Pseudoalteromonas sp. LC2018020214: JG479_10590
Help
Entry
JG479_10590 CDS
T10970
Name
(GenBank) AAA family ATPase
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
pslc Pseudoalteromonas sp. LC2018020214
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pslc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pslc03036
]
JG479_10590
Chromosome and associated proteins [BR:
pslc03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
JG479_10590
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_21
AAA_15
AAA_29
RRP4_S1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQM63188
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2403123..2406524)
Genome browser
AA seq
1133 aa
AA seq
DB search
MRLSTIKLAGFKSFVEPTKIPFPDQMTCVVGPNGCGKSNVIDAVRWVLGESSAKNLRGDA
MTDVIFNGSTNRKAISQASVELVFDNDKGSPSNTFADRNQIAIKRLVTRDGQSLYFLNGS
KCRKRDITDIFLGTGLGPRSYAIIEQGMISRLIESKPQELRVFLEEAAGVSKYKERRRET
QTRIKSTRENLERLLDVRKELQSQLDKLAVQSVDAKKYRELKAQERTLKGQIAVLKWQKL
HQQQLEKSAQIKKLNDQILFFKTANSGHDDVLASLEGQVQAQQDKLSDAQHQQHVIHTEL
TRAEQQQINVKQQTQTLKQSLIKLQQRQIQSAEVKSQQQIVCEQLNEALQEASENALICE
EQVSGLTHELEELLALKQRHHTHWQALCEQQQQLNNNVQLHSSHIKQTQQQISHVNEQID
QLTVQLSELQSSDVEQQLIQQTQQTQTLTQELAAKQTAHTKCTAKLEMQNELVNNSQTQY
STLTQTINELKASITGLKSTLGLDEKSERTNGLFNQLSVKEGFELLIEQALKSLEHLNVS
EQQADNSVWPNSDKSMPTNSLATYITSGVYPEHLARIAYSESGDLEILKDSFYTAVMDKN
GALYGRNWHVSAECNAENSLLLKHKQLQDKAQQLTNAEDELQQVTHTRDEHTAEQIKLIN
EQSELKEAIHELAQNIAVASTRNDMLKQQVAHFKLQLEKLQQQKQQLTNQLLQLNTVLDE
QVAQFEVMNEQQLNLADEVDAANSLRSQSDKSYSEALSMLEQYKTQAHKATLSEQKARSE
WQLSQTKLSHAEQEHVSASEGAQELLSEIEELLIPEQELSDEITQLLAQHQKGEQALVLL
QKELAQAKESLNTKQISLKNSQGELVGLQEQHQKLTIEEQSLVIKAQVALEPLEELKQSL
KAILDELPDSLNLSAAQNQLTGFTNQLDKLGAVNLAAIEEFDLAKARSDYLDNQLDDLTK
ALSTLEGAIRKIDSETKTRFKATFDQVNEDFAELFPKVFGGGSAYLELTSDDLLESGVSI
MARPPGKKNSTIHLLSGGEKALTALSLVFSIFRLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVVRFCRL
VEEMSQSVQFIYISHNKIAMEMAGRLTGVTMAEPGVSRMVAVDIEQAVQLAHA
NT seq
3402 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcttaagcactattaaattagcgggctttaaatcgtttgtagagcccactaaaatt
ccatttcctgatcaaatgacgtgtgttgttggccccaatggctgtggcaaatctaacgtt
attgatgcagtacgatgggtgctaggtgaaagctctgctaaaaacctgcgtggcgacgcc
atgaccgacgttatttttaatggctcaactaatcgaaaagccatatcacaagcctctgta
gagcttgtttttgataacgataaaggaagtccttcaaacacatttgccgatcgaaaccaa
attgctattaagcgtttagtaacgcgcgacggacagtcactgtattttttaaatggcagt
aaatgccgtaagcgcgatattaccgatatatttttaggcaccggtcttggtccacgtagt
tacgcaattattgagcaagggatgatctcgcgcttaatagaaagtaaaccacaagagctg
cgcgtatttttagaagaagccgctggcgtttctaaatacaaagagcgccgccgcgaaaca
caaactcgtataaagagcactcgcgaaaatcttgaacgtttgttagatgtgcgtaaagaa
ctacaaagccagctagataaattggctgtgcagtcggttgatgcaaaaaaataccgcgaa
ttaaaagcacaagaacgtacgctaaaaggccaaattgccgttttaaaatggcaaaagtta
catcagcagcaacttgaaaaaagtgcccaaattaaaaagcttaatgatcaaattttgttt
tttaaaaccgctaactcagggcatgacgatgtacttgcaagcttagaagggcaagtacaa
gctcagcaagataaactaagcgatgcacagcatcagcaacatgtaatacacacagagctt
acccgggctgagcaacaacaaatcaatgtaaagcagcaaacccaaacgcttaaacaaagt
ttaattaaattacagcaacgccaaattcaaagtgctgaggtaaaatcgcagcagcaaatt
gtgtgcgaacaactcaacgaagccctgcaagaggcaagtgaaaatgccttaatatgtgaa
gagcaagttagtgggttaacgcatgaacttgaggaattattagcacttaagcagcgccac
catactcattggcaagctttgtgtgagcaacagcaacagcttaataataacgtgcaacta
catagtagtcacattaaacaaactcagcagcaaataagccacgttaacgagcaaattgat
cagttaactgttcagcttagcgagctacaaagtagtgatgtagagcaacagttaatacag
caaacacagcaaacacaaacattaactcaagaacttgccgctaaacaaacagcacatacg
aagtgcactgctaagcttgaaatgcaaaatgagcttgttaataactcacaaacacaatat
tcgacgctcactcaaacaataaacgagttaaaagccagtataacggggcttaaaagtaca
ttagggcttgatgaaaaaagtgaacgtactaatggtttgtttaatcagctaagtgttaaa
gaaggctttgagcttctaatagagcaagcacttaaatctttagagcacttaaatgtaagt
gagcagcaagctgataacagtgtgtggccaaatagtgataaaagcatgccaacaaatagc
ttagctacatatataacaagcggtgtttatccagagcatttagcacgtattgcttatagt
gaaagcggtgatttagaaatactaaaagatagtttttatacagctgttatggataaaaac
ggtgctttatatggtcgtaactggcatgtaagtgccgaatgtaatgcagaaaactcatta
ctgttaaagcataagcaattgcaggataaagctcagcagttaactaatgccgaggacgag
ttacaacaagtaacacacactcgtgacgaacatacagctgagcaaataaaattaattaac
gaacaaagcgagctaaaagaagccatacatgagcttgcgcaaaatatagcagtagccagt
acgcgcaacgatatgctcaaacagcaagtagcgcactttaagttacaactagaaaagcta
caacaacaaaaacagcaattaacaaatcagcttttacaattaaataccgtgcttgatgag
caagtagcgcaatttgaagtgatgaatgagcagcaacttaacttagcggatgaagtagac
gctgcaaatagcttgcgctcacaaagtgataaaagttatagcgaagcattaagcatgctt
gagcaatataaaacacaagcacataaggcaacgctctcagagcaaaaggcacgcagtgaa
tggcagttaagccaaaccaaattgagccatgcagagcaagagcacgttagtgcatcagaa
ggtgcgcaagaactacttagtgaaatagaagagctgctgataccagagcaagaacttagc
gatgaaattacgcagctcttagcacagcatcaaaaaggtgagcaggcattagtattgcta
caaaaagaattagctcaggcgaaagagagcttaaacactaagcaaataagccttaaaaat
tcacaaggtgagctggtgggcttgcaagagcagcaccaaaagctaacaattgaagagcaa
agcttagtaataaaagcgcaagttgcgcttgagccattagaagagttgaaacaaagctta
aaagcaatacttgatgaattaccagattcattaaatttgagtgcagcgcaaaatcagtta
accggatttactaatcagttagataaattaggtgcagtaaacttagcggcaatagaagag
tttgatttagccaaggcacgtagtgattatcttgataatcaattagatgatttaacaaaa
gcgttaagtacccttgaaggtgcaattcgtaaaattgatagtgagaccaaaacacgcttt
aaagcgacgttcgatcaagttaacgaagactttgctgagctatttcctaaagtttttggt
ggtgggagcgcgtatttagaattaaccagtgacgatttactcgaaagtggtgttagtata
atggcacgaccaccgggtaagaaaaattcaacaattcatttgttaagtggtggagaaaaa
gcgctgaccgcattatcattagtgttttctatattcaggctcaatccagctcctttctgt
atgctggacgaagtagatgcaccactagatgatgccaacgttgtgcgtttttgccgtttg
gttgaagaaatgtcacaatcagtgcagtttatttatattagtcataataaaattgcgatg
gaaatggctggtagattaacaggtgttactatggcagaacctggcgtatcgcgtatggtt
gctgtagatatagagcaagctgtgcaacttgcacacgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
