Pseudoalteromonas sp. SM9913: PSM_B0370
Help
Entry
PSM_B0370 CDS
T01374
Name
(GenBank) putative TonB-dependent outer membrane receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
psm
Pseudoalteromonas sp. SM9913
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psm02000
]
PSM_B0370
Transporters [BR:
psm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSM_B0370
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT70408
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(412882..415452)
Genome browser
AA seq
856 aa
AA seq
DB search
MKLKSNALQQAIKFALATTAAGLFVSGSAIAQEEQTEVKVNKNVEKIAVVGTRSAPRSIG
DSPVPIDIIGGEELSKSGNTDMLELLKGAIPSLNVHSMPISDAASLVRPANLRGLPSDST
LILLNGKRRHRASVIAFLGGGINDGAQGADISVIPSIALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIAG
VLNFQLKDASEGGSFEVRKGQYYEGDGDTTQISGNVGLPFTDSGFANLSFQYKTADATSR
SVQRYDATQLIKAGVPDIAPITQVWGAPEVDDDISIFGNVGLELTNDSQFYMFGNYSERD
VRGGFYYRNPHTRPGAYSNDGGETLLVGDLTGDMSGNCPTIMIDDNVLDNPDYINGVANN
PDCFAFNEMLPGGFTPNFGGNITDTSLTIGTKGEFTGGFLEGAYYDLSGTVGYNESRYFI
YDTINASLGPDSPRDFSPGKYEQLEKNFNFDISKGFDFDLAYDVNIAGGLEWHEETFTVV
AGDEASFIAGPLTDQGFGIGSNGFPGFKPSDAGEYDRRNYAAYIDIEAPFTEEFLMGLAL
RYEDYDTFGSTTNYKLMGQYHLTEDLNIRGSISTGFRAPTVGQANVSNVQTNLSSGVLVD
SALLPPTNPIAIQLGGTELEPEESQSYTFGAVYTIGDLFLTVDYYNIQVDDRISQSDKIE
LSQADKDTLEAAGVPNVQNLAQVSFFTNDFDTTTQGVDLVANYSAELFSGSSTFSLAYNW
NETEVTRSSDITGAFKVSRLENDLPNHRATLSWAQQWESFSAFSRLNYFGEYQGVHVDYD
ETAKMADAAVTLDVEVTYFMNDSISFSLGAQNLLDQEAEKLDFTVAPNNNWGGKYYETSP
YGINGGFYYAKATYTF
NT seq
2571 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaaaagcaatgcgcttcaacaggccatcaaatttgctctagcaacaacagcc
gcaggcttatttgtttctggttcagcaattgctcaagaagagcaaaccgaagttaaagtt
aacaaaaatgtagaaaaaattgccgtagtaggtacgcgctctgcgcctcgttctattggt
gactctcctgtacctatcgatattattggtggtgaagagctaagtaaatcaggtaacact
gatatgctagagctattaaaaggggctattccttctttaaacgtacactcaatgccaatc
agtgatgctgcttcattagtgcgccctgcaaacttacgcggactaccttcagatagcaca
ctaattttacttaacggtaaacgtcgtcaccgtgcttcagttatcgcctttttaggtggt
ggtattaacgatggtgcgcaaggtgctgatatttcagtaattccaagtattgcactgaaa
caagtagaagtacttcgtgatggtgccgctgcacaatatggttctgatgcgattgctggg
gttttaaatttccaacttaaagatgcctcggaaggcggatctttcgaagttcgtaaaggc
caatattacgagggcgacggtgatacaacccaaatttcaggtaatgtgggcttaccgttt
accgatagcggttttgcaaatttaagctttcagtacaaaacagccgatgcgaccagccgt
tcagttcaacgctacgatgcaactcaacttatcaaggctggagtaccagacattgctccg
atcactcaagtatggggtgcaccagaggttgatgacgacatctctatctttggtaatgtt
ggtttagaacttactaacgactcacaattttacatgtttggtaactactcagagcgtgat
gtacgcggtggtttttattaccgtaacccacatactcgccctggtgcatactcaaatgat
ggtggcgaaacactgcttgttggtgatttaaccggtgatatgagcggtaactgtccaaca
atcatgattgatgacaacgttcttgataaccctgactacattaatggtgtagcaaataac
cctgattgtttcgcatttaacgaaatgcttccgggcggttttacaccaaactttggtggt
aatattacagatacgtcacttactatcggtactaaaggtgagtttactggcggcttttta
gaaggcgcttattatgatctaagtggtacggtagggtataacgaatctcgctactttata
tacgacacaatcaatgcttcactgggtccagatagcccgcgtgattttagcccaggtaaa
tatgaacaattagagaaaaactttaattttgatatttcaaaagggtttgactttgattta
gcttacgatgtaaatattgccggtggtttagaatggcatgaagaaacctttactgtagtg
gcaggtgatgaggcttcgtttattgcaggtccattaactgatcaaggttttggtataggt
tctaacggtttccctggatttaaaccatcagatgcaggcgaatatgaccgtcgtaactat
gcagcttatattgatattgaagcgccatttactgaagaattcttaatgggcttagcgctt
cgctacgaagattacgatacctttggttcaaccactaactataagttaatgggtcaatac
cacctgactgaagatctaaatattcgtggctctatcagcaccggtttccgtgcgcctacc
gtaggccaagcgaatgttagtaacgtacaaactaacttaagcagtggtgtactagtagat
tcggctttgctaccacctacaaacccaattgctattcaactaggtggtactgaacttgag
cctgaagaatcacaaagctacacctttggtgcggtgtatactattggcgatttattctta
acggttgattactacaacatccaagtagatgaccgtattagccaatcagataaaattgaa
cttagccaagcagataaagacacgcttgaagctgcgggcgtacctaacgtacaaaacctt
gcgcaagttagtttctttactaatgactttgataccactacacaaggtgttgatttagtt
gctaactactcagctgaattgttcagtggtagctctacatttagcttagcgtacaactgg
aatgaaacagaagtaacacgctcaagtgatataactggtgcatttaaagtaagccgtctt
gaaaatgacttacctaatcaccgtgcaacactgagctgggcacaacaatgggaaagcttt
tcagcattttctcgccttaactactttggtgagtaccaaggcgttcacgtagattatgat
gaaacagctaaaatggctgacgcagcagtcacgttagatgttgaagtcacttacttcatg
aatgactcaattagcttctcattgggtgcacaaaacttactggatcaagaagcagaaaaa
cttgatttcacagtggcaccaaataacaactggggtggtaagtactacgaaacatctcca
tacggaattaatggtggcttttactacgctaaagcaacctatactttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
