Pseudoalteromonas sp. LC2018020214: JG479_02680
Help
Entry
JG479_02680 CDS
T10970
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K16090
catecholate siderophore receptor
Organism
pslc Pseudoalteromonas sp. LC2018020214
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pslc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pslc02000
]
JG479_02680
Transporters [BR:
pslc02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
JG479_02680
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQM64799
LinkDB
All DBs
Position
1:639594..641774
Genome browser
AA seq
726 aa
AA seq
DB search
MSKPSNKGNAYVKPIAAVVTATLSTWASAQDVQELSVTKAETKTESSYVVEKSTSHKYTQ
PLLDTAKTVTVINQAVMKDRNVDSLRDALRNVSGISLAAGEGGSPTGDSMSIRGFSATND
IFVDGIRDVAGYTRDIYNIEAVEVAKGPGSAVSGRGATGGSVNLESKKAKLDNFNDVSLR
LGTENDYRGRFDTNIQVNDTSALRINLLTDKGDVAGRDHVENETNAVAFAFATGLGTNSR
FDLNLEYQRQDNLPDYGIPWVYSDTPVAELADSARSPSPVDFDNFYGNIYRDYEDIEAYS
TTARYEYDFSQNTTLRVQGRLGKVKRESVTTAPRYFSVTTDTDITFADEKTRDTENSLAA
LQVDLIGNYEFAGFTHDVVVGVELANETFTRHNFVATTPDNLIEDGIRNDLYNPDATIAF
TGVYGRDGTSIEAKAKNQAIYAFDTVTLNKQWEVTGGIRFDSFTTDYHNDYNNPSALIST
SDDLFSWNAAVVYKPTENGSVYLGAGNSFNPSAESLTVSTRSNAADLDAEESRSYELGTK
WSLMDGRLQTNAALFRTEKTNARTDDPFADSSSDEILGGEQRVQGLELSATGLITKEWTV
IASYTYQDSEVTEALGDDATQIGNELARTPKNSASVWTTYDMSDKLSFGLGAQYVGERYN
GTTSTRSRAPGYTIFDLMVAYDISKDLSLQLNGENLGDKDYVDQLGGGHFVPGDGRKFSL
TASYSF
NT seq
2181 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaagccatcgaataaaggaaatgcgtacgtgaagccaattgcagcggttgttaca
gctacgctttcaacttgggcaagtgcacaggatgttcaagaactatcggtaaccaaagca
gaaactaaaactgagtctagttatgttgtagaaaaatcaacgtcgcataaatacactcaa
ccgctactcgatacagctaaaacggtaacagtaatcaaccaagcggtaatgaaagacaga
aacgtagatagcctacgtgatgctttgcgtaatgtttcaggtatttctttagcagcaggt
gagggtggctcacctactggcgatagcatgtcgattcgtggttttagtgcaacaaatgat
atttttgttgatggtattcgcgatgttgcaggttacacacgtgatatttacaacattgaa
gccgttgaagttgcaaaaggcccaggctctgcagtttctggtcgtggcgcaacaggtggt
agtgttaatttagaaagtaaaaaagcgaagttagacaactttaacgacgtttctctacgt
ttaggtacagaaaacgattaccgtggtcgttttgatactaacatccaagtaaacgacaca
agcgcactacgtattaatcttcttactgataaaggtgatgttgcaggtcgtgatcatgtt
gaaaacgaaacaaatgctgttgcgtttgcatttgcaacagggcttggtacaaacagccgt
tttgatttaaacctagagtatcaacgccaagacaatttaccagattatggtattccttgg
gtttacagtgatacgccagtagctgaactagcagatagtgcacgctcaccttctcctgtc
gactttgataacttttacggtaatatttaccgtgattacgaagatattgaagcttactca
acaacagctcgttatgagtatgatttttctcaaaatactacgttacgtgtgcaaggtcgt
ttaggtaaagttaagcgtgaatcagtaacaactgcaccgcgttatttctcggttacaaca
gacactgatattacctttgcagatgaaaaaacacgtgatactgaaaattcacttgctgca
cttcaagttgatttaattggtaactatgagtttgctggctttactcacgatgttgtagtg
ggtgttgaacttgcaaatgaaacgtttacacgccataactttgttgcaactacgcctgat
aacctaattgaagatggaatacgtaacgacttatacaaccctgatgcaacaattgcattt
acgggtgtgtacggccgtgacggtacaagcattgaagctaaagctaaaaaccaagctatt
tatgcatttgatacagtgacgcttaacaagcaatgggaagttacaggtggaattcgcttt
gatagcttcactacggattatcacaacgattacaataatccaagcgctttaatttctaca
agtgacgatttatttagctggaatgcagctgtagtttataaacctacagaaaacggcagt
gtatatttaggcgcggggaattcatttaacccatcggcggaaagcctaacggtatctacg
cgttcaaatgcagctgatttagacgcagaagaaagtcgcagttatgaattaggaactaaa
tggagcctaatggatggccgcctgcaaactaatgctgcacttttccgtactgaaaaaacc
aatgcccgtactgatgacccatttgcagatagctcaagtgacgaaatacttggtggtgaa
cagcgcgttcaaggtttagagctttcagcaacgggcctaattactaaagagtggactgta
attgcttcatacacttaccaagatagcgaagtaacagaagcattaggcgacgacgcaact
caaatcggtaacgagcttgcacgtacgcctaaaaatagcgcgagtgtttggactacgtac
gatatgtcggataagttatcgtttggtttaggtgcgcagtatgtaggtgagcgttacaac
ggcactacgtcaacacgctctcgtgcgccaggttatactatttttgacctgatggttgcg
tatgacatatcaaaagatttgagcctgcagcttaatggtgaaaacctaggtgataaagat
tacgttgatcagttaggtggtggacactttgtaccaggtgatggtcgtaagtttagttta
acagcgagctactctttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
