Pseudoalteromonas sp. MT33b: H3302_10675
Help
Entry
H3302_10675 CDS
T10969
Name
(GenBank) VWA domain-containing protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
psmb Pseudoalteromonas sp. MT33b
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psmb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
psmb02044
]
H3302_10675
02035 Bacterial motility proteins [BR:
psmb02035
]
H3302_10675
Secretion system [BR:
psmb02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
H3302_10675
Bacterial motility proteins [BR:
psmb02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
H3302_10675
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
VWA_2
PQQ_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW16121
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2323526..2326795)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MKMKTLVRSILTGFVTCMVTAVYAEDIELYVNYNVSKNEKPRVLLIFDTSGSMAFSSTTG
DDCGQDRNGWIVCSDSRLAAAKNAMNQLIDTNPDIDFGLMRYREVSGGYVLKGIGSPASE
IKNSISNLPANGGTPLAETLWEAYLYITGKDLLYAQNVNGRDTSIESAINNPIKKQECRW
TWSGYRCKDVWIDNFTYSYISPFADSVAEAKRCDNSVNIIYMTDGDPSTDNDNDSDTDIS
NQHNSLFGNALGRNDYIYNNYLHQLAKVIHGTKDIKVDLYPATPDIHETGRLYTIGFGSG
MSAEGQNLLKAASETYGGGKHLVAGTPEELVKALNQAVSAIRKVNDTFTSPSIASNNVDQ
TRSRDGIYYAMFFPKEGARWRGNLKKLKVSGDEIVDLNGKPALNEDGLIDDEAKTFWLPV
NESADGNSVEQGGANLMLSNLSSRTIYTDAGSAGLVDFTKSAVSSALGGDLAAALKFNLT
TATSVNSLTLGLLSTELDKTIKWSRGIDVDDEDGDGSTSDQRQDIFGDPLHSKPVTIDYG
NDDVRILIGTNAGYLHFFQDKNDVLKESWAFIPSSLYKIIKPLRENQEKSKVYGVDGPIS
VFFDDKNGDGVVNGTDRVWAFFGLRRGGNNYYGLDITNPDSPRLMWGGPIIGGTGDFKEL
AQSWSKPTVTYINLKGYENRPLLVFGAGYDTNKDNVLRTEDTKGRGIYIVDAQSGKKVWA
LTSSENGFAGKHSIASDISVLDSDYDGYTDRLYASDTGGDVWRIDMPSNSPTSTESPWTH
FKLASLGSALASQDRRFFYKPMVARTMFSKVSETDVNGKSVKTRIDTPFDAVLLGSGNRS
KPTGTTTSDQLFMIRDINTVTRSFQSDEIPAAITQANLMNMDADPFGNALDSVDKFTDLE
VELGQYHGWYYTLPMAGEKSLAASTVIGGVAYFTSYAPASSTETANQCSLTGGSGGLYAF
HLHYGTKVYDSLKFTTSNDVPDTPQLYFGVGDSCVDSNNNGFCDGSPDADNPDEIKDTDE
KVKEMSQFLTIGPGLKGEQNPFKVKEIQGPGLTVKDGKIQLVNDATPIGFGFKTQQTYIY
KREVNDKSN
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatgaaaacgttagtgcgcagtatactgactggttttgtaacctgtatggttact
gcagtgtatgctgaagacattgagctatacgttaactacaatgttagcaaaaatgaaaaa
ccgcgtgttttacttatttttgacacctctggaagtatggcattttcctctacaacaggt
gatgattgtgggcaagatcgtaatggctggattgtctgtagtgatagccgtttggctgca
gcaaaaaatgcaatgaatcaattaattgatacaaatccggatattgactttgggttaatg
cgttacagagaagtaagtggtggttatgtattaaaagggattggtagccctgcatctgaa
attaaaaattctatttcgaacttacctgccaacggaggcacgccactggctgaaacactc
tgggaagcttacttatatataacaggcaaagacttgttatacgcacaaaatgtaaatggt
agagacactagcattgaatcagcaataaataatccgataaaaaagcaggagtgtagatgg
acttggtcaggatatcgttgtaaagatgtctggatagataattttacttattcatatatc
tctccctttgctgatagcgtcgcagaagccaaacgatgtgataactccgttaatatcatt
tacatgactgatggagacccctctacagataatgacaatgacagtgatacagatattagt
aatcaacacaactcattatttggtaatgctttggggagaaatgattatatttacaataat
tatcttcaccaattagccaaggtgatacatggtacaaaagatataaaagtagatttatat
cctgccacacctgatattcatgaaacagggcgtctttacaccattggttttggctctggt
atgagtgctgagggccaaaatttattgaaagcagcctcagaaacctacggtggaggcaaa
catttagtggcaggcactcctgaagagttggtaaaagcgttgaatcaggctgtttcggct
ataagaaaagtgaatgatactttcacatcaccgtccattgccagtaataatgtagaccaa
acacgtagtcgtgatggtatttattacgcgatgttttttcctaaagaaggcgctcgttgg
cgaggaaacctcaaaaagttaaaagtatcgggtgatgaaattgttgatttaaacggtaaa
ccagcacttaatgaagatggcctgattgacgatgaggcaaaaacgttttggttgcctgta
aatgaaagtgcagatgggaatagcgtagaacaaggtggggctaatttgatgctctctaac
ctttcatcgcggaccatttataccgatgccgggagcgctggattagttgattttactaaa
tctgcagtttcctcggcactaggtggcgacttagcggcagcgttaaagtttaatttaact
acagcaacaagtgtcaattcgttgactcttgggctcttatcgaccgagttagataaaacg
attaagtggagccgaggaatagatgtggatgatgaagacggtgatggcagtaccagtgat
caacgacaagatatttttggtgatcctctgcactcaaaacctgtgacaattgattacggt
aatgatgatgtgcgcattttaattggcaccaatgcaggttacctacacttttttcaagat
aaaaatgatgtattaaaagaaagctgggcttttatacccagtagcttatacaaaattatt
aaaccattacgagagaatcaagaaaaatcaaaggtctatggtgttgatggacctatttct
gtgttctttgatgataaaaatggtgatggagttgtaaatggcactgatcgtgtttgggcg
ttttttggcttaagacgtggcggcaataattattatggactggatattacaaacccagat
tcacctcgactcatgtgggggggaccgattattggtggaacgggagactttaaagaactt
gcgcaatcatggtctaaacctacggtgacatacattaacttaaaagggtatgaaaatcga
ccactgcttgtttttggtgcagggtacgacaccaataaagacaatgttctgcgtactgaa
gacacaaaagggcgcggtatttatattgttgatgcacagagcggcaaaaaagtgtgggct
ttaacgtcgagtgaaaatggctttgcaggtaaacacagtattgcttctgatattagtgtt
ttggattctgattatgacggttacactgatcgattatatgcatccgacacaggcggtgat
gtatggcgtattgatatgccttcaaatagcccaacgagcacagaaagtccttggacacac
tttaaacttgcgagtttaggcagtgcacttgcatctcaagatcgtcgtttcttttataaa
ccgatggttgcgagaacaatgtttagtaaggtctctgaaacagacgtaaatggtaagtcg
gttaaaacacgtattgataccccctttgatgcagtattactaggtagtgggaatcgctct
aaaccaacgggcaccacaacgagtgatcaattgtttatgatccgcgatatcaatacagtg
acgcgctcattccaaagcgatgagattccagcggcgatcacccaggctaatttaatgaat
atggatgctgacccgtttggtaatgcacttgatagtgtagataaatttaccgatttagaa
gttgaattaggtcaataccatggttggtattatacccttccaatggctggtgaaaaatca
ctggcagcaagtacggttattggaggagtcgcttatttcaccagttacgcacccgcttct
tcaacagaaacagcgaatcagtgttcattaacgggaggctcagggggattatatgcgttc
cacttacactacggtacaaaagtgtatgatagtctaaaatttacgacctcaaatgatgta
cctgatacacctcagctttatttcggtgttggtgatagctgtgttgatagtaataacaat
ggtttttgtgatggaagcccggatgctgataacccagatgagattaaggatacagacgaa
aaagtcaaagagatgagtcagttcttaaccataggaccaggtcttaaaggcgagcaaaac
ccctttaaagtgaaagaaatacaaggtccgggtttaacggttaaagatggaaaaatacaa
ctggttaatgatgcaactccgattggttttggttttaaaacacagcaaacctatatttat
aagcgagaagtaaatgacaagagtaactaa
DBGET
integrated database retrieval system