Pseudoalteromonas sp. SM9913: PSM_A2758
Help
Entry
PSM_A2758 CDS
T01374
Name
(GenBank) hypothetical TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psm
Pseudoalteromonas sp. SM9913
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psm02000
]
PSM_A2758
Transporters [BR:
psm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSM_A2758
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
DUF7781
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT69671
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2940437..2943457)
Genome browser
AA seq
1006 aa
AA seq
DB search
MSNISTKKCALALAITASLSGHAIANDEAIARQSTAKASEEVVQEAPEKITVTGSRLKRD
SFSVTTPLVTMDRASIQDTGLGNLSDVLIDNMPALSESIGNTTSQSSISGTGLSTVQLRD
LGANRTLTLIDGRRVVSNSYGGNYVSLNTIPSGMVERVEIISGGASATYGADAVAGVVNI
ITQSKKEGFEFQARGGETTDGGGREFTLDLNYGTSFADDRGYVFVSSNWDRDFGMTFYDR
DRAKIEAAHSYDDELMCNQMYTADGYQCMSGITQADWASKSDGTLGGVFLESNRNDTQFW
YDGQTLRDDWKGNEEIYGINSSQYVMLDVPSDNFSTAIKVDYDVTDDIMSYFQIQYSKSG
SFNDKSPEDEYEGAYVPRYDPVTGDPIDDIAPGYIPIDNPYVPQEIIDSNPYKDRIYWDR
RFGEVGNISTDNDRTTIRTWAGLQGMMFDDTWDWDISAGYGQFKQHQIRSNELNTVRVNQ
ALQAEKLADGTIQCKDAEARAQGCVPLNLFGEGSITPEMADWIRTNPIIDTEIQQYTVMG
YITGDLYELPAGNVSAVFGAEYRKDSQSLDTSDDMKAGGITFNVVPSFYGEVEVYEAFAE
LAVPLLKDAQFAKSLSAETSLRLANYSIDNISTVASYKLGLLWQPIDGYMLRANYARAQR
APTITELLSPPRGDFDSFDDICDGLTATSTNPGHDNCRLEPTLAQKLADDPNFEFESEDN
NYSPNTGNPNLKEETADTYTFGITVSPEFLDGFNLAVDYYDIAIVDAIDEISNENIMREC
YDSEAAWGSDNEYCNDITRNDEGNIVKILQREYNLDELTARGYDVVATYKYDIGSYGNLS
FKLDYNHIIENSQTYEGLDGNSVTSQYAGYGRSKDKAAMSIVWKMDDLRIRWRTNYVGAF
KASQEDEKDYLEYVAANDERCAAGDAGCIANPEPLAYQDYGSFLKHSLSASYTLALTDKS
DLRVFGGINNVFDDKGAFYPSGRGNFYSGYGGGAGRYVYLGAQYSF
NT seq
3021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagtaatatatcaacaaaaaaatgcgctttagcattggctataacagcgagtttatct
ggacatgcaatagcaaatgacgaggctattgctcgtcaatcaaccgctaaagcaagcgaa
gaagtggttcaagaagcaccagaaaaaataaccgtaacgggttcgcgtttaaagcgtgat
agtttttcggtaacaaccccgctggtaaccatggacagagcgtcaattcaggatacaggt
ttaggcaatctttcagatgtattaatcgataacatgcctgcactgagcgaaagtattggt
aacacaaccagccaatcaagtatttcgggtaccggtttatcaacggtgcagcttcgagac
ttaggcgctaacagaacgctaacgcttattgatggccgccgtgtggtatcaaatagttat
ggtggtaactatgtgagtttaaataccattccaagtggcatggtggagcgcgttgaaatt
ataagtggtggtgcgtcggccacttatggtgccgatgcggtagccggtgtagtgaatatt
attacccagtcaaaaaaagaaggctttgaatttcaagcccgtggcggtgaaacaacagat
ggtggcggtcgtgagtttacgcttgatttaaactacggaacgtcatttgccgatgatcgc
ggttatgtatttgtcagctcaaactgggatcgtgattttggcatgaccttttacgaccgt
gaccgcgcaaaaatagaagcggcacatagttacgatgatgagttaatgtgtaatcaaatg
tacactgctgatggttatcagtgtatgagtggtattacacaagctgattgggcaagcaaa
agcgatggtaccttaggcggtgtatttttagaaagcaaccgaaacgatacccagttttgg
tacgacgggcaaacgctgcgtgatgactggaaaggcaatgaagaaatttatggtataaat
tcgtcacaatacgtcatgcttgatgtacctagtgataacttttcgaccgcaataaaagta
gattatgatgtaacagacgacattatgagctacttccaaattcaatacagcaaaagtggc
tcgttcaacgataagtcaccagaagatgaatacgaaggggcttacgtacctcgctacgac
ccagtgactggcgatcctatcgatgatattgcgccaggttacattcctattgataaccca
tacgtgccacaagaaattattgacagcaacccatacaaagaccgcatttattgggatcgt
cgttttggtgaagtaggtaatatcagcactgataacgaccgtacgaccatccgtacttgg
gctggcctacaaggtatgatgtttgatgatacatgggattgggatatctctgctggatac
gggcaatttaaacagcatcaaatccgtagtaacgagttaaacacggtacgtgtcaatcaa
gcactgcaagctgaaaagctagccgatggcactattcaatgtaaagacgccgaagcgcga
gcgcaaggatgtgtcccgcttaatctatttggtgaagggtctattacccctgaaatggct
gactggatccgtactaacccaattattgatactgagattcagcaatatacggtaatgggt
tatatcaccggagacctatacgaattaccagcaggtaatgtgtctgcagtatttggtgca
gagtatcgtaaagactcacaaagcctagataccagtgatgatatgaaagcgggcggtatt
acgtttaacgttgtgccttctttttatggtgaagtagaagtgtatgaggcatttgctgaa
cttgcagtgccactacttaaagatgcgcaatttgctaaaagtttgtcggcagaaacgtcg
ctgcgtttagcaaattacagcattgataatatcagcactgtcgccagttataagctaggc
cttttatggcaaccaattgatggatacatgctacgtgccaattatgcacgagcacagcgt
gcgccgactatcacggaattattatcaccccctcgcggcgattttgattcatttgatgat
atttgtgatggtctaacagcaacatcaacaaacccaggacacgataactgtcgtttagag
ccaaccttggcacaaaagctagctgatgatcctaactttgaatttgaaagtgaagacaat
aactactcgccaaatacaggtaatccaaacttaaaagaagaaacagccgatacctatacc
tttggtattactgtatctcctgagtttttagatggctttaacttagcggtggattactac
gatattgctattgttgatgcaattgatgaaataagtaacgaaaacatcatgcgcgaatgt
tatgactcagaggctgcgtggggcagtgataacgaatactgtaacgatattactcgtaac
gacgaaggtaacattgtaaaaattctacagcgtgaatataacttggatgagttaactgcg
cgcggttacgatgtcgttgcaacttacaaatatgacataggcagctatggcaacttgtca
tttaagcttgattacaatcacattattgaaaactcgcaaacctatgaaggcttagatggt
aacagtgttacttcacagtatgcaggttatgggcgctcaaaagataaagccgctatgtcg
attgtatggaaaatggatgatttacgtatccgctggcgtacaaattacgtaggcgcgttt
aaagcaagccaagaagatgagaaagactaccttgagtatgttgctgcaaacgatgagcgc
tgtgctgcgggcgatgccggttgtattgcaaacccagagccacttgcgtatcaagattat
ggctcatttttaaagcacagtttatcagcgtcttacactctggcactgactgataaaagt
gacttacgtgtatttggcggtattaacaatgtatttgacgacaaaggggcattttaccca
agtggtcgtggtaacttttatagtggctacggcggcggtgccggtcgttatgtttatcta
ggtgcacaatatagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system