Pseudoalteromonas sp. LC2018020214: JG479_19265 Help Entry JG479_19265       CDS       T10970                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism pslc  Pseudoalteromonas sp. LC2018020214 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pslc00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:pslc02000]     JG479_19265 Transporters [BR:pslc02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    JG479_19265 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QQM66061 LinkDB All DBs Position 2:complement(640701..643622) Genome browser AA seq 973 aa AA seqDB search MIVASIYPFPFSTFCKSSLYVSIFSALGSTCAVAAQENSQHAKDMEVIEVRGIRSSMAEN LDVKRISGSVVDAITAEDIGKFPDKNVADSLQRVPGVVIERDGGEGSSVSIRGLSSELTF TQLNGNFIASSPGEPSRSFDYALLPSSMIESVEVYKSPEARLDEGGVGGTVLMHSRKPLN MDANSGVFNVESTYADVTKEYEPQFTGLYSWKNDNENFGVLVGYTYQERTNRTLSGGTDA NVWRYTGTGQATDIHGNTIDNNNGWGTINDANGNSYDGVWFPQVVRGSVLNEKREREGIQ LSSQWRPTNRLELGFNYFGFTLGQDRTESVIDIPEWSLNPDFLTDVNLDESGTIVTGMQY DAMASGVENDMQFPWMRGSYVREESTSDTFDFNLAYEGNNFKARFVIGNTQSEGGPEESW EAAYKSSNAGESAATIQNAAQTAGWSLNQNNVSLNIDPNTLVNLQNGVGGGRDAGSSNSS FVRSELEEDYYQADVDFYVDWGFLKTIRTGVKYRNSTLHRETGNTFFLDPNFDIAAGEAS EQGITRFDSYQWNGGMPLAKNVFTSENNIAGGFDINQMPSIDWNKYRDMVTASYVPYTRI EDNFVYDIEEKISAFYIQGDFEFSEVRGNLGVRVVQTKTLTSSTDLYTYQLDHTNDETGE PVTGDARFVEDYQLVTQQNKDTQVLPSFNIAWDATDDLVIRGAIAKVISRPDYSDLGAQQ RITYVSGEWAEDRAAFNELPGFSGSGGNKNLKPFESIQADLSIEYYYGEGSAVGLALFHK KVDNFVVPLVIDVEQNFAGKNNIVDAGTINIAPYSTVGNGTDAVSKGAEVFIQHAFDSGF GFYANYTYNKTNRADVTINGEEFGQSALIGSAKYQYNTSVYYEGDYFNVRASYNKRGETV LGLNSGLNVYQDPYEQLDVNASVNLYDGLSFTAAVINLTKSESVTRLGNDTDARLLNTSY SGRRFYAGFNYSF NT seq 2922 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgatagtagcaagcatataccctttccctttttcaacgttttgtaagtcgtcactttat gtatcaattttttctgctttgggttctacgtgtgctgttgcagcgcaagaaaactcgcag cacgcaaaagatatggaagtaatagaagtacgtggtattcgttcaagtatggccgaaaac ttagatgtaaaacgtatttcgggatctgtagttgatgccattaccgcggaagacattgga aagttccctgataaaaacgttgcagactcacttcagcgtgtacccggagtggtaattgag cgtgacggcggggaaggttcatctgtcagtattcgtggtttatcgtcagaacttaccttt acacagcttaatggtaattttatagcatcttctccgggggagccttcgcgttcgtttgat tatgctttgttaccgtcttcaatgattgaaagcgtagaggtttataaatcgccagaggca cgcttagatgaaggtggggttggtggcactgtactaatgcacagccgaaaacctttaaat atggatgcaaactcgggtgtatttaatgtcgagagtacttacgctgatgttacaaaagag tatgagccgcagtttacgggtttatattcatggaaaaacgacaacgaaaactttggtgta ttagttggctatacctatcaggaacggacaaacagaacgctttcgggcggtactgatgct aatgtatggcgctatactggcactgggcaagcaacagatatacatggtaatacaattgat aacaataacggttggggtactattaatgatgcaaacggcaacagttacgatggcgtttgg tttccgcaagttgttcgaggttctgttcttaacgaaaaacgtgagcgagaagggattcaa cttagttcacagtggcgaccaacaaatcgtttagagcttggctttaattattttggtttt acacttgggcaagacagaacagaatctgtgattgatataccagagtggtctttaaatcct gattttttgacggatgtaaatcttgatgagtcgggcactattgttactggtatgcaatac gatgcaatggcaagtggtgtcgaaaatgatatgcaatttccgtggatgcgtggcagctac gtacgtgaggaatctacctccgatacctttgattttaatttagcctatgaaggtaataat tttaaagcgcgctttgtaattggtaatacacaatcagagggcggcccagaagaaagctgg gaagcggcgtataaaagttctaacgcgggcgaaagcgcagccactattcaaaacgcagct caaacggcaggctggtcactcaatcaaaataatgtgtcacttaatatagaccctaataca ttagttaatttacaaaatggagttggaggcggtcgtgatgcgggctcttcgaactcaagc tttgtacgcagtgagctagaagaagattactaccaagctgatgtggatttttatgttgat tggggctttttaaaaacaattagaaccggtgttaaataccgcaattcaactcttcaccgt gaaaccggcaacaccttctttttagatccaaattttgatattgctgcaggggaagcaagt gagcaaggtattacccgttttgatagctaccagtggaatggtggaatgccattagctaaa aatgtatttactagtgagaataatattgcaggtggttttgatataaaccaaatgccaagt atcgactggaataaatatcgcgatatggtcactgctagttatgtaccttatacgcgcatt gaagataattttgtttacgatatagaagagaaaatatcggctttttatatacaaggtgat tttgaatttagtgaagtcagaggtaatttgggtgtgcgtgttgtgcaaacaaaaacactt acttcatctactgacttatatacctaccaattagatcacacaaatgatgaaacaggtgag ccagtaacaggtgacgctcgttttgtagaagactatcaattagtcactcagcaaaacaaa gacactcaagttttgccaagctttaatatagcgtgggatgcaaccgacgatttagttatt cgtggggcaatagctaaagtaatatctcgtcctgactatagtgatttaggtgcgcagcag cgcattacctatgtatcaggtgaatgggcagaagatagagccgcatttaacgagcttcct ggttttagcggtagtggcggaaataaaaacttgaaaccatttgaatcaattcaagccgat ttatctattgagtattattatggcgaaggttcagctgttgggctggcactttttcataaa aaagtagataactttgttgtgccactggtgatcgacgtagagcaaaactttgctggtaaa aataatatagtggatgcagggactattaatatagccccttacagcactgtaggtaatggc accgatgcagtatcaaaaggcgcggaagtatttattcagcatgcctttgatagtggtttt ggcttttacgcaaattacacttataacaaaaccaatagagcagatgtaacaattaatggt gaagaatttggtcagtcggccttaataggtagtgcaaagtatcagtacaacacctctgtt tattatgaaggagattattttaatgtacgtgcttcttataataagcgcggcgaaacagta ctcggtttaaatagcggattaaatgtataccaggacccttacgaacaactcgatgtaaat gcatccgtaaatttatacgacgggcttagctttaccgcagcggttattaatttaactaaa tctgaatcagtaacgcgtttaggaaatgacaccgatgcgcgattactcaatactagctac tcaggtcgtcgtttttacgcgggctttaactatagcttttag

DBGET integrated database retrieval system