Pseudoalteromonas sp. LC2018020214: JG479_07020 Help Entry JG479_07020       CDS       T10970                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism pslc  Pseudoalteromonas sp. LC2018020214 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pslc00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:pslc02000]     JG479_07020 Transporters [BR:pslc02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    JG479_07020 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug OMP_b-brl_3 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QQM65553 LinkDB All DBs Position 1:1587944..1590736 Genome browser AA seq 930 aa AA seqDB search MSMFKPSILTLAMATAGLASFASVAAQEDTVKNDDVEVIEVKGFRGSVVESINTKRFSTQ VVESISAEDIGKLPDSSIAESIARLPGLTAQRLDGRASRVSIRGFGENESGTTFNGREQV SISDNRGVEFDLYPSEIMSGVTVYKTPSANLDAEGIAGIINMQTVRPLSKGERVVQVNGQ YEQTSFDKLNPDGNDDGYRGTFSYIDQFADDTIGIAFALNTMSSPNQEKRWNSWGYPEFT AEDGNSYSILGGAKPYVRSSTLERDSAMLVLEAAPTDKLNMTFDALYVDFTDEQILRGIE VPFAWGQGSIDASSAIVDAESGFITSAVTQGQRVVVRNDYQERDAELTAFGFNTKYDIDD SWSVEFDASYSQVDRKIWSIESYSGTGRGDSRGVADNLGYAFNGGNTGATFSHDLDYSDY DLIQLGGPLSWGASSALNDAYGLTGTEYENQAQDGFINAPTIEDELVTLKLAASKVLENE YISSIEFGLSYKEREKSKSSQGYFLTLTDFSLENPGMLSVPEQYRLGSVGLDFIGLGDMI AYDVNGLVNDGYYETLDESLTSSTHATKSWTVKEEITSAFAQANINAEVSGLPLTGNVGV RYVHTDQSSQGNAFGVDGNTGLVITSPTDIGHDYSHVLPSLNLSLAIDEQQTIRFGAAKT ISRARIDEMNASVNASYNDTPDENGNFWSVSGGNPNLEPKEATGYDLSYENYFSDEGYFS AAFFYKDLTQWIFDGKYEIDMSGVADPSTGEVPATSEGTGSGKVNGGGGDLYGYELSLAL PFKIFHPSLEGFGLIASHTGIESDIEDGNGNEYELPGLSDKIQSLTVYYEMNGMQLRTSM RKRSDFKGDVYGLGFNTEQVNIIGETIWDIQAGYDFSEAGVESLEGLSIQFQVQNLTEEP FTSLSGDNALQVRDYQDYGRTYLLGFSYQL NT seq 2793 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtctatgttcaaaccaagtatattaacgttggcaatggctactgcaggattagcaagc tttgcctctgtagcagcacaagaagatacagtcaaaaatgatgacgttgaggttatcgaa gtaaaaggctttcgtggcagtgttgtagaatcaatcaacacaaagcgtttttctactcaa gtcgttgagtcaatttcagcagaagatataggtaagctacctgattcatctattgctgag tctattgcacgcttaccaggtttaacggcgcaacgcctagatggtcgtgcaagtagagta tctattcgtggctttggcgaaaacgaaagcggtactacatttaatggccgcgagcaagta tctattagtgataaccgcggcgtagaatttgacctttacccatcagaaattatgagcggt gtaactgtttataaaacacctagtgcaaatttagatgcagagggtattgcgggcataatt aacatgcaaacagttcgcccactaagtaaaggtgaacgtgttgttcaagttaatggacag tatgagcaaaccagctttgataaattaaaccctgacggcaacgacgacggttaccgtggc actttctcatacatcgaccagtttgctgatgacaccattggtattgcatttgcactaaac accatgagctcgccaaaccaagaaaaacgttggaattcatggggctaccctgaattcact gctgaagatggtaactcgtattcaattttaggcggtgctaaaccatatgttcgttcatca acgcttgaacgtgattcagcaatgcttgttctagaggcagcgcctacagataaactaaat atgacgtttgatgcgttgtatgtagactttacagatgagcaaattttacgcggcattgaa gttccttttgcttggggtcaaggtagtattgatgcaagcagtgctatagtagatgcagaa agtggatttataacaagtgctgtaacacaaggccaacgtgttgttgtgcgtaacgattac caagagcgtgatgctgaactaactgcatttggatttaacactaaatacgatattgatgat tcatggtcagtagaatttgacgcaagctactcgcaagttgaccgtaaaatttggagtata gaaagctactcaggtacagggcgtggtgattctcgcggtgttgcagataacttaggttat gcttttaatggtggcaatactggcgctactttttcacatgacttagattacagcgattat gatctaattcaattaggtgggccgctttcgtggggtgcaagctctgcactaaatgatgca tatggattaacgggcacagagtatgaaaaccaagctcaagacggttttattaatgctcca actattgaagatgaattagttacattaaaacttgcagcgtctaaagtactagaaaacgaa tacattagctcaattgaatttggcttaagttataaagagcgtgagaagtctaaatcttcg caaggttacttcttgactttaactgatttttctcttgaaaacccaggaatgcttagtgta cctgagcaataccgtttaggcagtgttggccttgactttattgggctaggcgacatgata gcctacgatgtaaatggtttagttaatgatggttactatgaaacccttgacgaaagttta actagctcaactcatgcaactaagtcgtggacagtaaaagaagaaatcacctcagcattt gcacaagctaatattaatgcagaagtaagtggtcttccattaactggtaatgttggggtg cgctatgttcatacagatcaatcctctcaaggtaatgcttttggtgtagatgggaatact ggtctagtcataacttcacctacagatattggtcacgattattctcacgttttaccaagc ttaaatttatcacttgcgattgatgagcagcaaacaatacgttttggcgcagctaaaaca atctcacgtgcgcgtatagatgaaatgaacgcctctgttaatgcatcatataatgataca ccggatgaaaacggtaacttttggtctgtatcgggtggtaaccctaacctagaacctaaa gaagcaacaggctacgatttatcttatgaaaactactttagtgatgaaggttacttctct gctgcatttttctataaagacttaacccagtggatttttgatggtaaatacgaaattgat atgtcgggcgttgcggacccatcaacaggtgaagtcccagctacgtcagaaggtactggc agtggtaaagtaaatggcggcggcggtgacctatacggttacgagctatctctagcgtta ccatttaaaattttccacccgtctcttgaaggctttggcttaattgctagtcatacaggt attgaatctgatattgaagatggaaatggcaatgagtacgaactaccgggtctatcagat aaaattcaaagcttaacggtttactacgagatgaatggcatgcaattacgaaccagcatg cgtaagcgtagtgacttcaaaggtgatgtttacggattaggctttaatacagagcaagtg aatattatcggcgaaacaatttgggatattcaggcaggttatgacttctctgaagcaggg gttgagagccttgaaggtttatcaattcagttccaagttcaaaacttaacagaagagccg ttcacatcgctttctggcgataacgcgctacaagttcgcgactaccaagattacggtcgc acttacttgttaggctttagctaccagctataa

DBGET integrated database retrieval system