Polypterus senegalus (gray bichir): 120542895
Help
Entry
120542895 CDS
T08668
Symbol
atrnl1b
Name
(RefSeq) attractin-like protein 1
KO
K24332
attractin
Organism
psex
Polypterus senegalus (gray bichir)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psex00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04091 Lectins [BR:
psex04091
]
120542895 (atrnl1b)
Lectins [BR:
psex04091
]
C-Type lectins
Others
120542895 (atrnl1b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_ATRN-LZTR1
Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7
GBD_ATRN
Kelch_5
Kelch_1
Kelch_4
Kelch_3
EGF_LMN_ATRN
Kelch_6
CUB
PSI
Kelch_2
EGF_TEN
NANM
EGF_Teneurin
EGF_2
EGF_laminin
TMEM100
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120542895
NCBI-ProteinID:
XP_039631549
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(281597242..282673193)
Genome browser
AA seq
1367 aa
AA seq
DB search
MDAPKNLQKGLLLFRCHGYSLSGWVLINRYLMVYILFYLVLYAEASHSKPCDKNCYFGRC
FNGTCLCDQGWVGDQCQHCQGRFKLTEPSGYLTDGPINYKYKTKCTWLIEGYPNAVLRLR
FNHFATECSWDHMYVYDGDSIYAPLIAVFSGLIVPEVRGNETVPEVVTTSGYALLHFFSD
AAYNLTGFNIFYSINSCPNNCSGHGKCTTGNSIASRVYCECDKYWKGEACDIPYCKNNCG
SPDHGYCDLTGEKLCVCNDSWQGPDCSLTVPSTESYWVLPNVKPFSPSVGRASHKAIVHG
KFMWVIGGYTFNYSSFQMVLNYNIESSIWNVVQINGGPLQRYGHSLALYQDDIYMYGGKI
ETGNGNVTDELWVFNIPSQTWTTKIPSVQAHGQQYGVEGHSAHIIEMDNGDVIMVIIFGY
SAIYGYISNVQEYNIRSNTWLVLETKGAIVQGGYGHSSVYDSMSKSVYVHGGYKALPASK
YGLVDDLYKYEVRTRTWTILKESGLARYLHSAVIISGAVLVFGGNTHNDTSLSNGAKCFS
ADFLAYDIACDEWRVLPKPNLHRDVNRFGHSAVVSNGSMYVFGGFSSVLLNDILVYNPPN
CEAFRNEGSCLSAGPGIRCLWSRDHCVSWHPSHTNGTIPDVQCPKKTTATDDRCYRFTDC
ASCTANTNGCQWCEDKRCISVSSNCSVSVKNYTKCHVRNEQICSKLTSCKSCSLNLNCQW
EQRQPECHALPAHLCGEGWNHVGDACLRINSSRESYDNAKLYCYNLSGNLASLTSSKEVE
FVLDELQKYTVQRITPWVGLRKINISYWGWEDMSPFTNTTLQWLPGEPNDSGFCAFLERA
EVAGLKANPCTAMADGLICEKPVVSPNQNARPCKTPCSLRTTCNNCTSQAMECMWCSSTK
RCVDSNAYVISFPYGQCLEWQTATCPSQNCSGLRTCTHCLEQPGCGWCNDPSNTGKGQCI
EGSSRGPMKVMGKQSQEMVLDQVLCPKEKNFEWAFIHCPACQCNGHSTCVNSSVCEHCRN
LTTGMQCEACMAGFYGDPTNGGKCQACKCNGHANVCQSQNGKCFCTTKGIKGDQCQLCDS
ENRYLGNPLRGTCYYSLLIDYQFTFSLLQEDDRHYTAINFMANPEQSNKNLDMSINASNN
FNLNITWSVGSTAGTISGEEIPIVSKSNIRDYRDSFSCEKFSFRNNPNITFYVYVSNFSW
PIKIQIAFSQHNSIMDLVQFFVTFFSCFLSLLLVAAVVWKIKQTCWASRRREQLMRERQQ
MASRPFASVDVALEVVGDQMDLLRGPLEGSPKPIAIEPCSGNKAAVLTVFICLPRGSSGV
PPPGQSGLAIASALIDISQQKPTECKDKSTGVRNRKQHPLTHQGTCV
NT seq
4104 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgcaccgaagaatctccaaaaaggacttctacttttcagatgccacggatactca
ctttccggatgggtgctcatcaacagatatttaatggtttatattttattctacctggtg
ctctacgccgaagcttcccattccaagccctgtgacaagaattgctactttggaagatgt
tttaacgggacgtgtctctgtgaccagggatgggttggagatcagtgccagcactgccag
ggcagatttaaattaactgagccttctggatatctaacagatggaccaattaattataag
tataaaacaaagtgtacctggctaattgagggatatccaaatgctgttttaagattacga
tttaaccactttgctacagaatgtagttgggaccatatgtatgtttatgacggtgactcc
atttatgcacctttaatagcagtgttcagtgggcttattgttccagaggtacgtggaaat
gagactgtaccagaggtagttacgacgtctggctatgcattgttgcacttttttagcgac
gctgcctataatttaacagggttcaacattttttactcgattaactcatgtcctaacaac
tgctcaggccacggcaagtgcacaacaggaaactcaatcgccagcagagtatactgtgaa
tgtgacaagtattggaaaggtgaagcatgtgatatcccctactgtaaaaacaactgtgga
agtcctgaccatggatattgtgacttgactggagagaaattgtgtgtttgcaatgacagc
tggcaaggtcccgactgctccctaacagttccatcaacagagtcctattgggtgctgcca
aatgtgaagccattcagcccatctgttggtcgagcatcccataaagcaattgtccatggg
aagtttatgtgggttataggtggctatacgttcaactatagctccttccaaatggtttta
aactacaatatagaaagcagtatatggaatgtagtgcagatcaatggtgggcctcttcag
agatatggtcactccctcgccttatatcaggatgatatttacatgtatggagggaagatt
gaaactggcaatgggaatgtcacagatgaactgtgggtttttaacatccctagccagacc
tggacaacaaaaatcccatctgtgcaagctcatggtcagcaatatggtgtggaaggtcat
tcagcccacatcatagaaatggacaatggtgatgttatcatggttatcatttttggatat
tctgctatttatggatacatcagcaatgttcaagaatacaacataaggtcgaatacttgg
ctagtgctagagaccaaaggagcaattgtccagggtggttatggtcacagcagtgtttat
gatagcatgtcaaaatcagtttatgtgcatggtggatacaaagcccttcctgctagtaaa
tatggcttggtggatgatctctacaaatatgaagttcgtacgcggacatggacaatctta
aaggaaagtggactggcacggtatctccattcagctgttatcatcagtggggctgttttg
gtttttggaggaaatacacataatgatacatctttgagcaatggggcgaaatgcttttct
gcagatttccttgcttatgacattgcatgcgatgaatggagagtgttgccaaagcccaat
ctacaccgggatgtcaaccgatttgggcactctgctgttgtcagcaatgggtccatgtat
gtgtttggcggcttttcaagtgtgcttttaaatgatattttagtgtataaccctcccaac
tgtgaagctttcagaaatgaaggttcttgcctcagtgctggtccaggtatccgatgtttg
tggagcagagatcactgtgtctcctggcatcccagtcataccaatggcaccatcccagat
gtgcagtgcccaaaaaagacaacagctacagacgacagatgttacaggttcacagactgc
gccagttgtactgcaaacactaatggctgccagtggtgtgaggataaaagatgcatttct
gtatccagcaattgttcggtttctgtaaaaaattacaccaagtgccatgtaaggaatgaa
cagatctgtagcaagctgacaagttgtaagagctgctctttaaacttgaactgtcagtgg
gaacagcggcagcctgaatgccatgccttgcccgcgcatctctgtggggaaggatggaat
cacgttggggatgcctgcctgagaattaattcaagcagagagagttatgataatgcgaag
ttgtattgttataaccttagtggcaaccttgcctctttgacatcatctaaagaggtggaa
tttgtcctggatgaactgcaaaaatacactgtacagaggatcacaccttgggttggactg
aggaaaatcaatatttcttactggggctgggaggacatgtctccatttacaaacacaaca
ttgcagtggttacctggtgaaccaaatgattctggattctgtgctttcctagaaagagca
gaggtggcaggattaaaggccaatccatgcactgcaatggcagatggtttaatctgtgag
aagcctgttgtgagccctaaccaaaatgccagaccctgcaagacaccatgctccttgcga
acaacctgcaataactgcactagccaagccatggagtgcatgtggtgcagcagtaccaaa
cgctgtgtggattctaatgcctacgttatctcattcccttatggtcaatgtttggagtgg
caaacggcaacctgtccctctcaaaactgttctggactgcgcacatgtactcattgttta
gagcagcctggctgtggatggtgcaatgaccccagcaacactgggaagggacagtgcatt
gagggatcttcaaggggtccaatgaaggtcatggggaagcaaagccaagaaatggttttg
gaccaagtgttgtgccctaaagagaagaattttgagtgggcatttattcactgtccagca
tgtcaatgcaacgggcacagcacttgtgtgaacagcagtgtgtgtgaacattgtaggaac
ctgaccacaggcatgcagtgtgaggcctgcatggcaggtttttatggagatcctaccaat
ggaggaaaatgtcaagcttgtaagtgtaatggacatgctaatgtttgccagtcacagaat
ggaaaatgcttctgcactaccaaaggaattaaaggagaccagtgccaattgtgtgactca
gaaaacagataccttggcaatccactcagggggacatgttactatagccttctcatcgac
tatcagttcaccttcagccttctccaggaggatgaccgtcattatacagctatcaacttc
atggctaacccagagcagtcaaacaagaatcttgatatgtctataaacgcatccaacaat
ttcaatttgaacatcacatggtcagtgggatcaacagctgggacaatatcaggagaggaa
attccaattgtttctaagtcaaatataagagactacagagacagcttctcttgtgagaag
ttcagcttcaggaacaatcccaacatcaccttctatgtgtatgtcagcaacttctcatgg
ccaataaaaatacagattgcgttctcccagcacaacagtataatggaccttgtgcagttc
tttgtaaccttctttagttgcttcttgtcactgctccttgttgctgccgtcgtgtggaag
atcaaacagacctgctgggcttccagacgcagagagcaactcatgagggagagacagcag
atggccagccgtccctttgcctctgttgatgtggcgctggaagttgtaggtgatcagatg
gaccttctgcgtgggcctttagagggttccccaaagcccatcgctatagagccatgctca
gggaacaaggcagcagtgcttacggtgtttatatgtctcccaagagggtcatcaggggtt
cctcctccaggccagtctggtttggcaatagccagcgcactgatagacatttcacaacag
aaacccacagaatgcaaagacaagagcacgggagtgcggaatcgaaagcagcatcccctg
acgcaccaagggacttgtgtttga
DBGET
integrated database retrieval system
