Pseudoalteromonas shioyasakiensis: KQ246_03840
Help
Entry
KQ246_03840 CDS
T08873
Name
(GenBank) DUF349 domain-containing protein
Organism
psho
Pseudoalteromonas shioyasakiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF349
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWV05637
LinkDB
All DBs
Position
829321..832002
Genome browser
AA seq
893 aa
AA seq
DB search
MIFKHLFTPKWKHPKNQVRLAAVERLDTERDLSILNSIALEDSSAEIRKKALNKVNDIVL
WWQAYKQDQALKDVAEQHINQAVLNTDSKLDANIKNEFIERYASVKTLEKLAFAEKEIQV
RVKLLKRLANPSLIDKAFKEGREELQLQLVELVISHQLAKSLLKHAKGEAYSQLAAYLEN
ERLATEMPAKVEADTRVVLAKLNALRDKNDFQLVSMQQAELLQQWQAIELKWLSDEQVST
LDKKYSAITQKLESHIAQLSKEHEAAQQALAEQQRQVLALASLEAIGEEIENALQLGLET
PEQIQQDWLEAKVAQAKDALTEANLPNNQNVRDVKQHLTNLFNQVEELPQLVTAIAEFKD
AFDKLNTVATTEEESEFDGLKQQFEQQQKLARKKLASIPNRLQGRFKANLAEAVNSWQQA
MAPLTNKFEKNQQTAKRKARDVKRLIDQGRFNVAFGVFKGFEELYATLTEYYKQPLNSLK
ADLEAQLAEAKDWQKYASAPKREALLAEVNELAATECTDPKQRAEQVKQLRRRWNELGRL
DTDAEKQQGELFDQQIELLFAPCREYFAEQEQQREQAKAQRLDTIKQMQELTDLDTSSDE
FDWKQFESKFNRTAKAWRSAGNVDPKTYRELQAQFKAAQSLVQAQLAAFHKANAEQKAAL
VEQATQLSQSDDLASACQELKVLQQTWQTIGFAGMKAENTLWQQFRRVNDDTFAKRSAEF
EQQKQVQQQNDEVAAAQLSELESALETVVHLAQLKDLTVKLAELEYSKALSARVSQLETA
ISAKTAHISKQAEQSKLTALFAALESGSELPSQFQAALTTNLNAAQLLTRIEILAGVESA
DSQLRMTEQVAMLDDKHRGEHADVYYYLKQLLAVSKGSVSADTLARLKTIFAI
NT seq
2682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatctttaaacacctgtttactccaaaatggaagcaccctaaaaatcaagttcgttta
gctgcggttgaacgtcttgatacagagcgtgaccttagtattttaaatagcattgctctt
gaagacagttctgctgagatccgtaaaaaagccctgaacaaggtcaatgatattgttcta
tggtggcaagcatacaaacaagatcaagcacttaaagacgttgcagagcaacatataaac
caagcggtgttaaacactgatagcaaactagatgcaaacatcaaaaatgagtttattgag
cgttatgcatcagtaaaaacgcttgaaaaactagcgtttgcagaaaaagaaattcaagtt
cgggttaaattattaaaacgcttagcaaatccaagtttaattgataaagcctttaaagaa
ggccgcgaagaactgcaattgcaacttgttgagcttgtcattagtcaccaacttgctaaa
tcattacttaaacatgcaaaaggtgaagcgtattcacagctagccgcttaccttgaaaat
gaacgcctagcaaccgaaatgcctgcaaaagttgaagcagatacacgtgtagtattagca
aagctgaatgcacttcgtgataaaaatgattttcagttggtatcaatgcaacaagctgag
ttattacagcagtggcaagctattgaattaaaatggttaagcgatgagcaagtaagcacg
cttgataaaaagtattcagcgattacgcaaaagcttgagtctcatattgcacaactaagc
aaagagcatgaagcggcgcagcaagctttagctgagcaacagcgtcaggtcttagcatta
gcaagccttgaagcaattggtgaagaaattgaaaatgcattgcaactgggtttagaaacg
ccagaacaaattcagcaagactggcttgaagctaaagttgcacaagcaaaagatgcgtta
acagaggcgaatctaccgaataaccaaaatgttcgtgatgtaaaacagcacttaacaaat
ttattcaaccaagttgaagagttaccgcaactagttactgctatcgctgagtttaaagat
gcatttgataaattaaacacggttgcgacaacagaagaagaaagcgagtttgacggcctg
aaacagcagtttgaacaacagcaaaaacttgcacgtaaaaagctggcaagtattcctaat
cgcttacaaggtcgctttaaagcaaatttagctgaagcagtaaatagctggcagcaagct
atggcaccgcttactaataagtttgagaagaaccaacaaacagcaaagcgtaaagcacgt
gatgtaaaacgcttaattgaccaagggcgctttaatgttgcatttggtgtgtttaaaggt
tttgaagagttatacgctacgctaacagagtattacaagcagccattaaatagcctaaaa
gctgatttggaagcgcaattagcagaagcaaaagattggcaaaaatatgcttcagcacca
aagcgtgaagcattacttgctgaagtaaatgaattagccgcaacagaatgtacagaccct
aaacaacgcgctgagcaagttaaacagctgcgtcgtcgttggaatgaattaggccgttta
gacactgatgcagagaaacaacaaggtgagttattcgatcagcaaatagagttgctgttt
gcaccatgtcgtgagtattttgctgagcaagagcaacagcgagaacaagctaaggcacag
cgtcttgatacaatcaagcaaatgcaagagctaacagatcttgatacgtcttctgacgag
ttcgattggaagcagtttgagagtaagttcaatcgtaccgctaaagcttggcgctcagca
ggaaatgttgatcctaaaacgtatcgtgaactacaagcgcaattcaaagctgcgcaatca
ctagtgcaagcacagctagctgccttccataaagcaaatgctgagcaaaaagcagcgctg
gtagagcaggcaacacagttatctcaaagcgatgatttagcgtctgcgtgccaagaactc
aaggtattgcaacaaacttggcaaactattggctttgcaggaatgaaagcagaaaatacc
ttatggcagcaatttagacgtgttaatgacgacacctttgcaaagcgcagcgccgagttt
gaacagcaaaagcaagtacagcagcaaaatgatgaagttgcagcagcgcagttgagtgag
cttgagtcagcacttgaaacagtggtgcatcttgcacagcttaaagatttgacagtgaag
ctggctgaacttgagtactcaaaagcattatcagcacgagtgagtcagttagagacagcg
attagtgcaaaaacagcgcacattagcaagcaagcagagcagtctaagttaacggcttta
tttgctgctcttgagagcggcagcgaacttccttcgcaattccaagctgcattaacgaca
aacttaaatgctgcgcagctcttaactcgtatcgaaattttggcaggcgttgagtcagct
gatagtcagttacgtatgacagagcaagttgcgatgttagatgataaacaccgtggtgaa
catgcagatgtttattattacttaaagcaattacttgcagtcagtaagggttcagtttca
gctgacacactagcaaggcttaaaacaatatttgcaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system