Pseudoalteromonas sp. SM9913: PSM_A0603
Help
Entry
PSM_A0603 CDS
T01374
Name
(GenBank) sensory box histidine kinase/response regulator
Organism
psm
Pseudoalteromonas sp. SM9913
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
Hpt
HATPase_c_3
FleQ
betaPIX_CC
DUF4381
THF_DHG_CYH_C
ULD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT67554
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(642455..645238)
Genome browser
AA seq
927 aa
AA seq
DB search
MQSKPSSAIKGLLPLFLVSNLIITALFVVAFVLYSQSNADNNASAPTSTLSLTKLAERLD
QPLAEALTIYEQDKVTQLLDMTTLLNDDYKYTLHRFNANNQAELVYSNNSKAIAPLAVNK
HIKEQNTLHHLISSEGQIIGELIIKQTQPSVTPSNQHSPLNAYVVAFAALVVLFLLAFML
NKYINKRLHKNTDSLTQELKEITQNDNYQSTLNEQLEGGLETVAQQVNLLLKKVSKVQAD
DQAAKKELKKLQTSLETEVQSRTFELEKQTQKALKASETKTTFLATMSHEIRTPMNGVIG
TIDLLRQTELDGAQQRLSTIIRESAFSLLSILDDILDFSKIEAGKLNIDPTPFSVADTLE
EVAKVLSSVAKNRHLELDLSIAPDIPNNLMGDSVRVRQVLYNLCSNAIKFTSTNGSTQGR
VKISVEVAHNTADHFTLRFCVVDNGKGMSQSQLRKIFSPFTQAESSITREFGGTGLGLSI
CKSLTELMLGTIHVTSHEGIGSEFTVELPFSTAGKTEFAHKNTLNNKHVVVVSDNAERGK
VIYRYLSFMGAKITYAHEQKDIEDHQDTKDIIWVVDGIDDMSSISTLLRSLLYSLEDNNQ
QMVVLSKLDEAVINHKNIFYINASPLCKSNFMLSILVAAGLHKPKQIKKAKSMNHYLNSE
EALAANRLVLLVEDNLLNQEVLTEQLHILGYSVEVANNGEEGIEMWRKNSYSLILTDLHM
PKMSGYDMVEKIREEAALLEAIDAQPYIIAVTANALKGERERCLAVGINDFITKPIELNA
LEDILNQWSDLDNKQPKQISSAEKPAMPINMESANKYINGDDAKKIRFFKMYLEQSQEQI
KSINFAVLQKSQSEIIAACHQLKSISKTVGANIVADLAQSFEDKCKADEVNADELIEMRD
ELEIEYSRAAQFLKEQIRNHDQQDDLI
NT seq
2784 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagagcaagccctcttcagcaataaaaggcctactacctttattcttagttagtaac
cttataataaccgcattatttgtagtcgcctttgtgctttattcacaaagtaatgctgat
aacaatgcatctgctccaacctctactttatcgttaacaaaacttgctgagcgtcttgat
cagcctttagcagaagcattaacaatatacgagcaagacaaggtcacgcaattactcgat
atgaccaccttactcaatgatgattataaatatacgctccaccgttttaatgccaataat
caagccgagttagtttatagcaataacagtaaagcaattgcgcctttagctgttaataaa
catattaaagaacaaaatactcttcatcatttaatctcatcagaggggcagataattgga
gagcttattattaagcaaacacagccctcagttacaccatcaaatcaacactcaccacta
aatgcctatgttgtagcctttgctgcactggtggtgctgtttttattagcattcatgttg
aataaatacattaacaagcgattacataaaaatacagattcacttactcaagaactaaaa
gaaattacgcaaaatgataactatcaaagcaccctaaatgagcaactagagggtggttta
gaaacggtagctcaacaagttaatttattactcaaaaaggtgagtaaggttcaagctgac
gatcaagcggcaaaaaaagagttaaaaaaattacaaacaagccttgaaacagaagtacaa
agcagaacctttgagttagagaaacaaacgcaaaaagcgctaaaagccagtgaaactaaa
accacctttttagccactatgagtcatgaaataagaacaccaatgaatggtgtaatcggt
accattgatttacttcgtcaaacagaacttgatggtgcacagcaacgtttaagtacaatt
attcgtgaatctgcattttcgttactcagtatcttagatgatattttggatttttctaaa
attgaagcaggaaagctcaatatagacccgactcccttctctgttgcagatacgctagaa
gaagtcgcaaaggtgttatcgtctgttgcaaaaaaccgtcacctagaactcgatttatca
attgcaccggatattcctaataaccttatgggcgactcagtcagggttcgccaagtactt
tataacttatgtagcaatgccattaaatttaccagcactaacggctctactcaaggtagg
gtgaaaatatcggttgaagttgcacacaacactgccgatcattttacactccgtttttgt
gtagttgataacggtaaaggaatgagtcagtctcaattaaggaaaatattcagcccgttt
actcaagctgaaagctcaattacccgagaatttggcggtacaggacttgggctttcaatt
tgtaaaagcttaaccgagctaatgcttggtactatacatgttacaagccatgaggggatt
ggtagtgagtttaccgttgaactgcctttttcaacggcaggtaaaactgaatttgctcat
aaaaatacactcaataataaacatgttgttgttgttagtgacaatgctgaacgcggcaag
gtaatttatcgttacttgtcattcatgggtgccaaaataacctatgcccatgagcaaaaa
gatatagaagatcatcaagacacaaaggatattatttgggttgttgatggtattgacgac
atgagtagcattagcactttgctaagaagtttactttactcactagaagataataatcag
caaatggtggtattaagtaagctagatgaagccgttattaatcataaaaatattttttat
attaatgcttcaccactgtgcaaatctaactttatgctttcaattttggttgcggcgggc
ttacataaacctaagcaaataaaaaaagctaaaagcatgaatcattacttaaattcagaa
gaagcactcgctgcgaataggcttgttttattggtagaagataacttactaaaccaagag
gtacttaccgagcagttacacatactagggtatagtgtggaagtagcgaataatggtgag
gaaggcatagagatgtggcgtaaaaacagctattcgctcatcctaaccgatttacatatg
ccgaaaatgtctggctacgatatggttgaaaagattagagaagaagcagcactgttagaa
gcaatcgacgcccaaccttatattattgctgtaacagccaatgccttaaaaggcgaaaga
gaacgctgtttagctgtgggaattaatgactttataactaaaccgattgagttaaatgcg
cttgaggacatattaaatcaatggagcgatttagataataaacagccaaaacaaattagc
tcagctgaaaagccagccatgcctattaacatggagtctgccaacaaatatataaatggc
gatgatgctaaaaaaattcgcttctttaaaatgtatttagagcaaagccaagaacaaatt
aaatcaatcaactttgcggtactacagaagagtcaaagtgaaattatagctgcctgccat
caattgaaatctatatcaaaaacagtgggggctaatattgtggctgatttagcgcagtca
tttgaggataagtgtaaggctgatgaagtcaatgccgatgagttaattgagatgagagat
gagctcgaaattgaatattcaagagcagcacaatttttaaaagaacaaattagaaaccac
gatcaacaagatgacttgatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
