Pseudoalteromonas sp. JSTW: GZH31_12770
Help
Entry
GZH31_12770 CDS
T10506
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
psjs Pseudoalteromonas sp. JSTW
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_3
PAS_8
PAS_4
PAS_12
PAS_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLJ07646
LinkDB
All DBs
Position
complement(2829032..2831203)
Genome browser
AA seq
723 aa
AA seq
DB search
MGTFDLKRIVESISNLKSENFYNAICLSLSEVVGASHVFLAHVDEDTMQATTLTLVANDE
IVENISYDIRCTPCNDVSCGGISSYSSDVQQLFPDDKLLVDMGIEAYVGVPLQSMSGKTD
TILVALFQHAISDAMQIESFFSLFTGLIQREIEKDRFIAKLDFANQLIEQSHEAIFICNE
NVEIIYANTAFTNMTGYSFDEIIGKNPKILSSNKHASHFYRAMWHHIDTEGKWSGEIMNK
NKQGDLYTQFLSITKMVNNGEVCYVAFILDITEKKEAERKIYFHANHDQLTGLTNRFYFK
ERICDLISAPSYQNDVNTHLAVIYFDVDRFQDINTVYGLTFGDKLLCEIANRLAYTFKEC
AFSRIDGDSFAILQTYQDSHELELVCKQINALLIEPFSIGGIRQNVTVTLGISHYEYNNV
LTSQVKIEKIARRLIRQAELASLNAKQTADPYLHFCTEMDDKVKKHNLLVEQLTQAVKNN
EIEVYFQPIIDIENNTVAKFESLVRWQNQGQWVSPVEFIPLAEESRVIIPLGELVLIKTC
QQIKALEAQGYDQLVFNVNRSLFEFAEYNPERNVWIDIIKSQGVKPSQISFELTESVLAP
ENTNHLDVLTQLKAAGCLISLDDFGTGYSSLSYLRRFPVDVLKLDKSFIDEIHVDLADEA
LVRSIIQMSRVLGIKVVAEGVEEYAQLEVLTDAGCDYIQGYYFSKPLPPSEILPFLEQFA
RDR
NT seq
2172 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggtacattcgacctaaaacgtattgttgaaagtatatctaatcttaaaagtgaaaac
ttttataatgctatatgcctctctttgtcagaagtggtgggggcgtcacacgttttttta
gctcatgttgatgaagacaccatgcaggcaacaacgctaacgttggtggccaatgacgaa
atcgtcgaaaacattagttatgatattcgctgcacgccttgcaacgatgtaagttgcggc
ggtatctcgagctatagctcagacgtacagcaattatttccagacgataaattactcgtt
gatatgggtattgaagcgtatgtcggggtgcccttgcagagtatgtctggcaaaacagat
accattctcgttgcactttttcagcatgcgatcagtgatgccatgcaaattgagtctttc
ttttccttatttacaggccttattcaacgagagattgaaaaagatcgctttattgccaag
ttagattttgccaatcaattgatagaacaaagtcacgaagctatttttatctgcaatgaa
aatgtcgagatcatatacgcaaatactgcatttacgaatatgactggctattcgttcgac
gagattataggaaaaaatcctaaaatattgagttcgaataagcatgcatcgcatttttat
cgtgccatgtggcatcacattgataccgaaggtaaatggtctggtgagatcatgaataag
aacaagcaaggggacttatacacccagtttttatcaattactaaaatggttaacaatggt
gaggtgtgttacgtcgccttcattctcgatatcacagagaaaaaagaagctgagcggaaa
atttattttcatgcaaatcatgaccaactgacgggcctcacaaatcgcttttattttaaa
gaacgtatttgtgatttaatttcggcaccgtcgtatcaaaatgatgttaatacgcacttg
gcagtgatttattttgatgttgatcgatttcaagacattaacaccgtatatggcttaacc
ttcggggataaactgctatgtgaaatagcaaatcggctggcatatacctttaaagagtgt
gcattttcacgcatcgatggagacagctttgcaatattacagacctatcaggatagccat
gagcttgaacttgtctgtaaacaaattaatgctttattgattgagcctttttctattggc
ggtattcgtcaaaatgtaacagtgacactgggtatcagtcattatgaatataataatgta
ctgacatcgcaggttaaaattgaaaaaatagcccgtcgtcttattaggcaagctgagctg
gctagcttaaacgcaaaacaaacagcggatccatatttacacttttgtactgaaatggac
gacaaagttaaaaaacacaatttactggtagagcaactgacacaggctgttaagaacaac
gagatagaggtttattttcaaccaattattgatattgaaaataacacagttgctaaattt
gagagtttagtcaggtggcaaaaccaagggcagtgggtgtcgcctgtagagtttatacca
ttagctgaagagtcgcgtgtcataattccactcggtgaattggtgttaataaaaacgtgt
cagcaaattaaggcacttgaagcacaagggtatgatcagctggtatttaatgttaaccgt
tcattatttgagtttgcagagtacaaccctgaacgcaatgtgtggattgacatcataaag
agtcaaggtgttaagccttcgcaaatatcgtttgaattaactgaaagtgtacttgccccc
gaaaataccaatcacctcgacgtgcttactcaacttaaagcagcagggtgtttaatttcg
ttagacgactttggtactggttactcatcgttaagttacctgcgtcgttttccggttgat
gtgctcaagctcgacaagtcgtttattgatgaaatacatgttgatttagctgacgaagcc
ttagttaggtcaatcattcaaatgagtcgtgtactgggtattaaagtggttgctgaaggg
gttgaagaatacgctcaacttgaagtgttaacggatgctggttgtgactatattcaaggt
tattacttttcaaaacctttgccacccagtgagatacttccttttttagagcaatttgct
agagaccgctga
DBGET
integrated database retrieval system
