Pseudoalteromonas sp. LC2018020214: JG479_11560
Help
Entry
JG479_11560 CDS
T10970
Name
(GenBank) pilin biogenesis protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
pslc Pseudoalteromonas sp. LC2018020214
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pslc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
pslc02044
]
JG479_11560
02035 Bacterial motility proteins [BR:
pslc02035
]
JG479_11560
Secretion system [BR:
pslc02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
JG479_11560
Bacterial motility proteins [BR:
pslc02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
JG479_11560
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
VWA_2
Importin_rep_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQM63365
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2599945..2603166)
Genome browser
AA seq
1073 aa
AA seq
DB search
MKLKLNKVLASLLGLTISASVYAEDIELYVNHDVDVEEKPRVLLIFDTSGSMAFSSSSGG
NCGFNNFLNLYNLCIDSRLAAAQFAMNKVISDNEDTIDFGLMRFKSTTGGYIVNGVGSDS
SVVRSSVASLPADGGTPLTETLWEAYLYITGQNVQYGLEATILERDTSVELRTGSEFTQL
ECGWVRNRGRWSYECENVTTNNYEYTYISPFADSTAEAKRCDNSINIIYMTDGDPSGDND
SDSQISAEHEKYFGEGLNWNTDSYYSSYLHQMAKIIHGTSDTTVDLYPSTPDIHETGRLY
TIGFGSGMSASGQELLRRAASLGGGENLPASTPDELSESLNSAISRIREVNDSFSSPSVA
SNNVDQTRSRDAIYFAMFYPETNTRWGGNLKKLKVSGSNIVDSAGNVALDSNGLIDTDAK
TFWLPDGKSADGNLVAQGGVNYQLSTLTGTNAEERRTLYTDKQGDIVRFTTSIVSDILDL
ITNNPISLSSSDIKWAMGIDVDDEDNDNDTTDQRDDIFGDPLHSKPVALDYGNDDIRILI
GTNAGFLHMFKDDDTNNEVSESWAFIPSDLYSIIQPLRNKETGKKYGMDGPISVYFNNKN
LNSDGLNDGIIDASGDDEVWAFAGMRRGGKNYYALDITNPDQPKKLWSAPIEGGKGDFKE
LAQTWSKPQIAYLKAFGDKPLLIFGAGYDTNKDAVIKSEDSTGRGIYIVEAETGKRVWAL
TPDINGFKGKHSIAADITTLDSDYDGYIDRIYAADTGGDIWRIDMPGTSTSEFSHFKLAE
LGSNKATEDRRFFYKPLVARTIYSKVSETTVDGSTVITRLDTPYDAIVIGSGNRSKPTGT
NEKDQLFMIRDENTVTKSYKTNAPDTIEPADLMQMNSDPFGNALDDVDDFVDLEVDLAKF
NGWRYELGTGEKSLAAATVVGGVAYFTSFTPASDTSTENQCSLSGGGGSLYAFHLHYGTK
VYDDLKFTTSYDVPDTPQLYFGEGPSCVDGNGDGKCDDNPTVDVTQESQFYLIGPGIKGE
NAENPMKPVEIKGPGLTIVDGKVVLVNDNAVGFGFKTQQTYIYKREENDEVNN
NT seq
3222 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaaattaaacaaagtgttagcctctttacttggcttaacaataagtgcgtca
gtttatgctgaagatatagagctttatgttaatcatgatgtggatgttgaagaaaagccc
cgagtattactgatttttgatacatcaggaagcatggctttttcatcttcaagtggtggt
aactgtggttttaataattttttaaacttatataatttatgtattgatagccgccttgct
gctgcgcagtttgcgatgaataaagtcatttctgataacgaagatactatcgactttggt
ttaatgcgctttaaaagtacgaccggtggttacattgttaacggtgttggtagtgattca
tcagttgtacgttcgtcggttgcatctttacctgcagatggtggaaccccgcttactgag
actctatgggaagcttatttatatattacagggcaaaacgttcaatatggcttagaggcc
acaattcttgaacgtgatacgagtgtcgagttaagaactggaagtgagtttacacagctt
gaatgtggttgggttagaaatagaggccgctggagttatgagtgtgaaaatgtaactaca
aataattatgagtatacttacatatcgccttttgcagatagcaccgctgaggctaagcgc
tgcgacaactcgataaatatcatttatatgaccgatggcgacccatctggtgataatgat
agtgacagccaaattagtgcagagcatgagaagtactttggggaaggattaaactggaat
acggatagttactacagtagttacctacaccaaatggctaaaattattcatggtacaagc
gacactactgttgatttatacccatcgactcccgatattcatgaaacaggccgtttatat
actatcggttttggctctggtatgagtgcgagcggacaagagcttttacgcagagctgct
tctttaggtggtggtgaaaacttgcccgcaagtacgccagatgagctttctgaatcatta
aacagtgcaatttctcgtattcgtgaagtaaatgatagcttttcatctccctctgttgct
agtaacaacgtagatcaaacccgtagtcgagatgctatttattttgcaatgttttaccca
gagacaaatacccgctggggcggtaacttaaaaaagttaaaggtatcgggtagtaacata
gttgattcagcaggcaatgtagcgcttgattctaatggtttgatagacactgatgcaaaa
acattttggcttcctgatggtaagtcagcagatgggaacttagtagcacaaggtggcgtt
aattatcaactaagtaccttaacaggaaccaacgcagaagaacgaagaacactatataca
gataaacaaggcgatatagtacgatttactacatcgattgttagtgacattcttgattta
ataactaataacccaattagcttatctagttcagatattaaatgggctatgggtattgat
gttgatgatgaagataacgataacgataccacggatcaaagagatgatatttttggtgat
cctctgcattcaaagcctgttgcgcttgattacggtaatgatgatattcgtattcttatt
ggtaccaatgctggctttttgcatatgtttaaagacgatgatacaaataatgaagtatct
gaaagctgggcatttataccctcagatctgtacagcattattcaaccgctgcgcaacaaa
gaaacgggtaaaaaatatggtatggatggtccaatcagcgtttattttaataataaaaac
ttaaatagcgatggtttaaacgacgggattattgatgcgagtggtgatgatgaagtatgg
gcttttgcagggatgcgtcgaggtggtaaaaactactacgcactggatataacaaatccc
gatcagcctaaaaaactatggagcgcaccaatagaaggcggaaaaggtgattttaaagag
cttgcgcaaacatggtcaaaaccgcaaatagcctaccttaaagcatttggtgacaagcct
ttattaatttttggtgctgggtacgatacaaacaaagatgcggtgattaaaagtgaagat
agtacagggcgaggtatttacattgttgaagcagaaacaggtaaaagagtatgggcatta
acacccgatattaatggctttaaaggtaagcatagtattgctgcagatattaccacgctt
gactcagattatgatggatatatagaccgaatttatgcggcagatactggtggagatatt
tggcgtatagatatgccaggcactagtactagtgaatttagtcactttaaattagctgag
cttggcagtaataaagcaactgaggacagacgctttttttacaaaccactcgttgcacga
accatttatagtaaagtaagcgagacaacagttgatggtagtaccgttataacacgctta
gatacgccgtatgatgcaatagttattggtagtggtaaccgctcaaaaccaaccggtacc
aatgaaaaagatcaactgtttatgataagagatgaaaatacagttactaaatcatataaa
acgaatgcaccggatactattgaacctgctgatttgatgcaaatgaattcagacccattt
ggtaatgctctagatgacgttgatgattttgttgacttagaagtcgacttggctaaattt
aatggttggagatatgagttaggaacgggtgaaaaatcactagctgctgctacagttgtt
ggaggtgttgcttattttacaagtttcacacctgcatcagatacatcgactgaaaaccaa
tgttcactaagtggtggtggtggttctttatacgcatttcacctacattatggtacgaaa
gtgtatgacgaccttaaatttacaaccagctatgatgtaccagatacacctcagttatac
tttggcgaaggcccttcatgcgtagatggtaatggagatggtaagtgtgatgacaaccca
acagttgacgtaacacaagaaagtcagttttatctaattgggccgggtatcaaaggtgaa
aatgctgaaaacccaatgaagcctgttgagataaagggccctggcttaacaattgttgat
ggtaaagttgtattggttaatgataatgctgtagggtttggctttaaaactcaacaaaca
tatatctataaacgtgaagaaaatgacgaagttaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
