Pseudoalteromonas shioyasakiensis: KQ246_03460
Help
Entry
KQ246_03460 CDS
T08873
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
psho
Pseudoalteromonas shioyasakiensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psho00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psho02000
]
KQ246_03460
Transporters [BR:
psho02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
KQ246_03460
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWV05584
LinkDB
All DBs
Position
738065..739444
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MSVKPQSKTKPDLLNSPILPTLKKMTIPMIFGMITLMMFNLVDTFFISLLGTEPLAAVSF
TFPVTFTVISLAIGLGIGTSAVIAKALGSDKLDEARFDASMSLLVSVVMVFSLSVMGYLL
IDPIFKLLGAGELVLPLIHDYMSVWFLGSVFLITPMVGNSVLRASGDTKTPSIVMGGAGL
INAILDPMLIFGFGPIPALGIQGAAIASVIAWSVAVVIILYILAIKNGLLSLHAGLQTPF
SSIQKILKIGLPAAGANMLTPIAMAVITALVAKHGPEAVAAFGVGSRIESIASLVVLALS
MTLPPFVSQNFGAGKFERVKEAYTKTLKFVMIWQFAIYILLLLTSGLIANVFGKEQAVMD
VIKLFIYILPLSYGLQGVIILSNSSFNALHKPMNALILSVVRLFVFYVPFAYIGSEFAGL
KGLFIGAAIGNLFTAVVAYRWFIKEVDGLSESYVKECHS
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgtgaaaccgcagagcaaaactaaacctgatcttttaaactcacccattctgcca
accttaaaaaaaatgaccattccgatgatctttggaatgatcaccctaatgatgtttaac
cttgttgacaccttctttattagtttactaggcactgaacctctcgccgctgtcagtttt
acctttcctgttacttttactgttattagccttgcaattggtttaggtataggcacttca
gcggttatcgctaaagccctcggtagtgataagttagatgaagctcgctttgatgccagt
atgtcattgttggtatcggttgtgatggtgtttagtctttctgtgatgggctatcttctg
atagatcctatttttaagttacttggtgctggtgaattagtattaccgcttattcatgat
tatatgagtgtatggttccttggcagcgtgtttttaattacacctatggttggcaactca
gtacttagagcaagtggtgataccaaaactccgagcattgttatgggtggagcggggctg
attaatgctattttagaccctatgcttatttttggctttgggcctattcccgcattaggt
atacaaggcgcagcaattgccagcgttattgcgtggtcggttgcggtggttatcatttta
tatattctagcaattaaaaatggcttattgagtttgcatgctggtttgcaaacaccattt
agctcaattcaaaaaattcttaaaattggtttaccagcggcgggggcaaatatgcttaca
ccaatagcaatggcggtaattacggcattagtggctaagcatggtcctgaagctgtagca
gcgtttggtgttggaagtcgaattgagtctatcgcaagtcttgttgtgcttgctttatcg
atgactttaccgccatttgttagtcaaaactttggtgccggtaagtttgaacgtgtaaaa
gaagcctacactaaaaccttaaaattcgtgatgatttggcagtttgctatttatatttta
ctgctattaacttctggcttgatagctaatgtatttggtaaagagcaggcggtaatggat
gttattaagctgttcatttatatcctaccgctcagttatggcctacaaggggtaattatt
ctatcgaactcttcatttaacgcattacataaaccgatgaatgcgcttattttaagtgta
gtacgtctgtttgttttttacgtgccttttgcttatatcggcagtgagtttgctgggtta
aaagggttatttattggcgcggctataggtaacctatttactgcggtggttgcctataga
tggtttatcaaagaagttgatgggttaagtgagtcttatgtgaaggagtgtcattcatga
DBGET
integrated database retrieval system