Pseudoalteromonas sp. JSTW: GZH31_11265
Help
Entry
GZH31_11265 CDS
T10506
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psjs Pseudoalteromonas sp. JSTW
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psjs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psjs02000
]
GZH31_11265
Transporters [BR:
psjs02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GZH31_11265
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl
Porin_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLJ07368
LinkDB
All DBs
Position
complement(2472846..2475137)
Genome browser
AA seq
763 aa
AA seq
DB search
MKAMKRSTLATLINATLFSAVAGTSFSSIAEEATAEKTNQLEVIQITARKRVENAQEVPV
AVSALQGDKLDAYSSAGMDIRFMNAKIPSLSIESSYGRTFPRFYVRGLGNTDFDLNASQP
VSLVVDDVVQENAILKGFPVFDVARVEVLRGPQGTLFGRNTPAGLVKFDTVKPSQEFDGF
SSVSYGTNNAIDFRGAVGGGLTDNLSARVSVLWQDKDDYIDNRAPGFEQDDILGGYTDRA
ARIQFLYEKDDFSALLNYHVRNMEGTPIPFRANAIKAGSNDLVDGFKDDVVYHDAAAREF
QRVDAEGVSLKLEYDLEAHTITSITGWESAKVNSRGDIDGGYGAAFLGDYQGPGIIPFPS
ESESGLPKHDQYTQELRISSNFVGDFNYQTGLFYFDESVSIDNFGYNTLAGGALNGYVNQ
QQDTKAWAVFGTVDYTLTDDLKLTAGLRYSDDDKDFVAVRKIVPADLNECNNDLMQCQTD
ITRTEDASDDHISWDISASYKLNDDVNLYARVANTFRAPSIQGRITFADEVTKADSETVT
SYEMGVKSDVLDGRGRVNATVFYFNMDDQQLTAVGGTANTTRLLNADKTTGYGFELDTEW
MLTDELNATFNLSYNNTELKDKNVSIAVPQRPSLTITDPVVDGKAFIDGNSLPHAPEWIS
NLTLRYSKELAGGEFFTYADVSYRSEINYFLYESVEFEGKSLTEVGLRSGYAWSEGDYEY
EAAVFARNLFDEQQAIGAIDFNNNTAMVNEGRFVGVEFKVKFF
NT seq
2292 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagcaatgaaaagatctacgttagcaaccctaattaatgcaacgttgttctctgca
gtagcaggtacttcattttcttctattgcagaagaagccactgctgaaaaaaccaaccaa
ttagaagtcattcaaatcaccgcgcgtaagcgtgtagagaacgcacaggaagtacctgtt
gctgtttcggctctacagggtgataagcttgatgcttatagttcagctggtatggatatt
cgttttatgaatgcgaaaattccaagcttatcaattgaatcttcgtatggtcgtacattc
cctcgcttttatgttcgtggtctaggtaacactgacttcgatttaaatgcttcacaaccg
gtatcgcttgttgttgatgatgtcgttcaagaaaacgcaatcttaaaaggctttcctgta
tttgacgtggcacgtgtagaagtacttcgtggtccacaaggtacgttgttcggtcgcaac
acgccagccggtcttgtcaagtttgacacagtaaaaccaagtcaagagtttgacgggttt
agctcagtttcttacggtactaataatgcgattgactttagaggtgctgttggtggtggc
ctgacagataatttatcagctcgtgtttctgttttatggcaagataaagatgattatatt
gataatcgcgccccaggttttgaacaagatgacatactaggtggctataccgatagagct
gctcgtatacagttcttgtatgaaaaagacgatttttcagcattacttaattaccacgtt
cgtaacatggaaggtactccaattccattccgtgcgaatgccatcaaagcgggttcaaac
gacttagtcgatggttttaaagacgatgtggtctatcatgatgccgctgcacgtgaattc
caaagagtagatgctgaaggtgtaagcttaaaacttgagtatgatcttgaagcccatacg
attacttcaatcacaggctgggaaagtgcaaaagttaactctcgtggtgatattgatggt
ggctatggcgcagcattcttaggcgactaccaaggtcctggtattattcctttcccttca
gaaagtgaaagtggtttaccaaagcatgaccaatacacacaagaacttcgtatctcgagt
aattttgtcggtgattttaactatcaaacgggcttattctacttcgacgagtcagtaagc
attgataactttggttataatactttggctggtggtgcattgaatggctatgttaatcag
cagcaagatactaaagcttgggctgtatttggtacggtcgattacactttaaccgacgat
ttaaagctaacagcgggccttcgctactcagatgacgataaagactttgttgcggtccgt
aaaattgtaccagctgatttaaacgaatgtaacaacgacttaatgcagtgccaaactgat
ataacgcgtacagaagatgcgagtgatgatcatatcagttgggatatttcagcttcttac
aagttaaatgatgatgtaaatctatatgcgcgtgttgctaatacattccgtgcacctagt
attcagggccgtattacttttgcagacgaagtaaccaaagcggattcagaaaccgtgaca
tcttatgaaatgggtgttaaatcagatgtattagacggccgtggccgtgttaatgcgacc
gtgttctattttaatatggacgaccagcagttaactgctgttggtggtacagcgaacaca
actcgcttacttaatgctgataaaacaactggttatggttttgagctagacacagagtgg
atgttaactgatgagttaaacgcaacatttaacttaagttataataacactgaacttaaa
gacaaaaacgtatctattgcggttccacagcgtccaagtttaacaattaccgacccggtt
gttgatggcaaagcgtttattgatggaaacagcttaccacatgcacctgagtggatttca
aaccttacactacgttacagtaaagaactcgctggcggtgaattcttcacctatgctgac
gtgtcttaccgtagcgaaatcaactacttcttatatgagtcagttgagtttgaaggcaag
tcattaacagaagtgggtttacgtagtggttatgcatggtcagaaggtgactatgagtat
gaagctgctgtatttgcacgtaacttatttgacgagcaacaagcaattggtgcaatcgac
ttcaacaacaacacagcaatggttaatgaaggccgctttgttggtgtagagtttaaggtt
aagttcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
