Phocoenobacter skyensis: A6B44_08665
Help
Entry
A6B44_08665 CDS
T06668
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
KO
K03555
DNA mismatch repair protein MutS
Organism
psky
Phocoenobacter skyensis
Pathway
psky03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psky00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
A6B44_08665
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
psky03400
]
A6B44_08665
DNA repair and recombination proteins [BR:
psky03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
A6B44_08665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_II
MutS_IV
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLB23271
LinkDB
All DBs
Position
1831204..1833768
Genome browser
AA seq
854 aa
AA seq
DB search
MTEFTNHTPMMKQYLTLKAEHSDVLLFYRMGDFYELFYDDAKKAARLLDISLTKRGKSAG
EPIPMAGVPYHAIEGYLAKLVHLGESVAICEQVGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVSDEA
LLPERQDNLVASVYVENGIYALALLDMTSGRFLINELPNRESLSAELQRAQPAEILYPET
FSEMDLIEHYKGLRRRPIWEFELVTAINLLNRQFGTQDLKGFGVEKSLVALCAAGCVLQY
AKETQRTALPHINSIHLIQNSDTILLDAATRRNLELTQNLAGGTENTLAHVLDHCVTSMG
SRLLKRWIHQPIRDVEKLKNRQQNIQTLLDHHLIDTLQPLLQQVGDMERILARVALRSAR
PRDLTRLRTALAQIPQIVNFTQNLTASLTLNINQIADFSDLHSLLERAIIEVPPQLVRDG
GVIATGYNAELDEWRSLADGATQYLDDLEIRERETTGIDTLKIGFNAVHGYYIQISKAQS
HNAPIHYVRRQTLKNAERYIIPELKTYEDKVLKAKGASLALEKRLYEELFDQLLPRLGEL
QLASMILSELDVLTNLAERAESLDYVAPTFTANRTINIKQGRHPVVENVLKAPFIANPVF
LNEQRHLLVVTGPNMGGKSTYMRQIALITLMAHIGSFVPAESAEIGTIDRIFTRIGASDD
LASGRSTFMVEMTEMANILHQATANSLVLIDEIGRGTSTYDGLSLAWACAEWLAQKTRSL
TLFATHYFELTSLPEQLKGVANVHLDAREHNDNIVFMHTVQEGAASKSYGLAVASLAGVP
KQVVKLAKQKLATLEQISHQTVDLDKNPQESLFEIPNNIIMDTPPALEMLQNINPDELTP
RQALDALYKLKDKL
NT seq
2565 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagaattcacaaatcacacccctatgatgaagcaatatctcactttaaaagcagag
cattctgatgttttgttgttttatcgtatgggagatttttatgaattgttctatgatgat
gcgaaaaaagcggcaagattactggacatttctttaacgaaaagagggaaatcagctggt
gaaccaattcctatggctggcgtaccttatcatgcgattgagggctatttagcaaaatta
gtacatcttggtgagtcggttgcgatttgtgagcaagtgggcgatcctgcaacaagtaaa
gggcctgttgagcgtaaagtggtgcgaattgtcacaccgggaacagtaagtgatgaagcc
ttgttaccagagcgccaagataaccttgtggcgagtgtttatgtagaaaatggtatttat
gcactggcgttattggatatgacatcagggcgttttttaatcaatgaattacctaatcgt
gaaagcttaagtgcggagttacagagagctcaacctgctgaaattttataccctgaaacc
ttttctgaaatggatttgattgagcattataaagggttacgtcgtcgtccgatttgggaa
tttgaattagtcaccgcaattaatttacttaatcgtcaatttggtacgcaagatttaaaa
ggctttggcgttgaaaaatctcttgttgcactgtgtgctgctggctgtgtattacaatat
gccaaagaaacacaacgcactgcactacctcatattaacagcattcatctaattcaaaat
agcgatacaattttattagatgccgccactcgccgtaatttagaattaacccaaaattta
gcagggggaacagaaaacacccttgctcacgtattggatcattgtgttacctcaatggga
agtcgtttattaaaacgctggattcatcaacctattcgtgatgtcgaaaaattaaaaaac
cgtcagcaaaatattcaaaccttgctcgatcatcatttaatcgacacattacaacccttg
ctacaacaagtgggtgatatggaacgaattttggcacgtgttgccctgcgttcagcacgt
cctcgagatttaactcgcttacgcactgcgttggctcaaattccacaaattgtaaatttt
acccaaaatctaaccgctagtttaaccctcaatatcaatcaaattgctgattttagcgat
ctacattctttattggaaagggcgattattgaggttccgccacaattagtgcgagatggg
ggtgtaattgccacaggctataatgccgaattagacgaatggcgttcccttgctgatgga
gcaacacaatatcttgacgatttagaaattcgtgaacgagaaacaacgggtattgatacc
ttaaaaattggttttaatgccgtacacggctattatattcaaatcagtaaagcacaaagc
cataatgccccaattcattatgtacgtcgtcaaaccttaaaaaatgccgagcgttatatt
atccctgaattaaaaacctatgaagataaagtattgaaagcaaaaggggcatcgctcgca
ttagaaaaacgtctttatgaagaactgtttgatcagcttctaccacgtttaggtgaatta
cagttagcgagtatgattttaagtgaattagacgtgctaactaatcttgccgaacgagca
gaaagtttggattatgtggcaccaacttttaccgccaatcgcaccattaacattaaacaa
ggtcgccacccagtggttgaaaatgtactaaaagccccttttattgccaatcccgttttc
ttaaatgaacaacgtcatttgttagtggtaacaggtcccaatatgggcggtaaaagtacc
tatatgcgacaaatcgctctgattactttaatggctcatatcggaagttttgtacctgca
gaaagtgccgaaattggcactattgatcgtatttttacgcgtattggtgcctctgatgat
cttgcctctggtcgctcaacctttatggtggaaatgacagaaatggcaaatattctccat
caagccaccgctaatagcttagtattgattgatgaaatagggcgaggaacatctacttat
gacggtttatcattggcgtgggcgtgtgctgaatggttggctcaaaaaacacgttcttta
accttatttgcaacccattattttgaattgaccagtttacctgaacaattaaaaggggtg
gcaaatgtgcatttagatgcccgtgaacataatgataatattgtgtttatgcacacagta
caagagggggcggcgagtaaaagttacggcttagcagtggcttctttggctggtgtacct
aaacaagtggttaagttagctaaacaaaaattagcaactttagaacaaatttcacatcaa
accgttgatttagataaaaatccacaagaaagtttgtttgaaataccaaataacatcatt
atggatactcctcctgcattagaaatgctacaaaatattaatcctgatgaacttacacca
cgacaagcgttggatgctctgtataaattaaaagataaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
