KEGG   Plesiomonas shigelloides: SAMEA2665130_0627
Entry
SAMEA2665130_0627 CDS       T04378                                 
Symbol
icsA
Name
(GenBank) Outer membrane protein IcsA autotransporter precursor
  KO
K12678  autotransporter family porin
Organism
pshi  Plesiomonas shigelloides
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pshi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pshi02000]
    SAMEA2665130_0627 (icsA)
   02044 Secretion system [BR:pshi02044]
    SAMEA2665130_0627 (icsA)
Transporters [BR:pshi02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   SAMEA2665130_0627 (icsA)
Secretion system [BR:pshi02044]
 Type V secretion system
  Autotransporter-1 (AT-1) family
   SAMEA2665130_0627 (icsA)
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter AC_1 Trypan_PARP BatD
Other DBs
NCBI-ProteinID: SBT60185
LinkDB
Position
1:685499..688825
AA seq 1108 aa
MKCSHNSIFTIGLLAASISSAFAAVQSFDDGGVHNLVGVIGDNKGNPNTPAVSASNGSTV
NIEEQSSISAFSPYSFGVLSSDAATVNITNSKVNSVSNYSFSVAAKQGGTVNISGSEITS
ESGGKKLPSSGSVLSSGNGAVVNIDNSKVIASSNGSTTAHDGLRVVNSAGVISENNGSVN
ITNSSVITSGDVSSGIFAQAKGNVLASGVDVTTSGKTSSAIEITGGSEAIINNNSVIKTT
GDDSHGIELVGGNVTLSDSSVMTAGLSNAANAQGANSSLSVENSTLSTVGDSAQAIYAGN
KANVSLNKVGVSTSGLGAYGVLATDKDTIVSITDSSISTSGNNNSALNYSSNAVVSQFGS
TVTLSGTNKIDTKGNQAVGLLSQVSGEGLDTLITATGKTEISTEGYNSFGLVSCSLQGGG
RECVSALEDGNDGNNPSSKSLIEGTGITVNTKGEGGYAVYANGKDATVNIKQSSLSTTGV
NAHGIAIRQGSVIGDNLNVKTSGVGANGATLFNGGTLGLSNSSLVSDNANGLLITGNGSL
NPAVIALDNSSVDGAVSGVAINDGSANINLLDSHLMSSRSNVLLDNKGGELAINAQGSIL
DGVSVLGDSGNTDVSLANSVWKQSAGSVLNNLAMSGSDLYFGKGNDVVLSSPDRTVHVKG
NYHGDNATIHFVTKLEGDNSETNKLIIDGDSSGTSLVSVSNAGGMGDQTINGIELISVAG
ESNGIFKQKSRIVAGAYDYQLTKKEKDWYLVSHLTTPEPTPEPTPEPTPEPTPEPTPEPT
PKPLIRPEVGSYLANNIAANTMFNMSLYDRIGSTYHADFNGEKNHSLWLRQVGEHTSFND
SSDGTKTRVNSFTTQLGGDIYKGSSNGNDSITFGAFGGYGYSSSKTRADLTGYSAKGHVD
GYSLGFYGTWFENPQQEKGLYVDSWLQYSWFNNSVDGQELSTEKYKSKGTTASLEIGNIN
KLKETIAEDGTKTSLIVKPHAQLIYMGVRPDTFVEGNGTVVKSNISGNFQTKLGVRLSLN
EKSIDAEKEVKDITPFVEANWIHNTRDNSVSMNGYNIAEAGVKNVAQIKVGVDGNVKNNL
SVWANTSVQVGAHNYTSIQGMIGVSYKF
NT seq 3327 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatgttctcataattcaatatttacaataggtttattagctgcttcaattagtagt
gcgtttgctgctgttcaaagttttgatgatggtggtgtgcacaatctcgttggcgtcatt
ggtgacaataaaggaaaccctaacacgcctgcagttagcgcttcaaatggctctactgta
aatattgaagagcaatctagcatatcagcattttcaccttattcatttggtgttttatca
tcagatgctgcaactgttaatataaccaattcaaaagttaatagtgtttctaactattca
ttttccgttgctgcaaaacaaggcggtacggttaatatatcaggttctgagattacgtct
gaatcaggaggtaagaaacttccgagcagtggttcagtattgagtagtggcaatggggcg
gtcgtcaatattgataactcaaaagtgatcgcatcatccaatggctcaactacggctcac
gatggattaagagttgttaatagtgccggtgttatatctgagaataatggctctgtcaat
ataaccaactcaagtgttattacatcaggcgatgtttcatctggcatttttgcacaggca
aaggggaatgttttagcctctggagttgatgttactacatcgggaaaaacaagctctgct
atagaaattactggtggttcagaggcaataataaataacaattctgttataaaaactact
ggtgatgattctcatggcatcgagttagtcggtggtaatgtgacactgtctgattcatct
gttatgacagcggggctttctaacgctgctaatgcacaaggtgctaactcatcgttatct
gttgaaaattctacgctatctaccgtaggagatagcgctcaagctatttatgcgggaaac
aaagcaaacgtttcgctgaataaagtaggtgtatccacctctggattaggggcatatggt
gtactagcaacagataaagatacaatagtatctattactgacagctccatttctacatca
ggaaataataattcagcactaaattattcatccaacgctgtagtgagccaattcggtagc
actgttaccttaagtggtactaataaaatagatacaaaaggtaatcaggcagttggttta
ttatcacaggttagtggtgaaggattagatacattaattacagctacaggtaaaactgag
attagcacggagggatataattctttcggtttagtgtcatgttcactacaagggggcggt
cgtgagtgtgtatccgccctggaagatggtaatgatggaaacaatccaagcagtaaatcc
ttaattgaagggactggcataacagtcaataccaaaggtgagggcggctacgcagtttat
gctaatggtaaagatgcaactgttaatataaaacaatcatctttatcgacaactggtgtt
aatgcacatggtattgctattcgtcaaggttcggtaattggcgataatttgaatgtaaaa
acctcaggtgttggtgctaacggtgccacattatttaatggcggcactcttggtttatca
aattctagccttgtatcagataatgctaatggtttactaattacaggtaatggctcacta
aatcctgcggttatagcgttggataatagctctgttgacggggcggtctcaggagtagcc
ataaatgatggttctgcaaatattaatttgctagatagccaccttatgtcatcgagatct
aatgttttgcttgataacaaaggaggtgagttagctattaatgcgcaaggttctatttta
gatggtgtatctgttttgggtgacagtgggaacaccgatgtttctttagccaatagtgtc
tggaagcaatcggctggttctgttctgaataatctggctatgagtggtagtgatctatat
tttgggaagggtaatgatgttgtattgtcctctcctgatagaaccgttcacgttaagggt
aactatcatggtgataacgcaaccattcacttcgttacaaaattagagggcgataactca
gaaaccaacaagttaattattgacggtgatagtagtggcacatctcttgtatctgtctca
aatgcaggggggatgggcgaccaaaccatcaacggaattgaattaatcagtgttgctggc
gaatccaatggtatttttaaacaaaaatcaaggattgttgctggggcgtatgattatcaa
ttaaccaagaaagagaaagattggtacttagtaagtcatcttacaacaccagagccaaca
ccagagccaacaccagagccaacaccagagccaacaccagagccaacaccagagccaaca
cctaagccattgataagaccagaggtaggtagttatttagctaataatattgcagctaat
acgatgtttaacatgagcctttacgatcgaattggtagcacataccatgctgattttaat
ggagaaaaaaatcatagtttatggttaagacaggttggggaacacacatcatttaatgat
tcatctgatggtactaaaactagagttaatagttttacgactcaattgggaggggatatt
tataaggggtcctctaatggtaatgattctattacctttggtgcatttggtggctatgga
tatagttcaagtaagaccagagctgatctgacaggttactccgcgaaaggtcatgttgat
gggtatagccttggtttttatgggacatggtttgaaaaccctcagcaagagaagggatta
tacgttgactcttggttgcagtattcttggtttaataactcggttgatgggcaagagttg
tctacggagaaatataagtcaaaagggacaacggcatctctagaaattggcaatatcaat
aaacttaaagaaactattgcggaagatgggaccaaaactagtctcatagttaaacctcat
gcgcagcttatttatatgggcgtaagaccagatacatttgttgagggtaatggtactgtt
gttaagtcaaatatttccggtaattttcaaacaaaacttggtgttagactctctcttaat
gagaagtctatcgatgcagaaaaagaagttaaagatattactccgtttgttgaggcgaac
tggattcacaatacaagagataattcagtttcaatgaatggatataatattgctgaggct
ggcgtgaaaaatgtagcccagatcaaggtcggtgttgatggtaacgttaaaaacaacctg
agcgtttgggctaatacatcagttcaggttggtgcccataattacaccagcattcaaggt
atgattggtgtaagttataagttctaa

DBGET integrated database retrieval system