQSFCFTRFDAGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPQEG
EVTFQDLCPFGHGVIQGNGNTREDVNECLENPGVCVNGVCINTDGSFRCECPFGYNLDYT
GVNCVDTDECLIGNPCGNGTCSNVVGGFECACDEGFEPGPMMTCEDINECSLNPLLCAFR
CVNTFGSYECTCPAGYTLRDDRRMCRDQDECAEGLHDCESRGMLCKNLIGNFMCICPPGM
QRHPDGESCIDENECRTKPGICKNGRCINTEGSFRCQCNEGFQVSVTGTECIDNRQGFCF
TEVLQVMCQQSSTNRNTVTKSECCCNGGRGWGSHCEICPLPGTTQYKKMCPLGPGYTTDG
RDIDECRVLPNLCKNGQCVNTIGSYRCHCNNGYTSDLTSTSCVDMDECAQSPKPCNFICK
NTEGSYLCSCPRGYILQPDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHQS
ACIDNNECSSQSNVCGSKGMCQNTPGSFSCDCQKGFSLDGTGQNCEDVDECVGNHRCQHG
CQNMLGGFRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECAGAQICGSASCYNTLGSFKCVCPSGFDFE
QNAGGCQDVNECSSDSNPCSYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRAGQGHCITGAGFSQVPYLTS
QPEEDDESALSPEACYECKINGDQKKRRQRRNIEENEIQKDSLNLASVDIDSSIPMNLSL
AAIQKEPILELLPAIEPLERHVRYIISKGNEDAHFRILQRRDGKSVLRFGRKLPPPGSYR
LEIASVRLFGPQELRHLEDEHDIDYLLGETGDALRLKLNLHLH
NT seq
8592 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggacctcctggttcaggaggttagtccttgtttggacaatggtgtcttggacctca
gcccaaccaccccgttctctgggagatggggcctacgaagccagcagattctccgtggga
attgatgaaagagatgctgctaaccgtgtgagacgcaggggccaggaatcacttcgtggc
cccaatgtgtgtggttcaaggtttcactcctattgttgtccaggatggaagaccttacca
ggaggaaaccagtgcatcgtgcctatctgcaggaacacatgtgcagagggtttctgctca
cgtcccaacatgtgtacttgctctaatgggcagctctcacccagctgtggtgctcaggca
gtgcagtcctgtaatgtccgctgtatgaatggaggtagctgcaatgaagactcctgttcg
tgtcaaaaaggctacacaggaacacattgtgggcagcctgtctgtgaaaatggctgtcag
aacgggggacgctgtatcggacctaaccgctgtgcctgtgtctacggctttactgggccc
cagtgtgagagagattaccgcactggaccatgcttcacacaagtcaacaatcaaatgtgc
caagggcagatcagtggaattgtctgtaccaagaccttgtgctgcgccactattggacgt
gcttggggtcacccttgtgaaatgtgcccagctcaaccacacccgtgccgcagaggcttc
atccccaacatccgtacaggggcctgtcaagatgtggacgagtgccaggcaataccaggg
ttatgccagggaggaaactgcatcaacacagtaggttcttatgaatgcaagtgcccagca
gggcaccggcagagcgagaccaaccaaaagtgtgaggacatcgacgaatgcagtaccatc
tcaggcgtgtgtgatgggggagagtgtaccaacacagttggtagctacgtgtgcacgtgc
ccacgtgggtatgttacaagcccagatggatctcgttgtgttgatcagcgtcgggggtca
tgttatgctgctcttgctaatggacgttgtgctgaagaactacgtggctcatttaccaag
atgcagtgctgctgtgaatctggtcgctgctgggctgctgtccatttcccggagatgtgt
cctgtgagaggctctgatgagtaccggagactatgcatagttggtgttccccacaatgga
ggtggtggtgttggtggtggtggaggaaacggtggctttccaggctcaaacaacattgac
tttggtaatgggaatggtggacctgggaatggaggtggcaatggaatggggcccaacaag
atagatactttgaaccagacaacagatttctgcaagcacttcaccaacctctgcttgaat
ggacgatgcattccaacaccatccagctaccgttgcgagtgcaacatgggcttccgacag
gatgttcgtggagaatgtattgatgttgatgagtgttccagtagcccttgtgttaacgga
gactgcgtgaataatccaggatcgtactactgcaagtgccatgaaggatatcagagtacc
ccgacaaaacaagcttgtattgatattgatgagtgcatcatgaatggtattatgtgtcgg
aatgggcgctgtgtgaacacggatggaagctttcagtgcatctgtaatgctggctttgaa
cttactcctgatggcaagaactgtgcagattatgatgagtgtgccaccacaaatatgtgc
ctgaatggaatgtgcatcaatgaggatggcagcttcaagtgcatctgcaaaccaggattt
ttcctggctccgaatgggcgctactgtacagatattgatgaatgccagacccctggaatc
tgcatgaatggtcgctgcatcaatacagaagggtctttccgctgcgaatgcctacctggc
ttggcaattgatgtggacggtcgtgtatgtgtggacacacacatgcgcagcacgtgctac
agcagcataaagaaaggaatctgcacacagtcatctcagagagccaccacaaagtcagaa
tgctgttgtgctaacccagagcatgcctttggagagccatgtcagccatgcccagccaag
aactcagctgaatttcaggccctgtgcagcagtgggattggcatcactgtagatggaaga
gacattaatgaatgcgctctcatccctgacatctgtcagtatggcacatgtgagaacctg
ttgggcagctaccgttgcatctgcaatattggatatgagtcagatcccagcggcaaggtc
tgcatagatgtggatgagtgcaatgtgaaccggctgctttgtgataatgggttgtgccga
aacacccctggaagttacacctgcacctgtccaaagggtttcgtattcaagtcggattct
gagacctgcgaagatgtgaatgagtgtgagtccaaaccctgtgtgaacggaatatgccgt
aacacagctggctctttccactgcgagtgttcccacggtagtaaactagactccagcaac
acagtttgcgtggacagcatgaaaggaacctgctggctcaatattcaagatggccgctgt
gaagtaaacattaacggtgcaaccctcaagtcagagtgctgctccactctaggtgcagct
tggggcagcccatgtgagcgctgtgaaattgatactgcctgctccagaggctttgctcgt
acgaaaggagtccagtgtgaagatgtgaacgagtgtgatgtgttccctggaatctgcacc
aatgggcaatgtgtaaatactcagggctccttccggtgtgaatgctcaccagggctcacc
ttggatggcactggcaggacttgcatggatgtacgcctggaacactgttacttgaaatgg
gaggaagatgaatgtggtgagccactcccaggaaaattccgcgttgatgcatgctgctgc
tcagttggtgctgcatggggtttcgactgtgaagagtgtccaaaaccaggaaccaaggag
tatgaggccatctgcccccgagggccaggttttgccatccgtggtgaagtcctaactgga
agacccttctacaaagatgtaaatgaatgcaaagtgttccccagcctctgctcccatgga
acttgtcgcaacactattgggagttttagatgccgttgtaacagtggctttgccctcaat
gcagaggagagaaactgcacagatattgatgagtgccgtatctcccctgacctgtgtggt
catggcagctgtgtgaacacaccaggaagctttgactgtgaatgttttgaaggctatgag
agtggattcatgatgatgaagaactgcatggacatcgatgagtgtgagagggatccttta
ctgtgccgtggtggtacttgcatcaacactgatgggagctttgagtgcatctgccctcct
ggccatgagcttagttctgatggggtgtcctgtgttgatgttaatgaatgtgagctcagc
gagaacctatgcagaaatggacgttgtgtgaacatggctggcacttaccagtgctcttgc
aaccctggttatcagggcactcctgacaggcaaggatgtgttgatattgatgaatgcaca
atcatgaatggaggatgtgattctcattgtaccaactcggagggcagttatgagtgcagc
tgtcgtgagggttatgccctgatgcctgataagagaacctgtgcagatatcgatgagtgt
gaagataccccagatatctgtgatggaggccaatgcaccaacatccctggggagtaccgc
tgcctctgctacgatggcttcatggcctccatggatatgaaaacctgcattgatgtcaat
gaatgtgacctgaaccccaacatctgtctacatgggagctgtgagaataccaagggatca
tttatttgtcattgtcaactgggttattttgtgaagaaaggaagcacagggtgcactgat
attgatgagtgtgaaattggagcacacaattgtgacatgcatgcagcttgtgtgaatgtt
ccagggagcttcaagtgtcgctgtcgtgatggatggatagggaatgggctgaagtgtaca
gacttggatgagtgtgccacagaggaccacaactgtaaccttaatgccaactgcgtcaac
acaccaggctcttaccgctgtgcgtgcaaagatggctttagtggagatggtttctcctgc
tcagatgttgatgaatgtgcggacaatgtaaacctttgtgagaatgggcagtgcctaaat
gctccaggaggctaccgctgtgaatgtgagatgggttttacccctactgaggacagcaaa
gcatgtcaggacattgacgaatgcaccttccagaatatctgtgtctttggaacttgccag
aacctgcctggtatgttccgatgcatttgcgatgatggatatgagttggaccgtggtggt
ggcaactgcacagatgtcaatgaatgtgctgatcctgtgaactgcatcaatggcctgtgt
gttaatactcctggaagctacctttgcaactgtcctcctgactttgagcttaacccaact
ggggttggctgtgttgatacacgtgttgggaactgcttcctgtccaccctagacagagga
gatggtggtatttcttgcagtgctgagattggtgttggtgtcactcgggcctcatgctgc
tgttcccgtggtggtgcctggggcaacccctgtgaattatgccctcctgtaaactcaacg
gaatacaagactttgtgtcctggaggagaagggttccgtccaaacccaattactgtcatt
ttggaggacatcgatgaatgccaagaactgcctggcttgtgccagggaggaaattgtttt
aacacttttggaagtttccagtgcgagtgtccattaggttactacctcaatgaagataca
cgaatctgtgaagatattgatgagtgcaccgcccatattggaatctgtggccctggaacc
tgttacaatacactgggcaattacacttgtgtctgccctcctgagtacatgcaggtcaat
ggaggcaacaactgtatggacatgaggaaaagcttgtgctaccgcaactttaatgacacc
tgtgaaaatgagctgtcttttaacatgaccaagaaaatgtgctgctgctcctacaatgtg
ggcaaggcctggaacaaaccatgtgaggcatgtcctactccagccacaccggagtaccag
cttctatgtggtaaccaagcacctggattcatcattgacattcacacaggaaaaccaata
gatatcgatgaatgccgtgaaatccctggaatctgtgccaatggcgtatgcatcaaccaa
attggtagtttccgctgtgaatgtcccatgggcttcagctacaataacatattgctcatc
tgtgaagacattgatgagtgcaataatggtgatatcctctgccagcgaaatgccaactgc
attaatatccctgggagctaccgctgtgaatgctctcctggtttcaagctgtcccctaca
ggagcctgtatagatcgcaatgaatgccaggaaattcccaatgtctgtagccatggagag
tgtattgacactcaaggtagctaccgctgcgcttgccacaatggtttcaaagctactgct
gacttaaccatgtgtatggatattgatgagtgtgaccggcagccatgtggaaatggcacc
tgtaagaacacggtgggctcctataattgcttgtgcttcccaggctttgagctgactcat
aacaacgactgtatggatgtggatgaatgttcagctctgattggccaggtgtgccgtaat
ggtcagtgtatcaacagactgggttccttccagtgtctttgccaagaaggctttgaattg
acacccgatggaaagaactgcattgacatcaatgagtgtattagcttccctggaacctgc
tctcctggcacatgccagaatctggatggcacattccgctgcatctgccctccgggctat
tcagttcagaatgaccactgcattgatattgacgaatgcaaggaggagcccaacctttgt
atgttcgggacttgcaccaacatccctggtggctttcagtgcaactgccaaccaggttat
gttttgtctgacaacggcaggcgctgctttgacacacgtcagagtttctgtttcacccgc
tttgatgctggcaaatgttcagtaccaaaagccttcaacacaaccaaggccaagtgctgc
tgcagcaaaatgcctggtgagggatggggagacccttgtgaactttgcccacaggaagga
gaggtaaccttccaggatctgtgcccctttggccatggggtgatccaaggcaatgggaac
acccgtgaagatgtaaatgagtgcttagaaaaccctggtgtttgtgtgaatggagtgtgt
atcaacacagatggctcattccgctgtgagtgcccctttggctataacctggactacact
ggagtcaactgtgttgacactgatgagtgtctaattggcaacccctgtggcaatggaacc
tgctccaatgttgtgggtggttttgagtgtgcctgtgatgaaggatttgaacctggaccc
atgatgacctgtgaagacatcaacgagtgctccctgaacccactgctctgtgccttccga
tgtgtcaacacttttggctcttatgaatgcacctgcccagctgggtacaccctgagggat
gacaggcgaatgtgcagagaccaggatgaatgtgctgagggtctgcatgactgcgaatct
cgagggatgttgtgtaaaaaccttattgggaacttcatgtgcatctgtccacctggtatg
cagcgccatccagatggggagagctgtattgatgagaatgagtgtcgcacaaaaccaggc
atctgcaagaatggccgctgtatcaatacagagggtagtttccgatgccagtgtaacgag
ggtttccaggtcagcgttactggcacagagtgtattgataaccgtcagggcttctgcttc
actgaggtactccaggtcatgtgccaacagtcctctaccaaccgcaacactgtcaccaaa
tctgaatgttgttgcaatggaggtcgtggctggggatcccactgtgagatctgccctctg
ccaggtaccacacaatacaagaaaatgtgtccattaggtcctggatacacaacagatgga
agagatattgacgagtgtcgtgtactgccaaacctttgcaagaatggccagtgtgtgaac
accattgggtcatatcgttgccactgtaacaatggctacaccagcgacctgaccagcaca
tcttgtgtcgacatggatgaatgtgcccagtctccaaaaccctgcaacttcatatgtaag
aacacagagggcagctacctatgctcctgtcccagagggtacattctgcaacctgatggc
aaaacctgcaaagaccttgatgaatgttccactaagcaacataattgccagttcctctgt
gtgaacaccattggaggtttcacctgcaagtgcccgcctggtttcacacagcaccagtct
gcctgcattgacaataatgagtgcagttcccagagcaatgtgtgtgggtccaagggaatg
tgtcaaaatactccaggaagctttagctgtgactgtcaaaagggattctctcttgatgga
acagggcaaaactgtgaagatgtagatgaatgcgttggaaaccaccgttgccagcatggc
tgccagaatatgctgggtggtttccgttgtggatgcccacaaggttatgttcagcactac
cagtggaaccagtgcgtagatgagaatgagtgtgccggagcacagatctgtggctctgcc
tcctgctacaatacactgggtagctttaagtgcgtttgtccgtctggctttgattttgaa
caaaatgctggtggctgccaagatgtaaatgaatgcagttcagacagtaatccatgcagc
tatggttgctcaaacactgatggtggctacctgtgtggctgcccaggtggctacttcaga
gcagggcaaggccattgcatcaccggtgctggcttcagtcaagtcccatacctgacctca
cagccggaagaggatgatgagagtgccctttccccagaggcttgttatgaatgcaagatc
aatggtgaccaaaagaagagacgccagagacgaaacattgaagaaaatgaaatacaaaag
gattccctaaatctagccagtgtagacattgattcatctataccaatgaatctgagtctg
gctgctatccagaaggaacccatccttgaactattgcctgcaatcgaacccttggagcgg
catgtacgctatatcatcagtaaaggcaatgaggatgcccacttccgtatcctgcaacga
cgtgatggaaagagtgtgttacgatttggacgcaagttacctcctcctggcagctatcga
ctggaaattgccagcgtgcgtctctttgggccacaggagctgcgtcacctggaagatgaa
catgacatagactacctccttggggagactggtgatgccctgcgactcaaactcaacctt
catctgcattag
DBGET
integrated database retrieval system