Pseudoalteromonas sp. SM9913: PSM_A1692
Help
Entry
PSM_A1692 CDS
T01374
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psm
Pseudoalteromonas sp. SM9913
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psm02000
]
PSM_A1692
Transporters [BR:
psm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSM_A1692
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT68619
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(1815368..1817638)
Genome browser
AA seq
756 aa
AA seq
DB search
MKNKGKLLNKKIGLICLPGFLLPLQAKVLVDDESANARNMEIIEVYAQKRAQKIEEVGIS
VSTIKGNDLQVQHVKDSTELSVFAPNLKISQNAAEGTPPAVNIRGVGLVDYNTANTSPVA
MYVDDIAVGSASNQIVNLFDIEQIDILRGPQGTLFGRNSTGGAILIRSKRPEFEQSGYLS
TGIANNNATSVDAMFNSGLSENTAVRIALNHQDYDYSTNNIFADSPKAGMRQTNGRVSFL
ADFDTVQLLIKGHIADWDGIVQPVGSIGIVANPLTGERCSPAQAGSTSCFDNFGFNDASD
DFYTVSVNNNSPHKTDGKGISAHANWQLDTHNELVFLSSYNKLKRDHAFNCDGSPAQLCE
GNLGLNTDLVTQELRLQSQLGEHFLTTGIYYADESIVQDNVNDILRDYRGVLSTDLTATF
FYNNKINTKSMAAFTQLDYQLNQDWLITAGLRYSYESLDYDSVSQLNVLIDADDLTGVKV
PFYRVQGEQSDNGISGQLGVNFKVDDSTYAYYRFANGAKSGGYNGGFLSSVEQAQLADYQ
KERLNSHEIGSKSWWPQQGIRFNWAAFYYDYNDQQVFMNQPSTSEQSPPIQLLENVADSI
IYGLEADLEYWLTDNLNVKFAMGYIPHAEFEEYVDPLGNALTNNRLPFTSKWNLSAGIEY
TFEVANHPLTTQLLVDYQSDYYFDQNQNPYAMQDSYSIFNANIHYQHDNWGVAIWGKNLF
GTQYSHLKFDLSSFLGMLEDFKGEGRRFGLDISYQF
NT seq
2271 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaaggcaagcttctcaataagaaaatagggttgatatgcttaccaggcttt
ttactgccactgcaggcgaaagtacttgtagatgatgaaagtgcgaatgcgcgtaatatg
gaaatcatagaagtttatgcgcaaaaaagagcgcaaaaaattgaagaagttggcatttct
gtaagcaccattaaaggtaatgatcttcaagtgcaacacgttaaagattcgacagagttg
tctgtatttgcgcctaatctaaaaattagtcaaaacgcagcggaaggcacaccgccagcg
gttaacattcgtggtgtagggctagttgattacaatacggcgaatacatcccctgtggcg
atgtatgttgatgacattgctgttggctctgcaagtaaccaaattgttaatttatttgat
attgaacaaattgatattttgcgtggtcctcaaggcactttatttggtcgcaactctact
gggggcgctattttaatccgctctaaacgccctgagtttgaacaaagtggttatttaagc
actggcattgctaataacaatgcgaccagtgttgatgctatgtttaattcaggacttagt
gaaaacactgccgttcgtatagcgcttaatcatcaagattatgattattccactaacaat
atttttgccgactcaccgaaagctggcatgcgacaaacgaatggccgagtttccttttta
gctgattttgacacggtacagctattgataaaagggcatattgccgattgggatggcata
gtacagccggttggcagtattggaattgttgctaatccactaacaggagagcgatgctcg
ccagcacaagcgggttcaaccagctgttttgataattttggctttaatgatgccagtgat
gatttttatacagtcagcgtaaataataattcgcctcataaaacagatggtaagggcatt
agcgcccatgctaattggcaattagacacacacaatgagcttgtttttttaagcagttat
aacaaattaaaacgggaccatgcttttaattgtgatggctctcccgcacagttatgtgag
ggcaacttagggttaaatactgatttggtgacgcaagaattgcgattgcaatctcagttg
ggtgagcattttttaacgacgggaatatattatgctgatgagtctattgttcaagataat
gtaaatgatattttacgcgactatcggggagttttatcgacagatttaaccgctactttt
ttttataataataaaataaacacaaagagtatggctgcgtttacgcaactcgattatcaa
ttaaaccaagattggttgatcactgcagggcttcgttactcttatgaatcgttagactac
gactcagtatctcagcttaacgttttaatagatgctgacgatttaacaggggttaaggtt
ccattttatcgtgttcaaggagagcagtcagataatggcatttcagggcagttaggagtg
aactttaaagtcgatgattcaacttacgcctattatcgttttgctaatggcgccaaaagc
ggaggctataacggtggatttttatcatcggttgaacaggcccaactcgctgactatcaa
aaagagcggttaaactcacatgaaatcggatcaaagtcctggtggccacagcagggtatt
cgatttaactgggctgcattttattatgattataatgatcaacaagtctttatgaatcag
ccttcaacatctgagcagagcccgccaattcaattattagaaaatgtggctgactccatt
atttacggcttagaagctgatcttgagtattggctgaccgataatttgaatgttaagttt
gctatgggttatatacctcatgcagagtttgaagaatatgttgatccactagggaatgcg
ttaactaataatcgtttgccgtttacctcaaaatggaatctcagtgcgggtattgaatac
acttttgaggtggctaatcacccactaactactcaattattagttgattatcaatccgat
tactattttgatcagaatcaaaacccctatgcgatgcaagacagctatagtatttttaac
gccaatatacactatcaacacgataactggggggttgccatttggggtaaaaacctgttt
ggtactcaatacagtcacttaaaatttgatttaagttcttttcttggcatgcttgaagat
tttaagggtgaaggccggcgttttggcttggatattagttatcagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
