Pseudoalteromonas sp. JSTW: GZH31_09445
Help
Entry
GZH31_09445 CDS
T10506
Name
(GenBank) pectate lyase
KO
K01728
pectate lyase [EC:
4.2.2.2
]
Organism
psjs Pseudoalteromonas sp. JSTW
Pathway
psjs00040
Pentose and glucuronate interconversions
psjs01100
Metabolic pathways
psjs02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psjs00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
GZH31_09445
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
GZH31_09445
Enzymes [BR:
psjs01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.2 pectate lyase
GZH31_09445
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pectate_lyase_4
3keto-disac_hyd
Big_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLJ07051
LinkDB
All DBs
Position
2068615..2074782
Genome browser
AA seq
2055 aa
AA seq
DB search
MNSTIKIPSCLLLAAVLAGCGEESSVNVKEAPLPPIQGVFIDSPVAGLTYNSPSVTNGKT
DSNGQFDYFRGEAITFSIGELTFPSVAASNVVTPLSVFSTDTVFHPAVINSLRLLQSLDV
DGDTSNGITISDAAAQAAVMELAQGQTPAEFFASDDFDEKVNQWLANAGGANTSLVSADT
AIMHFVDFIFEQYNSTQPLAFTPADFTGTIYNPVVKGAKASIEMWQFIPSEEGASTGSFT
KLVDGNETLVGSYEFQFGNRVLVLTTSEGDTPSKHYLISRSHNTVNNTFSVCSTNDAAQL
ATLVLSCDNNDDAYNNILAFDEQQAQNELVKLSELAEQTGLALNEEFDTDTDTFFSSSYK
SLSDEQGSGPLYFKSGGSAIINELGQLVLEGDRFTIGNTLPGKESSPSDTMGVGIYNLSE
GFTISFDVISHNGAGSLSLYVDNNTTSQSNSVHADASKFYGKSIDETNLPVGQRFSYTYI
PGQDVNTGTELTHPDARGILSADIKNSYFQIRTDSAALLVIDNLKIETVATDVPEVVPPV
EPPIDPPATGEIPTVELPYTNDFTTVTGDIFSVDYQKIVDSQGNEVPMFSKTGGSVTVVE
NGLELDGGRFTLGNTTAGVETSENDTNSTGVFDLSRPYQVVMDIVSASDPEGDNKFQIYV
DNNTSSSSKSMHGGESRFFNELINDLVVGETLVVPGKLATKNSFLQLRTETGGKVVINNL
RIEYVEDPSIFKCSDAPELYFCDDFESGDLSNWKILATPTNVDGAMGEFDILNINGNNMM
RYTAGNAGGELILATDEAMQNIPQTGNYFVEAKIRPRQNSTTANKQLYMMARYQDTGNWY
GGGLNVQNSSSSTRVEVAVSTEGSIARPVQASTPILLGEKGGTEDGVWYTTRFELINDQL
TIYLNGENLGSVSDTNYSARGLIGLFTNNRSFELDDLKVGDPTIKPIQLTLDYKDPNWDT
STTAEPLTINVTAIKNDGVTIDEFTVTSTDDKIVSVDINGSVITLTPMAAGNATITFVSG
SDSTITRTIEVSVAEGFVMPTTDYGDLAGKLFPEKNSANQFIDTQFSLTFDNEPSLGALG
EVRIYKVSDNSLVDTLTVGKNIDHIGFAGQAKVRSVYYYPLQLNGNTLTIKPRNNTLEYG
HTYRVVIGDDVVVGAMLNGQEFSGLGDNSQWDFVTKVSMPAGNQLLVDDEGAADFRTVQG
ALNFAMQYLGKDEHTTVSIKDGIYNELLFLRDKNNLTIQGESQENTVIQYENYESMNGGT
GGCAPISTGTPNGGRSVFLVEGVDMLTLNNLTLKNTHIRNKVDSNQAETIYFNSPYRLVA
NNARFKSEQDTLLLKGYSWFYNTLVAGNVDFIWGYPTTALFESSEIRTIGDSKDGDPLTD
SAGGYVLQARVPVETDPGFIFLNSRFTHGPGPIGNDVLDNSTYIARSGGSDTYFDNITLI
NNRFDTHIAKIGWAVQGVNNQPAPNPSVATATSGWREYGSMDLDGNPLDLSEREGGYILS
DSEVSELLDRENIFADYNDGQGWSPKPLAIPQLPDEPVSIAPINPSRGFAGYNYNITGGE
GGTVVTVDNGASLKAALAQAKSSASAITIYVDGVITDANSGGDNKSIEIKDMNNVSIIGV
ADRGEFNGIGIAIRRANNIIIQNLKIHEVLTGGKDGISIEGDENETTANIWIDHNELYSS
LSVDQDYYDGLIDSKSGAENITISYNYIHDSWKTSLHGHSDNDDSSNKNRHITFHHNRFE
NIVSRVPLFRFGNGHIFNNYYNNITSSAINSRMGAELHIENNYFENTKNPVVSFYSAQIG
YWNTSGNYLGEGITWSDAADGDVRAEVTENGMTPTSSYKAPYEYTLTPVMDVKAHVLAHA
GVGKLDQSDLNIPDIQSPTEPPIQEPLGLPFTENFSAANTDEFFSNSYRDISGAAGNEQA
LFYRVTGNVDVAGGQLTMTGARISIANTTPSTSTTGNDTETTGLLDLSNNYQVTFKVAAV
AGNTAKNFQIYVDNNTSGSSNSIHGTASKFYSVPLSDLTAGQTYTVDGLVATSTSFITIR
TESEATITLDEISIQ
NT seq
6168 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagcacaattaaaattccatcttgcttattgcttgctgccgtacttgcaggctgc
ggcgaagaaagctctgtcaacgtaaaagaggcgccactcccccctattcaaggggttttt
atagatagccctgtcgccggattgacctataacagcccgtctgtgacaaacggtaaaacg
gacagtaatggccaatttgattatttccgtggtgaagcgatcacattttctattggtgag
ctgacatttccaagtgtcgcggccagcaatgttgtcactccactgagcgtattctctaca
gacaccgtatttcatcctgctgtaatcaatagtttgcgtttattgcagtcgttagatgtg
gatggtgacaccagtaacggtattaccattagtgacgcagcagcacaggctgccgtaatg
gaattagcccaaggacaaacacctgcagaattctttgccagtgacgattttgacgaaaag
gtaaatcaatggcttgctaacgctgggggagcaaataccagcttagtgagtgctgatact
gccattatgcattttgtagattttatttttgagcagtataacagtacacagcctctcgcc
ttcactcctgccgacttcacgggaacaatttataaccccgttgtaaaaggggcaaaagcg
agtattgaaatgtggcagtttatacctagtgaagaaggagcaagcacggggtcattcact
aagctagtcgatgggaatgaaacgcttgttggcagctatgagtttcagtttggtaatcgc
gttttagtattaacaaccagtgaaggtgatacaccgagtaagcattatttaatttctcgc
tcgcacaacactgtcaataatacctttagtgtgtgctctacaaatgatgcagcacagctt
gcaacgttagtacttagctgtgataacaacgatgatgcatacaacaatattttagcattt
gatgaacagcaagcccaaaatgagttggtaaagcttagtgaacttgctgaacaaaccggt
cttgcgttaaacgaagaattcgataccgacactgatacattcttctcatccagttataag
agcctctctgatgagcaaggaagtgggcctctttattttaaatctggcggcagtgccatt
atcaatgaattgggtcagcttgttttggaaggtgaccgtttcacaatcggtaatacccta
cctggtaaagaatcatcgccaagcgatacaatgggtgtggggatatacaatttaagcgaa
ggcttcactattagctttgacgtcattagccataatggtgcaggctctctttctttatac
gttgataacaatacaacaagccaaagtaactctgtgcatgctgatgcatcaaagttttat
ggaaaatcgattgatgaaaccaacctgcctgtcggacaacgcttctcttatacttatata
cctgggcaagatgttaatacaggaactgaattaacgcacccagatgcacgcggtattctg
agcgcagatattaaaaactcttactttcaaatcagaaccgattcagccgccttattagtc
atagataatctaaaaatagaaacagttgcgacagatgtgccagaagttgtgccacctgtt
gaaccgccaattgatccacctgcgacaggtgagattcccactgttgaactgccttacaca
aacgattttacgactgttactggtgatattttttctgtcgactatcaaaaaatagttgat
agtcaaggtaatgaagttccgatgttttcaaaaactggaggatccgtcaccgtcgtcgaa
aacggcttagaactggacgggggccgattcactttgggtaataccactgcgggcgtggaa
accagcgaaaatgatacaaactcaacgggggtatttgatttatcaaggccttaccaagtc
gtcatggatattgtcagtgccagcgatcctgaaggtgacaacaagttccaaatctatgtc
gacaacaatacatcaagtagctctaaatcgatgcacggtggtgaatctcgattcttcaac
gagttaatcaatgacttagttgttggcgaaaccttagtcgtacccggaaaactcgctacc
aagaactcttttttacaattgcgtaccgagacaggcggtaaagtagtgattaataattta
cgcattgagtacgttgaagacccaagtatctttaagtgttcagatgcacctgaactgtat
ttttgtgatgattttgaaagtggtgatttgagcaactggaaaattttagcaacgcctact
aacgtagacggtgccatgggtgaattcgatattttaaatatcaacggtaataacatgatg
cgatacaccgcaggcaacgcaggcggtgaacttattttagctacagacgaagcaatgcaa
aatatcccacaaacaggtaattattttgtagaagcgaaaattcgtcctcgtcaaaacagt
acaacagcaaacaaacagttgtatatgatggcccgttatcaagatacaggaaactggtac
ggtggcggtttaaatgtacaaaactcatctagtagcacgcgagtagaagttgctgtcagc
accgagggctctattgcacgccctgttcaggcaagtacacctattttactcggcgaaaaa
gggggcacagaagacggtgtttggtacaccacccgttttgaattaatcaatgatcaatta
accatttacttaaatggtgaaaacttaggctcagtgagtgatacaaattacagcgcacgt
gggctaataggtttatttactaataaccgttcatttgaattggatgacttaaaagttggc
gatccgactatcaaacccattcaactcacactggattacaaggaccctaactgggacacc
tcaacgacagctgaaccattaacaattaatgtcaccgccattaaaaatgatggggtaaca
attgatgaattcacagtgacttcaactgatgacaaaattgtcagtgtcgatatcaatggg
agtgtaattactctcaccccaatggcggccggtaatgccacgattacgttcgtctctggt
tctgatagtaccataacccgaacaatagaggtgagtgtggctgaaggttttgtcatgcca
acaactgactatggcgacttagctggaaaattatttcctgaaaaaaacagtgccaatcaa
tttattgatacgcaatttagccttacatttgataatgaaccaagtttaggcgctttaggt
gaagtacgtatttataaagtcagcgataacagtttagtcgatacccttaccgttggtaaa
aacattgaccacattggttttgctggacaagctaaagttcgctctgtttactactatcca
ctacagctaaatgggaacacgctcaccattaaaccacgcaataatacccttgagtatgga
catacataccgtgttgtaattggtgatgatgtcgtggttggtgcaatgctaaatggtcaa
gaatttagtggcctaggtgataacagtcaatgggactttgtcactaaagtaagcatgcct
gcaggtaatcagctgctcgttgatgatgaaggtgcggcagactttagaactgtgcaaggt
gcacttaattttgctatgcagtacttgggcaaagatgagcacaccactgtctccataaaa
gacggcatctataacgaactgttatttttacgcgataaaaacaacctcactattcaaggt
gaaagccaagaaaacaccgttattcaatatgagaattacgagtctatgaatggcggcacg
ggtggctgtgcacctattagcacaggaacacctaacggaggtagaagtgtgtttttagta
gaaggtgtcgacatgctgacccttaataatctcacccttaaaaatacgcatattcgtaat
aaagtggattcgaaccaagcagaaactatttatttcaatagcccgtaccgcctagttgcg
aacaatgcccgctttaaaagtgaacaagataccctcctgttaaaaggatactcatggttc
tacaacacgcttgttgcagggaatgttgattttatttggggttacccaacaacggcgtta
ttcgagagttcagagatccgtacaatcggtgattcaaaagacggtgatcctttaactgac
tcagcgggtggctatgttttacaagcgcgtgtacctgtagaaacagaccctggttttatt
ttcttgaatagtcgattcacacatggtcctggccccattggcaatgatgttttagataac
tcaacatacattgcaagaagtggaggcagcgatacatactttgataatataaccttaata
aacaataggtttgatacacatatcgctaaaattggctgggctgttcaaggtgtaaataat
caacctgctcctaaccctagcgttgccacagcaaccagtggttggcgcgaatatggcagt
atggatttagacggtaatccacttgatttatctgaacgcgaaggtggctatattctttca
gattcagaagtcagcgagctgctagaccgcgaaaacatttttgcagattataacgacggt
caaggatggagtccaaaaccacttgctattcctcaactaccggatgagcctgtcagcatt
gcgccaatcaatcctagtcgagggtttgcagggtataactataatatcaccggaggtgaa
ggcggtactgttgttactgttgataatggggcttcattaaaagcagccctagcacaagcg
aagtcttcagcatccgctattactatctatgttgatggtgtaatcacagatgctaacagt
ggcggtgataataaatctattgaaattaaagatatgaataatgtctcaattatcggtgtg
gctgatagaggtgagtttaatgggattggcattgctattcgccgcgctaacaacattatc
atccaaaacttaaaaattcatgaagtactcactggtggtaaagacggaatttcaattgaa
ggtgatgaaaacgaaacaacagcaaacatttggattgaccataatgagttgtattcttcg
ctctccgtggatcaagactattatgatggcttaattgactctaagtcgggtgctgagaac
attaccatttcttacaactatatacatgatagttggaaaacttcattacatggccatagt
gacaatgacgacagcagtaataaaaaccgtcatatcaccttccatcacaaccgctttgaa
aatattgtctctcgggtccctttatttaggttcggtaatggtcatattttcaataactac
tataacaatatcacttcaagtgcaattaattcacgtatgggagctgagctacacatagag
aataattactttgaaaataccaagaaccctgtggtttctttttattcagcacagattggt
tattggaacacatcaggtaattatctaggcgaaggcattacatggagtgatgcggcagat
ggggatgtacgagcagaagtgactgaaaacggcatgacgccaaccagctcatataaagca
ccttatgaatatacgcttacgcctgtaatggatgttaaagcacatgtacttgctcatgca
ggtgttggtaagctggatcaaagtgatttaaacattcctgatattcagtctccaacggag
cctcctatacaagaaccacttggattgccttttactgaaaacttctctgctgctaatact
gatgagttttttagtaacagctatcgtgatatttcaggagctgcgggtaacgaacaagcg
ctgttctaccgtgtaacaggtaatgttgacgtcgctggcggacagttaacaatgactggc
gctagaattagcattgctaacacaaccccaagtaccagtacgacaggaaatgacaccgaa
acaacaggcttgcttgatttatcaaacaactaccaagtaacgttcaaagttgcagcggtg
gctggaaacacagccaaaaactttcaaatttatgtcgataacaatacttcgggtagtagc
aattcaattcatggcactgcgtctaagttttattctgtgccgctgtctgacttaacagca
ggccaaacttatactgtggatggactcgttgcaaccagcacttcattcatcaccataaga
acggaaagtgaagcgactatcacattggatgaaataagcattcaatag
DBGET
integrated database retrieval system