Pseudoalteromonas sp. SM9913: PSM_A1939
Help
Entry
PSM_A1939 CDS
T01374
Name
(GenBank) peptidase
KO
K07263
zinc protease [EC:3.4.24.-]
Organism
psm
Pseudoalteromonas sp. SM9913
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
psm01002
]
PSM_A1939
Peptidases and inhibitors [BR:
psm01002
]
Metallo peptidases
Family M16: pitrilysin family
PSM_A1939
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M16_C
Peptidase_M16
Peptidase_M16_M
SRP19
GerPC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT68863
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2075935..2078802)
Genome browser
AA seq
955 aa
AA seq
DB search
MKLTKIALAVLLASGLAACNSSTQAVDKNIVTETSIPGVTLIESVESNAGEINIPYKKYK
LDNGLTVIVHEDHSDPLVHVDVTYHVGSAREELGKSGFAHFFEHMMFQGSENVADEEHFK
IISEAGGTLNGTTNSDRTNYFETVPVNQLEKMLWLEADRMGFLLDAVTQEKFEVQRETVK
NERGQRVDNRPYGRLGERVAQAMYPDGHPYSWPVIGFMDDLNRVNVNDLKAFFLKWYGPN
NATLTIGGDINANEILPLVTKYFAPIPKGPTIPKVEKTAVTLDADRYISMEDKVHLPLLS
MSFPTTYARSEDEAPLDILAEILGGGNNSLLYKNLVKTQLAVQASANHPCQELACSISLY
ALPNPTAGKTLADMEKIIRDSFTEFEKRGVTQDDLDKVKAKIESGAIFGLQSVSGKVSQL
AASETFTGNPNSAKDEIARYNKVTKADVMRVFNQYIKGKSAVIMSVVPEGQTQLIAAPDN
FTPKAYDFGGPSTTSADDLVARRAVDTFDRSVHPEAGANPAVDVPTLWQTKTENGVKILG
TQSIETPTTAIFIKVPGGLYNEQAGKVGLSSMTASLMSESTQNYTTEQMSNALEKLGSQV
NIYADKTHTNVYVSSLTKNVDATLKLVEEKLFKPSFNADDFERNKKQIIQNIQHSMKDAG
YLASNTYSKLLYGDNIAALPSTGTLNSIEAITLDDVKAFYNANFKPQGAQVIIVSDLKES
TIEPKVKAALANWQGKSSPIAVDFSEPKVETNVIYLVDKPDAPQSEIRIGKRDMVEDITG
EFFKANLMNFAFGGTFNSRINLNLREDKGYTYGARSRFWGDKTSGGFTASAAVRADSTAA
SITEFTNELNNYAQNGVTDEELMFMRKAINQKDALKYETPNAKLGFLAQILEFDLKPSFV
KERNEIVSNISKEEVNALAKKHLNTKDMIYLVVGDAKTLRPELEKLGMKVIDYSL
NT seq
2868 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactcacaaaaattgcacttgctgttttacttgcatcagggttagctgcatgtaat
agctcaactcaagctgttgataaaaatattgttacagaaacatcaattcctggcgttaca
cttattgaatcagtggaatctaatgcaggcgaaatcaacataccgtataaaaaatacaaa
ctagataacggtttaactgtaattgtacatgaggatcattcagatcccttagtacacgtt
gatgtaacataccacgttggttctgctcgcgaggagttgggtaagtcaggctttgctcac
ttttttgagcatatgatgtttcaaggttcagaaaatgttgctgatgaggaacattttaaa
ataatatctgaagcaggcggtactttaaatggtactactaactcagatagaacaaattat
tttgaaacagtacctgtaaatcaattagaaaagatgttgtggctagaagctgaccgaatg
ggctttttactcgatgctgtaacccaagaaaaatttgaagtacaacgcgaaacagtaaaa
aatgagcgcggccaacgtgttgataatcgcccttatggtcgtttaggtgagcgtgttgct
caagctatgtatccagatggccatccatattcatggcctgtaattggttttatggacgat
ttaaatcgcgtaaatgtaaatgacttaaaagcattctttttaaaatggtacggaccaaat
aatgcaacgcttactattggtggcgacatcaacgctaatgaaatactaccattagttact
aaatactttgcaccaataccaaaaggtcctacaatacctaaagttgaaaaaacagcggta
acactagatgccgatagatatatttcaatggaagataaggttcacttacctttattaagt
atgagtttcccaacgacttatgctcgctctgaagatgaagcacctcttgatatacttgct
gaaatactaggtggaggtaataattcactactatacaaaaacctagttaaaactcaactt
gctgttcaagcaagtgcaaatcatccatgccaagagttagcatgctcaattagcctttat
gctttacctaatcctacagcaggaaaaacgttagctgatatggaaaaaatcattcgtgat
tcatttactgaatttgaaaagcgtggtgttacacaagatgatttagataaagtaaaagct
aaaatagagtcaggtgcaatttttggtctgcaaagcgtatcaggaaaagtctctcaacta
gccgcatctgaaacgttcacaggtaacccaaactcagctaaagatgagattgcacgttat
aacaaagttacaaaagccgatgttatgcgtgtttttaatcaatatatcaaaggtaagtct
gccgttattatgagtgttgtgccagaaggccaaactcaacttatagctgccccagacaac
tttactcctaaagcgtatgattttggaggtccatctacaacttcagctgatgatttagtg
gcacgaagagctgttgatacatttgaccgaagtgttcatccagaggccggcgctaatcct
gctgttgatgttcctactctttggcaaactaagaccgaaaacggtgttaaaatattaggt
actcaaagtatagaaacgccaactactgctatttttattaaagttccgggtggcttgtat
aatgagcaagctggtaaagtgggtttatcgtcaatgactgcatcgttaatgagcgagtca
acgcaaaactacactacggagcaaatgagtaatgcgcttgaaaaactgggtagccaggta
aacatatacgctgataaaacacatactaatgtgtatgtttctagcttaaccaaaaatgta
gatgcaacgctaaagcttgttgaagagaagttatttaaaccatcattcaatgccgatgac
tttgagcgtaataaaaagcaaatcattcaaaatattcaacattcaatgaaggatgcaggt
tatttagcatctaatacatatagcaaattactatatggcgacaatatagctgcacttcca
agtactggaacgcttaatagtattgaggctattacattagatgacgttaaagctttttat
aacgcaaactttaaaccacagggcgcgcaagtcattattgtttctgatttaaaagagtca
acaattgagccaaaagttaaagctgcacttgcaaactggcaaggtaaatcgagcccaatt
gccgttgatttcagcgaacctaaagtcgaaactaatgtcatttatttggttgataaacca
gacgctcctcaatcagaaattcgtattggtaaacgcgatatggttgaagacattacaggt
gagttttttaaagctaacttaatgaactttgcatttggtggcacttttaacagtcgtatc
aatctaaatttacgagaggataaaggctacacttacggtgctcgctctcgtttttggggt
gacaaaacatcaggtggctttacagcctctgcagcggtgagagccgactctactgcagcg
tctattacagagtttactaatgagcttaataactatgctcaaaacggtgtcactgacgaa
gagcttatgtttatgcgtaaagccatcaatcaaaaagatgcgcttaaatacgaaacgcct
aatgcaaaacttggctttttagcacaaatattagagttcgatttaaaacctagctttgta
aaagaaagaaatgagattgttagcaatattagcaaagaagaagttaacgccttagctaaa
aaacacttaaatactaaagatatgatttatttagtagtgggtgatgctaaaacacttcgt
ccagagcttgaaaaattaggcatgaaggttattgattatagcctttaa
DBGET
integrated database retrieval system