Phocoenobacter skyensis: A6B44_00370
Help
Entry
A6B44_00370 CDS
T06668
Name
(GenBank) beta-galactosidase
KO
K01190
beta-galactosidase [EC:
3.2.1.23
]
Organism
psky
Phocoenobacter skyensis
Pathway
psky00052
Galactose metabolism
psky00511
Other glycan degradation
psky01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psky00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
A6B44_00370
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
A6B44_00370
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
A6B44_00370
Enzymes [BR:
psky01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.23 beta-galactosidase
A6B44_00370
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_2_C
Bgal_small_N
Glyco_hydro_2_N
LacZ_4
Glyco_hydro_2
Glyco_hydro_2_N2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLB21752
LinkDB
All DBs
Position
complement(81614..84649)
Genome browser
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MLFTDYIQNPEVIHVNTTPHHAYFIPFENEQKCAKNERNLSAYVTLLSQCDWGFNYFESY
QDLPENFPENIAEQPAQASIPVPSNWQNYGYDQHQYTNINYPFPFDPPYVPTQNPCGLYQ
REFDLNLKSDKRYLINFEGVDSCFFLYINQKFVGYSQVSHATSEFDITDALQNGTNHIAV
LVLKWCDGSYLEDQDKFRMSGIFRDVYILEREQNYLQDFFIKTQLSDDLTSAKLSVETTF
IEQSQPINLQLFNPQGELILEKQAVSLSEKFANFQIANVQLWNAENPALYSLRLHYANEW
IEQKIGFRKIAVENGVLLFNSQPIKFKGVNRHDSDPKTGYSISYEQAVKDLTLMKQHNIN
AIRTAHYPNAPWFTELCDKYGFYVISESDIESHGPVMLPVPQPENSIFLNVPNENWDKQI
EQDTIDNFCYFARDPSFKAAILDRTFANIERDKNRTSILVWSLGNESGYGENFEEAAKWV
KDRDPERLVHYESSIYQHSQHKNDLTNLDFYSEMYSDTDVVEDYCSKPQSKPFLICEYSH
AMGNSNGDLEDYWQTFQKYDTACGGFIWEWCDHANQLPNAPQKLGYGGDFKETMHDGNFC
VDGLVSPNREPHSNLLELKNVNRPVRACLREGQLEFTNHFDFTNLSEVTIKYRLSENGYS
IKQGEIQLDCKPRQSVTVPFVLPKRNGNVWLLDLTYFAKNSTKLTACNHELGFDQLVLFD
DVMVKPRLEKTQSSNFTIEETTKTLVVKNEKLYCEFNKNKGIFNQLQYKGKAIIEQPLNF
NIWRAPTDNDRLVRELWQNVGYHNANSRAYQISVEKFSDKVVVFADCAIVATARERIVTF
NVQYHIHANHIEIVVLAERKPHLPYLPRFGLAFSLNKQNENVEYFGYGEGESYIDKHHLS
KLGRYVTTATQNHTDYFKPQENGSHYGCHYVKTDNLLITANQPFSFNYSPYTLEELTSKA
HHYDLQESPFNHLYIDYKMSGIGSNSCGPNLKGKYRLNETEFDWVVKLDFI
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatttacagattatattcaaaatcctgaagtgatacacgtgaacacaacaccacat
cacgcttattttatcccttttgaaaatgaacaaaaatgtgcaaaaaatgaaagaaatcta
tccgcttatgtaaccttattaagccaatgtgactggggatttaactattttgaaagctat
caagatttgcctgaaaacttccctgaaaacatagcagaacagcctgctcaggcaagcatt
cctgtgccatcaaactggcaaaattatggttatgatcaacatcaatacaccaatatcaat
taccccttcccgtttgatccaccttatgtaccaacacaaaatccttgtggattatatcaa
cgagaatttgatcttaatcttaaatcggataagcgttatttgatcaattttgaaggggtg
gatagctgtttcttcctatatatcaaccaaaaatttgttggatacagtcaagttagccac
gctactagtgaatttgatattactgacgcactacaaaatggcaccaaccatatcgctgtt
ttagttttaaaatggtgtgatggtagctatttagaagatcaagataaattcagaatgtca
gggatttttcgtgatgtgtatatcttagaacgagagcaaaattatctacaagattttttt
attaaaacacaattatctgatgatcttacatcagcaaaattatcagtagaaacgaccttt
attgaacaatctcaacctattaatttacagcttttcaatccacaaggtgagttaatcctt
gaaaaacaagcggtaagtttatcagagaaatttgcaaattttcagattgctaatgtacaa
ctctggaatgcagaaaatcctgcgttatacagcctaagattgcactatgcgaacgaatgg
attgaacaaaaaattggatttagaaaaattgccgttgaaaatggcgtgttactattcaac
agtcaaccaattaaattcaaaggggttaaccgccacgacagtgatccaaaaacaggttat
agcattagttatgaacaagcggtcaaagatcttaccttgatgaaacaacataatatcaat
gcgattcgcactgctcactatccaaatgccccttggtttaccgagctttgtgataaatac
ggattttatgtgatcagtgaaagcgacattgaaagtcacggtcctgtaatgttgccagta
ccacaaccagaaaatagtattttcttaaatgtccctaatgaaaactgggataaacagata
gagcaagatactatcgataatttctgctattttgcaagggacccaagctttaaagcggca
attttagatcgtacttttgcaaatattgaacgagataaaaaccgcacctcgatccttgtg
tggtcacttggtaatgaaagtggctatggtgaaaattttgaagaagccgcaaaatgggta
aaagatcgtgatcctgaacggcttgtgcattatgaaagctcaatctaccaacattcacag
cataaaaatgatctcacaaacttagatttttatagtgaaatgtatagcgataccgatgtg
gtcgaagactattgctcaaaaccacaaagcaaaccatttttaatctgtgaatacagccac
gcaatgggaaattccaatggcgacttagaagattactggcaaaccttccaaaaatatgac
acggcttgcggtggctttatttgggaatggtgcgatcacgctaaccagctaccaaatgct
ccacaaaaattaggttatggtggcgatttcaaagaaacaatgcacgatggcaatttctgt
gtggatggtttagtttctccaaatagagaaccacacagcaatttgttagaactaaaaaat
gttaaccgccctgtgcgagcttgtctgagagaaggacaattagaatttactaatcatttt
gattttaccaatctttctgaggtaaccattaaatatcgcctttcagaaaatggttattct
attaaacaaggtgaaattcaacttgattgtaaaccacgccaaagtgtcactgttcctttt
gtattaccaaaacgcaatggcaatgtatggcttttagatcttacttattttgcaaaaaat
tcaacgaaactaaccgcttgtaatcacgaattaggctttgatcagctggttctgtttgat
gatgtaatggttaaaccaagattggaaaaaacacaatcaagtaattttactattgaagaa
actacgaaaaccttagtggttaaaaatgaaaagctttattgtgaatttaataaaaataaa
ggtatttttaatcagttacaatataagggtaaagctattattgagcaaccacttaatttt
aatatatggcgtgctccaacggataatgatcgccttgtgcgagaattatggcaaaacgta
ggctatcacaatgctaacagtcgagcttaccaaatctcagtagaaaaatttagcgataaa
gtggtagtgtttgccgattgtgcaatagtggcaactgcacgagaacgtattgtaaccttt
aatgtgcaatatcatattcacgccaatcacattgaaattgtagtacttgcagaacgcaag
ccacatctgccttatttaccacgttttggactagcctttagtttaaataaacaaaatgaa
aatgtggaatattttggttatggtgagggtgaaagctatattgataaacatcatttaagc
aagcttggacgctatgtcaccaccgcaacccaaaatcatacggattatttcaaaccacaa
gaaaatggtagccactacggttgtcattatgtaaaaactgataatctgttaattacagcc
aatcaaccatttagctttaattactcgccttatacccttgaagagttaacgagtaaagca
caccactatgatttacaagagtcgccttttaatcatttatatattgattacaaaatgagt
ggtattggttcaaattcctgtggaccaaatttaaaaggtaaatatcgtttaaatgaaaca
gagtttgattgggtagttaaattagattttatataa
DBGET
integrated database retrieval system