Pseudoalteromonas sp. MT33b: H3302_15855
Help
Entry
H3302_15855 CDS
T10969
Name
(GenBank) S8 family serine peptidase
Organism
psmb Pseudoalteromonas sp. MT33b
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
PA
Cadherin_5
Big_9
Inhibitor_I9
fn3_5
CLIPPER
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
Cep192_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW14509
LinkDB
All DBs
Position
1:3518577..3523847
Genome browser
AA seq
1756 aa
AA seq
DB search
MFNMKKVSVMVASALYISAGTSHAALNQAQEWAEQPADYAPKPMVSAETNWDGKINQTVK
KQSRIFTPEKDITGVQTYIVQLIDAPISAYDGGLKGLASTRETVATARQTTAKPLDLNKP
EIASYSNHLASKRQNVVNSALTLQGLQLKVDREFSVTLNGFTTRMTQEEAARLAKVPGIK
HIARSKIYPLTTFNTIEQTGAKALWSNSQSGLTSNKGEGVVVGIIDTGINTDHPSFAAVG
DDGYTHTNPLGDTYLGDCAKAEFADRCNDKLIGVYSYPEITVAYSDPVFEESRPAYGEDY
NSHGSHVAGTAAGNVLYDITYKEPGYGSQNSGTETNLIFPQVSGMAPHANIISYQVCWPG
AAGDPYAGCPGSAIIAAIEQSAIDNVDVINASLGGFEEDPWVEPIEQAFFNAANSGVFVA
VAAGNSGPYLQSADHSSPWVTTVAAHTPSSQVVFSDKTLENLSGGDTDAPTDMIAAGITF
DELTGLIVSASDYPNPNEPVSRYQTDCDQPYPAGTFDFTDDPNTPDIDESQEDVIVVCKR
SNKPLYAKANNVLAGGAEGVIIYNLSSYQDRSPAPQLPYPAPTAHVTNAEGVKLLNWLST
GSGHKGTITANSASTEEVDEERIAYFSSRGPSYFGFDTLLVDVAAPGVDVFAASSDDQPF
SKNPSSTDWQTMSGTSMASPHVAGAAALLKQSHPEWSLMEIQSALMLTASNNLKNAQYLD
NYKDEGFDSSLQDMGAGRMHVDLADKAGLVMHESIENMKAANPNLGGRLKALNTAYMVDN
NCGLECSFMRTVTATEDATWSVSAEEWIGNSTITVTPSEFSLKAGETQNIVVEVKMNQVA
QAIDNIEVSGNQGQIKLVSSNPNSPVLEMPVWTFNGDTGLPSFIKVDAHRRSSTINVGPF
NTDEVSDFTSRSFGLVEGQQNTVKLFTDTTSGDPFDLVDVDGEMVNPNHIEWTTVPQDAK
MLSASPVGEASRVLMFMGKDSNNDGLASMDETICMSTSFTVTNFCNIVDPEAGEYFTVYM
SLANVPSGEEDQGRDITFATAVVQEGQSNLTVSAPEKIAGYKDYELTLSYNLPDMEVGDI
YFGGFDLGSNPEDAGNLGFVPVIINQIDKDMRFTANKEQATVGELVDFKIEVIANNEQAA
RNFTIDTAFPEGIEIIEDSIVATASTPATPELVDNVLSLQGTQETTKDVARNYKITTNLT
DEMCTLGAAKSPYPNYLDLRTLGWRTLEGVQGQYWNEFEYSFKELMATDLDVSFPFFNKY
HFDSIKLNPAGLVTFGSNGRTTPFHVELPSGGGFPPPPPYLIAPFWVGDNTIPERVDGTY
GNYEANAGITPTYTQARDWLVLEWDNIQRSQVEGQSVDVELFMRMNIAYEPGEYEMMFAY
DNVNLADNQGSIGFKAADGRIIVNGDMPVDLNIGDGFAYDNLDEVVHDELVVCMDYVGPE
VSKFDVQFQAYIGEAAAAQMHTLTVKNGLEGADDEVLTLELNVLGNISLSDFPDMQVEEN
KAISFDVLYADENNVSNQIDVLGNNFSYEVSGNTSGSTVTVTPNENFHGDIDVTVKVSDK
VNPADAATSSFLLSVISDGIELGCTDSEAINFDENANKDDGSCVYSLAELSIVELPDMTV
MENGKLGNIAVELSREVDAEFTLAVAADNADVTIDGTMFSITPNANFYGVIPVTVTMTSG
ETVLATDFELSVISDGIELGCTDTAATNFNPEANTDDGSCEYPEEIEEDDDSGSFGWLLL
AFAPLLTLRRKKSQIN
NT seq
5271 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcaatatgaaaaaagtatcagtgatggtcgcttctgcactgtatatcagtgctggc
acttcacatgctgcactgaatcaagcacaagaatgggctgaacaacccgctgattatgcg
ccaaaaccaatggtttctgctgaaactaattgggatggtaaaatcaaccaaacggtaaag
aaacaaagccgtattttcacgccagaaaaagacatcacaggtgttcaaacttatattgtt
caattaattgatgcacctatttcagcttatgatggcggcctaaaaggcctagcaagtaca
cgtgaaacagtggcaacagctagacaaacaaccgcaaagccacttgatttaaataaacct
gaaattgcaagctactcaaatcacctcgcaagcaagcgtcaaaatgttgtgaactctgca
ctgacacttcaaggtctgcaattaaaagtagatcgtgaatttagcgtcactttaaacggc
ttcaccacccgaatgacccaagaagaagctgcgcgtttagcaaaagtgcctggcattaag
cacatcgcacgctctaagatatacccactaactacgtttaacacgattgagcaaacaggt
gcaaaagcactgtggagcaacagtcaaagtggcctaacaagtaacaaaggtgaaggcgtt
gttgtcggtattatcgacacgggtattaatactgatcacccatcatttgctgccgtaggc
gatgatggctatacacacaccaatccactgggtgatacttacttaggtgattgtgctaaa
gctgaattcgcagatcgctgtaacgataagctcattggtgtgtattcatacccagaaatc
acggtagcgtattctgatcctgtatttgaagaatcgcgtccagcgtatggtgaagattat
aactctcacggttctcacgttgcaggcaccgcagcgggtaacgtgctttatgatattact
tataaagaacctggttacggtagccaaaactctgggactgaaacgaaccttatcttcccg
caagtgtcaggtatggcaccgcatgcaaatatcatttcttaccaagtttgttggcctggt
gctgctggcgacccatatgcgggctgtccaggtagtgcaattattgccgctatcgagcaa
tcagcaattgataacgttgatgtcattaatgcctcacttggtggttttgaggaagatcct
tgggttgaacctattgagcaagcatttttcaatgcggcaaactcaggtgtgttcgttgct
gttgcagccggtaacagtggcccttacttacaatcagctgatcactcatctccttgggta
acaacggttgctgcgcatactccctcttcgcaagttgtgtttagcgataaaactcttgag
aacttatcaggtggcgacactgacgcaccaacagacatgattgctgctggcattaccttt
gacgagctaacgggtttaattgtttctgcgtctgattaccctaacccaaatgagccagtg
tcacgctaccaaacagactgtgatcagccttatccagcgggcacctttgactttaccgat
gaccctaacacgccggatatcgacgaaagccaagaagacgttattgttgtgtgtaagcga
agcaataaaccgctttacgcaaaagcaaataacgtattagccggtggcgctgagggtgtc
attatttacaacctatcgtcataccaagaccgtagcccagcacctcaactgccttaccct
gcgcctacagcacatgtaaccaatgcagaaggtgttaaactacttaattggttaagcaca
ggctcaggtcataaaggaaccattacagcaaactcagctagcacagaagaagtagatgaa
gagcgcattgcgtacttctcaagtcgcggtccatcatactttggttttgataccttgtta
gttgatgttgctgcaccgggtgttgatgtgttcgcagcgagttcagacgaccaaccgttt
tctaaaaacccatcatcaacagactggcaaacgatgtcgggaacatcaatggcaagtccg
cacgttgctggtgctgccgcattgcttaaacagtctcatcctgaatggtctttaatggag
attcaatcagcgctaatgttaacagcaagcaacaaccttaaaaatgcacaataccttgat
aactataaagatgaaggctttgattcatctttacaagatatgggtgcgggtcgtatgcat
gttgaccttgctgataaagccggtttagtgatgcatgaaagcatcgaaaatatgaaagcg
gcaaatcctaatttaggcggccgcttaaaagcacttaacacggcttacatggttgataat
aactgtggcctagaatgtagctttatgcgtacagtgacagcaacagaagatgcaacgtgg
agcgtatcagctgaagagtggattggtaacagcacaattactgtaacgccgagtgagttt
tcactaaaagccggtgaaacacaaaacattgttgttgaagtgaaaatgaaccaagttgct
caagcaattgataatatcgaggtatcaggaaaccaaggtcaaataaaattggtttcgagc
aaccctaattcacccgttctagaaatgccagtatggacatttaacggtgatacaggatta
ccgagctttattaaagtagatgcgcatcgtcgttcttcaacaattaatgtaggtcctttc
aacaccgatgaagtgagtgatttcacatcgcgctcttttgggttagtggaaggccaacaa
aacaccgtaaaattattcacagacaccaccagcggcgacccatttgatttagtcgacgtc
gatggtgaaatggttaaccctaaccatattgagtggactaccgtaccacaagacgcaaaa
atgctgagtgcaagcccagtaggcgaagcctctcgcgtgcttatgtttatgggtaaagac
agtaataacgatggtttagcaagcatggatgaaactatctgtatgtctaccagctttact
gttaccaacttctgtaacattgttgacccagaagcaggtgaatatttcaccgtttacatg
agcttagcaaatgttccttcgggtgaagaagaccaaggccgagatatcacttttgcaaca
gcagtggttcaagaaggtcaaagcaacctaacagtcagtgctccagagaaaattgcaggt
tacaaagactacgaactaacactgtcgtacaacttacctgacatggaagtaggcgatata
tattttggtggttttgacttaggtagcaaccctgaagatgctggtaaccttggttttgtt
cctgtcattatcaatcaaattgataaagacatgcgctttacagcaaataaagaacaagcg
actgtgggtgaattagttgacttcaagattgaagtaatcgcaaataatgaacaagcggct
cgtaatttcacaattgatactgctttcccagaaggcatcgaaattattgaagacagcatt
gttgcgacagcatcaactccagcaacacctgaactggtagacaacgtattatcacttcaa
ggtacgcaagagacgaccaaagatgtggctcgtaactataaaattaccacgaatctaaca
gatgaaatgtgtactcttggagcagctaaatctccgtaccctaactatttagacttgcgt
acacttggctggcgtacacttgaaggagttcaaggccaatactggaacgagtttgagtat
tcatttaaagagttaatggcaacagatctcgatgtttctttcccattctttaataaatac
cattttgattcaatcaaacttaacccagctggtttagtgacgtttggctctaacggccgc
acaacaccattccatgtagaacttccatcaggcggcggtttcccaccaccacctccgtat
cttattgcgcctttctgggttggtgataacacaatccctgagcgtgtagatggtacttat
ggtaactatgaagctaacgcgggtattacaccaacttatactcaagcacgtgattggcta
gtccttgagtgggataacatccaacgctctcaagtagaagggcaatcagttgacgttgaa
ttgttcatgcgtatgaatattgcttatgagccaggcgaatatgaaatgatgtttgcttat
gacaacgttaacctcgctgataaccaaggttctattggtttcaaagctgctgacggtcgt
attattgttaatggtgatatgccagtagatcttaacattggtgatggttttgcatacgac
aaccttgatgaagttgttcatgatgagcttgtagtatgtatggattatgtaggccctgaa
gtgtctaagtttgacgttcagttccaagcgtatattggcgaagctgctgcagcacaaatg
catacgctgacggttaaaaacggcttagaaggcgctgatgacgaagtgttaaccttagag
cttaacgtactgggtaatatttcattatctgacttccctgatatgcaagttgaagaaaac
aaagctattagcttcgatgtactttacgcggatgaaaacaacgtaagtaaccaaatcgat
gtactaggcaataactttagctatgaagttagcggtaatacatcgggcagtacagtaact
gttacgccaaatgaaaacttccatggcgatatcgatgttactgtcaaagtaagtgacaaa
gtaaaccctgcagatgcagcaacaagctcatttttattatcggttatttcagatggtatt
gagttaggttgtacagactctgaagctattaactttgacgaaaatgcaaacaaagatgat
ggtagctgtgtttactcattagcggagcttagcatcgttgaattacctgatatgacggta
atggaaaacggcaaactaggtaacatcgcagtagagctttctcgcgaagtagacgcagag
tttactcttgcggtcgcagctgacaatgcagatgtaactatcgacggtacgatgtttagc
attactccaaatgctaacttctatggcgttattcctgtcacagtaaccatgacttcaggt
gaaactgtattagcaactgactttgagttatcggttatttcagatggtattgagcttggc
tgtactgatacagctgcaaccaacttcaacccagaagcgaatactgatgatggaagttgt
gaataccctgaagaaattgaagaagatgacgacagtggctcatttggctggttattacta
gcgtttgcaccacttctgacgcttcgtcgtaagaaatctcaaattaactaa
DBGET
integrated database retrieval system